Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HXG4

Protein Details
Accession A0A397HXG4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
411-433NKQQKKSSPTKNYQRSKNNNNNQHydrophilic
745-768LTTSKFTLQQQQQKQQHQHQYPYHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MPPKAKRTPQLPKRPSVDISISESVREANKIFVGNQENLIGLESLEVQTMVKTIIKEFADIKTTLTLRELWTPSAQTRAKGTPRPQNAFMLHRKDVSKEFCRARQSLSVCDSSIIASSRWNSYGEREKKFWTDLALIAKTLHSYNYPNYKYTPNRTQKSIKTSTTATPTIPTISTITTRATTATATNRSLRREQISPYYLRQKNNLLSLNSINSISIANLFDPPVVPSQSPSTRISSANTIITPNIASNITPIITPFIQQQQFSYTGILDDTNNNSDMISVDNNNNYNQNNHNHNTNNSNNYNYNNNNNLTFNNATQNIQNIHNIHNTSPTILLSSPAGLSLSPVGLLSSPAGLSSSITKTNTNRSSMNFRNRQRIQTSPYVIKTINNTTTTNPGRSSSRQITNFRTPTFNKQQKKSSPTKNYQRSKNNNNNQVQHIISNNSSPSPSFKNTKNNINNNNNNNNNNNNNNNNNSFNNNSSQVHSGQTVSAIMSSRQQEENISSSDNSTNSTIVSSSLSLSPSTSMKPSSSSSSSSSSLNNQQQAYYINSPNPLSSMSTISSQTLPNISSNISSSYNNNNHNHNNNNINHNNINININNINNNNNNLNNNNKDSTKANSYYNSISPSSVSSIYSQLDSRSIMNQPLTLPIPYFTTTTTSPSPFNSTTISPSSPAGFSGDQSQYIQPNMPYIRPQQYLNNSTTNNNNNGNSFLGNSSQPQQRFNFITTTSQYYTHHPQPTTNSSSSPLTTSKFTLQQQQQKQQHQHQYPYHHHQQSSPYTLQHQYHQQLQPSSSSSISPSPPLPTVGTEYYHQSSEDLYMLSHQLGLSGGGSIDPILLNQNDPLFTSFSYGRDASPDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.69
3 0.65
4 0.6
5 0.52
6 0.52
7 0.49
8 0.44
9 0.38
10 0.36
11 0.32
12 0.28
13 0.27
14 0.2
15 0.17
16 0.2
17 0.21
18 0.22
19 0.26
20 0.3
21 0.29
22 0.3
23 0.27
24 0.25
25 0.23
26 0.24
27 0.16
28 0.11
29 0.1
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.09
38 0.1
39 0.11
40 0.12
41 0.18
42 0.19
43 0.21
44 0.22
45 0.24
46 0.26
47 0.26
48 0.26
49 0.26
50 0.26
51 0.24
52 0.24
53 0.23
54 0.21
55 0.29
56 0.3
57 0.26
58 0.29
59 0.31
60 0.31
61 0.38
62 0.37
63 0.31
64 0.35
65 0.41
66 0.45
67 0.51
68 0.57
69 0.58
70 0.66
71 0.7
72 0.68
73 0.67
74 0.64
75 0.64
76 0.64
77 0.62
78 0.55
79 0.53
80 0.51
81 0.48
82 0.51
83 0.5
84 0.48
85 0.49
86 0.53
87 0.54
88 0.59
89 0.57
90 0.54
91 0.54
92 0.52
93 0.5
94 0.49
95 0.45
96 0.38
97 0.37
98 0.32
99 0.25
100 0.24
101 0.18
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.18
106 0.2
107 0.21
108 0.19
109 0.25
110 0.35
111 0.4
112 0.44
113 0.44
114 0.47
115 0.49
116 0.51
117 0.45
118 0.39
119 0.33
120 0.32
121 0.35
122 0.32
123 0.28
124 0.26
125 0.25
126 0.22
127 0.2
128 0.17
129 0.12
130 0.15
131 0.21
132 0.31
133 0.33
134 0.33
135 0.36
136 0.44
137 0.49
138 0.54
139 0.58
140 0.58
141 0.61
142 0.66
143 0.71
144 0.7
145 0.72
146 0.71
147 0.63
148 0.56
149 0.55
150 0.53
151 0.51
152 0.45
153 0.37
154 0.31
155 0.29
156 0.27
157 0.24
158 0.2
159 0.15
160 0.15
161 0.16
162 0.16
163 0.17
164 0.16
165 0.16
166 0.15
167 0.14
168 0.13
169 0.15
170 0.21
171 0.23
172 0.25
173 0.31
174 0.34
175 0.38
176 0.41
177 0.42
178 0.4
179 0.39
180 0.4
181 0.42
182 0.44
183 0.43
184 0.45
185 0.51
186 0.51
187 0.5
188 0.5
189 0.49
190 0.48
191 0.52
192 0.51
193 0.42
194 0.4
195 0.4
196 0.38
197 0.32
198 0.28
199 0.2
200 0.15
201 0.14
202 0.11
203 0.1
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.12
214 0.13
215 0.19
216 0.22
217 0.26
218 0.27
219 0.28
220 0.29
221 0.3
222 0.3
223 0.28
224 0.28
225 0.26
226 0.24
227 0.21
228 0.18
229 0.18
230 0.16
231 0.12
232 0.11
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.12
244 0.19
245 0.21
246 0.21
247 0.22
248 0.22
249 0.23
250 0.23
251 0.21
252 0.14
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.09
257 0.1
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.14
270 0.15
271 0.16
272 0.18
273 0.17
274 0.19
275 0.22
276 0.25
277 0.29
278 0.3
279 0.34
280 0.34
281 0.36
282 0.4
283 0.4
284 0.41
285 0.36
286 0.38
287 0.34
288 0.34
289 0.38
290 0.33
291 0.34
292 0.32
293 0.32
294 0.3
295 0.29
296 0.27
297 0.26
298 0.25
299 0.2
300 0.2
301 0.2
302 0.19
303 0.18
304 0.21
305 0.19
306 0.19
307 0.21
308 0.18
309 0.2
310 0.23
311 0.23
312 0.2
313 0.22
314 0.2
315 0.18
316 0.17
317 0.14
318 0.12
319 0.11
320 0.11
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.07
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.07
343 0.09
344 0.11
345 0.13
346 0.15
347 0.17
348 0.26
349 0.29
350 0.29
351 0.29
352 0.29
353 0.37
354 0.42
355 0.5
356 0.49
357 0.5
358 0.57
359 0.58
360 0.61
361 0.56
362 0.53
363 0.49
364 0.47
365 0.48
366 0.42
367 0.4
368 0.37
369 0.34
370 0.3
371 0.28
372 0.26
373 0.26
374 0.24
375 0.24
376 0.22
377 0.3
378 0.3
379 0.29
380 0.25
381 0.22
382 0.24
383 0.25
384 0.31
385 0.29
386 0.34
387 0.38
388 0.42
389 0.47
390 0.51
391 0.52
392 0.47
393 0.46
394 0.41
395 0.43
396 0.5
397 0.52
398 0.5
399 0.52
400 0.59
401 0.61
402 0.67
403 0.67
404 0.67
405 0.67
406 0.7
407 0.76
408 0.77
409 0.78
410 0.79
411 0.81
412 0.79
413 0.8
414 0.81
415 0.79
416 0.78
417 0.76
418 0.7
419 0.62
420 0.56
421 0.46
422 0.37
423 0.29
424 0.22
425 0.17
426 0.15
427 0.13
428 0.11
429 0.1
430 0.09
431 0.11
432 0.14
433 0.16
434 0.19
435 0.24
436 0.33
437 0.37
438 0.47
439 0.53
440 0.57
441 0.64
442 0.69
443 0.72
444 0.68
445 0.73
446 0.67
447 0.6
448 0.55
449 0.5
450 0.45
451 0.41
452 0.39
453 0.35
454 0.34
455 0.34
456 0.34
457 0.33
458 0.3
459 0.29
460 0.26
461 0.24
462 0.23
463 0.23
464 0.21
465 0.2
466 0.21
467 0.19
468 0.19
469 0.18
470 0.16
471 0.12
472 0.12
473 0.1
474 0.08
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.1
479 0.11
480 0.13
481 0.14
482 0.14
483 0.14
484 0.16
485 0.18
486 0.15
487 0.15
488 0.12
489 0.13
490 0.15
491 0.14
492 0.13
493 0.12
494 0.11
495 0.1
496 0.1
497 0.09
498 0.08
499 0.08
500 0.07
501 0.07
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.11
509 0.11
510 0.11
511 0.11
512 0.13
513 0.15
514 0.18
515 0.19
516 0.21
517 0.22
518 0.25
519 0.26
520 0.24
521 0.24
522 0.23
523 0.28
524 0.3
525 0.31
526 0.28
527 0.26
528 0.27
529 0.27
530 0.28
531 0.25
532 0.23
533 0.2
534 0.22
535 0.22
536 0.21
537 0.2
538 0.16
539 0.13
540 0.12
541 0.13
542 0.12
543 0.13
544 0.14
545 0.15
546 0.15
547 0.14
548 0.14
549 0.13
550 0.13
551 0.12
552 0.12
553 0.11
554 0.1
555 0.11
556 0.13
557 0.14
558 0.14
559 0.16
560 0.24
561 0.29
562 0.35
563 0.36
564 0.39
565 0.43
566 0.47
567 0.48
568 0.44
569 0.46
570 0.42
571 0.48
572 0.44
573 0.42
574 0.37
575 0.36
576 0.32
577 0.26
578 0.26
579 0.18
580 0.2
581 0.18
582 0.18
583 0.2
584 0.2
585 0.23
586 0.21
587 0.24
588 0.24
589 0.24
590 0.26
591 0.25
592 0.3
593 0.3
594 0.32
595 0.32
596 0.29
597 0.3
598 0.29
599 0.31
600 0.32
601 0.3
602 0.3
603 0.29
604 0.32
605 0.33
606 0.33
607 0.32
608 0.25
609 0.23
610 0.21
611 0.2
612 0.19
613 0.17
614 0.15
615 0.13
616 0.15
617 0.15
618 0.16
619 0.15
620 0.13
621 0.14
622 0.14
623 0.14
624 0.15
625 0.16
626 0.18
627 0.18
628 0.18
629 0.17
630 0.19
631 0.2
632 0.17
633 0.16
634 0.14
635 0.16
636 0.16
637 0.16
638 0.13
639 0.15
640 0.16
641 0.2
642 0.22
643 0.21
644 0.21
645 0.23
646 0.28
647 0.26
648 0.26
649 0.25
650 0.23
651 0.25
652 0.27
653 0.26
654 0.21
655 0.21
656 0.21
657 0.19
658 0.18
659 0.18
660 0.14
661 0.14
662 0.19
663 0.19
664 0.19
665 0.21
666 0.23
667 0.21
668 0.21
669 0.23
670 0.17
671 0.22
672 0.23
673 0.22
674 0.24
675 0.29
676 0.35
677 0.35
678 0.37
679 0.39
680 0.46
681 0.49
682 0.48
683 0.48
684 0.42
685 0.43
686 0.47
687 0.44
688 0.41
689 0.41
690 0.38
691 0.33
692 0.34
693 0.33
694 0.26
695 0.22
696 0.18
697 0.16
698 0.15
699 0.17
700 0.21
701 0.26
702 0.27
703 0.3
704 0.31
705 0.35
706 0.37
707 0.37
708 0.34
709 0.3
710 0.34
711 0.32
712 0.36
713 0.32
714 0.31
715 0.31
716 0.33
717 0.39
718 0.42
719 0.45
720 0.4
721 0.42
722 0.48
723 0.54
724 0.55
725 0.48
726 0.42
727 0.38
728 0.4
729 0.37
730 0.33
731 0.28
732 0.24
733 0.25
734 0.26
735 0.28
736 0.32
737 0.33
738 0.4
739 0.46
740 0.53
741 0.6
742 0.68
743 0.72
744 0.75
745 0.82
746 0.82
747 0.83
748 0.8
749 0.8
750 0.76
751 0.76
752 0.76
753 0.76
754 0.76
755 0.72
756 0.66
757 0.61
758 0.63
759 0.62
760 0.6
761 0.53
762 0.45
763 0.44
764 0.5
765 0.48
766 0.44
767 0.46
768 0.43
769 0.49
770 0.52
771 0.53
772 0.51
773 0.5
774 0.48
775 0.42
776 0.41
777 0.32
778 0.28
779 0.25
780 0.26
781 0.26
782 0.26
783 0.24
784 0.26
785 0.26
786 0.28
787 0.26
788 0.24
789 0.28
790 0.27
791 0.28
792 0.25
793 0.3
794 0.3
795 0.29
796 0.27
797 0.21
798 0.2
799 0.2
800 0.2
801 0.14
802 0.12
803 0.13
804 0.14
805 0.14
806 0.14
807 0.11
808 0.1
809 0.1
810 0.11
811 0.09
812 0.08
813 0.08
814 0.06
815 0.07
816 0.06
817 0.07
818 0.06
819 0.06
820 0.1
821 0.1
822 0.12
823 0.14
824 0.16
825 0.16
826 0.17
827 0.19
828 0.17
829 0.17
830 0.2
831 0.2
832 0.19
833 0.24
834 0.24
835 0.22