Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JCU6

Protein Details
Accession A0A397JCU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
319-345LPILKAKDKSEKKSKDFKKLVRLTFHNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
327-332KSEKKS
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041078  Plavaka  
Pfam View protein in Pfam  
PF18759  Plavaka  
Amino Acid Sequences MSWKCDFCLQRIFTTKTSYTNHIKQCLKSVDSSEELSLEVMMIDSLESENLLNNENNFESIHENSNEDESEGENEDEDNDSYNAEVEEESLTSDISHSSVSFFENMELSNSEPENYSFNNYASDYNNICEEAEPIEFPNNAYADLMALVTNYNLSNEVTNAVIRFFNEHSNLPLSPLPKNAKKGRELMEKMKIPTLTSKKHKILTHNNIDYYLFYHPVLNCIKNILSISDISQNFTLRFENFKYKGEKAYSEQYTGNWWKNTEASLPHGSNLLSIILYSDATTTDTLGKSSLHPIYISIGNISTKRRNKSDAKQLLGYLPILKAKDKSEKKSKDFKKLVRLTFHNSMKFLLDPLFAEKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.52
3 0.49
4 0.51
5 0.5
6 0.5
7 0.54
8 0.59
9 0.6
10 0.64
11 0.59
12 0.63
13 0.63
14 0.57
15 0.51
16 0.48
17 0.44
18 0.42
19 0.42
20 0.33
21 0.27
22 0.24
23 0.21
24 0.17
25 0.11
26 0.08
27 0.06
28 0.05
29 0.04
30 0.04
31 0.04
32 0.04
33 0.04
34 0.05
35 0.05
36 0.07
37 0.08
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.15
42 0.15
43 0.16
44 0.14
45 0.15
46 0.16
47 0.17
48 0.21
49 0.19
50 0.2
51 0.2
52 0.22
53 0.2
54 0.17
55 0.15
56 0.11
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.11
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.11
65 0.11
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.12
97 0.12
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.16
104 0.14
105 0.15
106 0.16
107 0.16
108 0.18
109 0.17
110 0.2
111 0.17
112 0.16
113 0.17
114 0.15
115 0.14
116 0.12
117 0.11
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.12
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.09
152 0.09
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.16
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.19
164 0.23
165 0.24
166 0.31
167 0.35
168 0.38
169 0.4
170 0.45
171 0.45
172 0.5
173 0.5
174 0.49
175 0.51
176 0.49
177 0.47
178 0.44
179 0.38
180 0.29
181 0.33
182 0.34
183 0.34
184 0.37
185 0.44
186 0.45
187 0.51
188 0.53
189 0.54
190 0.59
191 0.61
192 0.64
193 0.6
194 0.56
195 0.5
196 0.48
197 0.39
198 0.3
199 0.22
200 0.13
201 0.1
202 0.13
203 0.12
204 0.17
205 0.19
206 0.18
207 0.17
208 0.18
209 0.17
210 0.16
211 0.16
212 0.12
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.18
220 0.18
221 0.17
222 0.18
223 0.18
224 0.12
225 0.16
226 0.17
227 0.25
228 0.26
229 0.3
230 0.34
231 0.35
232 0.39
233 0.39
234 0.39
235 0.34
236 0.4
237 0.38
238 0.36
239 0.34
240 0.29
241 0.34
242 0.36
243 0.37
244 0.3
245 0.29
246 0.28
247 0.28
248 0.29
249 0.25
250 0.21
251 0.22
252 0.26
253 0.26
254 0.25
255 0.25
256 0.23
257 0.2
258 0.19
259 0.14
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.19
278 0.19
279 0.17
280 0.17
281 0.17
282 0.2
283 0.21
284 0.2
285 0.15
286 0.15
287 0.17
288 0.19
289 0.24
290 0.3
291 0.35
292 0.41
293 0.45
294 0.52
295 0.59
296 0.66
297 0.71
298 0.71
299 0.7
300 0.66
301 0.63
302 0.57
303 0.5
304 0.41
305 0.32
306 0.25
307 0.23
308 0.21
309 0.22
310 0.23
311 0.27
312 0.36
313 0.43
314 0.5
315 0.57
316 0.66
317 0.72
318 0.79
319 0.83
320 0.83
321 0.85
322 0.84
323 0.84
324 0.83
325 0.83
326 0.81
327 0.78
328 0.75
329 0.75
330 0.74
331 0.68
332 0.59
333 0.53
334 0.47
335 0.42
336 0.35
337 0.27
338 0.21
339 0.18