Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397GM53

Protein Details
Accession A0A397GM53    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-60LTYKKSLEITNRHKSRKRPRSVTPESVQNHydrophilic
103-122EYIQKESKKWWLPKRTDCADHydrophilic
182-203EDEKLPKPKKNKSSKIPAGKTQHydrophilic
285-310SSNFAAKRKKFKMKFRSKKDQQQSIAHydrophilic
421-443HNSIHGKVHKQKRYKLCRVMLRIHydrophilic
475-497QTQGMVRRGKRRIRSKTARMMLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-49SRKR
187-204PKPKKNKSSKIPAGKTQR
291-303KRKKFKMKFRSKK
481-490RRGKRRIRSK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, mito_nucl 12.5, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010095  Transposase_IS605_OrfB_C  
IPR021027  Transposase_put_HTH  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0032196  P:transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF12323  HTH_OrfB_IS605  
PF07282  OrfB_Zn_ribbon  
Amino Acid Sequences MTSQLKHCDDGPTPEELLLSGHLVENDSIQLLTYKKSLEITNRHKSRKRPRSVTPESVQNINETTLNDKSQIFNNTTQNTKSSVISDWDLTGNAGSLLPFWNEYIQKESKKWWLPKRTDCADLDLSLWNGSLRKMGLGSWYSVRISVLKVVKPENLRKTYSQSSRYLWQDIMECVPPPIVEEDEKLPKPKKNKSSKIPAGKTQRIRLFPTQEEKSKLKRWMGTARWTYNRCLVAVKKEGIERTKKALRAQCLNAANFNNTELQWVLETPYDIRDEAMNDLLKSYSSNFAAKRKKFKMKFRSKKDQQQSIAILSKHWGKSKGVYTFLCKMKSAENLPAELHYYSRLMMNRLGEFYLCIPQPLEIWAKNQGPTQSDAVIALDPGVRTFITGYDPSGQAVEWGKNDISRIYRLSHIYDKIQSTHNSIHGKVHKQKRYKLCRVMLRIHKKIRCLINDCHHKLAKWLCQSYRIILLPKFQTQGMVRRGKRRIRSKTARMMLTWSHFRFRQYLLHKVREYPWCRVIICTEEYTSKTCGCCGHIHRKLGGSKVFRCPSCTAELDRDINGARNILLRYLTVTSKEPVXGHASYT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.3
3 0.24
4 0.22
5 0.16
6 0.14
7 0.1
8 0.11
9 0.11
10 0.12
11 0.12
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.09
17 0.11
18 0.11
19 0.13
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.19
24 0.24
25 0.3
26 0.39
27 0.47
28 0.56
29 0.64
30 0.72
31 0.75
32 0.81
33 0.84
34 0.84
35 0.86
36 0.83
37 0.84
38 0.86
39 0.89
40 0.88
41 0.81
42 0.8
43 0.72
44 0.67
45 0.57
46 0.48
47 0.4
48 0.32
49 0.29
50 0.2
51 0.22
52 0.21
53 0.21
54 0.22
55 0.21
56 0.22
57 0.26
58 0.3
59 0.3
60 0.33
61 0.39
62 0.41
63 0.43
64 0.43
65 0.39
66 0.38
67 0.36
68 0.31
69 0.25
70 0.24
71 0.24
72 0.24
73 0.23
74 0.21
75 0.19
76 0.18
77 0.17
78 0.14
79 0.11
80 0.09
81 0.08
82 0.06
83 0.06
84 0.07
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.13
89 0.15
90 0.17
91 0.23
92 0.28
93 0.31
94 0.33
95 0.37
96 0.42
97 0.49
98 0.57
99 0.6
100 0.64
101 0.7
102 0.77
103 0.81
104 0.77
105 0.74
106 0.65
107 0.62
108 0.54
109 0.45
110 0.37
111 0.29
112 0.25
113 0.19
114 0.18
115 0.13
116 0.11
117 0.1
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.14
124 0.15
125 0.17
126 0.17
127 0.19
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.14
132 0.14
133 0.19
134 0.21
135 0.21
136 0.24
137 0.26
138 0.31
139 0.36
140 0.44
141 0.46
142 0.46
143 0.48
144 0.47
145 0.52
146 0.56
147 0.57
148 0.54
149 0.49
150 0.47
151 0.5
152 0.51
153 0.47
154 0.38
155 0.32
156 0.29
157 0.26
158 0.25
159 0.19
160 0.16
161 0.14
162 0.14
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.12
169 0.16
170 0.22
171 0.24
172 0.29
173 0.31
174 0.34
175 0.42
176 0.49
177 0.55
178 0.59
179 0.68
180 0.71
181 0.78
182 0.83
183 0.86
184 0.81
185 0.79
186 0.78
187 0.76
188 0.73
189 0.7
190 0.67
191 0.6
192 0.61
193 0.58
194 0.54
195 0.5
196 0.52
197 0.49
198 0.47
199 0.49
200 0.47
201 0.48
202 0.49
203 0.5
204 0.48
205 0.46
206 0.48
207 0.52
208 0.52
209 0.55
210 0.55
211 0.55
212 0.57
213 0.55
214 0.52
215 0.48
216 0.44
217 0.35
218 0.32
219 0.29
220 0.28
221 0.31
222 0.3
223 0.26
224 0.27
225 0.3
226 0.31
227 0.35
228 0.31
229 0.33
230 0.37
231 0.38
232 0.42
233 0.43
234 0.43
235 0.44
236 0.44
237 0.45
238 0.44
239 0.41
240 0.38
241 0.34
242 0.31
243 0.24
244 0.23
245 0.17
246 0.12
247 0.13
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.08
257 0.09
258 0.08
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.12
274 0.14
275 0.22
276 0.31
277 0.35
278 0.43
279 0.49
280 0.57
281 0.62
282 0.7
283 0.73
284 0.76
285 0.83
286 0.83
287 0.86
288 0.84
289 0.87
290 0.85
291 0.83
292 0.73
293 0.68
294 0.61
295 0.53
296 0.49
297 0.39
298 0.3
299 0.23
300 0.26
301 0.23
302 0.24
303 0.22
304 0.19
305 0.24
306 0.3
307 0.32
308 0.31
309 0.3
310 0.32
311 0.37
312 0.39
313 0.36
314 0.3
315 0.28
316 0.26
317 0.3
318 0.28
319 0.27
320 0.24
321 0.24
322 0.24
323 0.23
324 0.22
325 0.18
326 0.15
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.14
334 0.16
335 0.16
336 0.17
337 0.17
338 0.13
339 0.13
340 0.12
341 0.14
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.12
348 0.15
349 0.12
350 0.14
351 0.19
352 0.21
353 0.22
354 0.24
355 0.24
356 0.22
357 0.24
358 0.24
359 0.19
360 0.17
361 0.16
362 0.14
363 0.12
364 0.1
365 0.08
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.09
375 0.09
376 0.11
377 0.13
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.13
384 0.14
385 0.11
386 0.13
387 0.13
388 0.14
389 0.15
390 0.15
391 0.16
392 0.17
393 0.18
394 0.18
395 0.22
396 0.23
397 0.27
398 0.3
399 0.3
400 0.3
401 0.33
402 0.33
403 0.31
404 0.34
405 0.31
406 0.3
407 0.31
408 0.34
409 0.33
410 0.32
411 0.37
412 0.39
413 0.46
414 0.51
415 0.57
416 0.59
417 0.64
418 0.72
419 0.75
420 0.79
421 0.81
422 0.81
423 0.79
424 0.8
425 0.79
426 0.8
427 0.8
428 0.79
429 0.78
430 0.78
431 0.73
432 0.68
433 0.69
434 0.67
435 0.64
436 0.6
437 0.59
438 0.6
439 0.68
440 0.67
441 0.67
442 0.61
443 0.53
444 0.53
445 0.52
446 0.5
447 0.48
448 0.5
449 0.45
450 0.49
451 0.51
452 0.47
453 0.46
454 0.41
455 0.37
456 0.32
457 0.37
458 0.35
459 0.37
460 0.35
461 0.29
462 0.31
463 0.3
464 0.37
465 0.4
466 0.46
467 0.47
468 0.55
469 0.64
470 0.67
471 0.74
472 0.76
473 0.77
474 0.79
475 0.85
476 0.85
477 0.87
478 0.86
479 0.8
480 0.7
481 0.65
482 0.58
483 0.54
484 0.53
485 0.45
486 0.42
487 0.41
488 0.42
489 0.41
490 0.39
491 0.42
492 0.38
493 0.47
494 0.5
495 0.57
496 0.56
497 0.57
498 0.61
499 0.62
500 0.61
501 0.58
502 0.56
503 0.51
504 0.5
505 0.48
506 0.44
507 0.39
508 0.38
509 0.33
510 0.3
511 0.29
512 0.3
513 0.31
514 0.3
515 0.28
516 0.25
517 0.24
518 0.25
519 0.25
520 0.31
521 0.37
522 0.45
523 0.49
524 0.54
525 0.55
526 0.59
527 0.6
528 0.59
529 0.59
530 0.55
531 0.54
532 0.59
533 0.63
534 0.57
535 0.58
536 0.54
537 0.5
538 0.49
539 0.46
540 0.41
541 0.41
542 0.46
543 0.43
544 0.41
545 0.39
546 0.34
547 0.35
548 0.31
549 0.25
550 0.2
551 0.21
552 0.21
553 0.21
554 0.2
555 0.16
556 0.18
557 0.21
558 0.22
559 0.21
560 0.23
561 0.23
562 0.26
563 0.27
564 0.24
565 0.25