Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HPE9

Protein Details
Accession A0A397HPE9    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-39VDEPKVVKSKKRKHEVTTHTTPIHydrophilic
279-318GDEGKETKKSKKSRSTKKNDKLEPKKKRVSRTKIKSSEIVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-205RKLNKKTTAKTTKKSVSTKKK
284-312ETKKSKKSRSTKKNDKLEPKKKRVSRTKI
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044198  DEK  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR003034  SAP_dom  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
PS50800  SAP  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MSEGEQELINKSEFISVDEPKVVKSKKRKHEVTTHTTPIERPRRQARPVVPYGSQIPETKSRMKKPIEVGQGEGIPLGQIPPIVRAIDKLKTTDDIIKGLHKLLYGRIGTKHDIKSHIRAFSGFVVGTPVDEMVFKEKLEKWKIAGLKEMCSLFNLKSSGDKASIVERLFEFLKKPHDTSTDKERKLNKKTTAKTTKKSVSTKKKTPRDIYFAKQREIFEAKDDNESATRQEIQKQMSEAWNELSEKEKKPYVSLAENANKSIEASAASSNAITSVEDGDEGKETKKSKKSRSTKKNDKLEPKKKRVSRTKIKSSEIVYTEDELEDEGKTDEAVKPNEDSKSLEEDMSESDELSDALDEIEDEIEDESDNDNDEPPLKKAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.22
4 0.25
5 0.29
6 0.29
7 0.27
8 0.35
9 0.35
10 0.4
11 0.48
12 0.56
13 0.62
14 0.73
15 0.79
16 0.79
17 0.85
18 0.86
19 0.84
20 0.83
21 0.79
22 0.7
23 0.64
24 0.59
25 0.58
26 0.59
27 0.54
28 0.53
29 0.57
30 0.63
31 0.67
32 0.73
33 0.71
34 0.7
35 0.72
36 0.69
37 0.6
38 0.54
39 0.53
40 0.47
41 0.42
42 0.34
43 0.31
44 0.34
45 0.37
46 0.43
47 0.48
48 0.52
49 0.57
50 0.6
51 0.63
52 0.63
53 0.67
54 0.66
55 0.6
56 0.55
57 0.5
58 0.46
59 0.39
60 0.31
61 0.22
62 0.13
63 0.11
64 0.08
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.08
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.14
73 0.17
74 0.21
75 0.23
76 0.22
77 0.23
78 0.24
79 0.26
80 0.29
81 0.27
82 0.24
83 0.23
84 0.25
85 0.24
86 0.24
87 0.22
88 0.17
89 0.16
90 0.16
91 0.21
92 0.19
93 0.21
94 0.23
95 0.25
96 0.28
97 0.34
98 0.36
99 0.33
100 0.38
101 0.4
102 0.44
103 0.46
104 0.45
105 0.39
106 0.35
107 0.34
108 0.29
109 0.27
110 0.19
111 0.14
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.09
116 0.08
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.09
121 0.1
122 0.09
123 0.13
124 0.17
125 0.25
126 0.29
127 0.3
128 0.27
129 0.32
130 0.36
131 0.33
132 0.37
133 0.3
134 0.28
135 0.3
136 0.29
137 0.24
138 0.21
139 0.22
140 0.15
141 0.16
142 0.15
143 0.12
144 0.14
145 0.15
146 0.16
147 0.15
148 0.15
149 0.12
150 0.14
151 0.18
152 0.16
153 0.16
154 0.14
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.14
159 0.12
160 0.19
161 0.2
162 0.21
163 0.21
164 0.27
165 0.29
166 0.32
167 0.4
168 0.43
169 0.43
170 0.47
171 0.54
172 0.56
173 0.61
174 0.66
175 0.64
176 0.64
177 0.67
178 0.72
179 0.75
180 0.72
181 0.69
182 0.69
183 0.66
184 0.64
185 0.67
186 0.67
187 0.67
188 0.69
189 0.74
190 0.76
191 0.78
192 0.79
193 0.79
194 0.75
195 0.71
196 0.68
197 0.64
198 0.65
199 0.6
200 0.54
201 0.5
202 0.44
203 0.41
204 0.39
205 0.33
206 0.26
207 0.27
208 0.25
209 0.24
210 0.24
211 0.2
212 0.18
213 0.18
214 0.15
215 0.13
216 0.14
217 0.13
218 0.18
219 0.21
220 0.22
221 0.23
222 0.24
223 0.25
224 0.26
225 0.26
226 0.22
227 0.19
228 0.19
229 0.18
230 0.17
231 0.2
232 0.21
233 0.22
234 0.25
235 0.26
236 0.25
237 0.26
238 0.3
239 0.29
240 0.27
241 0.28
242 0.33
243 0.36
244 0.37
245 0.36
246 0.32
247 0.27
248 0.24
249 0.21
250 0.13
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.14
271 0.17
272 0.25
273 0.33
274 0.41
275 0.5
276 0.6
277 0.7
278 0.77
279 0.85
280 0.88
281 0.91
282 0.92
283 0.92
284 0.91
285 0.92
286 0.92
287 0.91
288 0.91
289 0.9
290 0.9
291 0.86
292 0.87
293 0.87
294 0.87
295 0.87
296 0.86
297 0.87
298 0.86
299 0.83
300 0.78
301 0.71
302 0.67
303 0.58
304 0.52
305 0.42
306 0.36
307 0.32
308 0.27
309 0.23
310 0.16
311 0.15
312 0.11
313 0.1
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.1
318 0.13
319 0.18
320 0.2
321 0.21
322 0.24
323 0.28
324 0.3
325 0.29
326 0.28
327 0.26
328 0.31
329 0.3
330 0.28
331 0.24
332 0.23
333 0.23
334 0.25
335 0.21
336 0.14
337 0.13
338 0.13
339 0.13
340 0.12
341 0.1
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.11
357 0.11
358 0.12
359 0.13
360 0.16
361 0.18
362 0.2