Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JQA1

Protein Details
Accession A0A397JQA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-209DDEFENKNDKKKNKKNKNKKDKDNIEKKIPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-201DKKKNKKNKNKKDKD
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 11.5, mito 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MADVFSDPSKKSFWRRHTAALPGSVKPVESKTGATNMVFGAQHTYGEMLAVSAAEALSHSQHSQSHLSSSTSTRSNITRDLPNQEEELFSSASNHHHSNNQQQQSSIANFSDFLSETNDEWNDRLDDEDLSIIGKLKIENRSEDDEDYEDEEDLSSLSMNNNNYNNDYDDDDDEGENNDDEFENKNDKKKNKKNKNKKDKDNIEKKIPELVVTAQQKVTDKEKKSTIGIKAEIAGLVQDPMNSINTMKLSSSFNNNSRQSEAERIRLNTRFKKFKDILQSLNVDLAALRQLSWSGIPNELRPMAWQLLLGYLPCNSDRRVATLARKRKEYEDSVSQAYSRGISGLDQTIWHQIHIDVPRTNPGTALYQYETTQQCLERILYVWAIRHPASGYVQGINDLVTPFFQVFLSAYIDENPEIYDPSNLPKEVLNVIEADSFWCLSKLLDGIQDNYTFAQPGIQRQINKLKDLINRIDEPLATHLQEEGLEFIQFAFRWMNCLLMREMSLKNTIRMWDTYLAEGTDGFSEFHLYVCAAFLVKWSDKIRSMDFQGIMMFLQSLPTSAWNEKDIELLLSEAYMWKTLFHNAPSHLLRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.64
3 0.7
4 0.73
5 0.75
6 0.7
7 0.69
8 0.63
9 0.54
10 0.53
11 0.45
12 0.39
13 0.33
14 0.3
15 0.26
16 0.24
17 0.25
18 0.24
19 0.29
20 0.31
21 0.28
22 0.27
23 0.23
24 0.25
25 0.22
26 0.19
27 0.19
28 0.17
29 0.17
30 0.15
31 0.16
32 0.11
33 0.12
34 0.11
35 0.06
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.04
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.05
44 0.07
45 0.09
46 0.1
47 0.12
48 0.14
49 0.18
50 0.22
51 0.22
52 0.24
53 0.25
54 0.26
55 0.26
56 0.27
57 0.28
58 0.27
59 0.27
60 0.27
61 0.28
62 0.3
63 0.32
64 0.34
65 0.38
66 0.39
67 0.45
68 0.45
69 0.44
70 0.42
71 0.38
72 0.33
73 0.27
74 0.25
75 0.18
76 0.15
77 0.15
78 0.15
79 0.18
80 0.21
81 0.21
82 0.2
83 0.25
84 0.3
85 0.39
86 0.47
87 0.5
88 0.47
89 0.45
90 0.46
91 0.45
92 0.43
93 0.34
94 0.25
95 0.19
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.14
100 0.12
101 0.14
102 0.15
103 0.15
104 0.19
105 0.2
106 0.18
107 0.18
108 0.19
109 0.16
110 0.14
111 0.15
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.09
122 0.1
123 0.15
124 0.21
125 0.23
126 0.27
127 0.3
128 0.36
129 0.37
130 0.36
131 0.33
132 0.28
133 0.27
134 0.26
135 0.22
136 0.15
137 0.13
138 0.12
139 0.1
140 0.08
141 0.07
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.1
146 0.11
147 0.15
148 0.18
149 0.2
150 0.21
151 0.23
152 0.23
153 0.21
154 0.22
155 0.19
156 0.18
157 0.18
158 0.17
159 0.15
160 0.13
161 0.13
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.1
169 0.11
170 0.19
171 0.21
172 0.28
173 0.35
174 0.43
175 0.54
176 0.62
177 0.71
178 0.74
179 0.83
180 0.88
181 0.92
182 0.96
183 0.95
184 0.95
185 0.95
186 0.94
187 0.94
188 0.93
189 0.88
190 0.86
191 0.77
192 0.67
193 0.62
194 0.52
195 0.41
196 0.32
197 0.27
198 0.26
199 0.26
200 0.26
201 0.2
202 0.22
203 0.22
204 0.23
205 0.29
206 0.3
207 0.31
208 0.34
209 0.37
210 0.38
211 0.39
212 0.43
213 0.41
214 0.38
215 0.36
216 0.32
217 0.29
218 0.27
219 0.23
220 0.17
221 0.12
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.11
237 0.12
238 0.19
239 0.22
240 0.26
241 0.33
242 0.35
243 0.35
244 0.34
245 0.34
246 0.3
247 0.34
248 0.33
249 0.3
250 0.31
251 0.31
252 0.34
253 0.38
254 0.43
255 0.43
256 0.47
257 0.5
258 0.48
259 0.56
260 0.53
261 0.52
262 0.55
263 0.51
264 0.47
265 0.43
266 0.43
267 0.34
268 0.33
269 0.28
270 0.17
271 0.13
272 0.1
273 0.07
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.08
281 0.08
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.11
289 0.13
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.09
302 0.09
303 0.13
304 0.13
305 0.16
306 0.19
307 0.21
308 0.28
309 0.36
310 0.44
311 0.43
312 0.46
313 0.45
314 0.46
315 0.48
316 0.44
317 0.41
318 0.39
319 0.39
320 0.37
321 0.35
322 0.31
323 0.27
324 0.22
325 0.17
326 0.1
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.14
336 0.14
337 0.14
338 0.13
339 0.12
340 0.17
341 0.2
342 0.23
343 0.18
344 0.19
345 0.24
346 0.25
347 0.25
348 0.2
349 0.19
350 0.18
351 0.18
352 0.2
353 0.16
354 0.15
355 0.16
356 0.22
357 0.21
358 0.19
359 0.2
360 0.18
361 0.17
362 0.17
363 0.17
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.13
371 0.15
372 0.14
373 0.14
374 0.13
375 0.14
376 0.15
377 0.16
378 0.16
379 0.15
380 0.15
381 0.14
382 0.14
383 0.12
384 0.11
385 0.09
386 0.07
387 0.06
388 0.07
389 0.06
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.08
395 0.1
396 0.09
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.13
409 0.17
410 0.16
411 0.17
412 0.16
413 0.18
414 0.18
415 0.18
416 0.15
417 0.11
418 0.12
419 0.12
420 0.11
421 0.1
422 0.09
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.07
427 0.06
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.13
432 0.14
433 0.16
434 0.19
435 0.19
436 0.18
437 0.19
438 0.18
439 0.13
440 0.12
441 0.14
442 0.13
443 0.18
444 0.25
445 0.28
446 0.29
447 0.35
448 0.45
449 0.43
450 0.44
451 0.42
452 0.4
453 0.42
454 0.48
455 0.47
456 0.43
457 0.41
458 0.41
459 0.4
460 0.33
461 0.29
462 0.27
463 0.24
464 0.19
465 0.17
466 0.16
467 0.15
468 0.15
469 0.13
470 0.11
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.08
475 0.1
476 0.1
477 0.11
478 0.12
479 0.11
480 0.15
481 0.15
482 0.21
483 0.19
484 0.22
485 0.22
486 0.2
487 0.22
488 0.23
489 0.24
490 0.21
491 0.28
492 0.27
493 0.27
494 0.28
495 0.29
496 0.28
497 0.28
498 0.29
499 0.28
500 0.27
501 0.27
502 0.26
503 0.24
504 0.21
505 0.19
506 0.16
507 0.12
508 0.11
509 0.09
510 0.08
511 0.11
512 0.1
513 0.11
514 0.11
515 0.09
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.07
520 0.07
521 0.09
522 0.15
523 0.16
524 0.22
525 0.24
526 0.28
527 0.34
528 0.38
529 0.41
530 0.4
531 0.44
532 0.44
533 0.42
534 0.38
535 0.33
536 0.29
537 0.24
538 0.19
539 0.15
540 0.08
541 0.09
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.11
546 0.16
547 0.18
548 0.2
549 0.21
550 0.23
551 0.23
552 0.24
553 0.22
554 0.19
555 0.17
556 0.15
557 0.12
558 0.1
559 0.1
560 0.1
561 0.1
562 0.12
563 0.11
564 0.12
565 0.14
566 0.2
567 0.25
568 0.26
569 0.31
570 0.31
571 0.4