FuNGI

A0A397INF9

Protein Details

Accession

A0A397INF9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
78-104	GFPKPVHRSLFKKRKDQESKEMKKMEI	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, plas 8, cyto 3, mito 1, pero 1, E.R. 1, golg 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MSRSRESSKNDFDSTPGKRFELNLENAHGTEHVPVIKKVLDLRSYQTGIVGKITENLTNESAVTAPMPTIDSTISNNGFPKPVHRSLFKKRKDQESKEMKKMEIDINENKFDKFNVENYKKDEDTRIFKNDYLDIDRENNEKIAKMSETEINETVEMLRKSLSPGFIEKLMKKKALVEKLEESNDNMINQYNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNEKNVRFEEKVQSMDTVSMECDYIEDDSLPDKMKEKYFPDVPAEPQKMEWMGIKYNNESDQSNFESIGIPSESPTASLRFDFNGNIVDKNSNIPSYLGLHHHGKDPDQAGYTISELLHLTRSTVPSQKIIPLNILGRIVKKVRKGVYGKENNEGIAEYVMRMKLPVYLRSALDDSFESVIVAAIDAIAALTIGGSEGFNEEEEYWENLFKLYRGYEMVALKVNLDNLTENHFGMDISSNDSNEESLDTIEGHNKLASKDLVAGFISMNIAHRFRYLLEVYELPSIANEQILLMLVYFARHSHKSAKIIYDCPRLLDVIHEKFISLPWPILRTENNSSTLKFPSLAAAKLIRTLCQTSKKISDEMITKYIDSFLRYIVINPASLSEKSEMIIGYEILKETLRIYHTLGAYGLYREIFSRAYSVINKYIIKDIIFSLSPPWEWDDNEIYHNQQKLSIAILFFGLFEIWMHNQNKETRNIQEPEAQPSDFIKDSIDFLARWISSFPINQSSKNTMKISDEYIMAALNLISSITRFISSWCKYLKDNSLKDISEIQRLWKILNMEHWHSSNLCIFLQNQLFNFTNEVTQKISKNNIWKISNFSGADCSSKYENFAAYFNLSVIFDTFLSFISLIHQTCELNVHDVSFLSKALEVVKSSFSVEILRLYIVKNPVEANWFAFFDRTRSYLLFEWINIFKFSIRNSSSLAHQFNYLFKILEAEFISVYNILPGDESMALDIIKSILKGICPKASDVLEPFYKHLIKIEKMKILDKQDETYSFSGSQNDKIDKTLMWDYSNELTGLPLSRGWIWSPIDTLFINKLKSGMDQERKIEIICNCLTFAWDTTQICNDSMDPTFVKYIIDPAITIISIMKIFMLEGELYNVPENKILIEEILSQFTFSQLNINSISKDDVIEQKSLEFIAKEVLRIPFYQFFSDFIGVYVAESAGNKSFVQLTIIPLSSLYPADFKLLVWSDLHNVLGTINIGYEDVLCINSTLNSYFWPIESNTAILQSFVSSILYNKVTRKKTPFLYWMVIHHLNGFVFWTKYMGSDDSKNKDNTHKKRVEISKAIIKSAKEEIIIDWLKYTSKNFGKDLSNLIMFPECFIEINNLIIDERINQLKNFGLDLRENIINI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.52
3	0.46
4	0.41
5	0.39
6	0.4
7	0.44
8	0.45
9	0.44
10	0.41
11	0.43
12	0.43
13	0.41
14	0.4
15	0.33
16	0.24
17	0.2
18	0.18
19	0.18
20	0.19
21	0.2
22	0.22
23	0.24
24	0.25
25	0.29
26	0.33
27	0.33
28	0.33
29	0.38
30	0.42
31	0.42
32	0.4
33	0.38
34	0.34
35	0.3
36	0.3
37	0.26
38	0.18
39	0.21
40	0.23
41	0.22
42	0.21
43	0.24
44	0.23
45	0.22
46	0.22
47	0.18
48	0.16
49	0.14
50	0.12
51	0.09
52	0.08
53	0.08
54	0.09
55	0.09
56	0.1
57	0.11
58	0.12
59	0.15
60	0.21
61	0.22
62	0.23
63	0.25
64	0.25
65	0.27
66	0.26
67	0.3
68	0.32
69	0.39
70	0.42
71	0.47
72	0.54
73	0.63
74	0.73
75	0.74
76	0.76
77	0.76
78	0.82
79	0.85
80	0.85
81	0.85
82	0.85
83	0.86
84	0.85
85	0.82
86	0.72
87	0.65
88	0.61
89	0.56
90	0.51
91	0.49
92	0.48
93	0.48
94	0.54
95	0.51
96	0.47
97	0.41
98	0.35
99	0.33
100	0.27
101	0.3
102	0.35
103	0.4
104	0.44
105	0.49
106	0.55
107	0.52
108	0.52
109	0.52
110	0.48
111	0.5
112	0.51
113	0.52
114	0.48
115	0.48
116	0.49
117	0.44
118	0.42
119	0.41
120	0.36
121	0.32
122	0.34
123	0.35
124	0.33
125	0.31
126	0.29
127	0.25
128	0.24
129	0.23
130	0.22
131	0.2
132	0.2
133	0.21
134	0.24
135	0.26
136	0.29
137	0.29
138	0.26
139	0.25
140	0.24
141	0.22
142	0.23
143	0.21
144	0.17
145	0.16
146	0.16
147	0.19
148	0.23
149	0.24
150	0.2
151	0.23
152	0.26
153	0.3
154	0.36
155	0.36
156	0.42
157	0.45
158	0.44
159	0.41
160	0.47
161	0.51
162	0.54
163	0.53
164	0.51
165	0.51
166	0.55
167	0.58
168	0.51
169	0.44
170	0.39
171	0.36
172	0.3
173	0.25
174	0.2
175	0.18
176	0.19
177	0.22
178	0.25
179	0.31
180	0.36
181	0.4
182	0.42
183	0.5
184	0.55
185	0.56
186	0.55
187	0.55
188	0.56
189	0.58
190	0.61
191	0.59
192	0.59
193	0.59
194	0.59
195	0.59
196	0.59
197	0.59
198	0.59
199	0.59
200	0.59
201	0.59
202	0.59
203	0.59
204	0.59
205	0.57
206	0.55
207	0.56
208	0.52
209	0.51
210	0.5
211	0.45
212	0.44
213	0.45
214	0.46
215	0.4
216	0.42
217	0.45
218	0.44
219	0.45
220	0.4
221	0.35
222	0.3
223	0.29
224	0.25
225	0.17
226	0.14
227	0.11
228	0.1
229	0.09
230	0.08
231	0.07
232	0.08
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.09
237	0.11
238	0.12
239	0.12
240	0.14
241	0.18
242	0.22
243	0.27
244	0.3
245	0.35
246	0.38
247	0.4
248	0.43
249	0.42
250	0.44
251	0.48
252	0.47
253	0.4
254	0.36
255	0.36
256	0.3
257	0.29
258	0.27
259	0.2
260	0.22
261	0.26
262	0.28
263	0.28
264	0.3
265	0.32
266	0.3
267	0.28
268	0.25
269	0.26
270	0.27
271	0.25
272	0.22
273	0.2
274	0.2
275	0.18
276	0.19
277	0.15
278	0.12
279	0.11
280	0.13
281	0.12
282	0.12
283	0.14
284	0.13
285	0.13
286	0.14
287	0.15
288	0.14
289	0.16
290	0.15
291	0.14
292	0.18
293	0.18
294	0.18
295	0.18
296	0.18
297	0.17
298	0.2
299	0.21
300	0.16
301	0.15
302	0.14
303	0.14
304	0.16
305	0.18
306	0.18
307	0.2
308	0.23
309	0.24
310	0.29
311	0.28
312	0.27
313	0.29
314	0.29
315	0.27
316	0.25
317	0.24
318	0.19
319	0.19
320	0.18
321	0.14
322	0.12
323	0.11
324	0.1
325	0.1
326	0.12
327	0.11
328	0.12
329	0.14
330	0.16
331	0.18
332	0.24
333	0.25
334	0.25
335	0.26
336	0.3
337	0.31
338	0.29
339	0.28
340	0.26
341	0.26
342	0.25
343	0.25
344	0.2
345	0.19
346	0.22
347	0.26
348	0.26
349	0.3
350	0.35
351	0.36
352	0.43
353	0.46
354	0.49
355	0.55
356	0.61
357	0.59
358	0.57
359	0.55
360	0.46
361	0.43
362	0.35
363	0.24
364	0.16
365	0.13
366	0.08
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.09
371	0.08
372	0.13
373	0.15
374	0.19
375	0.21
376	0.23
377	0.24
378	0.27
379	0.28
380	0.22
381	0.21
382	0.18
383	0.15
384	0.13
385	0.13
386	0.1
387	0.08
388	0.08
389	0.07
390	0.06
391	0.04
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.02
396	0.02
397	0.02
398	0.02
399	0.02
400	0.02
401	0.02
402	0.02
403	0.02
404	0.03
405	0.04
406	0.04
407	0.05
408	0.06
409	0.06
410	0.07
411	0.09
412	0.11
413	0.11
414	0.12
415	0.11
416	0.11
417	0.11
418	0.1
419	0.11
420	0.09
421	0.1
422	0.11
423	0.12
424	0.16
425	0.16
426	0.17
427	0.17
428	0.17
429	0.16
430	0.15
431	0.15
432	0.11
433	0.11
434	0.11
435	0.09
436	0.15
437	0.15
438	0.14
439	0.13
440	0.13
441	0.12
442	0.12
443	0.13
444	0.08
445	0.11
446	0.12
447	0.12
448	0.12
449	0.13
450	0.12
451	0.1
452	0.1
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.1
459	0.11
460	0.1
461	0.11
462	0.12
463	0.12
464	0.14
465	0.14
466	0.11
467	0.14
468	0.14
469	0.15
470	0.14
471	0.14
472	0.11
473	0.11
474	0.11
475	0.07
476	0.08
477	0.09
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.1
482	0.1
483	0.15
484	0.13
485	0.13
486	0.15
487	0.15
488	0.16
489	0.17
490	0.16
491	0.11
492	0.11
493	0.1
494	0.08
495	0.07
496	0.05
497	0.04
498	0.04
499	0.05
500	0.04
501	0.03
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.05
507	0.08
508	0.09
509	0.12
510	0.18
511	0.23
512	0.27
513	0.3
514	0.35
515	0.35
516	0.4
517	0.43
518	0.44
519	0.4
520	0.37
521	0.34
522	0.28
523	0.25
524	0.24
525	0.25
526	0.2
527	0.21
528	0.2
529	0.19
530	0.19
531	0.2
532	0.17
533	0.11
534	0.09
535	0.09
536	0.11
537	0.11
538	0.13
539	0.15
540	0.19
541	0.23
542	0.24
543	0.28
544	0.27
545	0.27
546	0.27
547	0.27
548	0.22
549	0.18
550	0.15
551	0.15
552	0.16
553	0.15
554	0.15
555	0.15
556	0.14
557	0.19
558	0.19
559	0.15
560	0.15
561	0.18
562	0.21
563	0.27
564	0.29
565	0.27
566	0.33
567	0.34
568	0.33
569	0.31
570	0.3
571	0.26
572	0.27
573	0.27
574	0.22
575	0.2
576	0.19
577	0.21
578	0.18
579	0.15
580	0.12
581	0.09
582	0.1
583	0.1
584	0.11
585	0.12
586	0.12
587	0.11
588	0.1
589	0.12
590	0.12
591	0.12
592	0.13
593	0.11
594	0.1
595	0.1
596	0.11
597	0.1
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.08
609	0.08
610	0.09
611	0.1
612	0.14
613	0.14
614	0.14
615	0.14
616	0.12
617	0.11
618	0.11
619	0.1
620	0.06
621	0.06
622	0.06
623	0.07
624	0.07
625	0.07
626	0.08
627	0.08
628	0.1
629	0.11
630	0.13
631	0.14
632	0.17
633	0.17
634	0.17
635	0.19
636	0.18
637	0.16
638	0.15
639	0.13
640	0.12
641	0.11
642	0.1
643	0.09
644	0.09
645	0.09
646	0.08
647	0.1
648	0.1
649	0.1
650	0.12
651	0.14
652	0.14
653	0.15
654	0.15
655	0.15
656	0.17
657	0.18
658	0.16
659	0.14
660	0.14
661	0.13
662	0.13
663	0.13
664	0.09
665	0.08
666	0.09
667	0.07
668	0.07
669	0.06
670	0.05
671	0.03
672	0.03
673	0.04
674	0.05
675	0.11
676	0.12
677	0.13
678	0.16
679	0.22
680	0.25
681	0.27
682	0.29
683	0.25
684	0.31
685	0.32
686	0.31
687	0.32
688	0.3
689	0.33
690	0.32
691	0.29
692	0.23
693	0.22
694	0.23
695	0.16
696	0.15
697	0.1
698	0.08
699	0.1
700	0.1
701	0.11
702	0.08
703	0.08
704	0.11
705	0.1
706	0.1
707	0.09
708	0.09
709	0.1
710	0.1
711	0.11
712	0.17
713	0.18
714	0.19
715	0.22
716	0.27
717	0.28
718	0.32
719	0.32
720	0.24
721	0.26
722	0.26
723	0.25
724	0.21
725	0.19
726	0.14
727	0.14
728	0.12
729	0.09
730	0.08
731	0.05
732	0.03
733	0.03
734	0.03
735	0.02
736	0.03
737	0.04
738	0.04
739	0.05
740	0.05
741	0.07
742	0.15
743	0.17
744	0.21
745	0.22
746	0.23
747	0.24
748	0.28
749	0.36
750	0.37
751	0.37
752	0.37
753	0.4
754	0.38
755	0.38
756	0.41
757	0.33
758	0.29
759	0.28
760	0.26
761	0.25
762	0.25
763	0.24
764	0.19
765	0.19
766	0.14
767	0.21
768	0.23
769	0.23
770	0.24
771	0.25
772	0.24
773	0.23
774	0.23
775	0.18
776	0.16
777	0.13
778	0.12
779	0.12
780	0.16
781	0.18
782	0.17
783	0.16
784	0.18
785	0.19
786	0.18
787	0.19
788	0.15
789	0.15
790	0.15
791	0.16
792	0.14
793	0.16
794	0.17
795	0.19
796	0.23
797	0.23
798	0.31
799	0.35
800	0.4
801	0.39
802	0.38
803	0.42
804	0.4
805	0.43
806	0.35
807	0.3
808	0.26
809	0.24
810	0.25
811	0.18
812	0.18
813	0.15
814	0.14
815	0.16
816	0.14
817	0.14
818	0.14
819	0.14
820	0.13
821	0.12
822	0.12
823	0.1
824	0.1
825	0.08
826	0.07
827	0.07
828	0.07
829	0.06
830	0.06
831	0.07
832	0.06
833	0.07
834	0.07
835	0.06
836	0.08
837	0.1
838	0.1
839	0.1
840	0.11
841	0.1
842	0.11
843	0.14
844	0.12
845	0.12
846	0.12
847	0.11
848	0.11
849	0.11
850	0.12
851	0.09
852	0.09
853	0.07
854	0.07
855	0.07
856	0.08
857	0.09
858	0.09
859	0.1
860	0.11
861	0.11
862	0.11
863	0.11
864	0.1
865	0.1
866	0.1
867	0.09
868	0.09
869	0.09
870	0.09
871	0.09
872	0.12
873	0.15
874	0.14
875	0.14
876	0.15
877	0.15
878	0.18
879	0.18
880	0.16
881	0.15
882	0.15
883	0.14
884	0.15
885	0.14
886	0.14
887	0.15
888	0.14
889	0.15
890	0.14
891	0.17
892	0.18
893	0.2
894	0.18
895	0.17
896	0.19
897	0.19
898	0.19
899	0.16
900	0.15
901	0.14
902	0.15
903	0.16
904	0.2
905	0.2
906	0.2
907	0.22
908	0.23
909	0.26
910	0.31
911	0.32
912	0.24
913	0.25
914	0.24
915	0.23
916	0.25
917	0.21
918	0.15
919	0.13
920	0.15
921	0.13
922	0.15
923	0.14
924	0.13
925	0.12
926	0.12
927	0.12
928	0.1
929	0.1
930	0.07
931	0.06
932	0.05
933	0.05
934	0.05
935	0.06
936	0.06
937	0.06
938	0.06
939	0.06
940	0.06
941	0.06
942	0.06
943	0.05
944	0.05
945	0.05
946	0.06
947	0.07
948	0.09
949	0.14
950	0.17
951	0.2
952	0.2
953	0.21
954	0.24
955	0.24
956	0.25
957	0.22
958	0.23
959	0.23
960	0.23
961	0.23
962	0.24
963	0.24
964	0.22
965	0.25
966	0.26
967	0.27
968	0.35
969	0.39
970	0.4
971	0.41
972	0.44
973	0.45
974	0.45
975	0.47
976	0.4
977	0.37
978	0.36
979	0.35
980	0.37
981	0.32
982	0.28
983	0.24
984	0.23
985	0.25
986	0.23
987	0.27
988	0.27
989	0.29
990	0.28
991	0.27
992	0.28
993	0.22
994	0.26
995	0.26
996	0.22
997	0.21
998	0.21
999	0.22
1000	0.23
1001	0.24
1002	0.19
1003	0.14
1004	0.12
1005	0.12
1006	0.12
1007	0.1
1008	0.08
1009	0.09
1010	0.1
1011	0.11
1012	0.11
1013	0.16
1014	0.16
1015	0.16
1016	0.18
1017	0.17
1018	0.18
1019	0.17
1020	0.18
1021	0.18
1022	0.2
1023	0.2
1024	0.18
1025	0.19
1026	0.18
1027	0.19
1028	0.24
1029	0.29
1030	0.34
1031	0.37
1032	0.4
1033	0.41
1034	0.41
1035	0.4
1036	0.38
1037	0.29
1038	0.27
1039	0.25
1040	0.23
1041	0.21
1042	0.2
1043	0.21
1044	0.16
1045	0.17
1046	0.14
1047	0.17
1048	0.17
1049	0.19
1050	0.22
1051	0.23
1052	0.22
1053	0.21
1054	0.18
1055	0.16
1056	0.16
1057	0.17
1058	0.14
1059	0.15
1060	0.15
1061	0.15
1062	0.14
1063	0.12
1064	0.14
1065	0.14
1066	0.13
1067	0.12
1068	0.12
1069	0.12
1070	0.12
1071	0.12
1072	0.09
1073	0.08
1074	0.07
1075	0.07
1076	0.06
1077	0.05
1078	0.05
1079	0.05
1080	0.07
1081	0.06
1082	0.06
1083	0.1
1084	0.1
1085	0.11
1086	0.13
1087	0.14
1088	0.13
1089	0.14
1090	0.14
1091	0.11
1092	0.11
1093	0.11
1094	0.09
1095	0.09
1096	0.13
1097	0.13
1098	0.15
1099	0.15
1100	0.14
1101	0.14
1102	0.14
1103	0.14
1104	0.1
1105	0.14
1106	0.12
1107	0.15
1108	0.18
1109	0.19
1110	0.19
1111	0.19
1112	0.21
1113	0.16
1114	0.16
1115	0.16
1116	0.21
1117	0.22
1118	0.23
1119	0.22
1120	0.2
1121	0.2
1122	0.2
1123	0.18
1124	0.11
1125	0.09
1126	0.15
1127	0.15
1128	0.15
1129	0.19
1130	0.21
1131	0.21
1132	0.22
1133	0.27
1134	0.26
1135	0.28
1136	0.31
1137	0.27
1138	0.26
1139	0.29
1140	0.29
1141	0.25
1142	0.18
1143	0.17
1144	0.14
1145	0.13
1146	0.12
1147	0.08
1148	0.07
1149	0.07
1150	0.09
1151	0.09
1152	0.11
1153	0.11
1154	0.12
1155	0.13
1156	0.13
1157	0.16
1158	0.15
1159	0.18
1160	0.2
1161	0.2
1162	0.19
1163	0.17
1164	0.18
1165	0.16
1166	0.15
1167	0.12
1168	0.1
1169	0.1
1170	0.13
1171	0.13
1172	0.12
1173	0.18
1174	0.19
1175	0.19
1176	0.18
1177	0.19
1178	0.2
1179	0.21
1180	0.21
1181	0.15
1182	0.13
1183	0.12
1184	0.12
1185	0.11
1186	0.07
1187	0.06
1188	0.06
1189	0.06
1190	0.06
1191	0.06
1192	0.06
1193	0.06
1194	0.07
1195	0.07
1196	0.07
1197	0.07
1198	0.08
1199	0.1
1200	0.1
1201	0.1
1202	0.11
1203	0.14
1204	0.14
1205	0.14
1206	0.16
1207	0.16
1208	0.18
1209	0.19
1210	0.19
1211	0.17
1212	0.18
1213	0.18
1214	0.15
1215	0.14
1216	0.11
1217	0.11
1218	0.09
1219	0.1
1220	0.08
1221	0.09
1222	0.14
1223	0.17
1224	0.2
1225	0.26
1226	0.35
1227	0.4
1228	0.48
1229	0.55
1230	0.58
1231	0.63
1232	0.68
1233	0.68
1234	0.65
1235	0.66
1236	0.6
1237	0.56
1238	0.55
1239	0.5
1240	0.42
1241	0.36
1242	0.32
1243	0.25
1244	0.23
1245	0.22
1246	0.17
1247	0.15
1248	0.14
1249	0.15
1250	0.13
1251	0.14
1252	0.17
1253	0.18
1254	0.19
1255	0.27
1256	0.35
1257	0.39
1258	0.45
1259	0.47
1260	0.48
1261	0.55
1262	0.62
1263	0.64
1264	0.67
1265	0.68
1266	0.66
1267	0.73
1268	0.79
1269	0.78
1270	0.75
1271	0.72
1272	0.71
1273	0.66
1274	0.66
1275	0.6
1276	0.51
1277	0.45
1278	0.43
1279	0.38
1280	0.29
1281	0.28
1282	0.24
1283	0.3
1284	0.31
1285	0.27
1286	0.23
1287	0.22
1288	0.22
1289	0.23
1290	0.25
1291	0.25
1292	0.3
1293	0.35
1294	0.36
1295	0.41
1296	0.44
1297	0.45
1298	0.49
1299	0.45
1300	0.4
1301	0.34
1302	0.34
1303	0.32
1304	0.27
1305	0.25
1306	0.21
1307	0.16
1308	0.15
1309	0.16
1310	0.19
1311	0.15
1312	0.17
1313	0.17
1314	0.15
1315	0.14
1316	0.15
1317	0.14
1318	0.11
1319	0.15
1320	0.2
1321	0.21
1322	0.21
1323	0.23
1324	0.26
1325	0.27
1326	0.28
1327	0.26
1328	0.24
1329	0.24
1330	0.27
1331	0.3

A0A397INF9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer