Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397J6G0

Protein Details
Accession A0A397J6G0    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-36VEKYCNTRWRNKWMRELENNRQRQEHydrophilic
127-153AEEERKSKKTVLKKKKKETKVTFDPAHBasic
197-218SQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-113KQKGKK
131-144RKSKKTVLKKKKKE
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MADWAAWKAGFVEKYCNTRWRNKWMRELENNRQRQEETVDAYYARFRRLVKRVEINVNQHKRLFIKGLLPHIAPLITMQAPGTLAAALELAQAYEEGLDMVNEIEPRKQKGKKKVVESSDEEEEEEAEEERKSKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNLDDLAKKFEKMQLNLIQKMEKLTTQVNQQPNYRNRGNNRDNSSQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCFKCGKEGHISWDCPDRKDNSDNSAHAKLVEVEKESEKEENKLLQHLLEAYDAYLGKRERDDSSDEDTPIKRPQDNFHNHTSLRIDPFYGDGTQDPLQWMLHFEKVARSNAWDEAKKIRKYATYLEDDAEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.42
3 0.49
4 0.49
5 0.56
6 0.62
7 0.64
8 0.7
9 0.72
10 0.78
11 0.79
12 0.83
13 0.83
14 0.85
15 0.85
16 0.85
17 0.85
18 0.77
19 0.7
20 0.61
21 0.54
22 0.5
23 0.44
24 0.4
25 0.34
26 0.33
27 0.3
28 0.3
29 0.33
30 0.29
31 0.26
32 0.24
33 0.25
34 0.33
35 0.41
36 0.47
37 0.49
38 0.57
39 0.61
40 0.68
41 0.71
42 0.71
43 0.74
44 0.74
45 0.69
46 0.61
47 0.57
48 0.49
49 0.46
50 0.41
51 0.33
52 0.33
53 0.34
54 0.38
55 0.38
56 0.37
57 0.33
58 0.3
59 0.27
60 0.19
61 0.15
62 0.13
63 0.1
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.04
88 0.05
89 0.06
90 0.07
91 0.11
92 0.14
93 0.19
94 0.27
95 0.34
96 0.41
97 0.51
98 0.61
99 0.65
100 0.71
101 0.75
102 0.73
103 0.72
104 0.69
105 0.63
106 0.55
107 0.48
108 0.39
109 0.31
110 0.25
111 0.19
112 0.14
113 0.09
114 0.07
115 0.07
116 0.09
117 0.11
118 0.13
119 0.13
120 0.18
121 0.24
122 0.34
123 0.45
124 0.54
125 0.63
126 0.72
127 0.82
128 0.87
129 0.9
130 0.9
131 0.88
132 0.87
133 0.85
134 0.82
135 0.75
136 0.66
137 0.61
138 0.52
139 0.44
140 0.34
141 0.24
142 0.18
143 0.2
144 0.18
145 0.19
146 0.17
147 0.16
148 0.17
149 0.23
150 0.26
151 0.22
152 0.28
153 0.32
154 0.36
155 0.38
156 0.38
157 0.33
158 0.28
159 0.28
160 0.23
161 0.15
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.16
166 0.22
167 0.26
168 0.28
169 0.31
170 0.38
171 0.41
172 0.45
173 0.45
174 0.44
175 0.44
176 0.52
177 0.55
178 0.54
179 0.56
180 0.56
181 0.55
182 0.56
183 0.56
184 0.55
185 0.54
186 0.55
187 0.53
188 0.55
189 0.59
190 0.6
191 0.66
192 0.65
193 0.7
194 0.71
195 0.77
196 0.79
197 0.81
198 0.83
199 0.8
200 0.78
201 0.74
202 0.69
203 0.66
204 0.63
205 0.58
206 0.54
207 0.48
208 0.49
209 0.45
210 0.46
211 0.46
212 0.42
213 0.44
214 0.45
215 0.44
216 0.38
217 0.46
218 0.4
219 0.34
220 0.36
221 0.32
222 0.32
223 0.36
224 0.37
225 0.34
226 0.38
227 0.38
228 0.4
229 0.38
230 0.33
231 0.28
232 0.26
233 0.22
234 0.2
235 0.2
236 0.16
237 0.17
238 0.18
239 0.2
240 0.2
241 0.22
242 0.21
243 0.21
244 0.22
245 0.25
246 0.24
247 0.25
248 0.25
249 0.21
250 0.2
251 0.19
252 0.17
253 0.13
254 0.12
255 0.09
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.14
260 0.14
261 0.15
262 0.17
263 0.2
264 0.2
265 0.23
266 0.27
267 0.27
268 0.33
269 0.35
270 0.34
271 0.35
272 0.34
273 0.34
274 0.36
275 0.35
276 0.32
277 0.32
278 0.38
279 0.44
280 0.53
281 0.54
282 0.56
283 0.59
284 0.54
285 0.55
286 0.52
287 0.46
288 0.41
289 0.37
290 0.3
291 0.24
292 0.26
293 0.24
294 0.21
295 0.18
296 0.14
297 0.18
298 0.18
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.17
303 0.16
304 0.19
305 0.17
306 0.19
307 0.19
308 0.19
309 0.25
310 0.29
311 0.33
312 0.31
313 0.31
314 0.31
315 0.37
316 0.44
317 0.39
318 0.37
319 0.44
320 0.52
321 0.52
322 0.52
323 0.51
324 0.48
325 0.51
326 0.57
327 0.55
328 0.53
329 0.52