Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HV38

Protein Details
Accession A0A397HV38    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-99VNEIEPRKQKGKKKVVESSDKEEHydrophilic
102-129EAEERKSKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNBasic
170-194NSSQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCHydrophilic
235-261KLLQHLKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNHydrophilic
302-326NSSQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCHydrophilic
428-466RTEITPKKKTKKKEVIKMVKGNKEKKKENATRPPLFRKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
83-90RKQKGKKK
105-119ERKSKKTVLKKKKKE
245-251VLKKKKK
434-466PKKKTKKKEVIKMVKGNKEKKKENATRPPLFRK
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08284  RVP_2  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MRELENNRQRQGETVDAYYARFRRLVKRVDINANQHKRLFIKGLLPHIASLITMQAPGTLAAVLELAQAYEEGLDMVNEIEPRKQKGKKKVVESSDKEEEEEAEERKSKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNLDDLAKKFEKMQLNLIQKMEKLTTQVNQQPNYRNRGNNRDNSSQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCFKCGKEGHISWDCPDRKDNSDNSAHAKLVEVEEESEKEEDKLLQHLXKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNLDDLAKKFEKMQLNLIQKMEKLTTQVNQQPNYRNRGNNRDNSSQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCFKCGKEGHISWDCPDRKDNSDNSAHAKLVEVEEESEKEEDKLLQHLFEAYDAYLGKRERDDSSDEDTPIKRPRKINIPEPKPSLNTFGLPKTTSVSVPKVVRTEITPKKKTKKKEVIKMVKGNKEKKKENATRPPLFRKKDFDIVEQLQNQPAGLSWADALEVPSIRKSFFEALRKPKEKEIKLADQEYSLKTTALKCNVAVGVYTVPTIVDSGAAISIVIRDAMEQLGYEIEEASKSIILPATGKKTQPLGVIRDLPITIQGQTIPIDVEVIDAATYSLLLGNNWLMKANASYNWSDQELTLRWRGKTLTVLANCSKETKEEFSELIENTDEESTNESDIETEDSEEDDEEIIFKNTTIEDDDDENDEDTVPYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.37
3 0.34
4 0.35
5 0.38
6 0.34
7 0.29
8 0.3
9 0.31
10 0.37
11 0.45
12 0.52
13 0.53
14 0.61
15 0.66
16 0.73
17 0.76
18 0.77
19 0.79
20 0.79
21 0.75
22 0.66
23 0.63
24 0.55
25 0.52
26 0.47
27 0.4
28 0.39
29 0.4
30 0.45
31 0.46
32 0.45
33 0.4
34 0.35
35 0.32
36 0.23
37 0.19
38 0.14
39 0.1
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.05
64 0.07
65 0.08
66 0.1
67 0.15
68 0.19
69 0.25
70 0.34
71 0.42
72 0.49
73 0.59
74 0.69
75 0.72
76 0.78
77 0.81
78 0.82
79 0.84
80 0.82
81 0.79
82 0.76
83 0.68
84 0.59
85 0.5
86 0.42
87 0.35
88 0.32
89 0.25
90 0.21
91 0.25
92 0.26
93 0.29
94 0.3
95 0.31
96 0.35
97 0.45
98 0.52
99 0.58
100 0.68
101 0.76
102 0.85
103 0.91
104 0.93
105 0.94
106 0.92
107 0.91
108 0.9
109 0.89
110 0.83
111 0.76
112 0.71
113 0.62
114 0.54
115 0.44
116 0.34
117 0.28
118 0.29
119 0.26
120 0.27
121 0.25
122 0.24
123 0.25
124 0.32
125 0.36
126 0.32
127 0.39
128 0.41
129 0.47
130 0.5
131 0.5
132 0.45
133 0.38
134 0.39
135 0.32
136 0.24
137 0.21
138 0.2
139 0.21
140 0.26
141 0.33
142 0.37
143 0.39
144 0.44
145 0.51
146 0.53
147 0.58
148 0.57
149 0.57
150 0.57
151 0.64
152 0.67
153 0.66
154 0.68
155 0.68
156 0.66
157 0.66
158 0.65
159 0.64
160 0.62
161 0.64
162 0.62
163 0.63
164 0.67
165 0.69
166 0.73
167 0.73
168 0.76
169 0.77
170 0.82
171 0.83
172 0.86
173 0.87
174 0.85
175 0.83
176 0.79
177 0.75
178 0.72
179 0.68
180 0.64
181 0.6
182 0.53
183 0.53
184 0.49
185 0.5
186 0.51
187 0.46
188 0.48
189 0.49
190 0.48
191 0.42
192 0.49
193 0.43
194 0.36
195 0.38
196 0.34
197 0.33
198 0.38
199 0.39
200 0.36
201 0.39
202 0.39
203 0.41
204 0.39
205 0.34
206 0.28
207 0.26
208 0.21
209 0.17
210 0.16
211 0.11
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.16
223 0.21
224 0.23
225 0.25
226 0.29
227 0.33
228 0.38
229 0.46
230 0.5
231 0.54
232 0.61
233 0.69
234 0.76
235 0.82
236 0.85
237 0.88
238 0.89
239 0.88
240 0.89
241 0.89
242 0.83
243 0.76
244 0.71
245 0.62
246 0.54
247 0.44
248 0.34
249 0.28
250 0.29
251 0.26
252 0.27
253 0.25
254 0.24
255 0.25
256 0.32
257 0.36
258 0.32
259 0.39
260 0.41
261 0.47
262 0.5
263 0.5
264 0.45
265 0.38
266 0.39
267 0.32
268 0.24
269 0.21
270 0.2
271 0.21
272 0.26
273 0.33
274 0.37
275 0.39
276 0.44
277 0.51
278 0.53
279 0.58
280 0.57
281 0.57
282 0.57
283 0.64
284 0.67
285 0.66
286 0.68
287 0.68
288 0.66
289 0.66
290 0.65
291 0.64
292 0.62
293 0.64
294 0.62
295 0.63
296 0.67
297 0.69
298 0.73
299 0.73
300 0.76
301 0.77
302 0.82
303 0.83
304 0.86
305 0.87
306 0.85
307 0.83
308 0.79
309 0.75
310 0.72
311 0.68
312 0.64
313 0.6
314 0.53
315 0.53
316 0.49
317 0.5
318 0.51
319 0.46
320 0.48
321 0.49
322 0.48
323 0.42
324 0.49
325 0.43
326 0.36
327 0.38
328 0.34
329 0.33
330 0.38
331 0.39
332 0.36
333 0.39
334 0.39
335 0.41
336 0.39
337 0.34
338 0.28
339 0.26
340 0.21
341 0.17
342 0.16
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.11
349 0.11
350 0.1
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.13
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.12
359 0.11
360 0.1
361 0.09
362 0.05
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.1
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.14
371 0.13
372 0.16
373 0.19
374 0.19
375 0.25
376 0.26
377 0.26
378 0.27
379 0.26
380 0.27
381 0.32
382 0.33
383 0.33
384 0.34
385 0.37
386 0.45
387 0.5
388 0.56
389 0.59
390 0.6
391 0.62
392 0.63
393 0.61
394 0.53
395 0.49
396 0.44
397 0.34
398 0.3
399 0.26
400 0.23
401 0.23
402 0.21
403 0.2
404 0.17
405 0.17
406 0.16
407 0.17
408 0.17
409 0.2
410 0.21
411 0.23
412 0.22
413 0.22
414 0.21
415 0.2
416 0.28
417 0.32
418 0.4
419 0.45
420 0.52
421 0.61
422 0.67
423 0.73
424 0.75
425 0.77
426 0.77
427 0.8
428 0.83
429 0.84
430 0.86
431 0.87
432 0.84
433 0.81
434 0.79
435 0.78
436 0.75
437 0.73
438 0.7
439 0.69
440 0.72
441 0.73
442 0.76
443 0.78
444 0.79
445 0.78
446 0.79
447 0.81
448 0.8
449 0.75
450 0.69
451 0.65
452 0.61
453 0.62
454 0.57
455 0.5
456 0.49
457 0.47
458 0.48
459 0.44
460 0.39
461 0.32
462 0.29
463 0.26
464 0.17
465 0.14
466 0.1
467 0.08
468 0.08
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.08
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.11
481 0.14
482 0.18
483 0.24
484 0.32
485 0.38
486 0.47
487 0.57
488 0.62
489 0.61
490 0.64
491 0.68
492 0.61
493 0.62
494 0.6
495 0.59
496 0.6
497 0.6
498 0.53
499 0.46
500 0.46
501 0.39
502 0.33
503 0.24
504 0.19
505 0.18
506 0.22
507 0.25
508 0.27
509 0.27
510 0.24
511 0.26
512 0.27
513 0.25
514 0.2
515 0.16
516 0.12
517 0.11
518 0.11
519 0.08
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.06
524 0.05
525 0.04
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.05
537 0.06
538 0.06
539 0.05
540 0.06
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.11
555 0.16
556 0.22
557 0.25
558 0.25
559 0.27
560 0.29
561 0.32
562 0.35
563 0.36
564 0.34
565 0.36
566 0.4
567 0.38
568 0.37
569 0.34
570 0.28
571 0.25
572 0.21
573 0.16
574 0.13
575 0.12
576 0.12
577 0.12
578 0.13
579 0.1
580 0.09
581 0.09
582 0.08
583 0.08
584 0.07
585 0.06
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.07
596 0.1
597 0.12
598 0.12
599 0.13
600 0.11
601 0.12
602 0.14
603 0.16
604 0.17
605 0.18
606 0.2
607 0.22
608 0.24
609 0.25
610 0.23
611 0.21
612 0.23
613 0.24
614 0.26
615 0.32
616 0.34
617 0.32
618 0.35
619 0.36
620 0.33
621 0.36
622 0.37
623 0.38
624 0.37
625 0.42
626 0.43
627 0.45
628 0.43
629 0.4
630 0.35
631 0.3
632 0.31
633 0.31
634 0.31
635 0.31
636 0.31
637 0.32
638 0.35
639 0.32
640 0.3
641 0.25
642 0.2
643 0.19
644 0.2
645 0.16
646 0.13
647 0.16
648 0.15
649 0.15
650 0.15
651 0.13
652 0.12
653 0.13
654 0.15
655 0.12
656 0.12
657 0.12
658 0.13
659 0.13
660 0.13
661 0.13
662 0.1
663 0.09
664 0.09
665 0.1
666 0.11
667 0.1
668 0.1
669 0.11
670 0.11
671 0.13
672 0.15
673 0.16
674 0.17
675 0.2
676 0.21
677 0.23
678 0.24
679 0.23
680 0.2
681 0.18