Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397IRS1

Protein Details
Accession A0A397IRS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
315-336GNEWPFKKYKWKTPQETFKHVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-153RRRKRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007852  Cdc73/Parafibromin  
IPR031336  CDC73_C  
IPR038103  CDC73_C_sf  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF05179  CDC73_C  
Amino Acid Sequences MNEIEESDPLQLLKQYSNKDILPELIDPEGNVVSSLREAAFIKFDNKTFDKNTTTNFRSAATNELLPLSVLYHATITKKLDLVHYNEDATNEKFPTRLGFVDRRNWLDFLKGIISSVSDLGKGSLARSYEKRPFEDTIDSEQQLAAERRRKRKVEYEKDKLWRESYQKKKEILPKSVWESVLESKAKDENYSFFIQIADDFFLKTRKDPQDRSGHLRTSEPIQRTYRSMQSRTKAPRVPIVLVPSAPSAFITMFNVKELLQDERFEDQIKLRDIKSKKERLIQITHKGKQYEFADTTDNFQDSDWDRVVCVITDGNEWPFKKYKWKTPQETFKHVSGIYFKYYGDDIKKCVKTWRNVKCIDIHRDLRHRDPEAYMEFWNVVERVGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.29
3 0.33
4 0.38
5 0.38
6 0.37
7 0.37
8 0.34
9 0.31
10 0.28
11 0.26
12 0.22
13 0.21
14 0.18
15 0.19
16 0.16
17 0.13
18 0.12
19 0.1
20 0.09
21 0.09
22 0.11
23 0.08
24 0.11
25 0.12
26 0.13
27 0.16
28 0.18
29 0.21
30 0.23
31 0.25
32 0.3
33 0.31
34 0.35
35 0.35
36 0.39
37 0.41
38 0.41
39 0.45
40 0.47
41 0.48
42 0.46
43 0.43
44 0.39
45 0.35
46 0.34
47 0.33
48 0.27
49 0.24
50 0.21
51 0.21
52 0.19
53 0.16
54 0.15
55 0.1
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.1
61 0.12
62 0.15
63 0.17
64 0.18
65 0.19
66 0.2
67 0.24
68 0.27
69 0.31
70 0.33
71 0.32
72 0.32
73 0.31
74 0.31
75 0.29
76 0.26
77 0.24
78 0.19
79 0.18
80 0.16
81 0.16
82 0.18
83 0.17
84 0.17
85 0.21
86 0.27
87 0.32
88 0.39
89 0.43
90 0.45
91 0.44
92 0.44
93 0.37
94 0.32
95 0.28
96 0.22
97 0.2
98 0.15
99 0.13
100 0.12
101 0.12
102 0.1
103 0.11
104 0.09
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.09
112 0.1
113 0.14
114 0.17
115 0.23
116 0.29
117 0.32
118 0.35
119 0.36
120 0.37
121 0.37
122 0.39
123 0.35
124 0.35
125 0.36
126 0.33
127 0.29
128 0.27
129 0.24
130 0.23
131 0.22
132 0.21
133 0.24
134 0.31
135 0.4
136 0.48
137 0.51
138 0.53
139 0.61
140 0.67
141 0.71
142 0.74
143 0.73
144 0.73
145 0.78
146 0.77
147 0.69
148 0.6
149 0.54
150 0.51
151 0.53
152 0.56
153 0.58
154 0.59
155 0.59
156 0.63
157 0.67
158 0.67
159 0.63
160 0.56
161 0.51
162 0.5
163 0.51
164 0.45
165 0.36
166 0.31
167 0.28
168 0.28
169 0.24
170 0.19
171 0.17
172 0.19
173 0.19
174 0.17
175 0.15
176 0.12
177 0.16
178 0.17
179 0.16
180 0.13
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.08
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.19
193 0.26
194 0.33
195 0.35
196 0.42
197 0.49
198 0.53
199 0.6
200 0.56
201 0.5
202 0.45
203 0.43
204 0.37
205 0.32
206 0.34
207 0.28
208 0.28
209 0.28
210 0.29
211 0.31
212 0.34
213 0.36
214 0.36
215 0.4
216 0.41
217 0.42
218 0.49
219 0.52
220 0.57
221 0.53
222 0.49
223 0.49
224 0.46
225 0.45
226 0.39
227 0.37
228 0.3
229 0.26
230 0.25
231 0.2
232 0.17
233 0.14
234 0.11
235 0.08
236 0.07
237 0.08
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.13
245 0.14
246 0.15
247 0.14
248 0.15
249 0.17
250 0.18
251 0.19
252 0.18
253 0.18
254 0.17
255 0.21
256 0.25
257 0.25
258 0.25
259 0.32
260 0.33
261 0.42
262 0.49
263 0.52
264 0.54
265 0.59
266 0.65
267 0.63
268 0.7
269 0.68
270 0.69
271 0.69
272 0.69
273 0.65
274 0.61
275 0.54
276 0.52
277 0.46
278 0.43
279 0.35
280 0.32
281 0.32
282 0.3
283 0.34
284 0.29
285 0.27
286 0.19
287 0.17
288 0.21
289 0.19
290 0.23
291 0.2
292 0.18
293 0.17
294 0.18
295 0.19
296 0.14
297 0.13
298 0.1
299 0.09
300 0.12
301 0.13
302 0.15
303 0.2
304 0.21
305 0.24
306 0.28
307 0.29
308 0.38
309 0.44
310 0.51
311 0.57
312 0.67
313 0.72
314 0.78
315 0.87
316 0.84
317 0.86
318 0.8
319 0.71
320 0.65
321 0.55
322 0.48
323 0.42
324 0.37
325 0.32
326 0.29
327 0.26
328 0.24
329 0.25
330 0.27
331 0.29
332 0.28
333 0.29
334 0.38
335 0.41
336 0.4
337 0.49
338 0.52
339 0.55
340 0.63
341 0.69
342 0.69
343 0.69
344 0.71
345 0.7
346 0.71
347 0.69
348 0.68
349 0.66
350 0.65
351 0.71
352 0.73
353 0.72
354 0.72
355 0.67
356 0.61
357 0.56
358 0.54
359 0.5
360 0.46
361 0.39
362 0.33
363 0.29
364 0.26
365 0.26
366 0.19