Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A397JJD1

Protein Details
Accession A0A397JJD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
700-733AINPKEQYSIRKRQRKLWKRRDKLKEKALQRLYAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
708-727SIRKRQRKLWKRRDKLKEKA
Subcellular Location(s) mito 16.5, mito_nucl 13.5, nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR033443  PPR_long  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF12854  PPR_1  
PF13041  PPR_2  
PF17177  PPR_long  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MRRYLSIFSTVCKSAESILNIGCLELKNEHNKLGSAKNLNSMKMTNIYNASSSSSSSSSSAADIPTGSHQSKNNNNNNNNNLSNVIFPRKRFNKMIGKDSKFSEKPITLINNLNLYSHDPWKAWTSYRTIVDNDQIKLLTNENLRQFLKLLCDNLNDMTFEWLDQIMKDIFSNNLKKVMDSSLYVSVLKSLAGRGDIRIITDVIRQMTLLGYYVEKSQLNDILSKFSDFDSAYKIIDSIISSHPQADYEWYQILIYMYCDNEDTESAIKILRLYNLSGQRPTIKFYSTIIHKLCKKNEMELAEELVKEMIEYFGPPNALMFNALISGYGRRNDMNMVIKTYNEMQKLGVEPDRSVYTSLIFANLRTRNIVEASKIYKKIVNQDLKHHKHLFIALLYLRGIIADVKGAREIFEKMKMIGIIPDTIAYNHLIFAYSREKPVDIEKIEALYLEMLSENLEPNIYTFELIIYALSRNDDHEKYSGAFNEMKKRNIPLTSNVFNPPIRSLSLAKKTEIAWKYSNQMIRAGIKPNLYTYTSIITLAVASSNFAMAFKVFNDLLANGLTPNVYVYSSIISSLCKSGNVNYAIKILIHMNNQGVAPNVVTFTSLIQGFMISKNYEDGKKVYEIMKQSNVIPDRMTYYHLEKLYKKTEHFKEIRSLHEDMKRYGIDPNSREKILTKGKGSYYWRARFLIYRRIERQKAAINPKEQYSIRKRQRKLWKRRDKLKEKALQRLYARLIKENENMEQYSEWKKKYVQDNFVELQRYKKAEKFPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.27
3 0.27
4 0.25
5 0.24
6 0.26
7 0.25
8 0.24
9 0.22
10 0.17
11 0.17
12 0.18
13 0.23
14 0.29
15 0.31
16 0.35
17 0.34
18 0.36
19 0.38
20 0.4
21 0.42
22 0.4
23 0.4
24 0.46
25 0.47
26 0.47
27 0.45
28 0.4
29 0.36
30 0.34
31 0.34
32 0.29
33 0.28
34 0.28
35 0.27
36 0.26
37 0.27
38 0.22
39 0.22
40 0.2
41 0.19
42 0.19
43 0.19
44 0.19
45 0.16
46 0.16
47 0.17
48 0.14
49 0.14
50 0.12
51 0.13
52 0.16
53 0.21
54 0.21
55 0.24
56 0.27
57 0.35
58 0.45
59 0.54
60 0.59
61 0.63
62 0.69
63 0.74
64 0.76
65 0.74
66 0.66
67 0.57
68 0.5
69 0.4
70 0.37
71 0.33
72 0.36
73 0.33
74 0.34
75 0.43
76 0.47
77 0.53
78 0.53
79 0.58
80 0.59
81 0.62
82 0.71
83 0.7
84 0.7
85 0.67
86 0.66
87 0.66
88 0.57
89 0.54
90 0.51
91 0.42
92 0.38
93 0.41
94 0.42
95 0.36
96 0.4
97 0.39
98 0.36
99 0.35
100 0.34
101 0.28
102 0.28
103 0.28
104 0.26
105 0.26
106 0.21
107 0.23
108 0.28
109 0.3
110 0.29
111 0.29
112 0.31
113 0.34
114 0.38
115 0.39
116 0.36
117 0.36
118 0.4
119 0.42
120 0.36
121 0.32
122 0.28
123 0.27
124 0.25
125 0.24
126 0.22
127 0.21
128 0.25
129 0.27
130 0.32
131 0.31
132 0.31
133 0.31
134 0.27
135 0.29
136 0.27
137 0.27
138 0.24
139 0.25
140 0.26
141 0.26
142 0.25
143 0.2
144 0.17
145 0.17
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.12
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.13
158 0.2
159 0.25
160 0.23
161 0.29
162 0.28
163 0.28
164 0.29
165 0.3
166 0.25
167 0.21
168 0.23
169 0.21
170 0.22
171 0.22
172 0.19
173 0.17
174 0.15
175 0.14
176 0.11
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.15
187 0.14
188 0.16
189 0.17
190 0.14
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.09
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.09
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.13
205 0.16
206 0.17
207 0.19
208 0.19
209 0.2
210 0.2
211 0.2
212 0.18
213 0.15
214 0.17
215 0.14
216 0.15
217 0.15
218 0.16
219 0.15
220 0.15
221 0.14
222 0.11
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.11
227 0.13
228 0.13
229 0.14
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.15
234 0.14
235 0.14
236 0.15
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.14
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.18
262 0.24
263 0.26
264 0.26
265 0.26
266 0.3
267 0.29
268 0.31
269 0.26
270 0.21
271 0.2
272 0.2
273 0.25
274 0.22
275 0.28
276 0.27
277 0.32
278 0.37
279 0.43
280 0.45
281 0.45
282 0.43
283 0.41
284 0.44
285 0.4
286 0.36
287 0.3
288 0.3
289 0.24
290 0.23
291 0.19
292 0.14
293 0.11
294 0.08
295 0.07
296 0.05
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.09
318 0.1
319 0.11
320 0.14
321 0.19
322 0.18
323 0.21
324 0.2
325 0.2
326 0.21
327 0.23
328 0.24
329 0.18
330 0.17
331 0.14
332 0.15
333 0.17
334 0.18
335 0.17
336 0.14
337 0.13
338 0.14
339 0.15
340 0.14
341 0.14
342 0.12
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.15
350 0.17
351 0.17
352 0.16
353 0.17
354 0.15
355 0.17
356 0.18
357 0.12
358 0.13
359 0.17
360 0.21
361 0.22
362 0.21
363 0.21
364 0.22
365 0.29
366 0.35
367 0.38
368 0.35
369 0.44
370 0.54
371 0.57
372 0.62
373 0.55
374 0.47
375 0.4
376 0.4
377 0.32
378 0.21
379 0.19
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.1
384 0.08
385 0.06
386 0.06
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.11
397 0.11
398 0.14
399 0.14
400 0.13
401 0.15
402 0.14
403 0.13
404 0.12
405 0.11
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.09
419 0.13
420 0.13
421 0.15
422 0.15
423 0.15
424 0.16
425 0.2
426 0.23
427 0.19
428 0.2
429 0.19
430 0.19
431 0.18
432 0.17
433 0.14
434 0.07
435 0.07
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.09
460 0.13
461 0.14
462 0.15
463 0.15
464 0.17
465 0.17
466 0.19
467 0.17
468 0.16
469 0.19
470 0.2
471 0.3
472 0.32
473 0.33
474 0.33
475 0.35
476 0.36
477 0.36
478 0.35
479 0.32
480 0.36
481 0.36
482 0.37
483 0.36
484 0.35
485 0.32
486 0.3
487 0.25
488 0.2
489 0.18
490 0.18
491 0.19
492 0.24
493 0.33
494 0.33
495 0.32
496 0.32
497 0.33
498 0.39
499 0.38
500 0.34
501 0.28
502 0.28
503 0.31
504 0.33
505 0.35
506 0.27
507 0.28
508 0.26
509 0.27
510 0.28
511 0.28
512 0.27
513 0.26
514 0.25
515 0.24
516 0.25
517 0.22
518 0.21
519 0.18
520 0.17
521 0.16
522 0.16
523 0.14
524 0.11
525 0.1
526 0.08
527 0.08
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.06
537 0.06
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.06
547 0.07
548 0.06
549 0.05
550 0.06
551 0.06
552 0.05
553 0.06
554 0.06
555 0.07
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.08
560 0.1
561 0.12
562 0.12
563 0.11
564 0.12
565 0.14
566 0.21
567 0.25
568 0.24
569 0.23
570 0.24
571 0.23
572 0.22
573 0.21
574 0.17
575 0.16
576 0.17
577 0.18
578 0.17
579 0.18
580 0.19
581 0.18
582 0.16
583 0.13
584 0.11
585 0.09
586 0.09
587 0.08
588 0.08
589 0.08
590 0.07
591 0.09
592 0.09
593 0.09
594 0.08
595 0.09
596 0.09
597 0.11
598 0.13
599 0.11
600 0.11
601 0.14
602 0.17
603 0.18
604 0.2
605 0.2
606 0.21
607 0.22
608 0.25
609 0.25
610 0.27
611 0.29
612 0.33
613 0.36
614 0.34
615 0.34
616 0.39
617 0.38
618 0.34
619 0.3
620 0.26
621 0.25
622 0.25
623 0.26
624 0.22
625 0.24
626 0.29
627 0.32
628 0.35
629 0.35
630 0.42
631 0.48
632 0.49
633 0.49
634 0.53
635 0.57
636 0.62
637 0.63
638 0.59
639 0.6
640 0.59
641 0.61
642 0.56
643 0.52
644 0.48
645 0.51
646 0.5
647 0.42
648 0.44
649 0.39
650 0.34
651 0.36
652 0.36
653 0.38
654 0.38
655 0.46
656 0.44
657 0.44
658 0.44
659 0.4
660 0.43
661 0.45
662 0.48
663 0.42
664 0.43
665 0.46
666 0.52
667 0.56
668 0.57
669 0.58
670 0.57
671 0.58
672 0.54
673 0.54
674 0.54
675 0.54
676 0.54
677 0.51
678 0.54
679 0.58
680 0.66
681 0.68
682 0.63
683 0.64
684 0.63
685 0.65
686 0.66
687 0.65
688 0.61
689 0.61
690 0.6
691 0.61
692 0.54
693 0.54
694 0.53
695 0.57
696 0.62
697 0.68
698 0.69
699 0.72
700 0.82
701 0.83
702 0.85
703 0.85
704 0.86
705 0.87
706 0.94
707 0.95
708 0.94
709 0.94
710 0.93
711 0.91
712 0.87
713 0.86
714 0.83
715 0.79
716 0.72
717 0.69
718 0.65
719 0.62
720 0.57
721 0.54
722 0.51
723 0.49
724 0.52
725 0.48
726 0.45
727 0.44
728 0.42
729 0.37
730 0.34
731 0.32
732 0.36
733 0.39
734 0.36
735 0.36
736 0.39
737 0.45
738 0.55
739 0.61
740 0.6
741 0.6
742 0.66
743 0.65
744 0.66
745 0.65
746 0.55
747 0.51
748 0.49
749 0.47
750 0.45
751 0.47