Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397J812

Protein Details
Accession A0A397J812    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
425-444NKTNNTVKSKSIKSRNQLHHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
155-175QEKLRKSTEELKNAKERRKVK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MILEFRVTNYQIGFVYKSRRFMEINNGVSDSIPNKNIRLRRLRTSESVKAKATKISTLKKLCLETLYKNRHEISKIGMAPYWLLKPLFEKFTSDELERLENLNPRLRNEDSELWRKHFADHFPDIFRKCDFPGQDWRKFYFTQRNEQTERLKRAQEKLRKSTEELKNAKERRKVKILNLNPPPTRKTYGWTKLTPLQREFKKTLRTNSFQVKTGPTMMTVPVGWLPPDCRKPTNLTNGICPQALLPIKYLPKSSNEKNENYGRFYSNQSTTKSQTPSIRNNTKPIHSISASTSSSRAQSQTKREKSAVSSPTAVNRNITSNLKRSREIETPTHPSKKLRCSNGQSILNLQKITTPQTTSVTTRKINTATARKINTATTRKVNPPSTSSSSPSLSSSSSNTFVSKITKGSQISKISRTSSTDTKSNKTNNTVKSKSIKSRNQLHH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.31
3 0.32
4 0.39
5 0.39
6 0.42
7 0.41
8 0.42
9 0.49
10 0.49
11 0.49
12 0.45
13 0.44
14 0.39
15 0.38
16 0.36
17 0.28
18 0.24
19 0.24
20 0.23
21 0.26
22 0.33
23 0.39
24 0.46
25 0.53
26 0.55
27 0.6
28 0.66
29 0.69
30 0.7
31 0.73
32 0.73
33 0.71
34 0.7
35 0.65
36 0.62
37 0.58
38 0.55
39 0.49
40 0.48
41 0.48
42 0.51
43 0.55
44 0.56
45 0.58
46 0.58
47 0.58
48 0.51
49 0.48
50 0.45
51 0.44
52 0.49
53 0.54
54 0.51
55 0.53
56 0.53
57 0.53
58 0.51
59 0.43
60 0.39
61 0.38
62 0.37
63 0.34
64 0.33
65 0.28
66 0.27
67 0.28
68 0.23
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.18
73 0.22
74 0.25
75 0.23
76 0.25
77 0.25
78 0.3
79 0.33
80 0.3
81 0.28
82 0.24
83 0.26
84 0.24
85 0.23
86 0.21
87 0.23
88 0.25
89 0.3
90 0.3
91 0.3
92 0.35
93 0.34
94 0.34
95 0.35
96 0.4
97 0.4
98 0.48
99 0.49
100 0.47
101 0.5
102 0.47
103 0.45
104 0.42
105 0.4
106 0.37
107 0.4
108 0.39
109 0.39
110 0.44
111 0.42
112 0.38
113 0.35
114 0.3
115 0.26
116 0.29
117 0.26
118 0.25
119 0.35
120 0.41
121 0.47
122 0.48
123 0.49
124 0.47
125 0.47
126 0.49
127 0.49
128 0.44
129 0.48
130 0.51
131 0.56
132 0.56
133 0.59
134 0.62
135 0.6
136 0.63
137 0.57
138 0.56
139 0.53
140 0.58
141 0.63
142 0.62
143 0.63
144 0.64
145 0.67
146 0.64
147 0.64
148 0.65
149 0.63
150 0.65
151 0.59
152 0.56
153 0.58
154 0.61
155 0.64
156 0.62
157 0.59
158 0.55
159 0.62
160 0.61
161 0.59
162 0.64
163 0.64
164 0.66
165 0.69
166 0.69
167 0.62
168 0.61
169 0.55
170 0.49
171 0.47
172 0.37
173 0.34
174 0.37
175 0.43
176 0.46
177 0.44
178 0.44
179 0.46
180 0.51
181 0.52
182 0.45
183 0.45
184 0.43
185 0.47
186 0.47
187 0.46
188 0.49
189 0.49
190 0.54
191 0.53
192 0.53
193 0.52
194 0.58
195 0.54
196 0.46
197 0.44
198 0.37
199 0.31
200 0.3
201 0.25
202 0.16
203 0.15
204 0.13
205 0.12
206 0.1
207 0.09
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.09
213 0.14
214 0.19
215 0.21
216 0.21
217 0.23
218 0.28
219 0.33
220 0.41
221 0.42
222 0.38
223 0.4
224 0.42
225 0.42
226 0.36
227 0.3
228 0.21
229 0.19
230 0.19
231 0.15
232 0.13
233 0.16
234 0.18
235 0.19
236 0.2
237 0.16
238 0.21
239 0.27
240 0.3
241 0.36
242 0.4
243 0.41
244 0.45
245 0.51
246 0.48
247 0.45
248 0.43
249 0.35
250 0.31
251 0.33
252 0.32
253 0.3
254 0.32
255 0.32
256 0.33
257 0.34
258 0.38
259 0.37
260 0.37
261 0.38
262 0.41
263 0.46
264 0.52
265 0.58
266 0.55
267 0.6
268 0.59
269 0.55
270 0.52
271 0.46
272 0.41
273 0.33
274 0.32
275 0.27
276 0.3
277 0.28
278 0.25
279 0.23
280 0.19
281 0.2
282 0.2
283 0.2
284 0.21
285 0.27
286 0.36
287 0.46
288 0.51
289 0.54
290 0.54
291 0.54
292 0.53
293 0.55
294 0.49
295 0.41
296 0.38
297 0.34
298 0.4
299 0.41
300 0.36
301 0.29
302 0.26
303 0.26
304 0.27
305 0.31
306 0.29
307 0.33
308 0.41
309 0.43
310 0.44
311 0.43
312 0.45
313 0.45
314 0.47
315 0.44
316 0.43
317 0.48
318 0.53
319 0.57
320 0.53
321 0.53
322 0.55
323 0.6
324 0.61
325 0.61
326 0.63
327 0.65
328 0.72
329 0.75
330 0.72
331 0.62
332 0.61
333 0.59
334 0.52
335 0.44
336 0.35
337 0.29
338 0.27
339 0.31
340 0.27
341 0.22
342 0.22
343 0.25
344 0.28
345 0.3
346 0.34
347 0.35
348 0.35
349 0.36
350 0.38
351 0.37
352 0.39
353 0.43
354 0.47
355 0.49
356 0.53
357 0.54
358 0.52
359 0.52
360 0.52
361 0.53
362 0.5
363 0.48
364 0.48
365 0.51
366 0.56
367 0.63
368 0.64
369 0.58
370 0.56
371 0.58
372 0.57
373 0.55
374 0.52
375 0.48
376 0.43
377 0.41
378 0.38
379 0.31
380 0.26
381 0.24
382 0.24
383 0.23
384 0.24
385 0.24
386 0.23
387 0.22
388 0.23
389 0.25
390 0.24
391 0.23
392 0.24
393 0.29
394 0.32
395 0.37
396 0.43
397 0.48
398 0.51
399 0.53
400 0.55
401 0.52
402 0.52
403 0.51
404 0.49
405 0.48
406 0.48
407 0.5
408 0.51
409 0.52
410 0.57
411 0.6
412 0.61
413 0.61
414 0.65
415 0.66
416 0.71
417 0.7
418 0.69
419 0.69
420 0.72
421 0.73
422 0.75
423 0.75
424 0.74