Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397J423

Protein Details
Accession A0A397J423    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
141-166YEDIHEKSRRKRNKQNGKNDRKSRTDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
147-162KSRRKRNKQNGKNDRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
Amino Acid Sequences MYNSQLNINSNTNQQHFQHLHKFHLTNKPTKSHSISTTSPLPTDLLNINLPFPPVLSASEIAHKRIRSKICQKSPNAFFVYRKAFVDHLSRLSHKLKMTDVSRLVSHHWKCEKSEIKMVYENIAKEVEIELNNIRNKNLVYEDIHEKSRRKRNKQNGKNDRKSRTDNTFINFDAGANLVTTLDFSINNSLSQSDNDQSSSPSTNSKFPEINKEFSNNIHLGDNNIYEPNDVYHNQNFPELNYTYYLIDYENFFYPIDTCLDNPTSSSSSSGSSPTTSDFSDNPLFVDKIPDKCETY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.42
3 0.42
4 0.47
5 0.51
6 0.48
7 0.5
8 0.53
9 0.54
10 0.52
11 0.59
12 0.58
13 0.56
14 0.59
15 0.61
16 0.57
17 0.62
18 0.61
19 0.56
20 0.55
21 0.53
22 0.5
23 0.48
24 0.51
25 0.45
26 0.39
27 0.34
28 0.29
29 0.23
30 0.23
31 0.19
32 0.16
33 0.17
34 0.17
35 0.18
36 0.18
37 0.18
38 0.15
39 0.14
40 0.12
41 0.1
42 0.11
43 0.12
44 0.13
45 0.13
46 0.21
47 0.22
48 0.24
49 0.27
50 0.28
51 0.29
52 0.36
53 0.41
54 0.43
55 0.53
56 0.6
57 0.66
58 0.73
59 0.74
60 0.76
61 0.74
62 0.71
63 0.65
64 0.57
65 0.48
66 0.47
67 0.47
68 0.4
69 0.36
70 0.32
71 0.28
72 0.28
73 0.32
74 0.27
75 0.25
76 0.26
77 0.27
78 0.3
79 0.32
80 0.33
81 0.29
82 0.29
83 0.27
84 0.3
85 0.3
86 0.32
87 0.31
88 0.28
89 0.28
90 0.27
91 0.28
92 0.31
93 0.31
94 0.32
95 0.35
96 0.35
97 0.36
98 0.44
99 0.47
100 0.42
101 0.48
102 0.43
103 0.4
104 0.42
105 0.41
106 0.35
107 0.31
108 0.27
109 0.21
110 0.19
111 0.16
112 0.12
113 0.13
114 0.11
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.15
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.16
123 0.15
124 0.16
125 0.16
126 0.13
127 0.13
128 0.15
129 0.2
130 0.21
131 0.24
132 0.25
133 0.27
134 0.33
135 0.41
136 0.48
137 0.52
138 0.61
139 0.69
140 0.77
141 0.84
142 0.87
143 0.89
144 0.9
145 0.91
146 0.89
147 0.84
148 0.79
149 0.76
150 0.7
151 0.65
152 0.61
153 0.54
154 0.48
155 0.44
156 0.38
157 0.33
158 0.27
159 0.21
160 0.14
161 0.11
162 0.09
163 0.06
164 0.06
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.13
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.15
186 0.16
187 0.14
188 0.18
189 0.19
190 0.24
191 0.26
192 0.29
193 0.3
194 0.29
195 0.39
196 0.38
197 0.39
198 0.36
199 0.37
200 0.34
201 0.32
202 0.36
203 0.25
204 0.23
205 0.21
206 0.19
207 0.18
208 0.19
209 0.18
210 0.14
211 0.15
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.12
216 0.14
217 0.14
218 0.17
219 0.2
220 0.22
221 0.23
222 0.26
223 0.25
224 0.22
225 0.27
226 0.23
227 0.2
228 0.2
229 0.21
230 0.17
231 0.17
232 0.17
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.13
245 0.12
246 0.16
247 0.18
248 0.18
249 0.18
250 0.21
251 0.2
252 0.2
253 0.21
254 0.18
255 0.18
256 0.19
257 0.2
258 0.17
259 0.16
260 0.17
261 0.18
262 0.19
263 0.18
264 0.2
265 0.18
266 0.23
267 0.26
268 0.25
269 0.24
270 0.26
271 0.25
272 0.23
273 0.31
274 0.3
275 0.32
276 0.35