Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HJ11

Protein Details
Accession A0A397HJ11    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-243SPAEARKKKHVYRLASKPRKGPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-241RKKKHVYRLASKPRK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MLPVISIDSRKARELDISIDLQKIYYHPSGYQRTSKKLYEVSQKAGFDFTLTEVQEWVERQALHQIHMPRPKSRFIPCVSFSNITVPFHIIQGDTCYMSHHQVKNQIYKYALNCIDIASLLEKLFKSRYCPRIFMVDKGTEFRGEVIFLANKYNVKIYIARNKESMGIVERFNRSFEEYIYLIQDAVEMRLPPGERCRDWIDNAPIFLKQYDNSVNRMIGMSPAEARKKKHVYRLASKPRKGPMGFDEEKLPFHVSVRYLLKPGELEGGRRRVTDMNWSPQIYRIKERLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.32
3 0.3
4 0.31
5 0.29
6 0.29
7 0.28
8 0.23
9 0.21
10 0.18
11 0.19
12 0.18
13 0.18
14 0.21
15 0.29
16 0.36
17 0.41
18 0.49
19 0.49
20 0.54
21 0.58
22 0.57
23 0.54
24 0.53
25 0.55
26 0.56
27 0.56
28 0.55
29 0.55
30 0.53
31 0.48
32 0.43
33 0.36
34 0.25
35 0.21
36 0.17
37 0.16
38 0.16
39 0.15
40 0.14
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.14
48 0.22
49 0.22
50 0.21
51 0.26
52 0.3
53 0.33
54 0.41
55 0.44
56 0.42
57 0.44
58 0.47
59 0.48
60 0.48
61 0.48
62 0.44
63 0.49
64 0.46
65 0.48
66 0.47
67 0.43
68 0.38
69 0.37
70 0.35
71 0.28
72 0.26
73 0.23
74 0.19
75 0.18
76 0.18
77 0.12
78 0.1
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.1
83 0.12
84 0.13
85 0.16
86 0.23
87 0.22
88 0.24
89 0.31
90 0.36
91 0.43
92 0.43
93 0.42
94 0.37
95 0.38
96 0.36
97 0.36
98 0.32
99 0.25
100 0.23
101 0.21
102 0.19
103 0.15
104 0.15
105 0.08
106 0.08
107 0.06
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.11
112 0.11
113 0.17
114 0.24
115 0.33
116 0.34
117 0.36
118 0.36
119 0.44
120 0.44
121 0.41
122 0.38
123 0.32
124 0.29
125 0.29
126 0.29
127 0.19
128 0.18
129 0.15
130 0.11
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.13
144 0.17
145 0.25
146 0.28
147 0.29
148 0.29
149 0.29
150 0.29
151 0.26
152 0.22
153 0.17
154 0.16
155 0.15
156 0.19
157 0.21
158 0.19
159 0.2
160 0.2
161 0.18
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.14
166 0.15
167 0.15
168 0.14
169 0.11
170 0.1
171 0.11
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.17
181 0.22
182 0.21
183 0.25
184 0.32
185 0.32
186 0.34
187 0.41
188 0.42
189 0.38
190 0.39
191 0.35
192 0.29
193 0.27
194 0.25
195 0.19
196 0.12
197 0.14
198 0.21
199 0.22
200 0.24
201 0.26
202 0.25
203 0.24
204 0.24
205 0.2
206 0.14
207 0.14
208 0.12
209 0.13
210 0.18
211 0.25
212 0.28
213 0.31
214 0.39
215 0.48
216 0.52
217 0.59
218 0.63
219 0.64
220 0.71
221 0.78
222 0.81
223 0.81
224 0.8
225 0.77
226 0.74
227 0.74
228 0.65
229 0.58
230 0.53
231 0.52
232 0.5
233 0.45
234 0.45
235 0.37
236 0.37
237 0.35
238 0.31
239 0.22
240 0.21
241 0.23
242 0.19
243 0.25
244 0.29
245 0.28
246 0.28
247 0.28
248 0.28
249 0.25
250 0.25
251 0.27
252 0.23
253 0.26
254 0.32
255 0.39
256 0.39
257 0.38
258 0.4
259 0.35
260 0.36
261 0.42
262 0.42
263 0.43
264 0.48
265 0.49
266 0.47
267 0.51
268 0.57
269 0.51
270 0.51