FuNGI

A0A397HBH4

Protein Details

Accession

A0A397HBH4

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-34	MSSKSSVKLPPVKPKKPKTKRSGRIKNATKTKVI	Hydrophilic
119-139	FAIYQKLPKEHKKPDPRQGTI	Hydrophilic
290-325	SPPSSPSKFVRKERERKRKEKERKERERERERERER	Basic
375-410	TYRDRDRERERIREKKRERERQRTREREKHRAHSEA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-32	LPPVKPKKPKTKRSGRIKNATKTK
297-340	KFVRKERERKRKEKERKERERERERERERERERERKEKDKISNK
380-406	DRERERIREKKRERERQRTREREKHRA

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 12.333, cyto_mito 3.666, mito 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011012 Longin-like_dom_sf IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR007233 TRAPPC IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0005783 C:endoplasmic reticulum GO:0005794 C:Golgi apparatus GO:0030008 C:TRAPP complex GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0048193 P:Golgi vesicle transport GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3 PF04099 Sybindin
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSSKSSVKLPPVKPKKPKTKRSGRIKNATKTKVIVRRLPPLLPEKLFLETVKPWANEETTDYYRFHQGRISRSKNKECIFSRAYFHFKTVEQVLEFHRAFDNHLFIDRNGVENRAVVEFAIYQKLPKEHKKPDPRQGTIETDPDYISFVESLKSEESQQQNISKEPGALLEGGATQLERLENRLALALANAAANVPEKPKSTPLLDYLRAQKSGAKSKSSPPPSKQPTIISSPGSPSKGGVGIGGGGSSGGGGGSKVKQSQIRSGVGSNSNNSSAPSSSQQTPTPTEVISPPSSPSKFVRKERERKRKEKERKERERERERERERERERERKEKDKISNKEAGKTINESEQDKDKDKNNNKDVAVTSSSQNKESTYRDRDRERERIREKKRERERQRTREREKHRAHSEAIKTETPTVTILTKPVTSTTTTTTTTTAASNVEDSNKSTDNSKEKETKETKRAPIKITIQQRQKDQIRSIIQRPAASLAKKENDNRLADGDKDKLTDSKLTAEKPTVENNNNNNNNNNNNNNNILHIIILYFIFFSDYVMKNPFYTPEMPIRSELFDLNLQKLMKQIGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.89
3	0.9
4	0.93
5	0.93
6	0.93
7	0.93
8	0.94
9	0.95
10	0.94
11	0.94
12	0.93
13	0.92
14	0.91
15	0.86
16	0.79
17	0.72
18	0.71
19	0.69
20	0.67
21	0.66
22	0.61
23	0.65
24	0.65
25	0.63
26	0.59
27	0.57
28	0.57
29	0.5
30	0.46
31	0.39
32	0.37
33	0.37
34	0.31
35	0.29
36	0.23
37	0.28
38	0.32
39	0.3
40	0.29
41	0.31
42	0.32
43	0.28
44	0.31
45	0.32
46	0.3
47	0.32
48	0.31
49	0.3
50	0.38
51	0.38
52	0.33
53	0.32
54	0.33
55	0.4
56	0.5
57	0.57
58	0.58
59	0.67
60	0.76
61	0.79
62	0.77
63	0.76
64	0.69
65	0.68
66	0.64
67	0.58
68	0.53
69	0.51
70	0.54
71	0.46
72	0.44
73	0.38
74	0.33
75	0.34
76	0.32
77	0.3
78	0.24
79	0.25
80	0.26
81	0.32
82	0.31
83	0.28
84	0.27
85	0.24
86	0.26
87	0.27
88	0.27
89	0.19
90	0.23
91	0.23
92	0.21
93	0.27
94	0.24
95	0.25
96	0.23
97	0.24
98	0.21
99	0.2
100	0.22
101	0.16
102	0.15
103	0.11
104	0.11
105	0.11
106	0.12
107	0.14
108	0.13
109	0.13
110	0.17
111	0.23
112	0.29
113	0.37
114	0.44
115	0.5
116	0.61
117	0.72
118	0.77
119	0.82
120	0.85
121	0.8
122	0.76
123	0.72
124	0.68
125	0.6
126	0.55
127	0.47
128	0.38
129	0.34
130	0.28
131	0.24
132	0.17
133	0.14
134	0.1
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.1
139	0.1
140	0.11
141	0.12
142	0.18
143	0.21
144	0.24
145	0.27
146	0.3
147	0.31
148	0.31
149	0.32
150	0.26
151	0.23
152	0.2
153	0.17
154	0.13
155	0.12
156	0.1
157	0.08
158	0.07
159	0.07
160	0.06
161	0.05
162	0.04
163	0.05
164	0.06
165	0.06
166	0.08
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.11
171	0.11
172	0.09
173	0.09
174	0.07
175	0.06
176	0.06
177	0.05
178	0.04
179	0.05
180	0.05
181	0.06
182	0.07
183	0.09
184	0.11
185	0.13
186	0.16
187	0.19
188	0.21
189	0.22
190	0.26
191	0.3
192	0.31
193	0.33
194	0.37
195	0.37
196	0.35
197	0.33
198	0.31
199	0.3
200	0.38
201	0.37
202	0.34
203	0.34
204	0.4
205	0.49
206	0.55
207	0.56
208	0.51
209	0.59
210	0.61
211	0.63
212	0.59
213	0.53
214	0.48
215	0.46
216	0.45
217	0.36
218	0.3
219	0.29
220	0.29
221	0.27
222	0.23
223	0.17
224	0.16
225	0.14
226	0.14
227	0.1
228	0.07
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.04
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.02
237	0.02
238	0.02
239	0.02
240	0.03
241	0.05
242	0.06
243	0.07
244	0.1
245	0.14
246	0.16
247	0.23
248	0.26
249	0.27
250	0.27
251	0.27
252	0.28
253	0.29
254	0.28
255	0.23
256	0.19
257	0.18
258	0.17
259	0.16
260	0.15
261	0.1
262	0.11
263	0.12
264	0.14
265	0.15
266	0.18
267	0.19
268	0.21
269	0.23
270	0.23
271	0.21
272	0.18
273	0.17
274	0.16
275	0.18
276	0.16
277	0.14
278	0.14
279	0.17
280	0.18
281	0.19
282	0.21
283	0.27
284	0.33
285	0.4
286	0.49
287	0.55
288	0.65
289	0.74
290	0.82
291	0.82
292	0.85
293	0.88
294	0.88
295	0.9
296	0.91
297	0.91
298	0.91
299	0.92
300	0.93
301	0.93
302	0.92
303	0.92
304	0.89
305	0.86
306	0.85
307	0.79
308	0.79
309	0.74
310	0.74
311	0.69
312	0.71
313	0.71
314	0.7
315	0.71
316	0.71
317	0.72
318	0.71
319	0.73
320	0.71
321	0.72
322	0.73
323	0.72
324	0.68
325	0.7
326	0.61
327	0.59
328	0.52
329	0.45
330	0.36
331	0.33
332	0.28
333	0.25
334	0.26
335	0.22
336	0.22
337	0.27
338	0.28
339	0.28
340	0.3
341	0.32
342	0.4
343	0.47
344	0.55
345	0.54
346	0.57
347	0.55
348	0.55
349	0.5
350	0.44
351	0.38
352	0.3
353	0.26
354	0.27
355	0.28
356	0.26
357	0.25
358	0.22
359	0.23
360	0.27
361	0.33
362	0.34
363	0.4
364	0.45
365	0.5
366	0.57
367	0.6
368	0.66
369	0.64
370	0.66
371	0.69
372	0.73
373	0.76
374	0.79
375	0.8
376	0.8
377	0.85
378	0.85
379	0.87
380	0.88
381	0.9
382	0.9
383	0.93
384	0.93
385	0.92
386	0.91
387	0.9
388	0.89
389	0.86
390	0.85
391	0.81
392	0.74
393	0.67
394	0.66
395	0.63
396	0.58
397	0.54
398	0.45
399	0.4
400	0.38
401	0.35
402	0.27
403	0.22
404	0.18
405	0.15
406	0.14
407	0.14
408	0.13
409	0.13
410	0.13
411	0.14
412	0.14
413	0.14
414	0.16
415	0.18
416	0.21
417	0.22
418	0.22
419	0.22
420	0.21
421	0.2
422	0.18
423	0.15
424	0.12
425	0.11
426	0.12
427	0.12
428	0.14
429	0.14
430	0.15
431	0.19
432	0.19
433	0.19
434	0.2
435	0.26
436	0.31
437	0.33
438	0.38
439	0.42
440	0.42
441	0.52
442	0.58
443	0.6
444	0.62
445	0.68
446	0.7
447	0.72
448	0.76
449	0.69
450	0.7
451	0.68
452	0.66
453	0.67
454	0.67
455	0.67
456	0.66
457	0.67
458	0.68
459	0.69
460	0.68
461	0.61
462	0.61
463	0.6
464	0.62
465	0.62
466	0.59
467	0.55
468	0.49
469	0.46
470	0.43
471	0.4
472	0.35
473	0.34
474	0.34
475	0.37
476	0.42
477	0.46
478	0.49
479	0.5
480	0.51
481	0.5
482	0.46
483	0.43
484	0.4
485	0.39
486	0.34
487	0.29
488	0.27
489	0.26
490	0.24
491	0.25
492	0.26
493	0.24
494	0.28
495	0.31
496	0.33
497	0.35
498	0.36
499	0.37
500	0.36
501	0.42
502	0.43
503	0.44
504	0.5
505	0.54
506	0.61
507	0.65
508	0.64
509	0.62
510	0.59
511	0.6
512	0.59
513	0.58
514	0.51
515	0.47
516	0.49
517	0.45
518	0.41
519	0.35
520	0.28
521	0.21
522	0.18
523	0.14
524	0.1
525	0.1
526	0.08
527	0.06
528	0.06
529	0.07
530	0.07
531	0.09
532	0.14
533	0.16
534	0.19
535	0.22
536	0.23
537	0.23
538	0.25
539	0.26
540	0.24
541	0.25
542	0.26
543	0.33
544	0.37
545	0.37
546	0.39
547	0.39
548	0.37
549	0.36
550	0.32
551	0.26
552	0.28
553	0.29
554	0.28
555	0.31
556	0.28
557	0.27
558	0.29

A0A397HBH4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer