Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HX48

Protein Details
Accession A0A397HX48    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-42QGFCTKSTKSSNKTAKTRRRQAKSNEDNSNEVHydrophilic
497-522YDQLPARIKKLKKKLKKIILGKVSSKHydrophilic
613-655NNDGSSQKDGKNKKRKRSADEGEKNAKKKKRKAERGGGGKISWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
457-464KLKGKKRK
503-539RIKKLKKKLKKIILGKVSSKYRKQALETYRKIGKRAK
622-656GKNKKRKRSADEGEKNAKKKKRKAERGGGGKISWK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, mito_nucl 13.666, cyto_nucl 13.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR028094  RTC4_C  
IPR001005  SANT/Myb  
Pfam View protein in Pfam  
PF13921  Myb_DNA-bind_6  
PF14474  RTC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
Amino Acid Sequences MVINTNLDKIQGFCTKSTKSSNKTAKTRRRQAKSNEDNSNEVSNKVNKVSNTEREVNNPRGHSLTSRWLDRQQCDEMGIKYKKGKFTAEEDRKVKQALNDYKTLHNLDDDGIRDLIYGRNDTEHKKFWISIATQLGTRPIRTLALHVQRQYHPFNYTGTWSPEEDEELNRLVLIYHHDWTTIGYQMDRTGQQCRDRWRDYVEYQNEMHLGKWSNEEEEKLTNIIVDLTKEHHADITTDWGIPWHVVSERMEHKRSHGQCSRKWRYSLRLKYELKNGIIAKWSDSDSYILVNKLLKCGAPEELEVNWEELISNENWGPWTPEVLKECWRRLKYTVKDFSAKSFRDVAVEILDRYKKTTKTYETPITFCNPRTVYPSPSPSPYASSSSKGPSSSLKYKSSKLKNSTLSKESDASDLDQESDKESTNQTIECPYCFEPLPNPLPPKLKEKLAQIDSNNGKLKGKKRKSFFDDDEFCKLHEAELKIISQGISKGYPQTIDYDQLPARIKKLKKKLKKIILGKVSSKYRKQALETYRKIGKRAKLPMSVMSRFEALRPGYFGPKGAEIIMETLMDMFTKKKNVLTAELAKPQSIVEYLQEVLVPETCIRLIREDYNDNNDGSSQKDGKNKKRKRSADEGEKNAKKKKRKAERGGGGKISWKEAKIIMKESAEYGECLNGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.41
4 0.5
5 0.53
6 0.52
7 0.6
8 0.67
9 0.71
10 0.78
11 0.83
12 0.84
13 0.86
14 0.91
15 0.91
16 0.9
17 0.9
18 0.89
19 0.9
20 0.9
21 0.88
22 0.87
23 0.8
24 0.75
25 0.68
26 0.66
27 0.55
28 0.46
29 0.41
30 0.37
31 0.37
32 0.37
33 0.38
34 0.31
35 0.38
36 0.45
37 0.47
38 0.49
39 0.52
40 0.5
41 0.55
42 0.62
43 0.61
44 0.59
45 0.53
46 0.48
47 0.44
48 0.44
49 0.39
50 0.36
51 0.39
52 0.38
53 0.41
54 0.43
55 0.47
56 0.53
57 0.53
58 0.54
59 0.49
60 0.44
61 0.42
62 0.42
63 0.38
64 0.41
65 0.4
66 0.38
67 0.42
68 0.45
69 0.49
70 0.49
71 0.51
72 0.45
73 0.5
74 0.57
75 0.59
76 0.63
77 0.61
78 0.6
79 0.58
80 0.55
81 0.49
82 0.43
83 0.43
84 0.44
85 0.45
86 0.48
87 0.48
88 0.5
89 0.52
90 0.49
91 0.39
92 0.3
93 0.26
94 0.22
95 0.23
96 0.21
97 0.19
98 0.17
99 0.16
100 0.15
101 0.15
102 0.17
103 0.16
104 0.15
105 0.13
106 0.18
107 0.21
108 0.26
109 0.31
110 0.33
111 0.34
112 0.35
113 0.35
114 0.32
115 0.37
116 0.33
117 0.34
118 0.34
119 0.32
120 0.29
121 0.29
122 0.34
123 0.28
124 0.27
125 0.22
126 0.18
127 0.2
128 0.19
129 0.24
130 0.26
131 0.34
132 0.38
133 0.39
134 0.44
135 0.45
136 0.49
137 0.49
138 0.43
139 0.36
140 0.32
141 0.32
142 0.28
143 0.28
144 0.27
145 0.27
146 0.26
147 0.24
148 0.24
149 0.23
150 0.24
151 0.21
152 0.19
153 0.17
154 0.16
155 0.15
156 0.13
157 0.13
158 0.1
159 0.09
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.17
167 0.17
168 0.15
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.14
173 0.16
174 0.17
175 0.17
176 0.2
177 0.25
178 0.31
179 0.35
180 0.43
181 0.48
182 0.49
183 0.5
184 0.5
185 0.51
186 0.48
187 0.54
188 0.49
189 0.44
190 0.41
191 0.39
192 0.35
193 0.29
194 0.26
195 0.2
196 0.18
197 0.15
198 0.18
199 0.18
200 0.19
201 0.2
202 0.21
203 0.19
204 0.19
205 0.18
206 0.15
207 0.14
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.12
222 0.15
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.06
231 0.06
232 0.08
233 0.09
234 0.15
235 0.22
236 0.28
237 0.3
238 0.29
239 0.33
240 0.4
241 0.43
242 0.46
243 0.46
244 0.47
245 0.5
246 0.61
247 0.66
248 0.63
249 0.64
250 0.6
251 0.62
252 0.66
253 0.7
254 0.67
255 0.68
256 0.66
257 0.65
258 0.68
259 0.64
260 0.53
261 0.49
262 0.41
263 0.32
264 0.32
265 0.28
266 0.22
267 0.18
268 0.18
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.09
276 0.1
277 0.13
278 0.12
279 0.13
280 0.13
281 0.12
282 0.11
283 0.12
284 0.13
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.11
292 0.09
293 0.07
294 0.07
295 0.05
296 0.07
297 0.06
298 0.07
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.1
304 0.07
305 0.1
306 0.1
307 0.14
308 0.15
309 0.17
310 0.25
311 0.27
312 0.32
313 0.37
314 0.38
315 0.37
316 0.4
317 0.48
318 0.47
319 0.52
320 0.54
321 0.49
322 0.52
323 0.5
324 0.51
325 0.49
326 0.42
327 0.34
328 0.3
329 0.27
330 0.24
331 0.24
332 0.19
333 0.14
334 0.14
335 0.12
336 0.13
337 0.14
338 0.13
339 0.15
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.28
344 0.31
345 0.34
346 0.41
347 0.46
348 0.44
349 0.44
350 0.42
351 0.39
352 0.36
353 0.31
354 0.31
355 0.23
356 0.22
357 0.27
358 0.27
359 0.29
360 0.31
361 0.36
362 0.32
363 0.33
364 0.34
365 0.28
366 0.29
367 0.26
368 0.27
369 0.23
370 0.24
371 0.24
372 0.24
373 0.25
374 0.22
375 0.21
376 0.2
377 0.25
378 0.3
379 0.33
380 0.38
381 0.39
382 0.44
383 0.53
384 0.57
385 0.59
386 0.58
387 0.6
388 0.62
389 0.66
390 0.66
391 0.6
392 0.54
393 0.48
394 0.44
395 0.37
396 0.3
397 0.24
398 0.19
399 0.17
400 0.14
401 0.13
402 0.12
403 0.11
404 0.12
405 0.12
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.12
410 0.13
411 0.13
412 0.12
413 0.16
414 0.16
415 0.15
416 0.18
417 0.17
418 0.18
419 0.18
420 0.18
421 0.16
422 0.21
423 0.25
424 0.26
425 0.27
426 0.29
427 0.35
428 0.37
429 0.41
430 0.38
431 0.39
432 0.38
433 0.42
434 0.47
435 0.46
436 0.48
437 0.42
438 0.48
439 0.45
440 0.47
441 0.44
442 0.36
443 0.35
444 0.35
445 0.44
446 0.46
447 0.54
448 0.55
449 0.59
450 0.68
451 0.72
452 0.76
453 0.73
454 0.72
455 0.68
456 0.65
457 0.65
458 0.55
459 0.48
460 0.4
461 0.34
462 0.26
463 0.24
464 0.22
465 0.18
466 0.2
467 0.2
468 0.18
469 0.19
470 0.17
471 0.13
472 0.12
473 0.12
474 0.11
475 0.11
476 0.13
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.17
481 0.17
482 0.18
483 0.18
484 0.21
485 0.2
486 0.25
487 0.29
488 0.25
489 0.28
490 0.33
491 0.38
492 0.43
493 0.54
494 0.6
495 0.66
496 0.76
497 0.82
498 0.85
499 0.89
500 0.88
501 0.87
502 0.86
503 0.81
504 0.74
505 0.71
506 0.7
507 0.68
508 0.63
509 0.59
510 0.56
511 0.55
512 0.55
513 0.56
514 0.57
515 0.61
516 0.61
517 0.61
518 0.63
519 0.6
520 0.61
521 0.59
522 0.55
523 0.54
524 0.59
525 0.6
526 0.58
527 0.59
528 0.62
529 0.63
530 0.59
531 0.51
532 0.43
533 0.38
534 0.31
535 0.3
536 0.28
537 0.21
538 0.19
539 0.21
540 0.22
541 0.24
542 0.25
543 0.26
544 0.22
545 0.22
546 0.22
547 0.19
548 0.17
549 0.13
550 0.14
551 0.13
552 0.1
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.07
557 0.07
558 0.08
559 0.11
560 0.15
561 0.17
562 0.19
563 0.24
564 0.28
565 0.32
566 0.38
567 0.42
568 0.44
569 0.5
570 0.48
571 0.43
572 0.4
573 0.35
574 0.29
575 0.22
576 0.17
577 0.11
578 0.13
579 0.13
580 0.13
581 0.13
582 0.12
583 0.13
584 0.13
585 0.12
586 0.1
587 0.11
588 0.11
589 0.13
590 0.14
591 0.17
592 0.19
593 0.24
594 0.3
595 0.35
596 0.38
597 0.43
598 0.44
599 0.4
600 0.37
601 0.33
602 0.28
603 0.24
604 0.26
605 0.24
606 0.27
607 0.36
608 0.45
609 0.54
610 0.65
611 0.72
612 0.76
613 0.82
614 0.87
615 0.87
616 0.88
617 0.88
618 0.88
619 0.89
620 0.87
621 0.87
622 0.85
623 0.83
624 0.81
625 0.79
626 0.78
627 0.77
628 0.79
629 0.8
630 0.84
631 0.88
632 0.9
633 0.92
634 0.92
635 0.91
636 0.84
637 0.75
638 0.71
639 0.62
640 0.57
641 0.5
642 0.41
643 0.35
644 0.36
645 0.43
646 0.4
647 0.43
648 0.41
649 0.4
650 0.4
651 0.38
652 0.37
653 0.3
654 0.26
655 0.22