Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397GAX5

Protein Details
Accession A0A397GAX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-143DNNQNNKNNDNNKNNNKNRNKNKIKINNNDINKHydrophilic
201-220LQKHIKKTSKLSKNNNNNDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MYTSKQQKQRPNLQKGLSEESEEELDLKFEGEEEEENSSDTEEPVVFPFSQKSSTTSTRTKFSNKPPSTGEEYLNMVKSEANKIPNVFVAKKNIRENIRGGGLSDSDNDNDNNQNNKNNDNNKNNNKNRNKNKIKINNNDINKIIDNNNNVKMAPWVKRGWANTKTTLIEEQDKQNRENGLVNEEWEKIFLERFEKLREELQKHIKKTSKLSKNNNNNDDDDDDDDDSMKLPKSKDEAGWLKFCYGLDYPLSPLSPLGEGFGSFGGSFGSFGSFGESFGGGSRGDDNDDDNNNNEKSSSYSKKGKELKKEEQEEDNEEVATMMLPSLNIISRLDQATTISLLSYHTKWLDTGMTITKSQWIFALLIRIDQLLTSNQMVTLREMCRKCITIRKNLVIRKDLMKELFTVDNEDDTTLASLNMIITIIRNYFGQRDLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.74
3 0.72
4 0.62
5 0.54
6 0.45
7 0.39
8 0.35
9 0.29
10 0.24
11 0.16
12 0.14
13 0.11
14 0.11
15 0.08
16 0.07
17 0.08
18 0.09
19 0.1
20 0.11
21 0.14
22 0.14
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.1
30 0.11
31 0.12
32 0.14
33 0.13
34 0.14
35 0.17
36 0.17
37 0.21
38 0.21
39 0.23
40 0.27
41 0.33
42 0.39
43 0.44
44 0.45
45 0.46
46 0.5
47 0.54
48 0.56
49 0.61
50 0.65
51 0.6
52 0.61
53 0.6
54 0.61
55 0.62
56 0.56
57 0.47
58 0.39
59 0.4
60 0.38
61 0.36
62 0.3
63 0.22
64 0.2
65 0.21
66 0.24
67 0.25
68 0.25
69 0.26
70 0.27
71 0.28
72 0.3
73 0.33
74 0.31
75 0.3
76 0.37
77 0.4
78 0.46
79 0.5
80 0.53
81 0.52
82 0.53
83 0.52
84 0.47
85 0.44
86 0.38
87 0.32
88 0.27
89 0.24
90 0.21
91 0.2
92 0.16
93 0.13
94 0.15
95 0.14
96 0.14
97 0.17
98 0.2
99 0.24
100 0.25
101 0.31
102 0.31
103 0.35
104 0.42
105 0.47
106 0.53
107 0.56
108 0.64
109 0.68
110 0.78
111 0.81
112 0.84
113 0.85
114 0.86
115 0.87
116 0.88
117 0.87
118 0.84
119 0.87
120 0.86
121 0.86
122 0.84
123 0.83
124 0.8
125 0.74
126 0.7
127 0.6
128 0.52
129 0.43
130 0.36
131 0.3
132 0.26
133 0.27
134 0.28
135 0.3
136 0.27
137 0.26
138 0.24
139 0.25
140 0.26
141 0.26
142 0.26
143 0.24
144 0.26
145 0.31
146 0.34
147 0.38
148 0.39
149 0.39
150 0.38
151 0.4
152 0.38
153 0.35
154 0.34
155 0.28
156 0.27
157 0.25
158 0.29
159 0.33
160 0.34
161 0.33
162 0.35
163 0.33
164 0.3
165 0.32
166 0.25
167 0.22
168 0.2
169 0.21
170 0.19
171 0.19
172 0.17
173 0.13
174 0.13
175 0.09
176 0.1
177 0.09
178 0.1
179 0.12
180 0.13
181 0.16
182 0.16
183 0.17
184 0.22
185 0.28
186 0.29
187 0.33
188 0.42
189 0.45
190 0.45
191 0.51
192 0.51
193 0.47
194 0.52
195 0.56
196 0.56
197 0.59
198 0.67
199 0.7
200 0.76
201 0.82
202 0.78
203 0.71
204 0.62
205 0.54
206 0.46
207 0.37
208 0.28
209 0.2
210 0.15
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.1
218 0.1
219 0.12
220 0.15
221 0.17
222 0.17
223 0.24
224 0.3
225 0.3
226 0.33
227 0.31
228 0.28
229 0.27
230 0.26
231 0.21
232 0.15
233 0.14
234 0.12
235 0.12
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.1
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.11
274 0.14
275 0.16
276 0.16
277 0.17
278 0.21
279 0.2
280 0.2
281 0.18
282 0.14
283 0.17
284 0.24
285 0.27
286 0.29
287 0.37
288 0.4
289 0.49
290 0.58
291 0.61
292 0.64
293 0.67
294 0.71
295 0.73
296 0.77
297 0.71
298 0.69
299 0.65
300 0.59
301 0.53
302 0.44
303 0.33
304 0.27
305 0.23
306 0.17
307 0.13
308 0.08
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.09
318 0.12
319 0.13
320 0.13
321 0.12
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.11
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.12
330 0.12
331 0.14
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.17
336 0.17
337 0.14
338 0.16
339 0.18
340 0.2
341 0.2
342 0.2
343 0.24
344 0.23
345 0.22
346 0.2
347 0.17
348 0.15
349 0.16
350 0.23
351 0.17
352 0.18
353 0.18
354 0.17
355 0.15
356 0.14
357 0.15
358 0.09
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.13
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.22
367 0.23
368 0.3
369 0.31
370 0.34
371 0.37
372 0.39
373 0.41
374 0.46
375 0.49
376 0.52
377 0.6
378 0.65
379 0.68
380 0.71
381 0.73
382 0.69
383 0.66
384 0.62
385 0.58
386 0.55
387 0.49
388 0.45
389 0.38
390 0.37
391 0.36
392 0.3
393 0.29
394 0.24
395 0.23
396 0.23
397 0.22
398 0.18
399 0.14
400 0.15
401 0.1
402 0.09
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.07
410 0.09
411 0.1
412 0.11
413 0.12
414 0.14
415 0.16