FuNGI

A0A397GS46

Protein Details

Accession

A0A397GS46

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-33	EKEEQRIKRKIEEKKREEQQKAKESST	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-22	KRKIEEKKR

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 11, nucl 10.5, cyto 10.5, plas 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MREVEIEKEEQRIKRKIEEKKREEQQKAKESSTTSIASTISTSTSLSSSSLSEKKRRWDMETPTIEDTKSSSEWSRTDDETSSVSKSRWDETPRTTDDEMDTPRKRSRWDVTPQVSTKKSRWDETPTHPTVQMGATPVGNLGLLTPTPGHLVPMTPEAQRWEKDLDARNRPLSDEELDAMFPPTGYKILEPPAGYVPIRTPARKLMATPTPMAADGFVMLEEDRNQTYDLPAEIPGVGNLPFFKQEDMQHFGKLLDDKDESELSVEELKERKIMRLLLKIKNGTPPMRKTALRQITDKARDFGAGPLFNQILPLLMSQNLEDQERHLLVKVIDRILYKLDALVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYFARCEGREIISNLSKAAGLPTMIATMRPDIDHVDEYVRNTTARAFSVVASAHGIPALLPFLKAVCKSKKSWQARHTGIKIVQQIAILMGCAVLPHLKNLVEAIAHGLEDEQQKVRTITALAIAALAEAAAPYGIESFDSVLKPLWTGIRKHRGKGLAAFLKAIGYIIPLMDAEYANYYTKEVMIILIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCAATDGVQPQYIKEEILPEFFKNFWVRRMALDRRNYRQVVETTVELAQKVGVTEIVGRIVEDLKDESEPYRKMVMETVEKVVSQLGAADIDTRLEEVLIDGILYAFQEQTVEDIVMLNGFGTVVNALGLRVKPYLQQITSTILWRLNNKSAKVRQQAADLISRIAVVMKTCGEEKLMGHLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGGLKSIVNVIGMSSMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQESCIDLVGRIADRGAEFVSAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRATVNTFGYIAKAIGPQDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHRQTACTTVKHMSLGVFGLGCEDALLHLLNYVWPNIFETSPHVINAVMEAIEGLRVAIGPATVLQYTLQGLFHPARKVREIYWKIYNNLYIGAQDALIPYYPRIEDDERNNYERYELSMWL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.66
3	0.69
4	0.74
5	0.79
6	0.78
7	0.81
8	0.86
9	0.87
10	0.88
11	0.86
12	0.85
13	0.84
14	0.82
15	0.74
16	0.69
17	0.61
18	0.56
19	0.52
20	0.43
21	0.33
22	0.29
23	0.26
24	0.22
25	0.2
26	0.17
27	0.13
28	0.12
29	0.12
30	0.11
31	0.12
32	0.12
33	0.11
34	0.12
35	0.12
36	0.18
37	0.25
38	0.31
39	0.39
40	0.44
41	0.52
42	0.61
43	0.64
44	0.65
45	0.67
46	0.7
47	0.72
48	0.73
49	0.68
50	0.63
51	0.59
52	0.52
53	0.43
54	0.36
55	0.3
56	0.24
57	0.23
58	0.22
59	0.26
60	0.27
61	0.32
62	0.35
63	0.32
64	0.34
65	0.32
66	0.3
67	0.28
68	0.29
69	0.28
70	0.25
71	0.24
72	0.26
73	0.27
74	0.28
75	0.33
76	0.38
77	0.41
78	0.46
79	0.54
80	0.53
81	0.57
82	0.54
83	0.49
84	0.45
85	0.45
86	0.44
87	0.45
88	0.44
89	0.43
90	0.48
91	0.49
92	0.5
93	0.52
94	0.53
95	0.53
96	0.59
97	0.65
98	0.65
99	0.71
100	0.72
101	0.72
102	0.69
103	0.65
104	0.59
105	0.59
106	0.57
107	0.53
108	0.54
109	0.54
110	0.57
111	0.61
112	0.68
113	0.61
114	0.59
115	0.55
116	0.49
117	0.42
118	0.36
119	0.28
120	0.21
121	0.18
122	0.15
123	0.15
124	0.15
125	0.13
126	0.11
127	0.09
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.07
132	0.08
133	0.08
134	0.11
135	0.11
136	0.12
137	0.1
138	0.12
139	0.13
140	0.17
141	0.18
142	0.17
143	0.18
144	0.22
145	0.27
146	0.27
147	0.28
148	0.27
149	0.27
150	0.34
151	0.42
152	0.46
153	0.5
154	0.55
155	0.57
156	0.54
157	0.53
158	0.48
159	0.43
160	0.36
161	0.29
162	0.24
163	0.2
164	0.2
165	0.19
166	0.17
167	0.13
168	0.11
169	0.09
170	0.09
171	0.09
172	0.1
173	0.1
174	0.12
175	0.16
176	0.2
177	0.2
178	0.21
179	0.23
180	0.25
181	0.24
182	0.22
183	0.2
184	0.25
185	0.28
186	0.27
187	0.27
188	0.3
189	0.36
190	0.36
191	0.36
192	0.35
193	0.38
194	0.4
195	0.39
196	0.34
197	0.29
198	0.28
199	0.27
200	0.19
201	0.12
202	0.09
203	0.08
204	0.06
205	0.06
206	0.05
207	0.06
208	0.08
209	0.1
210	0.1
211	0.11
212	0.12
213	0.12
214	0.13
215	0.13
216	0.13
217	0.12
218	0.12
219	0.12
220	0.11
221	0.11
222	0.1
223	0.1
224	0.09
225	0.08
226	0.08
227	0.09
228	0.1
229	0.11
230	0.12
231	0.14
232	0.18
233	0.23
234	0.29
235	0.29
236	0.28
237	0.28
238	0.26
239	0.26
240	0.25
241	0.2
242	0.18
243	0.18
244	0.18
245	0.2
246	0.21
247	0.17
248	0.16
249	0.15
250	0.12
251	0.14
252	0.13
253	0.14
254	0.16
255	0.16
256	0.2
257	0.21
258	0.22
259	0.22
260	0.28
261	0.3
262	0.38
263	0.45
264	0.47
265	0.53
266	0.54
267	0.51
268	0.53
269	0.53
270	0.5
271	0.5
272	0.47
273	0.47
274	0.49
275	0.49
276	0.46
277	0.52
278	0.54
279	0.5
280	0.48
281	0.47
282	0.52
283	0.58
284	0.55
285	0.46
286	0.37
287	0.35
288	0.33
289	0.31
290	0.27
291	0.21
292	0.19
293	0.2
294	0.2
295	0.19
296	0.18
297	0.14
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.11
306	0.12
307	0.12
308	0.12
309	0.12
310	0.15
311	0.15
312	0.15
313	0.13
314	0.14
315	0.14
316	0.19
317	0.21
318	0.19
319	0.2
320	0.2
321	0.21
322	0.2
323	0.2
324	0.15
325	0.13
326	0.16
327	0.15
328	0.16
329	0.19
330	0.18
331	0.19
332	0.21
333	0.21
334	0.17
335	0.16
336	0.15
337	0.14
338	0.15
339	0.14
340	0.12
341	0.1
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.07
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.07
354	0.08
355	0.1
356	0.11
357	0.14
358	0.15
359	0.2
360	0.23
361	0.23
362	0.22
363	0.2
364	0.18
365	0.14
366	0.13
367	0.09
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.13
384	0.13
385	0.15
386	0.16
387	0.15
388	0.13
389	0.13
390	0.14
391	0.13
392	0.12
393	0.13
394	0.12
395	0.11
396	0.14
397	0.13
398	0.12
399	0.12
400	0.11
401	0.09
402	0.08
403	0.08
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.08
412	0.09
413	0.15
414	0.21
415	0.24
416	0.28
417	0.36
418	0.46
419	0.53
420	0.61
421	0.61
422	0.65
423	0.68
424	0.73
425	0.66
426	0.62
427	0.55
428	0.5
429	0.46
430	0.38
431	0.32
432	0.24
433	0.22
434	0.16
435	0.14
436	0.09
437	0.06
438	0.04
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.05
443	0.05
444	0.06
445	0.08
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.09
450	0.07
451	0.07
452	0.08
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.08
458	0.09
459	0.1
460	0.1
461	0.1
462	0.11
463	0.12
464	0.12
465	0.1
466	0.09
467	0.08
468	0.09
469	0.09
470	0.08
471	0.07
472	0.07
473	0.06
474	0.05
475	0.04
476	0.02
477	0.02
478	0.02
479	0.02
480	0.02
481	0.02
482	0.02
483	0.02
484	0.03
485	0.03
486	0.04
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.07
491	0.07
492	0.07
493	0.08
494	0.11
495	0.13
496	0.16
497	0.24
498	0.34
499	0.36
500	0.37
501	0.41
502	0.4
503	0.39
504	0.4
505	0.4
506	0.34
507	0.32
508	0.31
509	0.26
510	0.23
511	0.21
512	0.17
513	0.09
514	0.04
515	0.04
516	0.03
517	0.03
518	0.03
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.05
524	0.06
525	0.06
526	0.07
527	0.07
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.05
532	0.05
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.09
537	0.1
538	0.1
539	0.1
540	0.1
541	0.1
542	0.11
543	0.13
544	0.12
545	0.12
546	0.12
547	0.13
548	0.15
549	0.13
550	0.15
551	0.15
552	0.16
553	0.22
554	0.27
555	0.29
556	0.28
557	0.28
558	0.26
559	0.27
560	0.24
561	0.21
562	0.18
563	0.15
564	0.17
565	0.17
566	0.15
567	0.15
568	0.14
569	0.12
570	0.09
571	0.12
572	0.1
573	0.13
574	0.15
575	0.13
576	0.14
577	0.14
578	0.16
579	0.17
580	0.17
581	0.17
582	0.2
583	0.2
584	0.22
585	0.3
586	0.34
587	0.37
588	0.45
589	0.48
590	0.5
591	0.56
592	0.53
593	0.47
594	0.44
595	0.38
596	0.34
597	0.29
598	0.24
599	0.19
600	0.2
601	0.2
602	0.15
603	0.13
604	0.09
605	0.08
606	0.08
607	0.06
608	0.04
609	0.04
610	0.05
611	0.05
612	0.06
613	0.05
614	0.05
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.07
620	0.07
621	0.07
622	0.08
623	0.09
624	0.14
625	0.14
626	0.15
627	0.18
628	0.17
629	0.17
630	0.19
631	0.22
632	0.21
633	0.22
634	0.23
635	0.2
636	0.2
637	0.19
638	0.17
639	0.13
640	0.08
641	0.07
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.04
652	0.04
653	0.03
654	0.04
655	0.03
656	0.03
657	0.03
658	0.03
659	0.03
660	0.03
661	0.03
662	0.03
663	0.03
664	0.03
665	0.03
666	0.04
667	0.05
668	0.05
669	0.05
670	0.05
671	0.05
672	0.05
673	0.05
674	0.04
675	0.03
676	0.03
677	0.03
678	0.03
679	0.03
680	0.03
681	0.03
682	0.03
683	0.04
684	0.06
685	0.06
686	0.08
687	0.08
688	0.09
689	0.11
690	0.16
691	0.2
692	0.19
693	0.2
694	0.2
695	0.24
696	0.25
697	0.24
698	0.21
699	0.19
700	0.2
701	0.23
702	0.25
703	0.29
704	0.32
705	0.33
706	0.4
707	0.44
708	0.52
709	0.54
710	0.55
711	0.48
712	0.47
713	0.48
714	0.42
715	0.39
716	0.31
717	0.25
718	0.2
719	0.18
720	0.15
721	0.12
722	0.1
723	0.06
724	0.07
725	0.07
726	0.08
727	0.09
728	0.1
729	0.1
730	0.1
731	0.1
732	0.15
733	0.17
734	0.15
735	0.14
736	0.15
737	0.14
738	0.13
739	0.13
740	0.07
741	0.04
742	0.04
743	0.05
744	0.04
745	0.04
746	0.04
747	0.04
748	0.05
749	0.05
750	0.05
751	0.05
752	0.04
753	0.04
754	0.04
755	0.04
756	0.05
757	0.04
758	0.04
759	0.05
760	0.04
761	0.05
762	0.05
763	0.05
764	0.04
765	0.04
766	0.04
767	0.05
768	0.05
769	0.05
770	0.06
771	0.09
772	0.09
773	0.09
774	0.1
775	0.1
776	0.12
777	0.14
778	0.16
779	0.19
780	0.22
781	0.23
782	0.25
783	0.29
784	0.31
785	0.37
786	0.44
787	0.45
788	0.5
789	0.52
790	0.58
791	0.57
792	0.57
793	0.55
794	0.55
795	0.5
796	0.47
797	0.45
798	0.37
799	0.33
800	0.29
801	0.24
802	0.17
803	0.14
804	0.1
805	0.09
806	0.08
807	0.08
808	0.09
809	0.09
810	0.08
811	0.08
812	0.08
813	0.09
814	0.11
815	0.11
816	0.13
817	0.13
818	0.13
819	0.17
820	0.17
821	0.17
822	0.15
823	0.15
824	0.17
825	0.17
826	0.18
827	0.15
828	0.17
829	0.21
830	0.21
831	0.23
832	0.21
833	0.26
834	0.32
835	0.42
836	0.48
837	0.47
838	0.53
839	0.59
840	0.65
841	0.61
842	0.53
843	0.45
844	0.36
845	0.33
846	0.27
847	0.19
848	0.12
849	0.12
850	0.12
851	0.11
852	0.11
853	0.1
854	0.1
855	0.1
856	0.09
857	0.07
858	0.07
859	0.08
860	0.11
861	0.11
862	0.12
863	0.12
864	0.14
865	0.18
866	0.24
867	0.31
868	0.38
869	0.43
870	0.5
871	0.52
872	0.52
873	0.49
874	0.43
875	0.38
876	0.32
877	0.26
878	0.19
879	0.16
880	0.13
881	0.13
882	0.12
883	0.08
884	0.05
885	0.05
886	0.05
887	0.05
888	0.05
889	0.06
890	0.09
891	0.09
892	0.1
893	0.11
894	0.15
895	0.16
896	0.17
897	0.17
898	0.16
899	0.17
900	0.18
901	0.19
902	0.2
903	0.22
904	0.25
905	0.26
906	0.24
907	0.27
908	0.26
909	0.25
910	0.19
911	0.16
912	0.14
913	0.14
914	0.14
915	0.1
916	0.11
917	0.1
918	0.11
919	0.12
920	0.12
921	0.12
922	0.11
923	0.11
924	0.11
925	0.1
926	0.09
927	0.08
928	0.08
929	0.07
930	0.08
931	0.07
932	0.08
933	0.08
934	0.08
935	0.08
936	0.07
937	0.06
938	0.07
939	0.1
940	0.09
941	0.09
942	0.09
943	0.11
944	0.15
945	0.16
946	0.19
947	0.17
948	0.18
949	0.21
950	0.27
951	0.27
952	0.25
953	0.28
954	0.29
955	0.29
956	0.29
957	0.28
958	0.22
959	0.21
960	0.2
961	0.17
962	0.13
963	0.11
964	0.11
965	0.1
966	0.09
967	0.07
968	0.06
969	0.05
970	0.06
971	0.07
972	0.05
973	0.06
974	0.06
975	0.09
976	0.1
977	0.11
978	0.11
979	0.11
980	0.14
981	0.15
982	0.16
983	0.14
984	0.19
985	0.23
986	0.24
987	0.24
988	0.21
989	0.19
990	0.19
991	0.2
992	0.15
993	0.09
994	0.07
995	0.07
996	0.07
997	0.07
998	0.07
999	0.05
1000	0.04
1001	0.04
1002	0.04
1003	0.05
1004	0.05
1005	0.05
1006	0.06
1007	0.08
1008	0.08
1009	0.09
1010	0.09
1011	0.1
1012	0.11
1013	0.12
1014	0.12
1015	0.1
1016	0.15
1017	0.18
1018	0.23
1019	0.29
1020	0.33
1021	0.36
1022	0.41
1023	0.45
1024	0.45
1025	0.52
1026	0.53
1027	0.52
1028	0.57
1029	0.59
1030	0.56
1031	0.58
1032	0.55
1033	0.45
1034	0.42
1035	0.36
1036	0.26
1037	0.22
1038	0.19
1039	0.14
1040	0.12
1041	0.12
1042	0.11
1043	0.12
1044	0.12
1045	0.11
1046	0.14
1047	0.15
1048	0.15
1049	0.21
1050	0.25
1051	0.31
1052	0.38
1053	0.48
1054	0.5
1055	0.53
1056	0.53
1057	0.47
1058	0.44
1059	0.38
1060	0.35

A0A397GS46

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer