Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HND0

Protein Details
Accession A0A397HND0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
239-266ESESTMSKRRGRPKGSKNKNPPENTKSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
246-259KRRGRPKGSKNKNP
Subcellular Location(s) nucl 10.5cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044210  Tfc3-like  
IPR007309  TFIIIC_Bblock-bd  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000127  C:transcription factor TFIIIC complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006384  P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04182  B-block_TFIIIC  
Amino Acid Sequences MRQIIDDLKEYCLEEISLEGALGCGLEELWIFVQDFFNQRFSYVEPLDIPAGLLKFETPEVPYADDYFKEFYWIRFMKSEELIFFIIKDKNEQSDLDSTIEKPKLYGMTLNDIKTTYGDKFRMKATTNYKKRILFGAVDTTQNIPPIAYNILQQIARKRNVGATQADLIKLLKINTKSFLHNIKILTDLNLIVNLPVVVKGTTSTNNYILGKFSDQTPACKEKEDEKLSSLVHGLSNGESESTMSKRRGRPKGSKNKNPPENTKSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.11
4 0.09
5 0.08
6 0.07
7 0.06
8 0.06
9 0.05
10 0.04
11 0.03
12 0.03
13 0.04
14 0.04
15 0.05
16 0.06
17 0.07
18 0.08
19 0.09
20 0.1
21 0.12
22 0.17
23 0.18
24 0.21
25 0.19
26 0.19
27 0.2
28 0.2
29 0.25
30 0.22
31 0.21
32 0.19
33 0.21
34 0.21
35 0.19
36 0.17
37 0.12
38 0.12
39 0.1
40 0.09
41 0.07
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.09
46 0.11
47 0.12
48 0.14
49 0.15
50 0.16
51 0.17
52 0.16
53 0.17
54 0.17
55 0.15
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.24
60 0.24
61 0.25
62 0.25
63 0.27
64 0.26
65 0.28
66 0.29
67 0.2
68 0.22
69 0.21
70 0.18
71 0.16
72 0.16
73 0.16
74 0.15
75 0.18
76 0.16
77 0.18
78 0.19
79 0.19
80 0.18
81 0.19
82 0.21
83 0.19
84 0.18
85 0.17
86 0.21
87 0.23
88 0.19
89 0.16
90 0.16
91 0.16
92 0.16
93 0.18
94 0.13
95 0.2
96 0.23
97 0.24
98 0.22
99 0.22
100 0.21
101 0.19
102 0.19
103 0.13
104 0.14
105 0.17
106 0.18
107 0.2
108 0.21
109 0.25
110 0.25
111 0.3
112 0.36
113 0.43
114 0.49
115 0.53
116 0.56
117 0.53
118 0.52
119 0.48
120 0.4
121 0.3
122 0.24
123 0.25
124 0.21
125 0.2
126 0.2
127 0.19
128 0.17
129 0.16
130 0.15
131 0.08
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.11
140 0.13
141 0.19
142 0.24
143 0.25
144 0.25
145 0.25
146 0.27
147 0.29
148 0.32
149 0.26
150 0.22
151 0.23
152 0.23
153 0.23
154 0.19
155 0.16
156 0.13
157 0.13
158 0.11
159 0.13
160 0.15
161 0.17
162 0.21
163 0.23
164 0.25
165 0.28
166 0.33
167 0.31
168 0.31
169 0.31
170 0.27
171 0.27
172 0.25
173 0.22
174 0.18
175 0.16
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.08
180 0.08
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.09
189 0.12
190 0.15
191 0.18
192 0.18
193 0.23
194 0.24
195 0.23
196 0.22
197 0.21
198 0.2
199 0.18
200 0.18
201 0.23
202 0.23
203 0.26
204 0.31
205 0.35
206 0.33
207 0.36
208 0.37
209 0.36
210 0.45
211 0.47
212 0.43
213 0.39
214 0.42
215 0.39
216 0.38
217 0.31
218 0.22
219 0.17
220 0.16
221 0.14
222 0.11
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.12
229 0.14
230 0.2
231 0.24
232 0.32
233 0.4
234 0.5
235 0.59
236 0.66
237 0.73
238 0.79
239 0.85
240 0.88
241 0.91
242 0.92
243 0.93
244 0.94
245 0.92
246 0.9