Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397GKN0

Protein Details
Accession A0A397GKN0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
455-481AYEQGKSELKRRSKKTFKYKSSSAESSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
464-469KRRSKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MKPLKPLLLCYPDFGLEGSHGQQFGGDFSFYLSIISCERIKQLNRTINEIIAIYNHKIEEIINYAEEQRNNGAPAIIDPREVQELRHIRAQINCLTRIRDNYLQILYDLEWLQDMDQQRNRTRLTVNIPRRRRPLYQNQQQPVRPSLNTLLPPRSPPLSAQIQRRNLSPEGSTFTQTRPSTRSNTSTSSDSPSRSISPIENTRRIQRDFLTGQYDSEFEVEYRPIINLPRNRNIEVEPEDQLLINFDGSDNNNNLEPEREEPNEEDQDIEAYNNENLQQFLQQIHEIEPEPQLIAERDMATFVVKPPKFSGTPNEDAQEWLQGFLVAAKANGWDDDRKRAVFGTYLKKEPREWYCEWVEDHNAHTWTELRTAFIETHCTDDWREQWHEELRSLKQRRGETVDEYFHQVRKLAKRVNLNAGCTLPYFIRGLLPDIKAIVKTHEPADLATAYGKAKAYEQGKSELKRRSKKTFKYKSSSAESSDSSDDKEEEGRRKRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.22
3 0.16
4 0.18
5 0.18
6 0.18
7 0.16
8 0.16
9 0.16
10 0.15
11 0.15
12 0.14
13 0.12
14 0.1
15 0.11
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.19
26 0.26
27 0.3
28 0.36
29 0.45
30 0.5
31 0.5
32 0.56
33 0.54
34 0.47
35 0.45
36 0.37
37 0.27
38 0.22
39 0.24
40 0.18
41 0.19
42 0.17
43 0.16
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.14
50 0.16
51 0.19
52 0.23
53 0.24
54 0.23
55 0.22
56 0.22
57 0.23
58 0.22
59 0.19
60 0.15
61 0.18
62 0.22
63 0.19
64 0.18
65 0.17
66 0.19
67 0.25
68 0.25
69 0.22
70 0.26
71 0.31
72 0.33
73 0.38
74 0.38
75 0.34
76 0.39
77 0.42
78 0.4
79 0.38
80 0.4
81 0.37
82 0.39
83 0.39
84 0.4
85 0.42
86 0.4
87 0.38
88 0.38
89 0.37
90 0.33
91 0.3
92 0.28
93 0.21
94 0.19
95 0.16
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.12
101 0.14
102 0.18
103 0.23
104 0.29
105 0.33
106 0.39
107 0.39
108 0.39
109 0.39
110 0.38
111 0.42
112 0.47
113 0.53
114 0.58
115 0.64
116 0.69
117 0.74
118 0.73
119 0.7
120 0.69
121 0.7
122 0.71
123 0.73
124 0.76
125 0.76
126 0.78
127 0.74
128 0.69
129 0.62
130 0.55
131 0.45
132 0.39
133 0.36
134 0.33
135 0.35
136 0.35
137 0.34
138 0.31
139 0.33
140 0.32
141 0.31
142 0.26
143 0.22
144 0.24
145 0.29
146 0.34
147 0.41
148 0.47
149 0.53
150 0.53
151 0.54
152 0.53
153 0.45
154 0.41
155 0.33
156 0.26
157 0.24
158 0.24
159 0.25
160 0.21
161 0.21
162 0.27
163 0.27
164 0.27
165 0.26
166 0.28
167 0.31
168 0.34
169 0.38
170 0.34
171 0.38
172 0.38
173 0.36
174 0.34
175 0.35
176 0.33
177 0.29
178 0.27
179 0.25
180 0.24
181 0.21
182 0.21
183 0.17
184 0.21
185 0.29
186 0.33
187 0.38
188 0.38
189 0.44
190 0.48
191 0.48
192 0.44
193 0.37
194 0.37
195 0.32
196 0.33
197 0.31
198 0.25
199 0.24
200 0.22
201 0.21
202 0.14
203 0.13
204 0.11
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.09
213 0.15
214 0.2
215 0.26
216 0.34
217 0.36
218 0.38
219 0.38
220 0.37
221 0.36
222 0.35
223 0.31
224 0.25
225 0.22
226 0.21
227 0.19
228 0.18
229 0.14
230 0.09
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.07
236 0.09
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.14
246 0.14
247 0.15
248 0.16
249 0.2
250 0.2
251 0.19
252 0.17
253 0.13
254 0.13
255 0.12
256 0.1
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.12
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.1
290 0.18
291 0.17
292 0.19
293 0.21
294 0.25
295 0.25
296 0.26
297 0.32
298 0.3
299 0.34
300 0.35
301 0.34
302 0.3
303 0.3
304 0.29
305 0.25
306 0.17
307 0.13
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.1
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.09
320 0.14
321 0.16
322 0.23
323 0.26
324 0.25
325 0.26
326 0.26
327 0.25
328 0.24
329 0.28
330 0.31
331 0.33
332 0.39
333 0.41
334 0.42
335 0.44
336 0.47
337 0.46
338 0.43
339 0.42
340 0.41
341 0.42
342 0.43
343 0.42
344 0.37
345 0.35
346 0.29
347 0.28
348 0.27
349 0.25
350 0.22
351 0.21
352 0.2
353 0.17
354 0.21
355 0.19
356 0.15
357 0.16
358 0.17
359 0.18
360 0.17
361 0.21
362 0.17
363 0.21
364 0.2
365 0.21
366 0.2
367 0.23
368 0.25
369 0.26
370 0.28
371 0.24
372 0.29
373 0.34
374 0.35
375 0.35
376 0.36
377 0.36
378 0.44
379 0.47
380 0.45
381 0.45
382 0.46
383 0.49
384 0.51
385 0.49
386 0.44
387 0.47
388 0.47
389 0.42
390 0.45
391 0.42
392 0.37
393 0.34
394 0.31
395 0.32
396 0.36
397 0.44
398 0.44
399 0.47
400 0.55
401 0.6
402 0.68
403 0.65
404 0.6
405 0.54
406 0.48
407 0.43
408 0.34
409 0.3
410 0.19
411 0.17
412 0.15
413 0.13
414 0.14
415 0.14
416 0.18
417 0.22
418 0.22
419 0.21
420 0.22
421 0.23
422 0.21
423 0.22
424 0.22
425 0.2
426 0.22
427 0.23
428 0.25
429 0.24
430 0.23
431 0.25
432 0.21
433 0.18
434 0.16
435 0.17
436 0.14
437 0.16
438 0.17
439 0.14
440 0.15
441 0.21
442 0.24
443 0.27
444 0.29
445 0.35
446 0.42
447 0.46
448 0.52
449 0.55
450 0.61
451 0.66
452 0.72
453 0.74
454 0.78
455 0.83
456 0.87
457 0.89
458 0.89
459 0.88
460 0.88
461 0.85
462 0.83
463 0.77
464 0.71
465 0.64
466 0.56
467 0.51
468 0.48
469 0.4
470 0.33
471 0.31
472 0.27
473 0.24
474 0.29
475 0.31
476 0.37