Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397I7J1

Protein Details
Accession A0A397I7J1    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
231-277RRERDRYRDSDRDRRRSRSRSRERERHRRHRTSSRERREREYDRRGSBasic
279-300DDYDRKRRYDDEKGLERRRSKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-278RSGRRERDRYRDSDRDRRRSRSRSRERERHRRHRTSSRERREREYDRRGSH
282-303DRKRRYDDEKGLERRRSKSPRN
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MKQSNKLETWGSETTMNLTNILYQNIQASPYFKQLYELKTYHEVIDEIYNHVESLEPFLKGTTASTAFCLLYKLWTLRLTVKQINGLIEHSDSPHIRALGFMYLRYVCKPAHLWDWFENYLDDEEQIQIQGGPRPVSITIGKLCRQLLTDQKWLGTILPRIPVPIARDIDQKLKEKPNRSLSRRDSPTYDLEPLKQEEGDRDYRRSRSQSVERGPSRPHRYRDHDYERSGRRERDRYRDSDRDRRRSRSRSRERERHRRHRTSSRERREREYDRRGSHDDYDRKRRYDDEKGLERRRSKSPRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.29
3 0.27
4 0.21
5 0.19
6 0.22
7 0.23
8 0.25
9 0.21
10 0.16
11 0.18
12 0.18
13 0.2
14 0.16
15 0.17
16 0.17
17 0.24
18 0.25
19 0.22
20 0.27
21 0.3
22 0.34
23 0.39
24 0.37
25 0.35
26 0.38
27 0.4
28 0.35
29 0.32
30 0.27
31 0.21
32 0.26
33 0.22
34 0.19
35 0.18
36 0.18
37 0.16
38 0.16
39 0.15
40 0.1
41 0.16
42 0.16
43 0.15
44 0.15
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.15
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.13
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.16
57 0.12
58 0.12
59 0.14
60 0.14
61 0.16
62 0.17
63 0.19
64 0.23
65 0.29
66 0.33
67 0.33
68 0.34
69 0.34
70 0.34
71 0.34
72 0.28
73 0.24
74 0.19
75 0.17
76 0.16
77 0.13
78 0.15
79 0.14
80 0.15
81 0.16
82 0.15
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.15
87 0.15
88 0.13
89 0.13
90 0.14
91 0.15
92 0.16
93 0.17
94 0.12
95 0.15
96 0.17
97 0.17
98 0.23
99 0.24
100 0.27
101 0.28
102 0.33
103 0.31
104 0.3
105 0.27
106 0.2
107 0.19
108 0.16
109 0.13
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.14
127 0.17
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.18
132 0.18
133 0.19
134 0.24
135 0.26
136 0.29
137 0.27
138 0.27
139 0.26
140 0.25
141 0.23
142 0.18
143 0.15
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.17
152 0.17
153 0.17
154 0.2
155 0.22
156 0.28
157 0.3
158 0.31
159 0.31
160 0.39
161 0.43
162 0.46
163 0.52
164 0.56
165 0.61
166 0.63
167 0.67
168 0.65
169 0.7
170 0.69
171 0.63
172 0.56
173 0.5
174 0.51
175 0.44
176 0.41
177 0.32
178 0.29
179 0.29
180 0.28
181 0.25
182 0.2
183 0.18
184 0.16
185 0.2
186 0.27
187 0.27
188 0.3
189 0.33
190 0.37
191 0.42
192 0.43
193 0.42
194 0.43
195 0.48
196 0.53
197 0.55
198 0.62
199 0.59
200 0.58
201 0.6
202 0.61
203 0.62
204 0.6
205 0.59
206 0.58
207 0.64
208 0.69
209 0.74
210 0.74
211 0.71
212 0.69
213 0.72
214 0.7
215 0.69
216 0.67
217 0.64
218 0.62
219 0.65
220 0.68
221 0.69
222 0.69
223 0.68
224 0.71
225 0.74
226 0.74
227 0.75
228 0.78
229 0.79
230 0.79
231 0.82
232 0.83
233 0.83
234 0.86
235 0.86
236 0.87
237 0.88
238 0.91
239 0.92
240 0.93
241 0.94
242 0.94
243 0.94
244 0.94
245 0.93
246 0.91
247 0.91
248 0.92
249 0.92
250 0.92
251 0.92
252 0.91
253 0.86
254 0.85
255 0.84
256 0.83
257 0.82
258 0.81
259 0.8
260 0.75
261 0.77
262 0.74
263 0.69
264 0.66
265 0.66
266 0.65
267 0.65
268 0.7
269 0.71
270 0.68
271 0.67
272 0.66
273 0.64
274 0.65
275 0.66
276 0.64
277 0.68
278 0.75
279 0.81
280 0.83
281 0.81
282 0.75
283 0.76