Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JCK4

Protein Details
Accession A0A397JCK4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
397-432IGNPLVSRRKGRPETKRYKSSTEKKPRAKYTCGTCGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
404-424RRKGRPETKRYKSSTEKKPRA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 12, mito 1.5, cyto 1, pero 1, golg 1, cysk 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031052  FHY3/FAR1  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MSENLPKNLKSKLCDQYDDFVHDFYLCRNSIYEELFYERWTNLIEKYSSVKGYLMRALYPSRQAWARAFTSKIFTAGIQTTSRVEGLNNIIKRELKANSTLCDLANVLDARLGNESQWNRFFEYRTLSNCMGITSVSNDLFPEIDNEMSKYLTPHILSAERLEMSQCFILLQDSSADVADGFIEDLYDAKQIRLKSIIAEIGEKNFREIWKIVDMRPENKKYTHFIVVVDPISYLCSCMSNISRGIICRHYFRVMMISTIAGFQIQMIPSRWYIDNQKDTNVMMETCYFVNQEAMQNFSGMMLIPNPSTIPITVTTVLRSAAKKKVKYGELWGLARQAAQFAVEHDSYGVMIAWLRKFIDQQKEIVVTQIGSVRNQDNLEIQVDDSNKENESESEQIGNPLVSRRKGRPETKRYKSSTEKKPRAKYTCGTCGQSGHNSARCQNRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.57
3 0.56
4 0.55
5 0.57
6 0.49
7 0.39
8 0.34
9 0.29
10 0.26
11 0.22
12 0.24
13 0.18
14 0.18
15 0.19
16 0.22
17 0.25
18 0.27
19 0.26
20 0.22
21 0.27
22 0.26
23 0.27
24 0.25
25 0.21
26 0.2
27 0.2
28 0.2
29 0.17
30 0.22
31 0.21
32 0.21
33 0.26
34 0.29
35 0.28
36 0.27
37 0.26
38 0.24
39 0.27
40 0.29
41 0.26
42 0.23
43 0.25
44 0.28
45 0.29
46 0.32
47 0.29
48 0.28
49 0.3
50 0.32
51 0.32
52 0.34
53 0.35
54 0.33
55 0.34
56 0.32
57 0.35
58 0.32
59 0.3
60 0.25
61 0.21
62 0.21
63 0.21
64 0.22
65 0.18
66 0.19
67 0.19
68 0.19
69 0.19
70 0.15
71 0.13
72 0.14
73 0.19
74 0.26
75 0.26
76 0.26
77 0.28
78 0.29
79 0.3
80 0.32
81 0.28
82 0.23
83 0.29
84 0.31
85 0.3
86 0.32
87 0.32
88 0.27
89 0.25
90 0.23
91 0.16
92 0.18
93 0.16
94 0.12
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.14
99 0.14
100 0.1
101 0.16
102 0.18
103 0.21
104 0.25
105 0.26
106 0.28
107 0.29
108 0.31
109 0.27
110 0.32
111 0.32
112 0.32
113 0.35
114 0.32
115 0.32
116 0.3
117 0.27
118 0.21
119 0.17
120 0.14
121 0.1
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.09
138 0.1
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.16
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.1
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.1
178 0.1
179 0.12
180 0.13
181 0.13
182 0.12
183 0.14
184 0.15
185 0.13
186 0.15
187 0.14
188 0.15
189 0.17
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.19
198 0.21
199 0.21
200 0.27
201 0.29
202 0.31
203 0.38
204 0.4
205 0.35
206 0.35
207 0.37
208 0.33
209 0.35
210 0.34
211 0.27
212 0.24
213 0.24
214 0.24
215 0.22
216 0.19
217 0.15
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.08
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.13
232 0.15
233 0.18
234 0.18
235 0.19
236 0.21
237 0.22
238 0.21
239 0.2
240 0.22
241 0.18
242 0.17
243 0.14
244 0.12
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.06
252 0.06
253 0.08
254 0.09
255 0.11
256 0.12
257 0.14
258 0.15
259 0.15
260 0.21
261 0.26
262 0.33
263 0.32
264 0.34
265 0.32
266 0.32
267 0.31
268 0.26
269 0.19
270 0.12
271 0.11
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.13
280 0.12
281 0.15
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.12
286 0.11
287 0.07
288 0.07
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.12
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.16
306 0.17
307 0.19
308 0.26
309 0.34
310 0.35
311 0.41
312 0.49
313 0.49
314 0.5
315 0.53
316 0.52
317 0.51
318 0.51
319 0.45
320 0.39
321 0.35
322 0.33
323 0.25
324 0.17
325 0.11
326 0.1
327 0.09
328 0.08
329 0.13
330 0.12
331 0.12
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.09
337 0.05
338 0.06
339 0.1
340 0.1
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.18
345 0.25
346 0.34
347 0.32
348 0.33
349 0.37
350 0.39
351 0.38
352 0.36
353 0.29
354 0.19
355 0.19
356 0.22
357 0.18
358 0.16
359 0.19
360 0.19
361 0.21
362 0.21
363 0.21
364 0.18
365 0.19
366 0.2
367 0.18
368 0.17
369 0.18
370 0.18
371 0.18
372 0.18
373 0.18
374 0.17
375 0.17
376 0.18
377 0.15
378 0.19
379 0.21
380 0.2
381 0.22
382 0.22
383 0.22
384 0.22
385 0.21
386 0.17
387 0.21
388 0.26
389 0.28
390 0.34
391 0.39
392 0.48
393 0.58
394 0.67
395 0.71
396 0.76
397 0.82
398 0.86
399 0.89
400 0.85
401 0.84
402 0.85
403 0.84
404 0.84
405 0.85
406 0.85
407 0.86
408 0.9
409 0.91
410 0.88
411 0.85
412 0.82
413 0.8
414 0.8
415 0.76
416 0.7
417 0.62
418 0.59
419 0.56
420 0.54
421 0.51
422 0.49
423 0.48
424 0.47
425 0.52