FuNGI

A0A397JT99

Protein Details

Accession

A0A397JT99

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
495-518	FEQGKGTSKQHKKTKKYESSSEDS	Hydrophilic
521-549	ESSEDEKPRFKKKEQKKKKPSSDEEMDEL	Acidic
569-596	KQAGRRERTNEPRKPFPRNNNNNNNSYE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
527-540	KPRFKKKEQKKKKP

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005162 Retrotrans_gag_dom
Pfam	View protein in Pfam PF03732 Retrotrans_gag

Amino Acid Sequences

MKLLHQCNTNDKSLIPKYRFLPKLKYPNPMFLYFYTILRAMFIDENTLYDLLEKISPSARPNRIYRLKMPLTDLEIGDLNRVITEIVALYQQKIRDIVNQTPDDQDPVWKLSDLEELQRIHEQLKLLFQIRDNCVKIIQDLEQLQNKSQHQRSHSQPEIQRPTSPRIRQRVYQQTSNRPPLNLSLPQYTTPLTIRSGNLSPVESVSSRTRSLPTPTFFNRPEERSPSPLENLRQFQRDYLTGIDPHSSDEETTYQYQPIAGSSRPNPNQNLIDFEEGQQEQQEEQEEEQNNQNNNPLFQYYNPNIRNNNNTQEPKEDNLPSGLLSEHTNNNSEESEEEMAFVVKPPKFSGTHNEDPKEWLEDFVMACHANNWNDDRTKNAFGAYLRKGAREWYLEWYEANDGADWPTTRDAFAAKYCNDAFKEQWLDKLRGLKQRKGESVEEYYYQVKKMAGRAGINVNATLPHFVRGLLPDIKAVVKTHAPANLATALTKAKLFEQGKGTSKQHKKTKKYESSSEDSDNESSEDEKPRFKKKEQKKKKPSSDEEMDELTKRFNKLQINLMQQVEGIAKQAGRRERTNEPRKPFPRNNNNNNNXSYED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.48
3	0.49
4	0.49
5	0.59
6	0.65
7	0.62
8	0.62
9	0.63
10	0.7
11	0.7
12	0.76
13	0.69
14	0.72
15	0.71
16	0.65
17	0.59
18	0.49
19	0.51
20	0.42
21	0.39
22	0.32
23	0.27
24	0.24
25	0.21
26	0.2
27	0.15
28	0.16
29	0.15
30	0.16
31	0.15
32	0.16
33	0.18
34	0.17
35	0.14
36	0.12
37	0.13
38	0.11
39	0.13
40	0.12
41	0.11
42	0.15
43	0.18
44	0.22
45	0.31
46	0.36
47	0.41
48	0.46
49	0.55
50	0.61
51	0.64
52	0.65
53	0.66
54	0.64
55	0.61
56	0.6
57	0.54
58	0.5
59	0.47
60	0.41
61	0.32
62	0.29
63	0.26
64	0.23
65	0.19
66	0.14
67	0.11
68	0.11
69	0.09
70	0.06
71	0.06
72	0.05
73	0.05
74	0.09
75	0.1
76	0.12
77	0.15
78	0.16
79	0.17
80	0.18
81	0.19
82	0.23
83	0.28
84	0.32
85	0.38
86	0.39
87	0.39
88	0.4
89	0.4
90	0.36
91	0.3
92	0.28
93	0.22
94	0.22
95	0.22
96	0.19
97	0.19
98	0.17
99	0.24
100	0.21
101	0.22
102	0.25
103	0.24
104	0.26
105	0.29
106	0.28
107	0.21
108	0.23
109	0.21
110	0.17
111	0.21
112	0.23
113	0.23
114	0.24
115	0.26
116	0.31
117	0.34
118	0.41
119	0.38
120	0.35
121	0.33
122	0.32
123	0.29
124	0.25
125	0.22
126	0.19
127	0.2
128	0.24
129	0.29
130	0.29
131	0.31
132	0.35
133	0.36
134	0.4
135	0.43
136	0.44
137	0.42
138	0.49
139	0.54
140	0.58
141	0.6
142	0.59
143	0.58
144	0.63
145	0.67
146	0.61
147	0.59
148	0.53
149	0.55
150	0.56
151	0.59
152	0.57
153	0.58
154	0.61
155	0.6
156	0.66
157	0.7
158	0.67
159	0.68
160	0.67
161	0.68
162	0.72
163	0.76
164	0.68
165	0.57
166	0.52
167	0.47
168	0.45
169	0.39
170	0.34
171	0.3
172	0.3
173	0.3
174	0.3
175	0.27
176	0.23
177	0.2
178	0.18
179	0.15
180	0.16
181	0.16
182	0.19
183	0.19
184	0.2
185	0.2
186	0.19
187	0.17
188	0.15
189	0.16
190	0.13
191	0.15
192	0.16
193	0.18
194	0.18
195	0.2
196	0.21
197	0.22
198	0.28
199	0.31
200	0.29
201	0.33
202	0.35
203	0.4
204	0.4
205	0.44
206	0.42
207	0.4
208	0.43
209	0.43
210	0.43
211	0.4
212	0.42
213	0.38
214	0.37
215	0.37
216	0.36
217	0.34
218	0.36
219	0.35
220	0.35
221	0.33
222	0.31
223	0.29
224	0.26
225	0.22
226	0.2
227	0.19
228	0.16
229	0.17
230	0.17
231	0.14
232	0.14
233	0.14
234	0.11
235	0.09
236	0.1
237	0.1
238	0.12
239	0.14
240	0.14
241	0.13
242	0.13
243	0.13
244	0.12
245	0.12
246	0.11
247	0.09
248	0.12
249	0.15
250	0.24
251	0.26
252	0.3
253	0.3
254	0.31
255	0.34
256	0.31
257	0.32
258	0.25
259	0.25
260	0.22
261	0.21
262	0.21
263	0.18
264	0.18
265	0.14
266	0.12
267	0.1
268	0.1
269	0.11
270	0.08
271	0.08
272	0.14
273	0.14
274	0.15
275	0.19
276	0.23
277	0.22
278	0.21
279	0.24
280	0.19
281	0.19
282	0.18
283	0.16
284	0.12
285	0.12
286	0.18
287	0.17
288	0.26
289	0.28
290	0.31
291	0.32
292	0.34
293	0.38
294	0.36
295	0.38
296	0.37
297	0.36
298	0.35
299	0.37
300	0.36
301	0.32
302	0.33
303	0.29
304	0.22
305	0.2
306	0.19
307	0.14
308	0.13
309	0.11
310	0.08
311	0.08
312	0.1
313	0.11
314	0.12
315	0.14
316	0.13
317	0.15
318	0.14
319	0.13
320	0.11
321	0.12
322	0.12
323	0.1
324	0.1
325	0.09
326	0.09
327	0.09
328	0.1
329	0.13
330	0.12
331	0.13
332	0.13
333	0.17
334	0.18
335	0.2
336	0.27
337	0.3
338	0.38
339	0.43
340	0.43
341	0.41
342	0.41
343	0.41
344	0.36
345	0.27
346	0.19
347	0.14
348	0.14
349	0.13
350	0.12
351	0.12
352	0.09
353	0.08
354	0.09
355	0.11
356	0.1
357	0.12
358	0.14
359	0.17
360	0.19
361	0.19
362	0.23
363	0.25
364	0.26
365	0.25
366	0.23
367	0.22
368	0.21
369	0.28
370	0.25
371	0.27
372	0.26
373	0.26
374	0.26
375	0.26
376	0.28
377	0.24
378	0.23
379	0.23
380	0.25
381	0.24
382	0.24
383	0.23
384	0.21
385	0.18
386	0.17
387	0.11
388	0.09
389	0.09
390	0.11
391	0.09
392	0.1
393	0.11
394	0.11
395	0.11
396	0.11
397	0.11
398	0.12
399	0.15
400	0.19
401	0.17
402	0.21
403	0.22
404	0.25
405	0.26
406	0.26
407	0.24
408	0.25
409	0.31
410	0.26
411	0.33
412	0.34
413	0.35
414	0.35
415	0.43
416	0.43
417	0.46
418	0.52
419	0.5
420	0.54
421	0.59
422	0.62
423	0.59
424	0.56
425	0.51
426	0.51
427	0.48
428	0.41
429	0.35
430	0.34
431	0.3
432	0.28
433	0.24
434	0.2
435	0.2
436	0.23
437	0.26
438	0.26
439	0.26
440	0.29
441	0.31
442	0.32
443	0.3
444	0.26
445	0.21
446	0.18
447	0.18
448	0.17
449	0.13
450	0.12
451	0.11
452	0.11
453	0.13
454	0.14
455	0.18
456	0.19
457	0.19
458	0.17
459	0.19
460	0.19
461	0.19
462	0.18
463	0.16
464	0.15
465	0.17
466	0.19
467	0.21
468	0.22
469	0.2
470	0.22
471	0.22
472	0.2
473	0.19
474	0.17
475	0.15
476	0.15
477	0.15
478	0.13
479	0.11
480	0.2
481	0.22
482	0.25
483	0.3
484	0.35
485	0.4
486	0.46
487	0.49
488	0.5
489	0.58
490	0.63
491	0.67
492	0.71
493	0.75
494	0.79
495	0.86
496	0.86
497	0.85
498	0.85
499	0.83
500	0.8
501	0.76
502	0.7
503	0.61
504	0.53
505	0.46
506	0.37
507	0.3
508	0.24
509	0.2
510	0.19
511	0.25
512	0.24
513	0.32
514	0.37
515	0.46
516	0.53
517	0.59
518	0.65
519	0.69
520	0.78
521	0.82
522	0.88
523	0.89
524	0.93
525	0.96
526	0.96
527	0.93
528	0.92
529	0.89
530	0.82
531	0.75
532	0.68
533	0.59
534	0.51
535	0.43
536	0.38
537	0.33
538	0.31
539	0.3
540	0.31
541	0.37
542	0.39
543	0.47
544	0.5
545	0.54
546	0.57
547	0.54
548	0.49
549	0.41
550	0.38
551	0.3
552	0.22
553	0.16
554	0.13
555	0.13
556	0.15
557	0.22
558	0.29
559	0.33
560	0.38
561	0.42
562	0.51
563	0.61
564	0.69
565	0.72
566	0.72
567	0.77
568	0.8
569	0.84
570	0.84
571	0.84
572	0.85
573	0.87
574	0.9
575	0.9
576	0.9
577	0.85

A0A397JT99

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer