Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JIA9

Protein Details
Accession A0A397JIA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
442-473SDTDTSVSKRKLKNNNKRAKVRKGNKRKGDIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
450-471KRKLKNNNKRAKVRKGNKRKGD
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.833, cyto_mito 2.833, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR039777  IFRD  
IPR007701  Interferon-rel_develop_reg_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF05004  IFRD  
Amino Acid Sequences MSRNLRKKAVARASRRASNNNNNNNTGPSLVSILAINNTPLSSLHNTDEEDLWSETSGDTIDSWASNSSKTNEDKAFEEAISWEDEVLQSVDDLEEKRTSIREDALAKLIRLLSRKFSAYLLESRRQSLLDLLIRSIKKDKSYKENVLAAKVLALLFITFGEGHEEMYQEVVPILKYITINTASPEVKSACIKTLGLSCFIAGSKYEAIDLLNFLSDIIRTSGASVNADDNAGPITSALNTYGLIFSELWSSSQKGGTQRAKEEFERVMPDHTKQLESATMEVRVASGENIALMFETLGIGRRIDSERWGNEDNSDEEGDTDYDGIEQLTHMLSTLATDSNRYRAKADRKIQRSVFRDVLRTVKDGDHIKEKLKFKNQTVYFTTWAKIIQLRSFREILAEGLKAHFEENTLLQEIFEFVPPPPLEPLRNRPDSALSYNTAGSDTDTSVSKRKLKNNNKRAKVRKGNKRKGDIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.79
3 0.77
4 0.76
5 0.77
6 0.79
7 0.79
8 0.77
9 0.73
10 0.69
11 0.63
12 0.54
13 0.44
14 0.34
15 0.25
16 0.21
17 0.17
18 0.16
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.12
24 0.11
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.14
29 0.17
30 0.19
31 0.21
32 0.23
33 0.24
34 0.26
35 0.27
36 0.23
37 0.22
38 0.2
39 0.18
40 0.16
41 0.15
42 0.12
43 0.12
44 0.1
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.07
50 0.09
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.16
55 0.18
56 0.24
57 0.26
58 0.32
59 0.32
60 0.34
61 0.34
62 0.35
63 0.35
64 0.28
65 0.26
66 0.2
67 0.18
68 0.17
69 0.15
70 0.11
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.09
75 0.08
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.08
80 0.09
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.13
85 0.15
86 0.17
87 0.17
88 0.19
89 0.21
90 0.23
91 0.25
92 0.31
93 0.3
94 0.28
95 0.28
96 0.28
97 0.25
98 0.26
99 0.26
100 0.24
101 0.26
102 0.28
103 0.26
104 0.25
105 0.25
106 0.25
107 0.31
108 0.32
109 0.35
110 0.35
111 0.36
112 0.36
113 0.33
114 0.3
115 0.24
116 0.24
117 0.22
118 0.21
119 0.21
120 0.26
121 0.26
122 0.27
123 0.3
124 0.27
125 0.3
126 0.36
127 0.4
128 0.44
129 0.52
130 0.57
131 0.58
132 0.61
133 0.56
134 0.51
135 0.47
136 0.37
137 0.29
138 0.23
139 0.16
140 0.09
141 0.08
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.1
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.16
170 0.14
171 0.14
172 0.16
173 0.14
174 0.14
175 0.16
176 0.16
177 0.13
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.18
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.15
186 0.14
187 0.14
188 0.13
189 0.07
190 0.09
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.07
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.1
216 0.08
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.13
242 0.15
243 0.23
244 0.28
245 0.3
246 0.33
247 0.36
248 0.38
249 0.36
250 0.36
251 0.29
252 0.25
253 0.26
254 0.23
255 0.23
256 0.21
257 0.22
258 0.23
259 0.23
260 0.22
261 0.18
262 0.19
263 0.17
264 0.16
265 0.17
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.1
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.09
290 0.12
291 0.12
292 0.16
293 0.2
294 0.21
295 0.27
296 0.29
297 0.26
298 0.25
299 0.27
300 0.24
301 0.21
302 0.2
303 0.15
304 0.13
305 0.13
306 0.12
307 0.1
308 0.08
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.05
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.11
326 0.11
327 0.19
328 0.22
329 0.23
330 0.24
331 0.3
332 0.4
333 0.47
334 0.56
335 0.58
336 0.61
337 0.68
338 0.72
339 0.73
340 0.68
341 0.65
342 0.63
343 0.56
344 0.54
345 0.48
346 0.48
347 0.42
348 0.39
349 0.34
350 0.28
351 0.31
352 0.32
353 0.33
354 0.34
355 0.34
356 0.37
357 0.43
358 0.47
359 0.5
360 0.55
361 0.59
362 0.56
363 0.64
364 0.62
365 0.61
366 0.61
367 0.57
368 0.51
369 0.46
370 0.42
371 0.33
372 0.3
373 0.26
374 0.24
375 0.23
376 0.25
377 0.31
378 0.34
379 0.37
380 0.38
381 0.35
382 0.33
383 0.3
384 0.26
385 0.22
386 0.19
387 0.15
388 0.15
389 0.16
390 0.14
391 0.14
392 0.12
393 0.1
394 0.11
395 0.12
396 0.14
397 0.16
398 0.15
399 0.15
400 0.15
401 0.16
402 0.15
403 0.14
404 0.12
405 0.1
406 0.18
407 0.19
408 0.2
409 0.23
410 0.26
411 0.3
412 0.36
413 0.46
414 0.47
415 0.52
416 0.51
417 0.49
418 0.51
419 0.51
420 0.49
421 0.44
422 0.37
423 0.33
424 0.33
425 0.31
426 0.26
427 0.2
428 0.18
429 0.15
430 0.14
431 0.14
432 0.16
433 0.18
434 0.25
435 0.31
436 0.37
437 0.43
438 0.51
439 0.61
440 0.7
441 0.79
442 0.83
443 0.87
444 0.89
445 0.92
446 0.93
447 0.93
448 0.93
449 0.92
450 0.92
451 0.93
452 0.94
453 0.93