Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397GNQ1

Protein Details
Accession A0A397GNQ1    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-103LITPEEREQRRQRYQQCQLERQIHydrophilic
343-369EEEERKPKKIVLKKKKKETKVTFDPAHBasic
411-436NSSQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
328-335RKQKGKKK
346-360ERKPKKIVLKKKKKE
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MVIAKRRNDCVDEAIKQKNEALSEIVERELSQEEKNPNYEVTYTLKDLNRTFRDSTRRTVQRLTPEEREQRRQLYQQRQLLITPEEREQRRQRYQQCQLERQIQRENQNPVTVRLPAIFLRQSPEQVTPCVITPPNNWDRLQNIRTFYQPIDFNLLNQQLAEAHLTASDSSDSSDTDTEDEMANAVLNYLENNLHNHTSLRVDPFYGDGTQDPLQWILHFEKVARSNAWNEVKKIRKYATYLEDDAEVWHDEIDANDMADWAAGFVEKRLVKRVDINVNQHKRLFIKGLLPHIAPLITMQAPGTLATALELAQVYKEGLDMVNEIEPRKQKGKKKVVESSDEEEEERKPKKIVLKKKKKETKVTFDPAHNLDDLAKKFEKMQLNLIQKMEKLTTQVNQQPNYRNRENNHDNSSQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCFKCGKEGHISWDCPDRKDNSDNSAHAKLVKVEEESEKEEDKLLQHLLEAYDAYLGKQERDDSSDEDTPIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.5
3 0.48
4 0.48
5 0.43
6 0.37
7 0.33
8 0.29
9 0.23
10 0.25
11 0.25
12 0.23
13 0.2
14 0.18
15 0.18
16 0.19
17 0.19
18 0.17
19 0.23
20 0.28
21 0.32
22 0.34
23 0.34
24 0.31
25 0.31
26 0.3
27 0.27
28 0.26
29 0.26
30 0.26
31 0.31
32 0.32
33 0.35
34 0.38
35 0.45
36 0.44
37 0.46
38 0.47
39 0.48
40 0.56
41 0.55
42 0.59
43 0.59
44 0.62
45 0.61
46 0.64
47 0.63
48 0.63
49 0.67
50 0.67
51 0.63
52 0.65
53 0.71
54 0.71
55 0.73
56 0.68
57 0.67
58 0.66
59 0.68
60 0.69
61 0.7
62 0.71
63 0.69
64 0.68
65 0.62
66 0.57
67 0.52
68 0.47
69 0.4
70 0.33
71 0.32
72 0.36
73 0.38
74 0.46
75 0.51
76 0.56
77 0.62
78 0.69
79 0.73
80 0.75
81 0.83
82 0.84
83 0.84
84 0.82
85 0.79
86 0.8
87 0.74
88 0.69
89 0.68
90 0.63
91 0.62
92 0.61
93 0.61
94 0.54
95 0.56
96 0.52
97 0.46
98 0.42
99 0.36
100 0.3
101 0.24
102 0.23
103 0.18
104 0.21
105 0.2
106 0.18
107 0.21
108 0.22
109 0.23
110 0.23
111 0.27
112 0.24
113 0.24
114 0.25
115 0.21
116 0.2
117 0.22
118 0.21
119 0.19
120 0.19
121 0.27
122 0.31
123 0.34
124 0.34
125 0.32
126 0.35
127 0.41
128 0.42
129 0.37
130 0.35
131 0.33
132 0.34
133 0.35
134 0.31
135 0.27
136 0.25
137 0.23
138 0.26
139 0.24
140 0.22
141 0.26
142 0.26
143 0.21
144 0.19
145 0.18
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.08
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.13
186 0.15
187 0.16
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.13
194 0.12
195 0.09
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.12
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.15
209 0.18
210 0.2
211 0.19
212 0.18
213 0.19
214 0.26
215 0.34
216 0.31
217 0.3
218 0.36
219 0.42
220 0.43
221 0.45
222 0.39
223 0.35
224 0.36
225 0.4
226 0.38
227 0.35
228 0.34
229 0.3
230 0.29
231 0.25
232 0.22
233 0.18
234 0.12
235 0.08
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.03
249 0.02
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.08
254 0.1
255 0.11
256 0.16
257 0.18
258 0.19
259 0.24
260 0.3
261 0.34
262 0.37
263 0.44
264 0.49
265 0.53
266 0.54
267 0.49
268 0.45
269 0.37
270 0.34
271 0.29
272 0.21
273 0.22
274 0.23
275 0.27
276 0.27
277 0.26
278 0.24
279 0.22
280 0.2
281 0.13
282 0.1
283 0.09
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.08
310 0.09
311 0.1
312 0.13
313 0.16
314 0.2
315 0.27
316 0.34
317 0.4
318 0.5
319 0.6
320 0.64
321 0.7
322 0.75
323 0.72
324 0.72
325 0.69
326 0.63
327 0.56
328 0.49
329 0.41
330 0.33
331 0.3
332 0.29
333 0.26
334 0.23
335 0.2
336 0.23
337 0.32
338 0.4
339 0.49
340 0.54
341 0.64
342 0.72
343 0.82
344 0.88
345 0.88
346 0.9
347 0.88
348 0.87
349 0.86
350 0.85
351 0.78
352 0.71
353 0.67
354 0.58
355 0.5
356 0.4
357 0.3
358 0.24
359 0.26
360 0.24
361 0.24
362 0.23
363 0.22
364 0.23
365 0.29
366 0.34
367 0.3
368 0.37
369 0.4
370 0.45
371 0.49
372 0.49
373 0.43
374 0.37
375 0.38
376 0.31
377 0.23
378 0.2
379 0.19
380 0.2
381 0.26
382 0.33
383 0.37
384 0.39
385 0.44
386 0.51
387 0.55
388 0.61
389 0.6
390 0.59
391 0.56
392 0.62
393 0.66
394 0.64
395 0.63
396 0.6
397 0.55
398 0.53
399 0.56
400 0.54
401 0.52
402 0.52
403 0.52
404 0.56
405 0.63
406 0.67
407 0.71
408 0.72
409 0.77
410 0.79
411 0.85
412 0.86
413 0.88
414 0.89
415 0.88
416 0.86
417 0.83
418 0.79
419 0.77
420 0.73
421 0.7
422 0.66
423 0.59
424 0.59
425 0.55
426 0.56
427 0.57
428 0.52
429 0.54
430 0.56
431 0.55
432 0.49
433 0.55
434 0.49
435 0.42
436 0.45
437 0.41
438 0.4
439 0.45
440 0.47
441 0.44
442 0.49
443 0.49
444 0.5
445 0.49
446 0.44
447 0.39
448 0.36
449 0.33
450 0.3
451 0.3
452 0.25
453 0.25
454 0.3
455 0.32
456 0.35
457 0.35
458 0.33
459 0.3
460 0.3
461 0.29
462 0.25
463 0.25
464 0.22
465 0.18
466 0.18
467 0.19
468 0.18
469 0.17
470 0.16
471 0.12
472 0.14
473 0.14
474 0.13
475 0.16
476 0.16
477 0.17
478 0.19
479 0.22
480 0.22
481 0.26
482 0.29
483 0.27
484 0.33
485 0.36