Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397GMF8

Protein Details
Accession A0A397GMF8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MDKCKPITSKKVEKRARLENSVHydrophilic
24-55EENLKTVFKKKIKKKDKLNKRIKSPHKISADRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-51KKKIKKKDKLNKRIKSPHKI
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.333, cyto 6, cyto_mito 4.833, pero 3, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51195  Q_MOTIF  
Amino Acid Sequences MDKCKPITSKKVEKRARLENSVIEENLKTVFKKKIKKKDKLNKRIKSPHKISADRNKITSDNITTTTNTIEEKDRNSKNDKIDEGNSKSEVTEFLECNSNQIIGNLNLKPIMSFSQLEIDKEIKRVLKIFEKPTPIQATCCSGKTLAFTVPAVMHIKNIKNKPYSNQPIVLVISPTRELAMQIQKQCVLFDSTCGIKSSCVYGGVSKTEQYKPVFTLLWLFPEGYLIWLTKKFVILAKFHILSLMKLIVCLIKVLRMR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.84
3 0.82
4 0.77
5 0.71
6 0.65
7 0.63
8 0.58
9 0.5
10 0.42
11 0.34
12 0.28
13 0.27
14 0.23
15 0.18
16 0.19
17 0.28
18 0.34
19 0.44
20 0.53
21 0.62
22 0.71
23 0.8
24 0.86
25 0.88
26 0.92
27 0.93
28 0.93
29 0.91
30 0.91
31 0.92
32 0.91
33 0.9
34 0.86
35 0.84
36 0.82
37 0.79
38 0.77
39 0.78
40 0.78
41 0.7
42 0.65
43 0.58
44 0.5
45 0.46
46 0.42
47 0.34
48 0.27
49 0.26
50 0.26
51 0.24
52 0.23
53 0.22
54 0.19
55 0.15
56 0.14
57 0.16
58 0.17
59 0.22
60 0.3
61 0.32
62 0.36
63 0.41
64 0.45
65 0.47
66 0.5
67 0.47
68 0.43
69 0.44
70 0.48
71 0.46
72 0.43
73 0.38
74 0.32
75 0.3
76 0.26
77 0.21
78 0.16
79 0.15
80 0.13
81 0.13
82 0.18
83 0.18
84 0.19
85 0.18
86 0.16
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.11
91 0.15
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.11
98 0.11
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.16
103 0.17
104 0.17
105 0.18
106 0.18
107 0.17
108 0.17
109 0.19
110 0.14
111 0.14
112 0.16
113 0.17
114 0.21
115 0.26
116 0.3
117 0.32
118 0.36
119 0.36
120 0.38
121 0.4
122 0.34
123 0.3
124 0.27
125 0.27
126 0.23
127 0.23
128 0.19
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.16
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.12
142 0.15
143 0.19
144 0.25
145 0.29
146 0.33
147 0.36
148 0.38
149 0.4
150 0.47
151 0.5
152 0.47
153 0.46
154 0.41
155 0.38
156 0.37
157 0.34
158 0.24
159 0.17
160 0.15
161 0.13
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.13
167 0.21
168 0.25
169 0.27
170 0.28
171 0.3
172 0.3
173 0.3
174 0.26
175 0.22
176 0.17
177 0.15
178 0.17
179 0.16
180 0.17
181 0.18
182 0.17
183 0.13
184 0.14
185 0.16
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.15
190 0.17
191 0.2
192 0.21
193 0.2
194 0.24
195 0.25
196 0.3
197 0.29
198 0.3
199 0.28
200 0.3
201 0.28
202 0.24
203 0.27
204 0.22
205 0.23
206 0.21
207 0.2
208 0.16
209 0.17
210 0.17
211 0.12
212 0.13
213 0.1
214 0.12
215 0.14
216 0.16
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.21
221 0.24
222 0.25
223 0.29
224 0.34
225 0.33
226 0.32
227 0.34
228 0.31
229 0.27
230 0.27
231 0.26
232 0.18
233 0.17
234 0.18
235 0.16
236 0.15
237 0.17
238 0.14