Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397J620

Protein Details
Accession A0A397J620    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-149TATTTRRNIMKKRRKKWSNLELDTHydrophilic
179-198TPVQLKDKARTEKMRRIREGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-141MKKRRKK
Subcellular Location(s) nucl 21, mito_nucl 13.833, cyto_nucl 11.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001005  SANT/Myb  
Pfam View protein in Pfam  
PF00249  Myb_DNA-binding  
Amino Acid Sequences MNPLTSNKLNKLNKLNKLNKFIEGEQSVKNTNKFDNENSKNRIRMNPFMEPKLIIGNGLDLVLQDDDYYPLPTTKNQISQKPFSYLKHNNNSSSSNNSISSEGEMVKGVIEEDEGEGEDQTRTSTTATTTRRNIMKKRRKKWSNLELDTLEKGMMEQGTKWRKILDVYGRPHGHLRERTPVQLKDKARTEKMRRIREGISLGIFEIATE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.78
3 0.76
4 0.8
5 0.75
6 0.69
7 0.65
8 0.58
9 0.55
10 0.49
11 0.44
12 0.38
13 0.38
14 0.38
15 0.36
16 0.38
17 0.32
18 0.32
19 0.34
20 0.35
21 0.39
22 0.45
23 0.49
24 0.54
25 0.58
26 0.6
27 0.59
28 0.6
29 0.61
30 0.56
31 0.56
32 0.54
33 0.57
34 0.56
35 0.54
36 0.51
37 0.44
38 0.38
39 0.33
40 0.27
41 0.17
42 0.13
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.05
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.07
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.15
61 0.17
62 0.25
63 0.29
64 0.36
65 0.4
66 0.44
67 0.45
68 0.47
69 0.46
70 0.39
71 0.44
72 0.45
73 0.48
74 0.53
75 0.54
76 0.5
77 0.5
78 0.52
79 0.44
80 0.4
81 0.34
82 0.27
83 0.24
84 0.23
85 0.21
86 0.18
87 0.16
88 0.12
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.04
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.15
114 0.19
115 0.24
116 0.26
117 0.31
118 0.37
119 0.42
120 0.49
121 0.53
122 0.61
123 0.66
124 0.73
125 0.79
126 0.81
127 0.84
128 0.86
129 0.85
130 0.85
131 0.78
132 0.74
133 0.65
134 0.6
135 0.51
136 0.4
137 0.3
138 0.18
139 0.14
140 0.11
141 0.1
142 0.08
143 0.08
144 0.17
145 0.24
146 0.25
147 0.26
148 0.25
149 0.26
150 0.27
151 0.34
152 0.35
153 0.37
154 0.41
155 0.5
156 0.5
157 0.5
158 0.52
159 0.48
160 0.47
161 0.45
162 0.45
163 0.45
164 0.47
165 0.54
166 0.57
167 0.59
168 0.57
169 0.59
170 0.59
171 0.57
172 0.63
173 0.64
174 0.65
175 0.69
176 0.71
177 0.73
178 0.79
179 0.81
180 0.77
181 0.74
182 0.69
183 0.65
184 0.6
185 0.54
186 0.46
187 0.36
188 0.31
189 0.27