Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397J1H4

Protein Details
Accession A0A397J1H4    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
358-385EEEERKPKKTVFKKKKKETKVTFDPAHNBasic
426-456NSLQNNWNNRNNRNNRNNNRKTRTCFKCGKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
340-345KQKGKK
362-375RKPKKTVFKKKKKE
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045358  Ty3_capsid  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0043227  C:membrane-bounded organelle  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF19259  Ty3_capsid  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MVIAKRRNDCVDEAIKQKNKALSEIVERELSREEKDPNYEQQIQRENQNPVTVRLPASNSTTTSSSATVGTFGTTPRHRRRSNETPQSFSQAVSPRRSPEQVTPRVVTPPNNWDQLQNIRTFYQPLDFNLLNQQLAEAHLTASDSSDSSDTDTEDEMANAVLDYLEDNLHNHTSLRVDPFYGDGTQDPLQWMIHFEKVVRSNAWDEAKKIRKYATYLENNAEEWYDEIVANDMADWAAWRAGFVEKYCNTWWKNKWLRELENNRQRPGETVDAYYARFKRLVKRVDINVNQHKRLFIKGLLPHIAPLITMQAPATLAAALEKAQAYEEGLDMVNEIEPRKQKGKKKVVESSDEEEEEEEEERKPKKTVFKKKKKETKVTFDPAHNLDDLAKKFEKMQLNLIQKMEKLTTQVNQQPNYRNRGNNRDNSLQNNWNNRNNRNNRNNNRKTRTCFKCGKEGHISWDCPERKDNSDNSAHAKLVEVEEESEKXGKIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.56
3 0.55
4 0.57
5 0.54
6 0.48
7 0.46
8 0.44
9 0.39
10 0.42
11 0.44
12 0.42
13 0.41
14 0.39
15 0.38
16 0.38
17 0.35
18 0.29
19 0.29
20 0.31
21 0.31
22 0.38
23 0.41
24 0.42
25 0.48
26 0.54
27 0.53
28 0.56
29 0.6
30 0.56
31 0.59
32 0.59
33 0.57
34 0.51
35 0.55
36 0.48
37 0.43
38 0.44
39 0.39
40 0.33
41 0.32
42 0.32
43 0.28
44 0.31
45 0.3
46 0.29
47 0.29
48 0.29
49 0.27
50 0.26
51 0.24
52 0.19
53 0.18
54 0.16
55 0.14
56 0.12
57 0.12
58 0.1
59 0.11
60 0.17
61 0.22
62 0.32
63 0.41
64 0.51
65 0.54
66 0.6
67 0.69
68 0.73
69 0.77
70 0.79
71 0.74
72 0.71
73 0.69
74 0.69
75 0.6
76 0.49
77 0.44
78 0.41
79 0.42
80 0.41
81 0.42
82 0.39
83 0.43
84 0.46
85 0.43
86 0.44
87 0.49
88 0.51
89 0.54
90 0.52
91 0.49
92 0.52
93 0.51
94 0.46
95 0.4
96 0.4
97 0.39
98 0.41
99 0.4
100 0.35
101 0.37
102 0.41
103 0.4
104 0.34
105 0.31
106 0.29
107 0.29
108 0.3
109 0.26
110 0.23
111 0.21
112 0.2
113 0.24
114 0.23
115 0.23
116 0.27
117 0.28
118 0.23
119 0.21
120 0.19
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.03
149 0.03
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.12
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.15
168 0.14
169 0.13
170 0.09
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.13
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.16
184 0.19
185 0.21
186 0.19
187 0.19
188 0.19
189 0.24
190 0.28
191 0.24
192 0.22
193 0.3
194 0.38
195 0.37
196 0.37
197 0.35
198 0.33
199 0.35
200 0.39
201 0.4
202 0.38
203 0.39
204 0.4
205 0.38
206 0.36
207 0.33
208 0.27
209 0.17
210 0.11
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.13
232 0.13
233 0.17
234 0.18
235 0.23
236 0.24
237 0.3
238 0.33
239 0.37
240 0.45
241 0.46
242 0.54
243 0.54
244 0.57
245 0.6
246 0.66
247 0.66
248 0.67
249 0.66
250 0.59
251 0.54
252 0.49
253 0.41
254 0.37
255 0.31
256 0.22
257 0.2
258 0.21
259 0.21
260 0.22
261 0.25
262 0.21
263 0.17
264 0.19
265 0.19
266 0.26
267 0.33
268 0.37
269 0.37
270 0.43
271 0.47
272 0.53
273 0.57
274 0.56
275 0.58
276 0.58
277 0.55
278 0.5
279 0.47
280 0.39
281 0.36
282 0.31
283 0.22
284 0.24
285 0.25
286 0.28
287 0.29
288 0.28
289 0.26
290 0.23
291 0.21
292 0.14
293 0.11
294 0.1
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.11
324 0.14
325 0.19
326 0.27
327 0.34
328 0.41
329 0.51
330 0.62
331 0.65
332 0.72
333 0.76
334 0.74
335 0.73
336 0.71
337 0.65
338 0.58
339 0.5
340 0.41
341 0.33
342 0.27
343 0.21
344 0.17
345 0.13
346 0.1
347 0.15
348 0.17
349 0.19
350 0.21
351 0.25
352 0.34
353 0.44
354 0.54
355 0.6
356 0.7
357 0.79
358 0.88
359 0.93
360 0.94
361 0.94
362 0.92
363 0.91
364 0.9
365 0.87
366 0.82
367 0.74
368 0.69
369 0.6
370 0.52
371 0.42
372 0.32
373 0.26
374 0.27
375 0.26
376 0.26
377 0.25
378 0.23
379 0.25
380 0.31
381 0.36
382 0.31
383 0.39
384 0.41
385 0.47
386 0.51
387 0.51
388 0.46
389 0.39
390 0.4
391 0.33
392 0.25
393 0.22
394 0.21
395 0.23
396 0.28
397 0.35
398 0.39
399 0.42
400 0.47
401 0.53
402 0.56
403 0.61
404 0.6
405 0.6
406 0.61
407 0.68
408 0.71
409 0.7
410 0.71
411 0.71
412 0.69
413 0.68
414 0.67
415 0.65
416 0.63
417 0.65
418 0.64
419 0.65
420 0.68
421 0.68
422 0.72
423 0.73
424 0.77
425 0.78
426 0.82
427 0.84
428 0.89
429 0.92
430 0.92
431 0.92
432 0.9
433 0.88
434 0.87
435 0.84
436 0.82
437 0.81
438 0.74
439 0.75
440 0.7
441 0.7
442 0.7
443 0.64
444 0.64
445 0.62
446 0.59
447 0.51
448 0.57
449 0.51
450 0.45
451 0.48
452 0.44
453 0.42
454 0.48
455 0.5
456 0.47
457 0.52
458 0.52
459 0.53
460 0.52
461 0.46
462 0.39
463 0.36
464 0.31
465 0.25
466 0.24
467 0.19
468 0.18
469 0.19
470 0.21
471 0.2