Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JF29

Protein Details
Accession A0A397JF29    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MASPDKKKKRHSKRLSLHNLLNIVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-14KKKKRHSKR
Subcellular Location(s) nucl 8.5, mito 8, cyto_nucl 5.5, E.R. 5, golg 2, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008949  Isoprenoid_synthase_dom_sf  
IPR002060  Squ/phyt_synthse  
IPR006449  Squal_synth-like  
IPR044844  Trans_IPPS_euk-type  
Gene Ontology GO:0004310  F:farnesyl-diphosphate farnesyltransferase activity  
GO:0051996  F:squalene synthase activity  
GO:0008610  P:lipid biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00494  SQS_PSY  
Amino Acid Sequences MASPDKKKKRHSKRLSLHNLLNIVFPQKINSPSPLSRIPANYLTHEQKREKCTELFKLVSNSYRRMISKLDTDMNIVMSIYYMLLRGMDTIEDDMTIPVEKKIPLLRNFHKLIQQRGWTFTKNGPNEKHRQLLVEFDVVIEEFLSFSPEIQDIFVDVAKDMGNGMADYILLQEKSKYHVITIEDYDRYCFHVCSVFCLGFGRIMNTLNPELPDTDENYYLIKDVSFFIQKLDIIKDFREDFLQNRVYWPRAIWGQYVNDVSEILDPNKKEKALNCLSAMTFNALSHLINSLEFLSKIDDPVVFEIIALSIAVEFAYLTSIFRNHEVFIKHMTYQGINEVKSQCKNLRDICILFKSNVKTIMKKNDIKDFRNYLKINKSCKKIEQWCDRYLSKQQNQYVAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.95
2 0.95
3 0.92
4 0.86
5 0.8
6 0.73
7 0.62
8 0.54
9 0.44
10 0.36
11 0.29
12 0.23
13 0.21
14 0.22
15 0.26
16 0.27
17 0.3
18 0.35
19 0.35
20 0.41
21 0.43
22 0.41
23 0.41
24 0.41
25 0.41
26 0.41
27 0.41
28 0.4
29 0.43
30 0.48
31 0.51
32 0.55
33 0.58
34 0.59
35 0.63
36 0.63
37 0.61
38 0.58
39 0.59
40 0.59
41 0.59
42 0.54
43 0.5
44 0.5
45 0.49
46 0.5
47 0.47
48 0.42
49 0.38
50 0.41
51 0.38
52 0.35
53 0.36
54 0.32
55 0.34
56 0.36
57 0.38
58 0.33
59 0.34
60 0.32
61 0.29
62 0.25
63 0.19
64 0.13
65 0.09
66 0.08
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.11
87 0.1
88 0.13
89 0.2
90 0.27
91 0.32
92 0.41
93 0.45
94 0.5
95 0.53
96 0.53
97 0.54
98 0.51
99 0.52
100 0.5
101 0.52
102 0.46
103 0.48
104 0.49
105 0.44
106 0.42
107 0.41
108 0.43
109 0.42
110 0.48
111 0.48
112 0.52
113 0.57
114 0.59
115 0.57
116 0.49
117 0.47
118 0.39
119 0.38
120 0.33
121 0.27
122 0.22
123 0.17
124 0.16
125 0.13
126 0.12
127 0.08
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.11
162 0.14
163 0.13
164 0.12
165 0.16
166 0.18
167 0.19
168 0.21
169 0.21
170 0.19
171 0.19
172 0.2
173 0.17
174 0.18
175 0.16
176 0.13
177 0.11
178 0.15
179 0.14
180 0.18
181 0.2
182 0.17
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.14
187 0.14
188 0.11
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.11
216 0.11
217 0.12
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.17
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.16
227 0.15
228 0.21
229 0.24
230 0.21
231 0.24
232 0.26
233 0.25
234 0.24
235 0.23
236 0.19
237 0.19
238 0.21
239 0.18
240 0.19
241 0.19
242 0.21
243 0.22
244 0.19
245 0.16
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.13
250 0.12
251 0.14
252 0.14
253 0.17
254 0.2
255 0.2
256 0.2
257 0.21
258 0.29
259 0.31
260 0.35
261 0.33
262 0.32
263 0.31
264 0.3
265 0.28
266 0.21
267 0.16
268 0.12
269 0.12
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.1
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.12
287 0.13
288 0.14
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.07
295 0.05
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.08
307 0.1
308 0.12
309 0.14
310 0.13
311 0.18
312 0.2
313 0.21
314 0.24
315 0.26
316 0.24
317 0.26
318 0.27
319 0.23
320 0.22
321 0.28
322 0.27
323 0.25
324 0.29
325 0.3
326 0.34
327 0.36
328 0.41
329 0.39
330 0.39
331 0.46
332 0.46
333 0.49
334 0.5
335 0.5
336 0.5
337 0.52
338 0.5
339 0.44
340 0.44
341 0.41
342 0.38
343 0.44
344 0.41
345 0.4
346 0.46
347 0.56
348 0.59
349 0.62
350 0.64
351 0.67
352 0.71
353 0.68
354 0.69
355 0.67
356 0.64
357 0.67
358 0.64
359 0.61
360 0.64
361 0.67
362 0.69
363 0.68
364 0.7
365 0.67
366 0.73
367 0.75
368 0.75
369 0.78
370 0.79
371 0.77
372 0.76
373 0.76
374 0.7
375 0.65
376 0.65
377 0.66
378 0.62
379 0.64
380 0.63