FuNGI

A0A397I0S0

Protein Details

Accession

A0A397I0S0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
65-85	DSSLREPIKKLQRNHDNPESH	Hydrophilic
265-291	SKTITIPIRKPKNRIRRQNNQNNQSVS	Hydrophilic
845-870	HSIKSSNRTKKKSILKKTLQQKSQNA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 15, cyto 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR014839 Crt10 IPR000684 RNA_pol_II_repeat_euk IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08728 CRT10 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00115 RNA_POL_II_REPEAT PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MKEYHKLAVKNIYKNLTFNIQGVRSWRMNLSAVSLSQQTFYVAVDTIIHVYRLLEEENPTEVAQDSSLREPIKKLQRNHDNPESHIINAIKVGMLGFQEVLVCVDEVGEVCVWYTANLDRSPIRFMNEESTWGIALHGPKRLLAVSSNSHKITIYDLRNGLKDPNNPNDVNLSENANMQETSTSILNKNGILHYSLVGHTNNIPDISFSPCGRYLVSCSVDCSCRVWNVQTGGEIVGKDISRLWGWSARFVSSSSFELVPENKISKTITIPIRKPKNRIRRQNNQNNQSVSDINIMSTVITSHISTRERVRNLDSEYEDGYFFPPEDESFESSEHDSNQESESENENEDDPYPTQARMHGVREFVPSIDYEHERDYESDSRTIPMTDDEWALSSENHDREENEQNERDEQNEQNEQNEQNEQNERNGDESPIIRPGAPRISPVGVVANYQYSHWVPREYSYSATSPPYSPQTPQYFNFAYSNSNSEHRSIPPPPTPRPASVNFSPIVMSRQTSSSYLVSTPNINPTSPPSRQLPNNSRTARFTPVSPTYFPTSPAYVLSPTYSPTSPQYSETSPVYSPTSPNHIESPNYGNTSPISNYSDSTLNYGDASNHESTSSNREVAISNCPVTPDYGTITPTYEPATRNYGATTPDYGSTTPEYGNTSPNYNPSPSYGATSFSPIREETPQTIYDENYNDTGSNSDGGDSPNNEFGMPSPLFSPSTPYSIPTSPTYREIHEDSTIDDTSESRYSDTLISLDDDSSLSSQEELSSQSRESPGINAYDNYDNNASPSHSTTSGESSGRRSYERQSNYSPTYIRLVRRNLSLFTDLNDNISTDESGFTRTSDHSIKSSNRTKKKSILKKTLQQKSQNAINELILFSTQTDLYLLDPKSDLCILDCKKSVVTRNDIRRGINIAEFDRLNMIEYVPELSLAIVASQKGRVALVRILRFYDSRGEINYSLYPEIYLPTFPLPPSPLLGMFIVKNEKLPKDSSLFYCCLYLIYLNGEFYCYDIRKSEENYTLGVPEKIWL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.53
3	0.48
4	0.42
5	0.37
6	0.37
7	0.32
8	0.32
9	0.34
10	0.37
11	0.33
12	0.34
13	0.32
14	0.29
15	0.29
16	0.28
17	0.29
18	0.25
19	0.24
20	0.24
21	0.25
22	0.22
23	0.21
24	0.2
25	0.16
26	0.14
27	0.14
28	0.13
29	0.1
30	0.1
31	0.1
32	0.11
33	0.13
34	0.13
35	0.13
36	0.11
37	0.11
38	0.13
39	0.14
40	0.14
41	0.14
42	0.16
43	0.18
44	0.2
45	0.21
46	0.19
47	0.18
48	0.17
49	0.16
50	0.14
51	0.15
52	0.16
53	0.17
54	0.22
55	0.23
56	0.24
57	0.26
58	0.35
59	0.43
60	0.48
61	0.52
62	0.58
63	0.68
64	0.75
65	0.81
66	0.81
67	0.74
68	0.69
69	0.71
70	0.62
71	0.51
72	0.48
73	0.4
74	0.3
75	0.27
76	0.24
77	0.16
78	0.14
79	0.13
80	0.09
81	0.09
82	0.09
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.08
87	0.09
88	0.08
89	0.07
90	0.06
91	0.06
92	0.06
93	0.07
94	0.08
95	0.07
96	0.06
97	0.06
98	0.07
99	0.07
100	0.07
101	0.09
102	0.11
103	0.15
104	0.15
105	0.18
106	0.21
107	0.23
108	0.29
109	0.29
110	0.29
111	0.27
112	0.29
113	0.33
114	0.3
115	0.31
116	0.26
117	0.26
118	0.23
119	0.21
120	0.19
121	0.15
122	0.19
123	0.19
124	0.23
125	0.22
126	0.22
127	0.24
128	0.24
129	0.23
130	0.2
131	0.22
132	0.25
133	0.31
134	0.36
135	0.35
136	0.35
137	0.33
138	0.31
139	0.32
140	0.33
141	0.31
142	0.31
143	0.35
144	0.37
145	0.38
146	0.39
147	0.39
148	0.36
149	0.4
150	0.41
151	0.44
152	0.48
153	0.47
154	0.47
155	0.45
156	0.39
157	0.35
158	0.29
159	0.25
160	0.2
161	0.22
162	0.21
163	0.19
164	0.18
165	0.15
166	0.14
167	0.11
168	0.12
169	0.12
170	0.13
171	0.13
172	0.15
173	0.16
174	0.17
175	0.19
176	0.18
177	0.18
178	0.17
179	0.17
180	0.15
181	0.16
182	0.16
183	0.16
184	0.15
185	0.15
186	0.15
187	0.16
188	0.16
189	0.15
190	0.14
191	0.12
192	0.13
193	0.17
194	0.19
195	0.17
196	0.2
197	0.21
198	0.22
199	0.22
200	0.22
201	0.21
202	0.25
203	0.28
204	0.25
205	0.25
206	0.27
207	0.28
208	0.28
209	0.25
210	0.2
211	0.2
212	0.22
213	0.22
214	0.25
215	0.26
216	0.26
217	0.25
218	0.24
219	0.22
220	0.21
221	0.19
222	0.14
223	0.14
224	0.12
225	0.12
226	0.11
227	0.12
228	0.11
229	0.12
230	0.14
231	0.16
232	0.17
233	0.23
234	0.23
235	0.22
236	0.23
237	0.23
238	0.23
239	0.2
240	0.21
241	0.18
242	0.17
243	0.16
244	0.18
245	0.18
246	0.18
247	0.19
248	0.19
249	0.17
250	0.18
251	0.19
252	0.18
253	0.19
254	0.24
255	0.28
256	0.35
257	0.4
258	0.49
259	0.59
260	0.63
261	0.69
262	0.72
263	0.75
264	0.77
265	0.83
266	0.82
267	0.82
268	0.88
269	0.91
270	0.91
271	0.88
272	0.84
273	0.75
274	0.67
275	0.59
276	0.48
277	0.38
278	0.32
279	0.24
280	0.17
281	0.14
282	0.13
283	0.1
284	0.09
285	0.08
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.08
290	0.13
291	0.14
292	0.16
293	0.24
294	0.3
295	0.32
296	0.34
297	0.37
298	0.38
299	0.4
300	0.43
301	0.37
302	0.32
303	0.3
304	0.29
305	0.25
306	0.2
307	0.17
308	0.12
309	0.1
310	0.09
311	0.08
312	0.07
313	0.1
314	0.12
315	0.13
316	0.14
317	0.15
318	0.16
319	0.17
320	0.18
321	0.15
322	0.14
323	0.13
324	0.12
325	0.13
326	0.12
327	0.12
328	0.13
329	0.16
330	0.16
331	0.16
332	0.15
333	0.15
334	0.15
335	0.14
336	0.15
337	0.11
338	0.14
339	0.14
340	0.14
341	0.14
342	0.15
343	0.18
344	0.19
345	0.22
346	0.21
347	0.21
348	0.23
349	0.25
350	0.24
351	0.2
352	0.17
353	0.14
354	0.13
355	0.15
356	0.15
357	0.14
358	0.15
359	0.16
360	0.16
361	0.16
362	0.19
363	0.21
364	0.22
365	0.22
366	0.21
367	0.21
368	0.21
369	0.2
370	0.16
371	0.12
372	0.11
373	0.1
374	0.1
375	0.09
376	0.1
377	0.1
378	0.1
379	0.09
380	0.1
381	0.13
382	0.14
383	0.16
384	0.15
385	0.16
386	0.19
387	0.28
388	0.29
389	0.29
390	0.3
391	0.29
392	0.33
393	0.32
394	0.29
395	0.24
396	0.23
397	0.23
398	0.26
399	0.25
400	0.23
401	0.25
402	0.24
403	0.22
404	0.24
405	0.2
406	0.18
407	0.22
408	0.22
409	0.21
410	0.22
411	0.21
412	0.19
413	0.19
414	0.16
415	0.13
416	0.13
417	0.12
418	0.13
419	0.13
420	0.12
421	0.12
422	0.14
423	0.17
424	0.17
425	0.17
426	0.17
427	0.17
428	0.17
429	0.17
430	0.17
431	0.12
432	0.12
433	0.11
434	0.1
435	0.09
436	0.09
437	0.11
438	0.09
439	0.11
440	0.12
441	0.13
442	0.12
443	0.13
444	0.17
445	0.17
446	0.18
447	0.18
448	0.18
449	0.18
450	0.19
451	0.19
452	0.15
453	0.16
454	0.18
455	0.17
456	0.17
457	0.23
458	0.27
459	0.29
460	0.29
461	0.33
462	0.29
463	0.3
464	0.3
465	0.24
466	0.2
467	0.17
468	0.19
469	0.15
470	0.16
471	0.15
472	0.16
473	0.17
474	0.17
475	0.21
476	0.21
477	0.24
478	0.29
479	0.33
480	0.34
481	0.39
482	0.4
483	0.37
484	0.4
485	0.39
486	0.38
487	0.34
488	0.34
489	0.27
490	0.25
491	0.23
492	0.19
493	0.17
494	0.12
495	0.11
496	0.09
497	0.1
498	0.11
499	0.11
500	0.13
501	0.11
502	0.12
503	0.12
504	0.12
505	0.12
506	0.13
507	0.13
508	0.16
509	0.16
510	0.16
511	0.15
512	0.19
513	0.24
514	0.23
515	0.25
516	0.22
517	0.25
518	0.29
519	0.38
520	0.41
521	0.39
522	0.48
523	0.48
524	0.47
525	0.46
526	0.45
527	0.41
528	0.33
529	0.3
530	0.27
531	0.29
532	0.3
533	0.27
534	0.27
535	0.26
536	0.26
537	0.27
538	0.23
539	0.19
540	0.17
541	0.17
542	0.15
543	0.12
544	0.12
545	0.11
546	0.1
547	0.1
548	0.12
549	0.11
550	0.11
551	0.13
552	0.17
553	0.17
554	0.19
555	0.2
556	0.19
557	0.22
558	0.22
559	0.21
560	0.17
561	0.18
562	0.18
563	0.16
564	0.16
565	0.15
566	0.2
567	0.19
568	0.2
569	0.22
570	0.2
571	0.21
572	0.22
573	0.25
574	0.22
575	0.22
576	0.21
577	0.18
578	0.18
579	0.19
580	0.17
581	0.15
582	0.15
583	0.13
584	0.14
585	0.15
586	0.17
587	0.15
588	0.17
589	0.14
590	0.12
591	0.12
592	0.12
593	0.1
594	0.09
595	0.13
596	0.12
597	0.11
598	0.12
599	0.12
600	0.13
601	0.19
602	0.19
603	0.16
604	0.15
605	0.16
606	0.16
607	0.17
608	0.21
609	0.17
610	0.16
611	0.16
612	0.16
613	0.16
614	0.16
615	0.15
616	0.1
617	0.11
618	0.11
619	0.12
620	0.12
621	0.13
622	0.12
623	0.12
624	0.13
625	0.14
626	0.14
627	0.15
628	0.2
629	0.19
630	0.2
631	0.2
632	0.19
633	0.19
634	0.19
635	0.19
636	0.14
637	0.15
638	0.16
639	0.15
640	0.15
641	0.14
642	0.14
643	0.12
644	0.12
645	0.15
646	0.14
647	0.18
648	0.17
649	0.18
650	0.18
651	0.21
652	0.22
653	0.2
654	0.2
655	0.19
656	0.21
657	0.19
658	0.22
659	0.19
660	0.19
661	0.18
662	0.22
663	0.21
664	0.17
665	0.19
666	0.16
667	0.18
668	0.19
669	0.21
670	0.2
671	0.22
672	0.22
673	0.23
674	0.23
675	0.21
676	0.21
677	0.2
678	0.18
679	0.16
680	0.15
681	0.13
682	0.13
683	0.13
684	0.1
685	0.1
686	0.08
687	0.08
688	0.08
689	0.1
690	0.11
691	0.12
692	0.13
693	0.15
694	0.15
695	0.14
696	0.13
697	0.12
698	0.17
699	0.16
700	0.14
701	0.13
702	0.14
703	0.16
704	0.16
705	0.21
706	0.16
707	0.2
708	0.2
709	0.21
710	0.23
711	0.23
712	0.26
713	0.24
714	0.27
715	0.25
716	0.29
717	0.3
718	0.27
719	0.3
720	0.3
721	0.29
722	0.28
723	0.26
724	0.22
725	0.24
726	0.23
727	0.18
728	0.16
729	0.13
730	0.14
731	0.16
732	0.15
733	0.11
734	0.11
735	0.13
736	0.13
737	0.13
738	0.11
739	0.09
740	0.11
741	0.1
742	0.1
743	0.09
744	0.09
745	0.09
746	0.09
747	0.09
748	0.07
749	0.07
750	0.07
751	0.07
752	0.07
753	0.1
754	0.12
755	0.13
756	0.13
757	0.15
758	0.16
759	0.17
760	0.17
761	0.16
762	0.16
763	0.17
764	0.18
765	0.16
766	0.18
767	0.23
768	0.22
769	0.23
770	0.22
771	0.19
772	0.19
773	0.19
774	0.17
775	0.14
776	0.16
777	0.16
778	0.16
779	0.17
780	0.18
781	0.21
782	0.23
783	0.23
784	0.22
785	0.23
786	0.26
787	0.27
788	0.28
789	0.27
790	0.31
791	0.39
792	0.43
793	0.45
794	0.47
795	0.52
796	0.53
797	0.54
798	0.48
799	0.41
800	0.41
801	0.4
802	0.4
803	0.4
804	0.42
805	0.41
806	0.46
807	0.47
808	0.43
809	0.42
810	0.41
811	0.34
812	0.29
813	0.31
814	0.25
815	0.25
816	0.23
817	0.19
818	0.16
819	0.16
820	0.15
821	0.1
822	0.11
823	0.09
824	0.12
825	0.12
826	0.11
827	0.13
828	0.14
829	0.18
830	0.21
831	0.23
832	0.22
833	0.29
834	0.33
835	0.4
836	0.49
837	0.54
838	0.6
839	0.65
840	0.68
841	0.71
842	0.77
843	0.78
844	0.79
845	0.8
846	0.8
847	0.82
848	0.87
849	0.87
850	0.85
851	0.83
852	0.79
853	0.75
854	0.73
855	0.69
856	0.62
857	0.54
858	0.47
859	0.39
860	0.32
861	0.26
862	0.18
863	0.13
864	0.1
865	0.1
866	0.09
867	0.07
868	0.08
869	0.08
870	0.09
871	0.16
872	0.16
873	0.16
874	0.16
875	0.16
876	0.19
877	0.19
878	0.18
879	0.13
880	0.22
881	0.23
882	0.29
883	0.3
884	0.29
885	0.31
886	0.36
887	0.43
888	0.41
889	0.48
890	0.51
891	0.59
892	0.67
893	0.67
894	0.63
895	0.58
896	0.55
897	0.49
898	0.44
899	0.37
900	0.3
901	0.3
902	0.29
903	0.26
904	0.24
905	0.21
906	0.19
907	0.16
908	0.14
909	0.11
910	0.11
911	0.13
912	0.1
913	0.1
914	0.08
915	0.08
916	0.08
917	0.08
918	0.08
919	0.07
920	0.08
921	0.09
922	0.1
923	0.11
924	0.11
925	0.12
926	0.13
927	0.15
928	0.2
929	0.27
930	0.3
931	0.31
932	0.33
933	0.34
934	0.34
935	0.32
936	0.34
937	0.29
938	0.27
939	0.28
940	0.31
941	0.29
942	0.32
943	0.32
944	0.28
945	0.25
946	0.23
947	0.21
948	0.16
949	0.18
950	0.15
951	0.13
952	0.12
953	0.14
954	0.16
955	0.16
956	0.2
957	0.21
958	0.21
959	0.23
960	0.24
961	0.21
962	0.22
963	0.22
964	0.21
965	0.18
966	0.22
967	0.24
968	0.22
969	0.26
970	0.3
971	0.33
972	0.34
973	0.36
974	0.36
975	0.36
976	0.4
977	0.4
978	0.4
979	0.39
980	0.36
981	0.35
982	0.3
983	0.26
984	0.22
985	0.18
986	0.13
987	0.16
988	0.17
989	0.17
990	0.17
991	0.17
992	0.15
993	0.16
994	0.23
995	0.19
996	0.2
997	0.22
998	0.26
999	0.3
1000	0.35
1001	0.41
1002	0.41
1003	0.41
1004	0.41
1005	0.4
1006	0.38
1007	0.36
1008	0.31

A0A397I0S0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer