Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JJR4

Protein Details
Accession A0A397JJR4    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
511-537EEEERKPKKTVLKKKKKETKVTFDPAHBasic
579-604NSSQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCFHydrophilic
700-746VPKVVKTEITPKKRSKKKEVIKIVKGNKEKKKENATRPPLFRKKDFDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
493-498KQKGKK
515-528RKPKKTVLKKKKKE
710-742PKKRSKKKEVIKIVKGNKEKKKENATRPPLFRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MYYEDLKDLKDLKDPKDPKDLKDPKDPKISYIKDGFWPEAKASLLYLQLPLIKSSCSSNVFIKKDKPPSVTIWCLLAETQKEIILLIVIAKRRNDCVDEAIKQKNEALSEIVERELSREEKDPNYEVTYTLKDLNRVKDHLDLIKHHVWIRDNILVDNGRTVFNIPTRRTVRQLTPEEREQRRQLYQQRRLERQVQRENQNPVTVRLPTSNSATTSPSATVGTFGTTSRQRRRSNETPQSFSQAISPRQSPEQVTPCVATPPNNWDQLQNLRTFYQPLDFNLLNRQLAEVNQDIASNSSDSSDTDTEDEMANTVLDYLEDNLHNHTSLRVDPFYRDGTQDPLQWMIHFEKVARSNAWDEAKKIRKYATYLEDDAEEWYDEIVPGEMADWAAWRAGFVEKYCNTRWKNKWMRELENNRQRQGETIDAYYARFKRLVKRVEIQVDQRKRLFIKGLLPHIAPLVTMQTPATLAAALELAQAYEEGLDMVNEIEPRKQKGKKKVVESSDEEEEEEEEERKPKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNLDNLAKKFEKMQLNLIQKMEKLTTQVNQQPNYRNRGNNRDNSSQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCFKCGKEGHISWDCPDRKDNSDNSAHAKLVEVEEESEKEEDKLLQHLLDAYDAYLGKRERDDSSDEDTPIKRPRETNIPEPKPSLNTFGLPKTTSVPVPKVVKTEITPKKRSKKKEVIKIVKGNKEKKKENATRPPLFRKKDFDIVKQLQNQPAGLSWADALEVPSIRKSFFEAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.52
3 0.59
4 0.61
5 0.57
6 0.63
7 0.67
8 0.62
9 0.69
10 0.7
11 0.67
12 0.74
13 0.7
14 0.64
15 0.65
16 0.63
17 0.6
18 0.59
19 0.54
20 0.5
21 0.54
22 0.52
23 0.45
24 0.43
25 0.36
26 0.34
27 0.32
28 0.25
29 0.22
30 0.21
31 0.2
32 0.18
33 0.18
34 0.16
35 0.19
36 0.19
37 0.19
38 0.18
39 0.16
40 0.16
41 0.19
42 0.23
43 0.23
44 0.25
45 0.32
46 0.4
47 0.45
48 0.5
49 0.54
50 0.57
51 0.63
52 0.67
53 0.63
54 0.58
55 0.61
56 0.63
57 0.6
58 0.53
59 0.45
60 0.38
61 0.35
62 0.31
63 0.29
64 0.22
65 0.2
66 0.2
67 0.18
68 0.18
69 0.17
70 0.16
71 0.12
72 0.1
73 0.1
74 0.13
75 0.15
76 0.19
77 0.22
78 0.24
79 0.27
80 0.3
81 0.3
82 0.29
83 0.33
84 0.37
85 0.39
86 0.43
87 0.47
88 0.45
89 0.42
90 0.42
91 0.38
92 0.32
93 0.28
94 0.25
95 0.19
96 0.21
97 0.21
98 0.19
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.19
103 0.18
104 0.18
105 0.21
106 0.25
107 0.28
108 0.33
109 0.33
110 0.32
111 0.34
112 0.32
113 0.29
114 0.29
115 0.27
116 0.25
117 0.28
118 0.26
119 0.29
120 0.34
121 0.41
122 0.43
123 0.42
124 0.42
125 0.41
126 0.44
127 0.42
128 0.41
129 0.36
130 0.38
131 0.41
132 0.41
133 0.38
134 0.39
135 0.36
136 0.36
137 0.37
138 0.34
139 0.31
140 0.28
141 0.3
142 0.27
143 0.25
144 0.25
145 0.2
146 0.17
147 0.16
148 0.17
149 0.16
150 0.2
151 0.28
152 0.26
153 0.35
154 0.39
155 0.42
156 0.46
157 0.48
158 0.5
159 0.52
160 0.59
161 0.56
162 0.57
163 0.62
164 0.67
165 0.67
166 0.67
167 0.62
168 0.59
169 0.58
170 0.6
171 0.62
172 0.63
173 0.68
174 0.7
175 0.73
176 0.74
177 0.75
178 0.76
179 0.74
180 0.73
181 0.74
182 0.73
183 0.72
184 0.72
185 0.73
186 0.66
187 0.63
188 0.54
189 0.47
190 0.42
191 0.36
192 0.3
193 0.26
194 0.27
195 0.23
196 0.26
197 0.25
198 0.24
199 0.24
200 0.24
201 0.22
202 0.21
203 0.19
204 0.16
205 0.15
206 0.13
207 0.12
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.13
213 0.18
214 0.26
215 0.34
216 0.43
217 0.48
218 0.53
219 0.63
220 0.68
221 0.72
222 0.75
223 0.73
224 0.69
225 0.65
226 0.65
227 0.56
228 0.47
229 0.42
230 0.37
231 0.34
232 0.32
233 0.32
234 0.28
235 0.3
236 0.32
237 0.28
238 0.28
239 0.31
240 0.29
241 0.28
242 0.27
243 0.26
244 0.27
245 0.25
246 0.21
247 0.18
248 0.23
249 0.26
250 0.28
251 0.28
252 0.25
253 0.28
254 0.33
255 0.34
256 0.3
257 0.27
258 0.25
259 0.25
260 0.26
261 0.22
262 0.19
263 0.17
264 0.17
265 0.21
266 0.2
267 0.2
268 0.24
269 0.26
270 0.21
271 0.2
272 0.2
273 0.14
274 0.14
275 0.17
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.13
316 0.13
317 0.13
318 0.14
319 0.17
320 0.19
321 0.19
322 0.18
323 0.16
324 0.2
325 0.21
326 0.22
327 0.2
328 0.19
329 0.18
330 0.17
331 0.18
332 0.15
333 0.14
334 0.13
335 0.12
336 0.15
337 0.18
338 0.2
339 0.17
340 0.17
341 0.18
342 0.22
343 0.26
344 0.22
345 0.21
346 0.28
347 0.36
348 0.35
349 0.35
350 0.33
351 0.31
352 0.33
353 0.37
354 0.34
355 0.3
356 0.3
357 0.29
358 0.27
359 0.25
360 0.23
361 0.17
362 0.11
363 0.07
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.04
378 0.04
379 0.03
380 0.04
381 0.06
382 0.07
383 0.07
384 0.13
385 0.14
386 0.19
387 0.21
388 0.28
389 0.3
390 0.38
391 0.43
392 0.47
393 0.56
394 0.58
395 0.66
396 0.64
397 0.68
398 0.68
399 0.73
400 0.72
401 0.72
402 0.68
403 0.6
404 0.55
405 0.49
406 0.41
407 0.35
408 0.28
409 0.2
410 0.17
411 0.17
412 0.16
413 0.17
414 0.2
415 0.18
416 0.15
417 0.16
418 0.17
419 0.24
420 0.32
421 0.37
422 0.36
423 0.41
424 0.45
425 0.48
426 0.5
427 0.49
428 0.51
429 0.51
430 0.5
431 0.45
432 0.42
433 0.38
434 0.37
435 0.32
436 0.25
437 0.28
438 0.29
439 0.32
440 0.32
441 0.31
442 0.29
443 0.26
444 0.23
445 0.15
446 0.11
447 0.09
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.1
477 0.13
478 0.17
479 0.25
480 0.32
481 0.39
482 0.49
483 0.59
484 0.63
485 0.69
486 0.74
487 0.71
488 0.71
489 0.68
490 0.62
491 0.54
492 0.47
493 0.39
494 0.3
495 0.25
496 0.19
497 0.15
498 0.11
499 0.09
500 0.14
501 0.16
502 0.17
503 0.18
504 0.22
505 0.3
506 0.4
507 0.5
508 0.57
509 0.66
510 0.74
511 0.84
512 0.9
513 0.91
514 0.91
515 0.9
516 0.88
517 0.87
518 0.85
519 0.79
520 0.7
521 0.66
522 0.57
523 0.49
524 0.39
525 0.3
526 0.25
527 0.28
528 0.26
529 0.26
530 0.24
531 0.22
532 0.25
533 0.31
534 0.35
535 0.29
536 0.36
537 0.4
538 0.46
539 0.49
540 0.47
541 0.41
542 0.35
543 0.36
544 0.29
545 0.21
546 0.18
547 0.17
548 0.18
549 0.24
550 0.3
551 0.34
552 0.37
553 0.41
554 0.48
555 0.51
556 0.56
557 0.55
558 0.54
559 0.55
560 0.62
561 0.66
562 0.65
563 0.66
564 0.66
565 0.65
566 0.65
567 0.64
568 0.63
569 0.62
570 0.63
571 0.62
572 0.63
573 0.67
574 0.69
575 0.73
576 0.73
577 0.77
578 0.77
579 0.83
580 0.84
581 0.86
582 0.88
583 0.86
584 0.84
585 0.8
586 0.76
587 0.73
588 0.7
589 0.66
590 0.62
591 0.55
592 0.55
593 0.51
594 0.52
595 0.53
596 0.48
597 0.5
598 0.52
599 0.51
600 0.45
601 0.51
602 0.46
603 0.39
604 0.42
605 0.37
606 0.36
607 0.42
608 0.43
609 0.4
610 0.44
611 0.44
612 0.46
613 0.44
614 0.39
615 0.32
616 0.3
617 0.25
618 0.2
619 0.19
620 0.13
621 0.13
622 0.14
623 0.15
624 0.16
625 0.15
626 0.14
627 0.13
628 0.14
629 0.14
630 0.13
631 0.16
632 0.15
633 0.14
634 0.14
635 0.16
636 0.15
637 0.14
638 0.13
639 0.1
640 0.11
641 0.11
642 0.11
643 0.15
644 0.15
645 0.17
646 0.19
647 0.22
648 0.22
649 0.25
650 0.3
651 0.29
652 0.36
653 0.38
654 0.36
655 0.38
656 0.36
657 0.38
658 0.41
659 0.41
660 0.37
661 0.36
662 0.4
663 0.46
664 0.51
665 0.56
666 0.6
667 0.62
668 0.62
669 0.64
670 0.61
671 0.56
672 0.52
673 0.47
674 0.38
675 0.36
676 0.36
677 0.36
678 0.37
679 0.33
680 0.32
681 0.29
682 0.3
683 0.3
684 0.32
685 0.31
686 0.34
687 0.39
688 0.4
689 0.4
690 0.4
691 0.4
692 0.37
693 0.45
694 0.47
695 0.51
696 0.58
697 0.64
698 0.72
699 0.77
700 0.84
701 0.85
702 0.86
703 0.87
704 0.89
705 0.9
706 0.9
707 0.91
708 0.92
709 0.9
710 0.88
711 0.87
712 0.86
713 0.84
714 0.84
715 0.81
716 0.81
717 0.83
718 0.84
719 0.85
720 0.86
721 0.87
722 0.86
723 0.87
724 0.89
725 0.88
726 0.85
727 0.8
728 0.77
729 0.74
730 0.74
731 0.72
732 0.69
733 0.69
734 0.69
735 0.7
736 0.71
737 0.7
738 0.66
739 0.62
740 0.54
741 0.45
742 0.4
743 0.34
744 0.26
745 0.2
746 0.15
747 0.13
748 0.13
749 0.12
750 0.11
751 0.11
752 0.13
753 0.14
754 0.18
755 0.19
756 0.19
757 0.2