Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HDG8

Protein Details
Accession A0A397HDG8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
358-414SSTSHTHKHIGRPRRRQSLEEKEQKDKRRREKNRQAARRSRTRKRVQREQLENQINEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
365-402KHIGRPRRRQSLEEKEQKDKRRREKNRQAARRSRTRKR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000837  AP-1  
IPR004827  bZIP  
IPR046347  bZIP_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF07716  bZIP_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50217  BZIP  
PS00036  BZIP_BASIC  
CDD cd14691  bZIP_XBP1  
Amino Acid Sequences MSQLNKSSSLLWWNPSIEELNSKSQQFSNDQVPHFLIVHTTPAEIVPELSTLISIPQTFIEQHQRQQQQQQQPSQNFNFVNDNFVESLFPLSEPSSFHSYPFLNSSLHLSSSNSSTSSSSNSSSSASSYDASFPPQTSFNLIVNQDSSSTDLNIQPREEEPETCTFSQTQISSLNQSPILKQQQQQQQRLSQPPQLTLIHQPTNNNKSINTINAFNGIKISDNKISDNINNMPDIINNNNNNNISDSMTKNQLSSIHSTHSTHPIRNTHPIHPTHPIRNTHPTHLTHLTHPTLGIDYNSSNDSSIPSDNGNDSQDSSSPTPMELGFDITATIITTSSSSSSLSSSLSSSLSSSLQRQSSTSHTHKHIGRPRRRQSLEEKEQKDKRRREKNRQAARRSRTRKRVQREQLENQINELEIENDLLKNSVKEKDFEIEKLIKLLGEKRDEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.31
4 0.24
5 0.27
6 0.28
7 0.32
8 0.35
9 0.36
10 0.36
11 0.36
12 0.39
13 0.36
14 0.37
15 0.39
16 0.42
17 0.42
18 0.43
19 0.42
20 0.39
21 0.36
22 0.31
23 0.23
24 0.16
25 0.19
26 0.17
27 0.15
28 0.14
29 0.13
30 0.15
31 0.13
32 0.13
33 0.1
34 0.09
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.07
39 0.08
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.11
45 0.12
46 0.16
47 0.26
48 0.27
49 0.33
50 0.42
51 0.47
52 0.5
53 0.59
54 0.63
55 0.63
56 0.68
57 0.72
58 0.72
59 0.71
60 0.75
61 0.68
62 0.66
63 0.56
64 0.5
65 0.48
66 0.39
67 0.37
68 0.29
69 0.29
70 0.22
71 0.22
72 0.2
73 0.12
74 0.14
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.15
82 0.21
83 0.21
84 0.21
85 0.24
86 0.24
87 0.24
88 0.27
89 0.24
90 0.17
91 0.18
92 0.22
93 0.19
94 0.19
95 0.18
96 0.16
97 0.16
98 0.17
99 0.18
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.17
106 0.17
107 0.16
108 0.17
109 0.17
110 0.16
111 0.16
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.14
117 0.13
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.2
126 0.18
127 0.21
128 0.21
129 0.2
130 0.19
131 0.19
132 0.16
133 0.13
134 0.14
135 0.1
136 0.11
137 0.12
138 0.14
139 0.17
140 0.18
141 0.18
142 0.17
143 0.17
144 0.23
145 0.22
146 0.2
147 0.2
148 0.23
149 0.27
150 0.26
151 0.27
152 0.21
153 0.2
154 0.23
155 0.19
156 0.16
157 0.15
158 0.16
159 0.18
160 0.19
161 0.2
162 0.18
163 0.19
164 0.18
165 0.22
166 0.27
167 0.27
168 0.29
169 0.36
170 0.42
171 0.51
172 0.56
173 0.53
174 0.53
175 0.55
176 0.59
177 0.54
178 0.5
179 0.43
180 0.38
181 0.38
182 0.32
183 0.28
184 0.27
185 0.28
186 0.27
187 0.27
188 0.29
189 0.32
190 0.36
191 0.37
192 0.32
193 0.27
194 0.27
195 0.28
196 0.28
197 0.22
198 0.19
199 0.16
200 0.2
201 0.2
202 0.17
203 0.16
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.15
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.17
212 0.18
213 0.17
214 0.2
215 0.19
216 0.16
217 0.15
218 0.15
219 0.14
220 0.13
221 0.14
222 0.12
223 0.16
224 0.17
225 0.18
226 0.2
227 0.21
228 0.21
229 0.2
230 0.19
231 0.15
232 0.16
233 0.17
234 0.15
235 0.19
236 0.19
237 0.17
238 0.17
239 0.18
240 0.18
241 0.2
242 0.19
243 0.18
244 0.19
245 0.21
246 0.22
247 0.29
248 0.29
249 0.28
250 0.31
251 0.34
252 0.35
253 0.43
254 0.45
255 0.4
256 0.45
257 0.45
258 0.44
259 0.47
260 0.49
261 0.46
262 0.49
263 0.48
264 0.46
265 0.53
266 0.53
267 0.49
268 0.51
269 0.46
270 0.45
271 0.47
272 0.44
273 0.37
274 0.4
275 0.36
276 0.29
277 0.27
278 0.22
279 0.17
280 0.15
281 0.13
282 0.09
283 0.08
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.13
296 0.15
297 0.15
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.17
303 0.17
304 0.17
305 0.16
306 0.16
307 0.15
308 0.14
309 0.15
310 0.11
311 0.12
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.07
318 0.07
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.13
339 0.16
340 0.2
341 0.21
342 0.22
343 0.22
344 0.24
345 0.28
346 0.35
347 0.37
348 0.39
349 0.41
350 0.47
351 0.51
352 0.58
353 0.61
354 0.63
355 0.69
356 0.73
357 0.78
358 0.82
359 0.81
360 0.77
361 0.79
362 0.79
363 0.8
364 0.79
365 0.74
366 0.74
367 0.78
368 0.82
369 0.82
370 0.81
371 0.81
372 0.82
373 0.87
374 0.89
375 0.92
376 0.93
377 0.94
378 0.94
379 0.94
380 0.93
381 0.92
382 0.91
383 0.9
384 0.9
385 0.89
386 0.9
387 0.89
388 0.89
389 0.91
390 0.91
391 0.91
392 0.91
393 0.89
394 0.88
395 0.87
396 0.77
397 0.68
398 0.58
399 0.47
400 0.38
401 0.3
402 0.2
403 0.11
404 0.13
405 0.12
406 0.11
407 0.11
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.17
412 0.22
413 0.23
414 0.25
415 0.28
416 0.34
417 0.37
418 0.36
419 0.4
420 0.38
421 0.36
422 0.37
423 0.34
424 0.27
425 0.27
426 0.32
427 0.32