Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397H525

Protein Details
Accession A0A397H525    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-141LEYALKKHQKPTNKKDDKKKSPPKKYLKDFEMDBasic
358-378ANKLKESNKIKRQREDKRNLYHydrophilic
600-627TQLSVKKTKIFHKKLFKGRKNNNKKIKNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-133LKKHQKPTNKKDDKKKSPPKK
605-627KKTKIFHKKLFKGRKNNNKKIKN
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12416  RRM4_RBM28_like  
Amino Acid Sequences MKTKDFVPVTTDSLTRSKIKLFVRKVPYDATDFEFEAFFSEVGPIRSCFLIKESENAKSVNKSSVNEDLKNVVKNLGYGFVKYALSQDAERALKQLKNVKFRGQRTLRLEYALKKHQKPTNKKDDKKKSPPKKYLKDFEMDGKNNNVMDDENSVMDDENNVMDDENAELDDEDAKLDDEDAKLDDEGAELDDGNSELDDENSELDDENVELDENSELDDVKDDNDNREITTERNSEGTVLFIRNLAFEAEEEELGAIFRKFGPLRYYVITRDNTTKRSRGTGFVCFVHKKHADSCLAEANKMTHIYTDSSEKLITKRKGKELMYKSILTADPSDSQTHKFTLHGRVLSVVKAINRDEANKLKESNKIKRQREDKRNLYLMKEGVIFPNTPDAESLPTSEVNKRSASHAMRKNLLSKNPNLYISKIRLSIRNIPRMIDELKLKHLGKEAIKKFKVEVKNGERNDLSESEKKEGWDKFVHIKQAKIVRSKDKIDPATQKLRSKGYGFLEYSEHSHALAALRYLNNNPEIFGDSKRLIVEFSVENTIIVKNRVEKLKNTKDTRNISIDNGDTNKNSSKKFTNNSIIKNKDDLNLKRKASSAETQLSVKKTKIFHKKLFKGRKNNNKKIKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.31
4 0.31
5 0.35
6 0.43
7 0.5
8 0.53
9 0.59
10 0.64
11 0.66
12 0.66
13 0.63
14 0.58
15 0.53
16 0.48
17 0.43
18 0.37
19 0.33
20 0.31
21 0.26
22 0.22
23 0.2
24 0.18
25 0.13
26 0.1
27 0.12
28 0.13
29 0.15
30 0.18
31 0.16
32 0.16
33 0.18
34 0.18
35 0.16
36 0.17
37 0.22
38 0.2
39 0.27
40 0.29
41 0.33
42 0.35
43 0.35
44 0.36
45 0.34
46 0.36
47 0.36
48 0.36
49 0.33
50 0.36
51 0.44
52 0.47
53 0.43
54 0.43
55 0.4
56 0.41
57 0.42
58 0.38
59 0.31
60 0.25
61 0.25
62 0.24
63 0.25
64 0.22
65 0.2
66 0.2
67 0.2
68 0.2
69 0.19
70 0.2
71 0.15
72 0.17
73 0.16
74 0.16
75 0.2
76 0.21
77 0.21
78 0.23
79 0.25
80 0.25
81 0.31
82 0.38
83 0.39
84 0.46
85 0.5
86 0.57
87 0.61
88 0.63
89 0.69
90 0.66
91 0.68
92 0.65
93 0.69
94 0.6
95 0.56
96 0.56
97 0.52
98 0.53
99 0.54
100 0.55
101 0.53
102 0.6
103 0.62
104 0.69
105 0.72
106 0.75
107 0.77
108 0.79
109 0.83
110 0.86
111 0.91
112 0.92
113 0.92
114 0.93
115 0.92
116 0.92
117 0.94
118 0.94
119 0.93
120 0.92
121 0.91
122 0.84
123 0.78
124 0.69
125 0.67
126 0.66
127 0.57
128 0.5
129 0.43
130 0.4
131 0.36
132 0.33
133 0.25
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.13
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.07
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.11
209 0.11
210 0.13
211 0.16
212 0.17
213 0.16
214 0.17
215 0.17
216 0.14
217 0.2
218 0.19
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.16
223 0.15
224 0.16
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.08
247 0.09
248 0.11
249 0.14
250 0.16
251 0.19
252 0.21
253 0.23
254 0.21
255 0.27
256 0.26
257 0.25
258 0.31
259 0.31
260 0.34
261 0.36
262 0.37
263 0.33
264 0.37
265 0.36
266 0.34
267 0.34
268 0.35
269 0.33
270 0.32
271 0.35
272 0.31
273 0.3
274 0.31
275 0.3
276 0.26
277 0.25
278 0.29
279 0.27
280 0.26
281 0.28
282 0.27
283 0.26
284 0.25
285 0.23
286 0.18
287 0.17
288 0.16
289 0.14
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.15
300 0.23
301 0.27
302 0.31
303 0.35
304 0.4
305 0.46
306 0.48
307 0.55
308 0.52
309 0.55
310 0.51
311 0.47
312 0.41
313 0.37
314 0.35
315 0.26
316 0.22
317 0.15
318 0.14
319 0.15
320 0.16
321 0.14
322 0.16
323 0.17
324 0.17
325 0.15
326 0.15
327 0.17
328 0.22
329 0.25
330 0.23
331 0.22
332 0.23
333 0.24
334 0.22
335 0.2
336 0.14
337 0.12
338 0.13
339 0.14
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.2
344 0.24
345 0.26
346 0.25
347 0.28
348 0.26
349 0.33
350 0.39
351 0.44
352 0.48
353 0.55
354 0.6
355 0.66
356 0.74
357 0.77
358 0.8
359 0.81
360 0.79
361 0.76
362 0.77
363 0.71
364 0.63
365 0.56
366 0.45
367 0.37
368 0.3
369 0.23
370 0.17
371 0.17
372 0.15
373 0.11
374 0.17
375 0.15
376 0.14
377 0.14
378 0.13
379 0.14
380 0.14
381 0.16
382 0.11
383 0.12
384 0.14
385 0.18
386 0.2
387 0.2
388 0.21
389 0.2
390 0.22
391 0.28
392 0.31
393 0.36
394 0.41
395 0.43
396 0.46
397 0.47
398 0.52
399 0.49
400 0.52
401 0.47
402 0.44
403 0.46
404 0.45
405 0.47
406 0.41
407 0.39
408 0.38
409 0.37
410 0.36
411 0.33
412 0.32
413 0.33
414 0.36
415 0.44
416 0.45
417 0.5
418 0.48
419 0.44
420 0.43
421 0.42
422 0.39
423 0.32
424 0.29
425 0.22
426 0.26
427 0.32
428 0.31
429 0.29
430 0.32
431 0.33
432 0.34
433 0.42
434 0.46
435 0.5
436 0.51
437 0.5
438 0.48
439 0.52
440 0.52
441 0.48
442 0.51
443 0.5
444 0.58
445 0.58
446 0.6
447 0.52
448 0.46
449 0.44
450 0.37
451 0.33
452 0.29
453 0.31
454 0.3
455 0.31
456 0.31
457 0.33
458 0.32
459 0.32
460 0.3
461 0.31
462 0.36
463 0.38
464 0.47
465 0.43
466 0.42
467 0.44
468 0.48
469 0.5
470 0.49
471 0.52
472 0.51
473 0.55
474 0.58
475 0.59
476 0.6
477 0.58
478 0.58
479 0.6
480 0.58
481 0.62
482 0.64
483 0.63
484 0.58
485 0.59
486 0.56
487 0.49
488 0.49
489 0.44
490 0.45
491 0.4
492 0.37
493 0.35
494 0.32
495 0.33
496 0.29
497 0.24
498 0.17
499 0.16
500 0.16
501 0.15
502 0.14
503 0.13
504 0.14
505 0.15
506 0.17
507 0.18
508 0.2
509 0.22
510 0.21
511 0.21
512 0.18
513 0.21
514 0.21
515 0.21
516 0.23
517 0.2
518 0.22
519 0.22
520 0.2
521 0.17
522 0.16
523 0.17
524 0.14
525 0.16
526 0.17
527 0.16
528 0.16
529 0.17
530 0.19
531 0.17
532 0.18
533 0.18
534 0.2
535 0.26
536 0.35
537 0.37
538 0.43
539 0.52
540 0.61
541 0.68
542 0.69
543 0.72
544 0.73
545 0.76
546 0.75
547 0.71
548 0.63
549 0.56
550 0.54
551 0.47
552 0.43
553 0.39
554 0.36
555 0.29
556 0.31
557 0.36
558 0.35
559 0.36
560 0.37
561 0.41
562 0.47
563 0.53
564 0.58
565 0.62
566 0.64
567 0.72
568 0.76
569 0.73
570 0.68
571 0.66
572 0.59
573 0.54
574 0.56
575 0.55
576 0.52
577 0.56
578 0.55
579 0.53
580 0.53
581 0.52
582 0.49
583 0.47
584 0.48
585 0.45
586 0.46
587 0.47
588 0.49
589 0.5
590 0.47
591 0.43
592 0.4
593 0.4
594 0.47
595 0.55
596 0.59
597 0.64
598 0.72
599 0.8
600 0.85
601 0.9
602 0.9
603 0.9
604 0.91
605 0.93
606 0.93
607 0.94