Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HA39

Protein Details
Accession A0A397HA39    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
338-370LIKNPLVSRRKGRSETKRYKSATEKKGKSRAYAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-366RRKGRSETKRYKSATEKKGKS
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MQICDTEHSTDHNLEHSTNHNLEHIVCYPDSFEGESRSTADVQTTSCVEDLNAIIKRTLTASSSLCNLADVLDARLQNEAQWNRFFEYHTMSSCMGIVSVGHDLFPEIDKQMTKYLTPHILSAEQSEMAQCLYFVDFSSLEVADEFVENLYDAKQILLKSMIAEVGEENIQEVWKITDIRPQNSKYSHFVVVVDSISYLCSCMSNISRGIICRHYFRVMMYSKIAGFHIQMIPSRWYTDVQKDNNIVTEACCFINKESAKNYSNELLTPNPSTIPKSVIHVLRRAAQRKLKYGEVWGLARHAAQLTVEEIVVGSVQNQDFQEFTEIQNDANKENELGLIKNPLVSRRKGRSETKRYKSATEKKGKSRAYACGTCNQPGHNSATCQNH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.27
4 0.3
5 0.28
6 0.28
7 0.26
8 0.25
9 0.26
10 0.27
11 0.26
12 0.22
13 0.2
14 0.2
15 0.19
16 0.19
17 0.2
18 0.18
19 0.16
20 0.17
21 0.19
22 0.2
23 0.21
24 0.22
25 0.21
26 0.19
27 0.2
28 0.17
29 0.16
30 0.18
31 0.17
32 0.16
33 0.15
34 0.15
35 0.12
36 0.13
37 0.13
38 0.17
39 0.19
40 0.18
41 0.19
42 0.19
43 0.19
44 0.19
45 0.19
46 0.14
47 0.15
48 0.16
49 0.17
50 0.19
51 0.2
52 0.18
53 0.17
54 0.15
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.14
60 0.14
61 0.15
62 0.16
63 0.15
64 0.15
65 0.23
66 0.24
67 0.25
68 0.28
69 0.29
70 0.3
71 0.32
72 0.31
73 0.25
74 0.28
75 0.27
76 0.26
77 0.27
78 0.25
79 0.24
80 0.23
81 0.2
82 0.13
83 0.1
84 0.08
85 0.06
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.09
94 0.07
95 0.1
96 0.1
97 0.12
98 0.16
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.21
103 0.25
104 0.25
105 0.25
106 0.22
107 0.23
108 0.23
109 0.22
110 0.19
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.1
115 0.08
116 0.08
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.06
162 0.08
163 0.08
164 0.14
165 0.17
166 0.21
167 0.26
168 0.28
169 0.31
170 0.32
171 0.35
172 0.33
173 0.33
174 0.32
175 0.26
176 0.25
177 0.2
178 0.19
179 0.16
180 0.12
181 0.08
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.06
190 0.07
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.15
197 0.17
198 0.18
199 0.19
200 0.21
201 0.21
202 0.21
203 0.2
204 0.25
205 0.21
206 0.22
207 0.2
208 0.19
209 0.17
210 0.18
211 0.18
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.14
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.14
223 0.15
224 0.17
225 0.24
226 0.29
227 0.29
228 0.33
229 0.34
230 0.34
231 0.33
232 0.31
233 0.24
234 0.16
235 0.16
236 0.13
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.18
242 0.18
243 0.2
244 0.22
245 0.28
246 0.3
247 0.3
248 0.32
249 0.28
250 0.28
251 0.25
252 0.24
253 0.2
254 0.2
255 0.2
256 0.18
257 0.17
258 0.17
259 0.19
260 0.17
261 0.19
262 0.17
263 0.19
264 0.24
265 0.29
266 0.31
267 0.32
268 0.33
269 0.36
270 0.44
271 0.45
272 0.46
273 0.48
274 0.5
275 0.54
276 0.56
277 0.53
278 0.47
279 0.47
280 0.44
281 0.41
282 0.37
283 0.3
284 0.27
285 0.23
286 0.22
287 0.19
288 0.14
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.08
302 0.08
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.14
308 0.17
309 0.14
310 0.15
311 0.18
312 0.18
313 0.18
314 0.22
315 0.22
316 0.19
317 0.21
318 0.2
319 0.16
320 0.16
321 0.18
322 0.15
323 0.15
324 0.16
325 0.18
326 0.17
327 0.2
328 0.21
329 0.27
330 0.31
331 0.36
332 0.44
333 0.48
334 0.58
335 0.62
336 0.71
337 0.74
338 0.8
339 0.85
340 0.84
341 0.85
342 0.79
343 0.79
344 0.8
345 0.79
346 0.79
347 0.79
348 0.79
349 0.79
350 0.86
351 0.81
352 0.79
353 0.74
354 0.72
355 0.71
356 0.69
357 0.62
358 0.6
359 0.61
360 0.58
361 0.55
362 0.48
363 0.43
364 0.39
365 0.42
366 0.38
367 0.38