FuNGI

K1WUW5

Protein Details

Accession

K1WUW5

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-48	LYVRRSKAADPLRPRKKPVRRTGAAPHAS	Hydrophilic
548-571	SSGNESTRKKLKKKHQTSASGSST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
24-41	RSKAADPLRPRKKPVRRT
427-448	KKAKEARKKLGKDVTKALRKRE
480-518	KKKDEEAKNKEKAEEAKNKEKAKLDSTSKPPSGASTKGA
521-526	PSGRPK
555-561	RKKLKKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	mbe:MBM_00568 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPSGQSNGPTPKGDAPLYVRRSKAADPLRPRKKPVRRTGAAPHASTYKPNGLPVAGRPTPQYPVNGKLPPRGAGPGPNQSSNVPGAGNSSAKGGWTTSPEGQFMDYPLFTTKRAMREGLRYHIARFASKKPVDPSDQNEFTRPVLLHRRDPRQPPPGKGVKDEDQTTMEAPMDSKEREKQEIAKAEKEKQRALDLAQIAPTGNNAAALAAKKTQAFRHEKTTQVYRLDKTEEQKKLSDLKYEEALAWHLEDADNKNTWVGNYEAALSDTNVIFVIEGASFKMIPIEKWYRFTPKGQFKTYTIEEAETQMAKKHKESRWVMKTNEQNESQRAVQESRKAMGSLFTVKAESNTFKSVGKREVQEMDDMDFEEGDLFQDDDEQVTFDPENDEDAKDAQERVKRDRQGANVFDQTNEADVDEEEAEDKKAKEARKKLGKDVTKALRKRERNFVYNSDSDHPYSDSSEDDTSDEEKQKEIDKKKDEEAKNKEKAEEAKNKEKAKLDSTSKPPSGASTKGANTPSGRPKHTDPLEKVKNLKRAGSPNLSESSGNESTRKKLKKKHQTSASGSSTPVPGSRPMSPAPQQAGPGQISRKGSLVNIKVNQGKLSDIVSAPPNPSPVRGSAAGDGEATGGEGSDGGKAPQKIKIHIASRAGSRAGSPAAASGKIFRLCKRRSGGYIEHPVLIRFAASSHTENHLLTYATGESPSSRAQSPSARAQSPSARAQSPGAGPVGPVQAHEIRKALPARGIPMKDLLKVFVGRVTADNRADFIRLVKSNSAYGQDKLLRPKTK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.41
3	0.39
4	0.38
5	0.37
6	0.43
7	0.48
8	0.5
9	0.46
10	0.44
11	0.48
12	0.46
13	0.49
14	0.49
15	0.51
16	0.56
17	0.66
18	0.74
19	0.76
20	0.82
21	0.83
22	0.84
23	0.85
24	0.85
25	0.85
26	0.79
27	0.8
28	0.83
29	0.83
30	0.78
31	0.69
32	0.61
33	0.55
34	0.51
35	0.47
36	0.42
37	0.39
38	0.34
39	0.35
40	0.34
41	0.3
42	0.31
43	0.34
44	0.37
45	0.31
46	0.3
47	0.32
48	0.33
49	0.36
50	0.36
51	0.38
52	0.33
53	0.37
54	0.44
55	0.47
56	0.47
57	0.49
58	0.5
59	0.45
60	0.43
61	0.41
62	0.36
63	0.37
64	0.41
65	0.43
66	0.44
67	0.44
68	0.43
69	0.39
70	0.4
71	0.34
72	0.29
73	0.19
74	0.15
75	0.16
76	0.17
77	0.17
78	0.15
79	0.15
80	0.14
81	0.14
82	0.15
83	0.13
84	0.12
85	0.16
86	0.2
87	0.24
88	0.26
89	0.26
90	0.26
91	0.26
92	0.25
93	0.22
94	0.21
95	0.16
96	0.15
97	0.18
98	0.19
99	0.18
100	0.24
101	0.27
102	0.29
103	0.33
104	0.35
105	0.35
106	0.43
107	0.48
108	0.48
109	0.51
110	0.46
111	0.44
112	0.46
113	0.43
114	0.39
115	0.38
116	0.37
117	0.4
118	0.41
119	0.46
120	0.46
121	0.5
122	0.52
123	0.53
124	0.53
125	0.52
126	0.56
127	0.52
128	0.5
129	0.45
130	0.39
131	0.38
132	0.32
133	0.29
134	0.33
135	0.37
136	0.43
137	0.49
138	0.57
139	0.61
140	0.68
141	0.7
142	0.71
143	0.72
144	0.68
145	0.69
146	0.7
147	0.65
148	0.62
149	0.6
150	0.56
151	0.55
152	0.52
153	0.45
154	0.39
155	0.37
156	0.32
157	0.27
158	0.2
159	0.15
160	0.13
161	0.12
162	0.14
163	0.14
164	0.17
165	0.22
166	0.26
167	0.29
168	0.32
169	0.36
170	0.41
171	0.49
172	0.5
173	0.52
174	0.52
175	0.57
176	0.6
177	0.58
178	0.53
179	0.47
180	0.46
181	0.4
182	0.37
183	0.36
184	0.32
185	0.29
186	0.26
187	0.24
188	0.2
189	0.18
190	0.16
191	0.1
192	0.08
193	0.06
194	0.05
195	0.05
196	0.07
197	0.08
198	0.09
199	0.1
200	0.11
201	0.13
202	0.16
203	0.19
204	0.26
205	0.34
206	0.35
207	0.43
208	0.46
209	0.48
210	0.51
211	0.55
212	0.51
213	0.5
214	0.52
215	0.44
216	0.43
217	0.44
218	0.43
219	0.42
220	0.46
221	0.44
222	0.43
223	0.43
224	0.42
225	0.45
226	0.43
227	0.43
228	0.36
229	0.33
230	0.32
231	0.31
232	0.28
233	0.21
234	0.2
235	0.14
236	0.12
237	0.1
238	0.08
239	0.08
240	0.1
241	0.12
242	0.15
243	0.15
244	0.14
245	0.15
246	0.15
247	0.15
248	0.14
249	0.12
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.1
254	0.1
255	0.11
256	0.09
257	0.09
258	0.08
259	0.08
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.05
264	0.06
265	0.04
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.15
275	0.22
276	0.23
277	0.27
278	0.29
279	0.34
280	0.36
281	0.4
282	0.43
283	0.46
284	0.51
285	0.52
286	0.53
287	0.47
288	0.51
289	0.48
290	0.42
291	0.32
292	0.27
293	0.23
294	0.21
295	0.21
296	0.15
297	0.14
298	0.14
299	0.17
300	0.17
301	0.21
302	0.28
303	0.3
304	0.39
305	0.45
306	0.52
307	0.58
308	0.63
309	0.61
310	0.59
311	0.63
312	0.57
313	0.56
314	0.49
315	0.41
316	0.37
317	0.38
318	0.31
319	0.26
320	0.24
321	0.22
322	0.21
323	0.25
324	0.24
325	0.22
326	0.22
327	0.21
328	0.19
329	0.18
330	0.17
331	0.15
332	0.14
333	0.13
334	0.13
335	0.13
336	0.14
337	0.14
338	0.14
339	0.13
340	0.14
341	0.14
342	0.16
343	0.18
344	0.21
345	0.23
346	0.25
347	0.24
348	0.25
349	0.27
350	0.26
351	0.25
352	0.22
353	0.19
354	0.16
355	0.15
356	0.12
357	0.08
358	0.07
359	0.06
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.06
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.09
382	0.09
383	0.1
384	0.11
385	0.14
386	0.16
387	0.22
388	0.29
389	0.31
390	0.36
391	0.39
392	0.42
393	0.45
394	0.45
395	0.43
396	0.4
397	0.37
398	0.32
399	0.28
400	0.22
401	0.17
402	0.14
403	0.1
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.08
413	0.08
414	0.1
415	0.14
416	0.18
417	0.26
418	0.33
419	0.42
420	0.5
421	0.53
422	0.58
423	0.63
424	0.63
425	0.59
426	0.6
427	0.59
428	0.58
429	0.57
430	0.59
431	0.59
432	0.62
433	0.62
434	0.65
435	0.61
436	0.58
437	0.6
438	0.56
439	0.53
440	0.47
441	0.46
442	0.39
443	0.35
444	0.31
445	0.27
446	0.23
447	0.17
448	0.17
449	0.14
450	0.11
451	0.12
452	0.11
453	0.11
454	0.1
455	0.11
456	0.12
457	0.14
458	0.17
459	0.15
460	0.15
461	0.15
462	0.21
463	0.28
464	0.33
465	0.39
466	0.42
467	0.45
468	0.51
469	0.6
470	0.59
471	0.61
472	0.64
473	0.65
474	0.66
475	0.64
476	0.58
477	0.52
478	0.53
479	0.52
480	0.52
481	0.5
482	0.52
483	0.58
484	0.6
485	0.6
486	0.59
487	0.54
488	0.48
489	0.49
490	0.45
491	0.45
492	0.5
493	0.53
494	0.48
495	0.46
496	0.41
497	0.37
498	0.35
499	0.3
500	0.26
501	0.23
502	0.24
503	0.28
504	0.29
505	0.28
506	0.27
507	0.31
508	0.37
509	0.37
510	0.37
511	0.36
512	0.4
513	0.47
514	0.51
515	0.53
516	0.49
517	0.55
518	0.6
519	0.59
520	0.63
521	0.6
522	0.61
523	0.55
524	0.54
525	0.49
526	0.49
527	0.52
528	0.51
529	0.46
530	0.42
531	0.42
532	0.39
533	0.33
534	0.27
535	0.28
536	0.25
537	0.24
538	0.25
539	0.24
540	0.28
541	0.37
542	0.44
543	0.44
544	0.51
545	0.61
546	0.68
547	0.77
548	0.82
549	0.83
550	0.84
551	0.84
552	0.83
553	0.78
554	0.68
555	0.58
556	0.49
557	0.4
558	0.31
559	0.25
560	0.17
561	0.16
562	0.18
563	0.2
564	0.22
565	0.22
566	0.28
567	0.31
568	0.34
569	0.34
570	0.32
571	0.31
572	0.29
573	0.32
574	0.27
575	0.27
576	0.23
577	0.24
578	0.25
579	0.24
580	0.24
581	0.21
582	0.21
583	0.26
584	0.29
585	0.32
586	0.32
587	0.37
588	0.39
589	0.4
590	0.39
591	0.32
592	0.28
593	0.21
594	0.2
595	0.17
596	0.13
597	0.15
598	0.16
599	0.17
600	0.18
601	0.18
602	0.2
603	0.19
604	0.21
605	0.2
606	0.19
607	0.22
608	0.22
609	0.23
610	0.22
611	0.23
612	0.22
613	0.2
614	0.18
615	0.13
616	0.11
617	0.09
618	0.06
619	0.04
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.05
624	0.06
625	0.07
626	0.12
627	0.14
628	0.16
629	0.23
630	0.25
631	0.27
632	0.33
633	0.4
634	0.4
635	0.43
636	0.47
637	0.44
638	0.43
639	0.43
640	0.38
641	0.3
642	0.26
643	0.23
644	0.19
645	0.16
646	0.13
647	0.13
648	0.14
649	0.15
650	0.15
651	0.15
652	0.19
653	0.24
654	0.26
655	0.29
656	0.37
657	0.39
658	0.48
659	0.51
660	0.52
661	0.52
662	0.57
663	0.58
664	0.58
665	0.65
666	0.58
667	0.55
668	0.49
669	0.45
670	0.37
671	0.3
672	0.2
673	0.11
674	0.09
675	0.1
676	0.13
677	0.15
678	0.17
679	0.21
680	0.23
681	0.23
682	0.24
683	0.22
684	0.19
685	0.17
686	0.17
687	0.14
688	0.13
689	0.13
690	0.12
691	0.11
692	0.13
693	0.16
694	0.17
695	0.17
696	0.18
697	0.22
698	0.29
699	0.33
700	0.4
701	0.44
702	0.44
703	0.44
704	0.48
705	0.51
706	0.49
707	0.51
708	0.46
709	0.41
710	0.4
711	0.4
712	0.4
713	0.34
714	0.31
715	0.25
716	0.2
717	0.19
718	0.21
719	0.23
720	0.18
721	0.17
722	0.19
723	0.25
724	0.27
725	0.29
726	0.27
727	0.24
728	0.31
729	0.34
730	0.31
731	0.3
732	0.31
733	0.35
734	0.41
735	0.41
736	0.37
737	0.41
738	0.41
739	0.4
740	0.38
741	0.34
742	0.3
743	0.3
744	0.29
745	0.24
746	0.23
747	0.2
748	0.23
749	0.24
750	0.26
751	0.28
752	0.28
753	0.27
754	0.27
755	0.27
756	0.24
757	0.23
758	0.25
759	0.25
760	0.28
761	0.31
762	0.32
763	0.34
764	0.36
765	0.4
766	0.35
767	0.33
768	0.37
769	0.39
770	0.42
771	0.49

K1WUW5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer