Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HYB0

Protein Details
Accession A0A397HYB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
535-557DTITSPKDKKRKKEDKEKEVEVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
541-548KDKKRKKE
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037651  Swc3  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000812  C:Swr1 complex  
GO:0140849  F:ATP-dependent H2AZ histone chaperone activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MSRKRAESLKSLSLPSSARPQTEKEMATMHNYRESGILLLSLTQSRQAWTSSILKKFSSKQDVVYHPVLPENTCQVANVSLLGKCHITIGPHTFYDTKIYEAVYEKDTKNNIEFQSGSSQSQINSQFPTLFQTTSHPHVQLNNTQSVVATPSLSNLQTLPTKTNSYSATSRPIQPAIQPRPLSQSPQLQVPIQPRVVIPRIPTRSTPSTPSTPSNSIIPSSTVPILSNSIISSSISSSTPTSSNSSIPSSIPSFTPFTTTPISSNINVQSINALVPTNTSLSTNGNVQNGSRAITSPNLPANSQLTALMQTVLQTVNPTQILAIQEHLRQPQAATHMTQEQKNALISQLSTIHQLLTTSQLVQQQQTQQQQQQQQQQQQQQQHQLHQLQQIHSRSQSQIPRSRQIVRYEVLLEFKENKNDKWLFPKETILEALSMSEPYDVLASFYLPQNDEPTSGKQIHQPVTMHLTNLTQVTWDALQKATNDVASVIQSMATKMNTKPPRVYLQHCLPCDYPEELLEAIGQKVSKLDGTLIIDTITSPKDKKRKKEDKEKEVEVEVVIETRSKDIKDGKDIDMEAPEISETRATKKLKSTSKNTEGGRTTSRASTSNTPKKAKSVPNLAASSTSASSGGNKRCAYCFCKTTPMWRRGPDGAGTLCNACGVKWKQGKILQGPNASRTAEGDANNAASSSKSRKYSLSAASSRAKKKSGRSLSMSEGASALTYIGNDDGREKVSETSGGGFTNSGSQRIGLGRRASISAKKAITSTVLGGEFAASPDAESPDNVTSPLRSPPPPQVTIVPTSNQNTLIPTSSRTTSTTSQNNNNGPGGVIGGGGYPINLKLNSILFGIGGGSTYFSQPNCSAEVFENYLKVKLTKDGYEKTEVDIWKESIDFIAFENERDLATGFPILALQARVGQYLSGFDQELLNPDRNDTLVMFKFINLNVNFRPSVTENILSGNNGGNNIGNNNGGGESSSSVRNNGESRDLKTFLEKWLTTNNVIRIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.37
3 0.4
4 0.35
5 0.35
6 0.36
7 0.39
8 0.43
9 0.49
10 0.47
11 0.39
12 0.4
13 0.38
14 0.42
15 0.43
16 0.38
17 0.37
18 0.36
19 0.34
20 0.31
21 0.3
22 0.23
23 0.19
24 0.16
25 0.1
26 0.11
27 0.12
28 0.13
29 0.12
30 0.15
31 0.15
32 0.16
33 0.18
34 0.18
35 0.17
36 0.21
37 0.3
38 0.34
39 0.39
40 0.41
41 0.41
42 0.46
43 0.51
44 0.56
45 0.56
46 0.5
47 0.51
48 0.57
49 0.6
50 0.61
51 0.58
52 0.5
53 0.41
54 0.43
55 0.38
56 0.3
57 0.28
58 0.26
59 0.25
60 0.23
61 0.23
62 0.2
63 0.2
64 0.19
65 0.18
66 0.15
67 0.14
68 0.15
69 0.16
70 0.15
71 0.14
72 0.16
73 0.15
74 0.15
75 0.19
76 0.25
77 0.27
78 0.27
79 0.3
80 0.29
81 0.28
82 0.32
83 0.28
84 0.24
85 0.21
86 0.21
87 0.21
88 0.23
89 0.25
90 0.23
91 0.28
92 0.27
93 0.32
94 0.34
95 0.35
96 0.34
97 0.39
98 0.36
99 0.35
100 0.34
101 0.31
102 0.36
103 0.35
104 0.33
105 0.28
106 0.28
107 0.23
108 0.3
109 0.31
110 0.25
111 0.25
112 0.26
113 0.25
114 0.24
115 0.29
116 0.24
117 0.21
118 0.19
119 0.22
120 0.25
121 0.29
122 0.33
123 0.28
124 0.28
125 0.33
126 0.38
127 0.4
128 0.4
129 0.38
130 0.35
131 0.34
132 0.32
133 0.27
134 0.24
135 0.18
136 0.14
137 0.1
138 0.12
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.12
143 0.15
144 0.18
145 0.2
146 0.22
147 0.22
148 0.26
149 0.26
150 0.31
151 0.29
152 0.3
153 0.32
154 0.32
155 0.36
156 0.36
157 0.4
158 0.39
159 0.39
160 0.35
161 0.37
162 0.45
163 0.45
164 0.5
165 0.47
166 0.44
167 0.5
168 0.5
169 0.49
170 0.44
171 0.46
172 0.39
173 0.43
174 0.44
175 0.37
176 0.4
177 0.4
178 0.4
179 0.32
180 0.32
181 0.27
182 0.31
183 0.33
184 0.31
185 0.29
186 0.33
187 0.38
188 0.4
189 0.42
190 0.43
191 0.47
192 0.47
193 0.48
194 0.44
195 0.44
196 0.45
197 0.47
198 0.46
199 0.42
200 0.41
201 0.38
202 0.34
203 0.29
204 0.26
205 0.24
206 0.19
207 0.19
208 0.18
209 0.15
210 0.15
211 0.15
212 0.16
213 0.14
214 0.14
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.13
227 0.15
228 0.18
229 0.18
230 0.19
231 0.2
232 0.22
233 0.21
234 0.2
235 0.22
236 0.19
237 0.19
238 0.18
239 0.18
240 0.18
241 0.17
242 0.21
243 0.18
244 0.2
245 0.22
246 0.23
247 0.21
248 0.23
249 0.26
250 0.22
251 0.25
252 0.23
253 0.22
254 0.21
255 0.2
256 0.17
257 0.14
258 0.13
259 0.1
260 0.08
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.11
269 0.12
270 0.16
271 0.17
272 0.18
273 0.18
274 0.17
275 0.2
276 0.18
277 0.18
278 0.15
279 0.13
280 0.13
281 0.15
282 0.16
283 0.16
284 0.2
285 0.2
286 0.19
287 0.21
288 0.21
289 0.2
290 0.18
291 0.15
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.1
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.11
308 0.12
309 0.11
310 0.13
311 0.12
312 0.15
313 0.17
314 0.19
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.16
319 0.18
320 0.18
321 0.16
322 0.17
323 0.23
324 0.26
325 0.27
326 0.25
327 0.22
328 0.22
329 0.21
330 0.19
331 0.13
332 0.12
333 0.1
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.11
341 0.12
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.1
346 0.12
347 0.16
348 0.17
349 0.18
350 0.21
351 0.22
352 0.28
353 0.33
354 0.34
355 0.35
356 0.4
357 0.46
358 0.5
359 0.53
360 0.53
361 0.55
362 0.58
363 0.62
364 0.62
365 0.61
366 0.6
367 0.61
368 0.57
369 0.54
370 0.53
371 0.49
372 0.46
373 0.46
374 0.44
375 0.37
376 0.41
377 0.39
378 0.35
379 0.33
380 0.31
381 0.27
382 0.3
383 0.33
384 0.34
385 0.39
386 0.42
387 0.47
388 0.48
389 0.53
390 0.51
391 0.51
392 0.47
393 0.39
394 0.37
395 0.33
396 0.3
397 0.25
398 0.21
399 0.17
400 0.17
401 0.18
402 0.24
403 0.24
404 0.23
405 0.29
406 0.31
407 0.31
408 0.36
409 0.4
410 0.36
411 0.36
412 0.39
413 0.32
414 0.31
415 0.3
416 0.21
417 0.17
418 0.13
419 0.12
420 0.09
421 0.08
422 0.07
423 0.06
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.05
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.1
437 0.11
438 0.12
439 0.13
440 0.15
441 0.18
442 0.18
443 0.19
444 0.21
445 0.26
446 0.27
447 0.28
448 0.26
449 0.23
450 0.28
451 0.28
452 0.24
453 0.19
454 0.17
455 0.14
456 0.14
457 0.12
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.09
466 0.09
467 0.1
468 0.1
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.07
474 0.07
475 0.05
476 0.06
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.08
481 0.09
482 0.1
483 0.19
484 0.22
485 0.24
486 0.26
487 0.28
488 0.34
489 0.36
490 0.4
491 0.37
492 0.42
493 0.46
494 0.45
495 0.44
496 0.37
497 0.34
498 0.33
499 0.27
500 0.18
501 0.12
502 0.13
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.07
507 0.06
508 0.07
509 0.06
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.07
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.09
524 0.08
525 0.07
526 0.08
527 0.14
528 0.23
529 0.3
530 0.39
531 0.49
532 0.59
533 0.68
534 0.78
535 0.83
536 0.84
537 0.86
538 0.8
539 0.71
540 0.61
541 0.52
542 0.4
543 0.3
544 0.19
545 0.12
546 0.09
547 0.07
548 0.06
549 0.07
550 0.09
551 0.08
552 0.11
553 0.17
554 0.19
555 0.25
556 0.29
557 0.28
558 0.3
559 0.3
560 0.28
561 0.23
562 0.21
563 0.14
564 0.1
565 0.09
566 0.06
567 0.06
568 0.07
569 0.07
570 0.1
571 0.18
572 0.19
573 0.22
574 0.28
575 0.36
576 0.43
577 0.49
578 0.53
579 0.56
580 0.62
581 0.66
582 0.6
583 0.59
584 0.52
585 0.49
586 0.44
587 0.36
588 0.3
589 0.25
590 0.26
591 0.22
592 0.23
593 0.28
594 0.35
595 0.42
596 0.47
597 0.49
598 0.48
599 0.51
600 0.56
601 0.55
602 0.51
603 0.52
604 0.5
605 0.53
606 0.53
607 0.48
608 0.41
609 0.35
610 0.3
611 0.21
612 0.16
613 0.09
614 0.08
615 0.12
616 0.17
617 0.2
618 0.25
619 0.25
620 0.26
621 0.28
622 0.33
623 0.34
624 0.33
625 0.33
626 0.29
627 0.36
628 0.36
629 0.44
630 0.49
631 0.52
632 0.53
633 0.52
634 0.54
635 0.49
636 0.51
637 0.41
638 0.36
639 0.29
640 0.24
641 0.22
642 0.17
643 0.15
644 0.14
645 0.12
646 0.08
647 0.15
648 0.17
649 0.25
650 0.3
651 0.31
652 0.37
653 0.41
654 0.46
655 0.45
656 0.51
657 0.49
658 0.5
659 0.5
660 0.46
661 0.45
662 0.39
663 0.32
664 0.25
665 0.22
666 0.19
667 0.18
668 0.17
669 0.15
670 0.16
671 0.15
672 0.14
673 0.11
674 0.08
675 0.1
676 0.14
677 0.19
678 0.21
679 0.23
680 0.25
681 0.29
682 0.35
683 0.39
684 0.42
685 0.39
686 0.41
687 0.47
688 0.53
689 0.54
690 0.51
691 0.49
692 0.46
693 0.51
694 0.57
695 0.59
696 0.57
697 0.58
698 0.58
699 0.58
700 0.59
701 0.51
702 0.41
703 0.32
704 0.25
705 0.19
706 0.15
707 0.1
708 0.05
709 0.04
710 0.05
711 0.06
712 0.06
713 0.06
714 0.08
715 0.09
716 0.1
717 0.11
718 0.12
719 0.12
720 0.13
721 0.13
722 0.13
723 0.14
724 0.14
725 0.13
726 0.12
727 0.11
728 0.1
729 0.16
730 0.16
731 0.14
732 0.14
733 0.14
734 0.15
735 0.19
736 0.22
737 0.2
738 0.21
739 0.21
740 0.22
741 0.25
742 0.26
743 0.27
744 0.28
745 0.29
746 0.28
747 0.28
748 0.27
749 0.26
750 0.25
751 0.21
752 0.19
753 0.16
754 0.15
755 0.14
756 0.13
757 0.13
758 0.11
759 0.1
760 0.09
761 0.06
762 0.06
763 0.07
764 0.09
765 0.08
766 0.08
767 0.11
768 0.12
769 0.12
770 0.13
771 0.13
772 0.12
773 0.14
774 0.19
775 0.2
776 0.21
777 0.25
778 0.34
779 0.4
780 0.41
781 0.41
782 0.41
783 0.4
784 0.43
785 0.42
786 0.34
787 0.31
788 0.32
789 0.31
790 0.28
791 0.25
792 0.22
793 0.21
794 0.22
795 0.19
796 0.19
797 0.2
798 0.21
799 0.22
800 0.22
801 0.25
802 0.27
803 0.33
804 0.39
805 0.42
806 0.48
807 0.54
808 0.55
809 0.53
810 0.5
811 0.42
812 0.34
813 0.28
814 0.2
815 0.13
816 0.1
817 0.06
818 0.06
819 0.06
820 0.05
821 0.05
822 0.05
823 0.06
824 0.09
825 0.08
826 0.09
827 0.11
828 0.12
829 0.14
830 0.13
831 0.13
832 0.1
833 0.1
834 0.1
835 0.07
836 0.06
837 0.05
838 0.06
839 0.07
840 0.08
841 0.1
842 0.1
843 0.15
844 0.16
845 0.18
846 0.19
847 0.18
848 0.19
849 0.19
850 0.24
851 0.24
852 0.24
853 0.25
854 0.24
855 0.25
856 0.24
857 0.23
858 0.2
859 0.22
860 0.25
861 0.28
862 0.35
863 0.39
864 0.42
865 0.47
866 0.46
867 0.43
868 0.46
869 0.4
870 0.37
871 0.35
872 0.31
873 0.26
874 0.25
875 0.22
876 0.17
877 0.17
878 0.14
879 0.11
880 0.18
881 0.17
882 0.17
883 0.18
884 0.17
885 0.17
886 0.17
887 0.17
888 0.09
889 0.1
890 0.1
891 0.08
892 0.08
893 0.08
894 0.08
895 0.09
896 0.09
897 0.08
898 0.12
899 0.13
900 0.13
901 0.14
902 0.13
903 0.12
904 0.14
905 0.15
906 0.12
907 0.12
908 0.12
909 0.14
910 0.14
911 0.19
912 0.21
913 0.24
914 0.23
915 0.23
916 0.24
917 0.23
918 0.24
919 0.19
920 0.23
921 0.2
922 0.23
923 0.22
924 0.21
925 0.25
926 0.24
927 0.31
928 0.25
929 0.29
930 0.28
931 0.33
932 0.32
933 0.29
934 0.33
935 0.27
936 0.33
937 0.32
938 0.32
939 0.27
940 0.3
941 0.31
942 0.27
943 0.25
944 0.22
945 0.18
946 0.16
947 0.16
948 0.14
949 0.15
950 0.15
951 0.16
952 0.13
953 0.12
954 0.12
955 0.12
956 0.1
957 0.1
958 0.1
959 0.1
960 0.12
961 0.17
962 0.17
963 0.19
964 0.2
965 0.24
966 0.25
967 0.26
968 0.34
969 0.33
970 0.37
971 0.42
972 0.43
973 0.39
974 0.43
975 0.42
976 0.39
977 0.44
978 0.39
979 0.36
980 0.42
981 0.46
982 0.44
983 0.48