Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397GQH4

Protein Details
Accession A0A397GQH4    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-36VEKYCNTRWKNKWMRELENNRQRQGHydrophilic
43-62YTRFRRLVKRVDINDNQHKRHydrophilic
101-120VNEIEPRKQKGKKKVVESSDHydrophilic
127-154VEEERKSKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNBasic
197-219LQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCHydrophilic
318-349KVVKTEITPKKKSKKKKVIKMVKGNKEKKKENBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-113KQKGKK
131-144RKSKKTVLKKKKKE
326-358PKKKSKKKKVIKMVKGNKEKKKENATRPPLFRK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF08284  RVP_2  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MADWTVWRTGFVEKYCNTRWKNKWMRELENNRQRQGETVDAYYTRFRRLVKRVDINDNQHKRLFIKGLLPHIAPLITMQAPGTLAAALELAQVYEEGLDMVNEIEPRKQKGKKKVVESSDEEEEEEVEEERKSKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNLDDLAKKFKKMQLNLIQKMEKLTTQVNQQPNYHNRGNNRDNSLQNNWNNRNNRNNRNNNRETRTCFKCGKEGHISWDYPDRKDNSDNSAHAKLVEVEEESEKEEDKLLQHLLEAYDAYLGKRERDDSSDEDTPIKRPRETNIPEPKSSLNTFGLPKTMSTPVPKVVKTEITPKKKSKKKKVIKMVKGNKEKKKENATRPPLFRKKDFDIVEKLQNQPAGLSWADALEVPSIRKSFFEALRKPKEKEIKLADQEYSLKTTALKYNVAVGVYTVPTIVDSGVAISIVTRDAMEQLGYEIEEASKSIILPATGKKTQPLGVIRDLPITIQGQTIPIDVEVIDAATYSLLLGNNWLMKANASYNWSDQELTLRWRGKTLTVPANCSKETKEEFPELSENMDEESTNESDTETEESEEDDDEIIFKNTTNLLEKEIKLADQEYSLKTTALKYNVAVGVYTVPTIVDSGVAISIVTRDAMEQLGYEIEEASKSIILPATGKKTQPLGVIRDLPITIQGQTIPIDVEVIDAATYSLLLGNNWLMKANASYNWSDQELTLRWRGKTLTVPANCSKETKEEFPELSENMDEESTNESDTETEESEEDDDEIIFKNTTIEDRDDKSDEDTVSVFLSEKLNKNELDIGQLNNHQQQKFDKLMEQNKDLFAMMLVHWDELISLNIKLM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.46
3 0.53
4 0.54
5 0.58
6 0.63
7 0.67
8 0.75
9 0.77
10 0.8
11 0.79
12 0.83
13 0.84
14 0.86
15 0.86
16 0.86
17 0.84
18 0.77
19 0.71
20 0.62
21 0.55
22 0.51
23 0.47
24 0.4
25 0.35
26 0.35
27 0.33
28 0.35
29 0.38
30 0.34
31 0.31
32 0.32
33 0.34
34 0.4
35 0.48
36 0.56
37 0.58
38 0.67
39 0.69
40 0.75
41 0.79
42 0.79
43 0.81
44 0.79
45 0.73
46 0.65
47 0.61
48 0.52
49 0.51
50 0.46
51 0.38
52 0.39
53 0.39
54 0.44
55 0.45
56 0.44
57 0.38
58 0.35
59 0.31
60 0.23
61 0.18
62 0.16
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.11
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.05
88 0.07
89 0.08
90 0.09
91 0.15
92 0.19
93 0.25
94 0.33
95 0.41
96 0.49
97 0.58
98 0.68
99 0.72
100 0.77
101 0.81
102 0.79
103 0.79
104 0.76
105 0.71
106 0.65
107 0.57
108 0.48
109 0.38
110 0.31
111 0.24
112 0.19
113 0.14
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.15
118 0.17
119 0.18
120 0.24
121 0.31
122 0.41
123 0.51
124 0.6
125 0.69
126 0.77
127 0.86
128 0.9
129 0.93
130 0.93
131 0.92
132 0.91
133 0.9
134 0.89
135 0.83
136 0.76
137 0.71
138 0.62
139 0.54
140 0.44
141 0.34
142 0.28
143 0.29
144 0.28
145 0.3
146 0.29
147 0.29
148 0.34
149 0.39
150 0.45
151 0.42
152 0.51
153 0.53
154 0.62
155 0.66
156 0.67
157 0.63
158 0.55
159 0.54
160 0.45
161 0.35
162 0.27
163 0.25
164 0.21
165 0.26
166 0.33
167 0.37
168 0.39
169 0.42
170 0.47
171 0.5
172 0.54
173 0.53
174 0.5
175 0.49
176 0.55
177 0.59
178 0.57
179 0.58
180 0.57
181 0.55
182 0.57
183 0.57
184 0.56
185 0.55
186 0.58
187 0.58
188 0.6
189 0.62
190 0.63
191 0.67
192 0.68
193 0.73
194 0.73
195 0.78
196 0.8
197 0.84
198 0.87
199 0.85
200 0.83
201 0.79
202 0.75
203 0.72
204 0.69
205 0.65
206 0.6
207 0.54
208 0.54
209 0.5
210 0.5
211 0.51
212 0.46
213 0.47
214 0.47
215 0.45
216 0.39
217 0.46
218 0.41
219 0.34
220 0.38
221 0.34
222 0.33
223 0.37
224 0.38
225 0.35
226 0.38
227 0.38
228 0.38
229 0.37
230 0.33
231 0.29
232 0.27
233 0.22
234 0.17
235 0.16
236 0.11
237 0.1
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.14
263 0.17
264 0.16
265 0.19
266 0.23
267 0.23
268 0.29
269 0.3
270 0.3
271 0.31
272 0.3
273 0.31
274 0.34
275 0.33
276 0.29
277 0.28
278 0.3
279 0.38
280 0.42
281 0.48
282 0.52
283 0.54
284 0.52
285 0.53
286 0.51
287 0.44
288 0.4
289 0.34
290 0.24
291 0.23
292 0.24
293 0.22
294 0.22
295 0.18
296 0.18
297 0.17
298 0.18
299 0.17
300 0.18
301 0.2
302 0.24
303 0.28
304 0.28
305 0.27
306 0.26
307 0.28
308 0.27
309 0.35
310 0.39
311 0.43
312 0.5
313 0.56
314 0.64
315 0.68
316 0.77
317 0.78
318 0.8
319 0.82
320 0.85
321 0.88
322 0.89
323 0.91
324 0.92
325 0.9
326 0.89
327 0.89
328 0.88
329 0.85
330 0.82
331 0.77
332 0.74
333 0.75
334 0.74
335 0.74
336 0.75
337 0.76
338 0.75
339 0.76
340 0.79
341 0.77
342 0.72
343 0.65
344 0.61
345 0.56
346 0.57
347 0.54
348 0.47
349 0.45
350 0.44
351 0.47
352 0.43
353 0.39
354 0.33
355 0.31
356 0.26
357 0.2
358 0.17
359 0.13
360 0.1
361 0.09
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.1
375 0.14
376 0.18
377 0.26
378 0.31
379 0.4
380 0.5
381 0.54
382 0.53
383 0.55
384 0.59
385 0.53
386 0.53
387 0.51
388 0.49
389 0.49
390 0.49
391 0.43
392 0.36
393 0.36
394 0.29
395 0.24
396 0.17
397 0.13
398 0.11
399 0.13
400 0.15
401 0.15
402 0.15
403 0.13
404 0.15
405 0.16
406 0.15
407 0.13
408 0.1
409 0.09
410 0.08
411 0.08
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.07
448 0.09
449 0.15
450 0.17
451 0.17
452 0.18
453 0.19
454 0.21
455 0.25
456 0.26
457 0.24
458 0.25
459 0.27
460 0.26
461 0.26
462 0.23
463 0.18
464 0.17
465 0.13
466 0.11
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.05
476 0.05
477 0.04
478 0.04
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.02
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.05
489 0.06
490 0.07
491 0.07
492 0.08
493 0.06
494 0.07
495 0.08
496 0.09
497 0.1
498 0.12
499 0.13
500 0.14
501 0.15
502 0.16
503 0.15
504 0.14
505 0.15
506 0.15
507 0.17
508 0.22
509 0.24
510 0.23
511 0.24
512 0.25
513 0.24
514 0.27
515 0.3
516 0.33
517 0.31
518 0.37
519 0.39
520 0.43
521 0.41
522 0.37
523 0.32
524 0.3
525 0.31
526 0.3
527 0.3
528 0.29
529 0.29
530 0.3
531 0.31
532 0.25
533 0.22
534 0.19
535 0.15
536 0.12
537 0.12
538 0.09
539 0.08
540 0.11
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.09
545 0.09
546 0.1
547 0.11
548 0.08
549 0.09
550 0.08
551 0.09
552 0.09
553 0.1
554 0.09
555 0.07
556 0.06
557 0.06
558 0.07
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.08
563 0.09
564 0.11
565 0.14
566 0.14
567 0.18
568 0.23
569 0.23
570 0.25
571 0.25
572 0.23
573 0.2
574 0.2
575 0.15
576 0.12
577 0.14
578 0.11
579 0.13
580 0.13
581 0.12
582 0.11
583 0.13
584 0.15
585 0.15
586 0.15
587 0.13
588 0.15
589 0.16
590 0.15
591 0.13
592 0.1
593 0.09
594 0.08
595 0.08
596 0.05
597 0.04
598 0.04
599 0.05
600 0.04
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.03
605 0.03
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.05
629 0.05
630 0.05
631 0.07
632 0.09
633 0.15
634 0.17
635 0.17
636 0.18
637 0.19
638 0.21
639 0.25
640 0.26
641 0.24
642 0.25
643 0.27
644 0.26
645 0.26
646 0.23
647 0.18
648 0.17
649 0.13
650 0.11
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.08
655 0.09
656 0.07
657 0.06
658 0.06
659 0.05
660 0.05
661 0.04
662 0.04
663 0.03
664 0.03
665 0.03
666 0.03
667 0.03
668 0.02
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.05
673 0.06
674 0.07
675 0.07
676 0.08
677 0.06
678 0.07
679 0.08
680 0.09
681 0.1
682 0.12
683 0.13
684 0.14
685 0.15
686 0.16
687 0.15
688 0.14
689 0.15
690 0.15
691 0.17
692 0.22
693 0.24
694 0.23
695 0.24
696 0.25
697 0.24
698 0.27
699 0.3
700 0.33
701 0.31
702 0.37
703 0.39
704 0.43
705 0.41
706 0.37
707 0.32
708 0.3
709 0.31
710 0.3
711 0.3
712 0.29
713 0.29
714 0.3
715 0.31
716 0.25
717 0.22
718 0.19
719 0.15
720 0.12
721 0.12
722 0.09
723 0.08
724 0.11
725 0.1
726 0.1
727 0.1
728 0.09
729 0.09
730 0.1
731 0.11
732 0.08
733 0.09
734 0.08
735 0.09
736 0.09
737 0.1
738 0.09
739 0.07
740 0.06
741 0.06
742 0.07
743 0.07
744 0.07
745 0.07
746 0.08
747 0.09
748 0.12
749 0.15
750 0.19
751 0.24
752 0.27
753 0.32
754 0.33
755 0.34
756 0.34
757 0.35
758 0.3
759 0.27
760 0.24
761 0.2
762 0.18
763 0.17
764 0.14
765 0.12
766 0.16
767 0.2
768 0.26
769 0.31
770 0.34
771 0.34
772 0.36
773 0.4
774 0.36
775 0.38
776 0.34
777 0.31
778 0.31
779 0.35
780 0.37
781 0.38
782 0.45
783 0.38
784 0.39
785 0.42
786 0.44
787 0.46
788 0.44
789 0.44
790 0.47
791 0.56
792 0.59
793 0.59
794 0.55
795 0.51
796 0.49
797 0.42
798 0.33
799 0.25
800 0.2
801 0.15
802 0.17
803 0.16
804 0.15
805 0.15
806 0.14
807 0.14
808 0.12
809 0.15
810 0.11