Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HYK9

Protein Details
Accession A0A397HYK9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-51INPENKPKKRCYEFLRQTSRNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 11, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008949  Isoprenoid_synthase_dom_sf  
IPR002060  Squ/phyt_synthse  
IPR006449  Squal_synth-like  
IPR044844  Trans_IPPS_euk-type  
IPR033904  Trans_IPPS_HH  
Gene Ontology GO:0004310  F:farnesyl-diphosphate farnesyltransferase activity  
GO:0051996  F:squalene synthase activity  
GO:0008610  P:lipid biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00494  SQS_PSY  
CDD cd00683  Trans_IPPS_HH  
Amino Acid Sequences MSYLISSIFRPSEIVALIRYKYFRSTHILQINPENKPKKRCYEFLRQTSRNFAAVIQEIHEDLRDVICIFYLILRGLDTIEDDMTIPIEKKEPLLRNFHNIIFKKGWTYTESGPDEKDRQLLLEFDIVIDEFLCLKKEFRDIIVYATKEVGNGMADYAKDTVHNKYGIVTLKDYDKYSYYAAGLPGISLTKLFVASGLEDPEFGKNLELANSMGLFIQKTGVIRDYSVDDQEGRKFWPKEIWSKYCDDLSKLKKPENATSAVNCLSDMTSCALQHVPDCLTYMNRLKEQSIFNFCAVPQVLAMATLSIHFRNHDIFKKDVKLRKGESVKLILRCKNIYEVANIIRYYGRVIVGKNDLRDPNYWKIKIACDQIEQWCTANLPDLDNYITCNTSIIYKSRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.21
4 0.22
5 0.24
6 0.25
7 0.23
8 0.28
9 0.29
10 0.29
11 0.33
12 0.37
13 0.43
14 0.49
15 0.51
16 0.48
17 0.56
18 0.59
19 0.57
20 0.61
21 0.61
22 0.59
23 0.65
24 0.7
25 0.71
26 0.71
27 0.75
28 0.73
29 0.76
30 0.79
31 0.81
32 0.83
33 0.78
34 0.73
35 0.73
36 0.68
37 0.58
38 0.48
39 0.38
40 0.32
41 0.31
42 0.28
43 0.21
44 0.19
45 0.18
46 0.18
47 0.17
48 0.13
49 0.1
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.11
76 0.11
77 0.13
78 0.21
79 0.28
80 0.32
81 0.4
82 0.42
83 0.47
84 0.5
85 0.51
86 0.52
87 0.46
88 0.47
89 0.41
90 0.39
91 0.35
92 0.34
93 0.32
94 0.25
95 0.28
96 0.25
97 0.31
98 0.33
99 0.31
100 0.31
101 0.33
102 0.33
103 0.3
104 0.3
105 0.21
106 0.2
107 0.19
108 0.18
109 0.16
110 0.14
111 0.13
112 0.1
113 0.11
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.1
124 0.14
125 0.15
126 0.16
127 0.2
128 0.19
129 0.23
130 0.27
131 0.26
132 0.22
133 0.23
134 0.21
135 0.16
136 0.16
137 0.12
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.08
145 0.07
146 0.08
147 0.1
148 0.12
149 0.14
150 0.15
151 0.14
152 0.14
153 0.18
154 0.2
155 0.2
156 0.19
157 0.16
158 0.19
159 0.21
160 0.2
161 0.17
162 0.15
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.11
217 0.13
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.21
222 0.21
223 0.22
224 0.28
225 0.3
226 0.37
227 0.44
228 0.46
229 0.42
230 0.44
231 0.45
232 0.41
233 0.39
234 0.33
235 0.33
236 0.36
237 0.41
238 0.41
239 0.43
240 0.43
241 0.46
242 0.49
243 0.45
244 0.42
245 0.36
246 0.34
247 0.33
248 0.3
249 0.27
250 0.2
251 0.16
252 0.13
253 0.11
254 0.11
255 0.09
256 0.1
257 0.09
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.12
262 0.13
263 0.12
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.16
269 0.21
270 0.23
271 0.25
272 0.26
273 0.26
274 0.3
275 0.33
276 0.35
277 0.35
278 0.34
279 0.32
280 0.32
281 0.3
282 0.31
283 0.27
284 0.21
285 0.14
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.15
299 0.21
300 0.27
301 0.3
302 0.33
303 0.38
304 0.46
305 0.53
306 0.55
307 0.56
308 0.57
309 0.57
310 0.63
311 0.63
312 0.6
313 0.57
314 0.59
315 0.59
316 0.58
317 0.61
318 0.56
319 0.55
320 0.51
321 0.47
322 0.44
323 0.42
324 0.36
325 0.32
326 0.32
327 0.31
328 0.34
329 0.32
330 0.28
331 0.24
332 0.23
333 0.22
334 0.19
335 0.18
336 0.16
337 0.17
338 0.22
339 0.3
340 0.33
341 0.34
342 0.38
343 0.39
344 0.39
345 0.43
346 0.44
347 0.45
348 0.51
349 0.5
350 0.47
351 0.47
352 0.5
353 0.53
354 0.54
355 0.49
356 0.43
357 0.47
358 0.5
359 0.49
360 0.45
361 0.38
362 0.32
363 0.28
364 0.25
365 0.26
366 0.2
367 0.2
368 0.2
369 0.21
370 0.22
371 0.21
372 0.24
373 0.19
374 0.19
375 0.16
376 0.16
377 0.14
378 0.17
379 0.2