Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397J7U4

Protein Details
Accession A0A397J7U4    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
274-294ELTSKKKKKSNENPRNIHNNKHydrophilic
539-559ELTSKKKKKSNENPRNIHNNKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-283RKGHPSNKRIKNAIELTSKKKKKS
525-548RKGHPSNKRIKNAIELTSKKKKKS
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MSKSPVATNNLVPIIHGSALNAFQSALEVQKEKTEFTIYRQNNYNTLYKITSPHEFQCASILTSYSYKKIQEQLLQLSNYKCEEISRQSIEKIFNVQRHEKETNGRIVKYESNSNYFTCSCKYTQFLGFICRHIFRTATQLNLTELPPSIFYEHWKKNPSEEQLIKNYIAFTTGSSNISSSNLQQQSQQLSNNEFDNYEYMLTRLLQKVKRFVTQNPSTAITFYNSFNKIFTFKIENISKPQSTNSTEQPTILNPSVIHRKGHPSNKRIKNAIELTSKKKKKSNENPRNIHNNKENFISENQKEVNNPDTYKNPNNIHEYDFLFEDLNFEENQNNEKCLYCDIILSNPLSLKVSKYLNDIKIGKISANTAVEQYEFCRIHHGKEVIIPYRIEKGYPLNIDFINLPNRILNMRSELLKIIKGQKYSEYRVNAIKGIQEIGAAKFNNPLVQMSYFESFQPGYYGSKGLVVIIETLNEMFLKTDILTTSLCKPQSTSQYITQIENISKPQSTNSTEQPTILNPSVIHRKGHPSNKRIKNAIELTSKKKKKSNENPRNIHNNKENFISENQKEVNNPDTYKNPNNIHEYDFLFEDLNFEENQNNEKCLYCDIILSNPLSLKVSKYLNDIKIGKISANTAVEQYEFCRIHHGKEVIIPYRIEKGYPLNIDFINLPNRILNMRSELLKIIKGQKYSEYRVNAIKGIQEIGAAKFNNPLVQMSYFESFQPGYYGSKGLVVIIETLNXTFIYFNIKIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.21
3 0.19
4 0.14
5 0.14
6 0.16
7 0.16
8 0.14
9 0.11
10 0.1
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.14
15 0.15
16 0.16
17 0.22
18 0.24
19 0.23
20 0.24
21 0.28
22 0.26
23 0.3
24 0.4
25 0.37
26 0.42
27 0.49
28 0.5
29 0.48
30 0.51
31 0.51
32 0.43
33 0.45
34 0.41
35 0.35
36 0.37
37 0.36
38 0.38
39 0.36
40 0.37
41 0.39
42 0.37
43 0.35
44 0.35
45 0.32
46 0.28
47 0.24
48 0.22
49 0.18
50 0.23
51 0.25
52 0.23
53 0.25
54 0.26
55 0.29
56 0.35
57 0.39
58 0.41
59 0.45
60 0.5
61 0.53
62 0.53
63 0.52
64 0.47
65 0.44
66 0.39
67 0.33
68 0.25
69 0.21
70 0.25
71 0.27
72 0.33
73 0.36
74 0.37
75 0.39
76 0.43
77 0.44
78 0.4
79 0.41
80 0.4
81 0.39
82 0.43
83 0.48
84 0.48
85 0.53
86 0.54
87 0.49
88 0.51
89 0.53
90 0.55
91 0.53
92 0.49
93 0.43
94 0.45
95 0.47
96 0.42
97 0.45
98 0.39
99 0.39
100 0.4
101 0.39
102 0.39
103 0.34
104 0.33
105 0.27
106 0.27
107 0.24
108 0.26
109 0.29
110 0.29
111 0.32
112 0.35
113 0.33
114 0.37
115 0.37
116 0.36
117 0.36
118 0.34
119 0.32
120 0.28
121 0.28
122 0.21
123 0.29
124 0.28
125 0.28
126 0.28
127 0.27
128 0.28
129 0.29
130 0.28
131 0.2
132 0.18
133 0.16
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.13
138 0.18
139 0.26
140 0.32
141 0.38
142 0.43
143 0.42
144 0.47
145 0.55
146 0.56
147 0.56
148 0.55
149 0.54
150 0.56
151 0.58
152 0.51
153 0.44
154 0.38
155 0.28
156 0.24
157 0.18
158 0.12
159 0.13
160 0.15
161 0.15
162 0.14
163 0.15
164 0.14
165 0.16
166 0.16
167 0.13
168 0.21
169 0.22
170 0.22
171 0.25
172 0.28
173 0.31
174 0.33
175 0.35
176 0.28
177 0.29
178 0.31
179 0.29
180 0.26
181 0.21
182 0.19
183 0.16
184 0.15
185 0.12
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.13
191 0.16
192 0.22
193 0.26
194 0.3
195 0.37
196 0.4
197 0.45
198 0.45
199 0.46
200 0.49
201 0.51
202 0.51
203 0.46
204 0.45
205 0.39
206 0.37
207 0.32
208 0.24
209 0.19
210 0.17
211 0.21
212 0.2
213 0.2
214 0.2
215 0.2
216 0.2
217 0.19
218 0.2
219 0.19
220 0.19
221 0.27
222 0.3
223 0.31
224 0.35
225 0.39
226 0.37
227 0.33
228 0.34
229 0.3
230 0.31
231 0.33
232 0.33
233 0.34
234 0.33
235 0.33
236 0.32
237 0.27
238 0.28
239 0.25
240 0.2
241 0.14
242 0.18
243 0.27
244 0.27
245 0.27
246 0.24
247 0.32
248 0.39
249 0.49
250 0.53
251 0.52
252 0.61
253 0.69
254 0.73
255 0.68
256 0.62
257 0.61
258 0.57
259 0.55
260 0.53
261 0.48
262 0.49
263 0.56
264 0.6
265 0.56
266 0.56
267 0.57
268 0.6
269 0.67
270 0.71
271 0.72
272 0.77
273 0.79
274 0.81
275 0.84
276 0.75
277 0.7
278 0.66
279 0.59
280 0.5
281 0.48
282 0.41
283 0.33
284 0.34
285 0.34
286 0.27
287 0.27
288 0.27
289 0.24
290 0.24
291 0.24
292 0.26
293 0.22
294 0.23
295 0.21
296 0.23
297 0.28
298 0.32
299 0.36
300 0.34
301 0.35
302 0.39
303 0.39
304 0.38
305 0.35
306 0.31
307 0.26
308 0.23
309 0.2
310 0.15
311 0.13
312 0.11
313 0.08
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.13
320 0.12
321 0.13
322 0.12
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.14
327 0.1
328 0.11
329 0.1
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.09
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.11
340 0.12
341 0.13
342 0.17
343 0.22
344 0.23
345 0.28
346 0.28
347 0.25
348 0.26
349 0.25
350 0.21
351 0.16
352 0.15
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.14
362 0.13
363 0.13
364 0.21
365 0.21
366 0.22
367 0.28
368 0.28
369 0.21
370 0.25
371 0.29
372 0.23
373 0.24
374 0.23
375 0.18
376 0.22
377 0.22
378 0.18
379 0.15
380 0.16
381 0.18
382 0.2
383 0.2
384 0.16
385 0.16
386 0.17
387 0.17
388 0.16
389 0.16
390 0.14
391 0.14
392 0.12
393 0.13
394 0.13
395 0.13
396 0.12
397 0.11
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.14
402 0.15
403 0.15
404 0.17
405 0.21
406 0.23
407 0.23
408 0.23
409 0.28
410 0.32
411 0.35
412 0.38
413 0.33
414 0.32
415 0.34
416 0.35
417 0.29
418 0.25
419 0.22
420 0.16
421 0.15
422 0.13
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.13
427 0.12
428 0.12
429 0.13
430 0.13
431 0.14
432 0.13
433 0.13
434 0.11
435 0.12
436 0.13
437 0.13
438 0.14
439 0.13
440 0.13
441 0.13
442 0.11
443 0.11
444 0.1
445 0.09
446 0.09
447 0.1
448 0.1
449 0.09
450 0.1
451 0.1
452 0.09
453 0.08
454 0.07
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.08
471 0.1
472 0.13
473 0.17
474 0.18
475 0.17
476 0.19
477 0.23
478 0.31
479 0.34
480 0.34
481 0.34
482 0.41
483 0.43
484 0.41
485 0.38
486 0.33
487 0.29
488 0.26
489 0.24
490 0.18
491 0.17
492 0.17
493 0.17
494 0.19
495 0.22
496 0.24
497 0.28
498 0.33
499 0.32
500 0.33
501 0.32
502 0.27
503 0.28
504 0.25
505 0.2
506 0.14
507 0.18
508 0.27
509 0.27
510 0.27
511 0.24
512 0.32
513 0.39
514 0.49
515 0.53
516 0.52
517 0.61
518 0.69
519 0.73
520 0.68
521 0.62
522 0.61
523 0.57
524 0.55
525 0.53
526 0.48
527 0.49
528 0.56
529 0.6
530 0.56
531 0.56
532 0.57
533 0.6
534 0.67
535 0.71
536 0.72
537 0.77
538 0.79
539 0.81
540 0.84
541 0.75
542 0.7
543 0.66
544 0.59
545 0.5
546 0.48
547 0.41
548 0.33
549 0.34
550 0.34
551 0.27
552 0.27
553 0.27
554 0.24
555 0.24
556 0.24
557 0.26
558 0.22
559 0.23
560 0.21
561 0.23
562 0.28
563 0.32
564 0.36
565 0.34
566 0.35
567 0.39
568 0.39
569 0.38
570 0.35
571 0.31
572 0.26
573 0.23
574 0.2
575 0.15
576 0.13
577 0.11
578 0.08
579 0.09
580 0.08
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.13
585 0.12
586 0.13
587 0.12
588 0.13
589 0.13
590 0.13
591 0.14
592 0.1
593 0.11
594 0.1
595 0.11
596 0.12
597 0.12
598 0.11
599 0.09
600 0.1
601 0.09
602 0.09
603 0.09
604 0.11
605 0.12
606 0.13
607 0.17
608 0.22
609 0.23
610 0.28
611 0.28
612 0.25
613 0.26
614 0.25
615 0.21
616 0.16
617 0.15
618 0.13
619 0.13
620 0.12
621 0.1
622 0.1
623 0.1
624 0.1
625 0.1
626 0.14
627 0.13
628 0.13
629 0.21
630 0.21
631 0.22
632 0.28
633 0.28
634 0.21
635 0.25
636 0.29
637 0.23
638 0.24
639 0.23
640 0.18
641 0.22
642 0.22
643 0.18
644 0.15
645 0.16
646 0.18
647 0.2
648 0.2
649 0.16
650 0.16
651 0.17
652 0.17
653 0.16
654 0.16
655 0.14
656 0.14
657 0.12
658 0.13
659 0.13
660 0.13
661 0.12
662 0.11
663 0.12
664 0.13
665 0.13
666 0.14
667 0.15
668 0.15
669 0.17
670 0.21
671 0.23
672 0.23
673 0.23
674 0.28
675 0.32
676 0.35
677 0.38
678 0.33
679 0.32
680 0.34
681 0.35
682 0.29
683 0.25
684 0.22
685 0.16
686 0.15
687 0.13
688 0.1
689 0.1
690 0.1
691 0.13
692 0.12
693 0.12
694 0.13
695 0.13
696 0.14
697 0.13
698 0.13
699 0.11
700 0.12
701 0.13
702 0.13
703 0.14
704 0.13
705 0.13
706 0.13
707 0.11
708 0.11
709 0.1
710 0.09
711 0.09
712 0.1
713 0.1
714 0.09
715 0.1
716 0.1
717 0.09
718 0.08
719 0.07
720 0.08
721 0.08
722 0.09
723 0.07
724 0.08
725 0.09
726 0.09
727 0.09
728 0.08
729 0.12