Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HMD1

Protein Details
Accession A0A397HMD1    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-51MTKSHKAKKARKAKKAKRFSIASPIKAIKKKGKKNQKNKITKKQISQLGHFHydrophilic
207-234DSRRKLKNTAMNDKKKRRRRAVDFMMQGHydrophilic
280-302DPVVKDVCKKQQKQRIRNVASKIHydrophilic
364-409IIDNKRKRKSSSSSSNKKRKRESSKKDSNKKKNKKKQKNKKKNKKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-43SHKAKKARKAKKAKRFSIASPIKAIKKKGKKNQKNKITKK
165-177KRKINKKYKVTGA
179-192IIKMLQRRHRSRHR
208-226SRRKLKNTAMNDKKKRRRR
368-409KRKRKSSSSSSNKKRKRESSKKDSNKKKNKKKQKNKKKNKKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039715  ZCCHC10  
Amino Acid Sequences MTKSHKAKKARKAKKAKRFSIASPIKAIKKKGKKNQKNKITKKQISQLGHFYYDLMTKKKNKKASSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTTSSSEQVSQSLISSSSSDEDKRIKPLDVESYKRIKKEVFLVVDSEMNTVYQINDRLTWAAQKHDVITKLLPPLKRKINKKYKVTGAEIIKMLQRRHRSRHRVNNIGNQGPRAVINDSRRKLKNTAMNDKKKRRRRAVDFMMQGGNNNNNNDNDNNNDNNNSNEKTTSIYVYEKWWRLDALIKLFNERIDPVVKDVCKKQQKQRIRNVASKINRDGHPPVGAPSWTLNTVALMHENQDQSKIVIYDPDTEEEESEGEGEDNTDEDDDDDGNDLIIDNKRKRKSSSSSSNKKRKRESSKKDSNKKKNKKKQKNKKKNKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.94
3 0.92
4 0.9
5 0.85
6 0.79
7 0.79
8 0.77
9 0.69
10 0.66
11 0.64
12 0.63
13 0.62
14 0.65
15 0.64
16 0.67
17 0.74
18 0.77
19 0.82
20 0.84
21 0.9
22 0.93
23 0.94
24 0.94
25 0.94
26 0.95
27 0.95
28 0.92
29 0.89
30 0.87
31 0.85
32 0.8
33 0.75
34 0.72
35 0.65
36 0.59
37 0.5
38 0.41
39 0.34
40 0.33
41 0.32
42 0.27
43 0.3
44 0.38
45 0.48
46 0.55
47 0.63
48 0.63
49 0.69
50 0.75
51 0.78
52 0.77
53 0.74
54 0.69
55 0.64
56 0.61
57 0.52
58 0.43
59 0.34
60 0.27
61 0.21
62 0.19
63 0.16
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.17
81 0.17
82 0.19
83 0.18
84 0.18
85 0.17
86 0.15
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.12
95 0.12
96 0.15
97 0.2
98 0.22
99 0.27
100 0.28
101 0.28
102 0.27
103 0.3
104 0.37
105 0.37
106 0.4
107 0.41
108 0.48
109 0.5
110 0.49
111 0.48
112 0.39
113 0.36
114 0.38
115 0.39
116 0.33
117 0.31
118 0.32
119 0.3
120 0.31
121 0.28
122 0.21
123 0.14
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.16
136 0.14
137 0.15
138 0.17
139 0.17
140 0.18
141 0.2
142 0.21
143 0.19
144 0.19
145 0.19
146 0.23
147 0.26
148 0.27
149 0.27
150 0.33
151 0.41
152 0.47
153 0.53
154 0.58
155 0.65
156 0.71
157 0.75
158 0.76
159 0.74
160 0.73
161 0.68
162 0.64
163 0.55
164 0.49
165 0.42
166 0.35
167 0.3
168 0.28
169 0.25
170 0.24
171 0.31
172 0.34
173 0.43
174 0.52
175 0.6
176 0.67
177 0.76
178 0.79
179 0.79
180 0.78
181 0.78
182 0.73
183 0.67
184 0.58
185 0.47
186 0.39
187 0.29
188 0.25
189 0.18
190 0.14
191 0.14
192 0.2
193 0.28
194 0.3
195 0.37
196 0.38
197 0.4
198 0.41
199 0.43
200 0.43
201 0.43
202 0.52
203 0.55
204 0.63
205 0.7
206 0.78
207 0.82
208 0.84
209 0.86
210 0.85
211 0.85
212 0.84
213 0.85
214 0.83
215 0.82
216 0.74
217 0.67
218 0.59
219 0.49
220 0.4
221 0.31
222 0.27
223 0.2
224 0.19
225 0.18
226 0.17
227 0.19
228 0.19
229 0.19
230 0.17
231 0.19
232 0.2
233 0.19
234 0.2
235 0.19
236 0.2
237 0.23
238 0.21
239 0.18
240 0.16
241 0.16
242 0.17
243 0.17
244 0.16
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.19
249 0.25
250 0.26
251 0.26
252 0.25
253 0.23
254 0.23
255 0.27
256 0.26
257 0.26
258 0.28
259 0.27
260 0.29
261 0.29
262 0.29
263 0.24
264 0.21
265 0.17
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.2
270 0.21
271 0.23
272 0.27
273 0.35
274 0.42
275 0.48
276 0.55
277 0.6
278 0.7
279 0.76
280 0.83
281 0.84
282 0.81
283 0.82
284 0.78
285 0.77
286 0.73
287 0.69
288 0.65
289 0.6
290 0.54
291 0.52
292 0.5
293 0.43
294 0.39
295 0.33
296 0.29
297 0.25
298 0.24
299 0.2
300 0.19
301 0.18
302 0.16
303 0.16
304 0.14
305 0.12
306 0.13
307 0.12
308 0.13
309 0.11
310 0.12
311 0.16
312 0.17
313 0.17
314 0.18
315 0.18
316 0.16
317 0.18
318 0.17
319 0.13
320 0.15
321 0.16
322 0.2
323 0.22
324 0.24
325 0.23
326 0.23
327 0.23
328 0.2
329 0.19
330 0.13
331 0.11
332 0.09
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.07
350 0.1
351 0.15
352 0.23
353 0.29
354 0.39
355 0.46
356 0.51
357 0.57
358 0.63
359 0.67
360 0.69
361 0.73
362 0.75
363 0.79
364 0.85
365 0.91
366 0.9
367 0.9
368 0.9
369 0.89
370 0.9
371 0.9
372 0.9
373 0.9
374 0.93
375 0.95
376 0.95
377 0.95
378 0.95
379 0.95
380 0.96
381 0.96
382 0.96
383 0.96
384 0.97
385 0.97
386 0.97
387 0.98
388 0.98
389 0.98