FuNGI

A0A397HV79

Protein Details

Accession

A0A397HV79

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
47-67	EGSNGARRREKKTKDSSSGHL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
35-60	IGRGGREIRSRGEGSNGARRREKKTK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR039177 SMG9
Gene Ontology	GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay

Amino Acid Sequences

MAKISNGSRDFEDRNEEERGMRINREVSNSIHSKIGRGGREIRSRGEGSNGARRREKKTKDSSSGHLTTPYPDHLPKSFYQTPVILERRPQPITPTTPTTPTTSQQSSNENSKPITDQKVVNSETSTDRVSSLNASRVDMKQPTVSGNLRVKSLEKPFVKIINEKGVFNQESVLKILSDLPGHFVIGVCGPQGVGKSTVISTLCQDPQNAFTTQSIDTLNFASHETIGIDIHVTPERIILLDAQPLFSLSILEHAIRNDYIPDNMSPELWLESQSLQVVIFLYSVCNVVITVTESVDYSMWNFLKKAEMLKYRIPEFPTIPSLMTADSGVEYYPDIVLVCNKSAPTDFTTSKFKTLNNLLSKFFKDSNLKIFGSISMSKSFSMFKHESDLPSPNLFLLPYENQPLRLKQESAGLNYLNAPDTFFVMADSLRNQIFQLPKRAGKKGQVSEKEWFKSSMKIWDLVRKSEFLSEYGKLSQKVKEM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.4
3	0.38
4	0.34
5	0.34
6	0.37
7	0.33
8	0.32
9	0.32
10	0.34
11	0.36
12	0.41
13	0.41
14	0.36
15	0.41
16	0.42
17	0.39
18	0.38
19	0.35
20	0.31
21	0.35
22	0.4
23	0.35
24	0.37
25	0.43
26	0.47
27	0.56
28	0.57
29	0.54
30	0.53
31	0.52
32	0.48
33	0.45
34	0.42
35	0.38
36	0.45
37	0.47
38	0.47
39	0.52
40	0.56
41	0.6
42	0.65
43	0.69
44	0.69
45	0.74
46	0.79
47	0.8
48	0.81
49	0.78
50	0.76
51	0.71
52	0.61
53	0.54
54	0.45
55	0.38
56	0.36
57	0.33
58	0.28
59	0.27
60	0.3
61	0.28
62	0.32
63	0.3
64	0.37
65	0.39
66	0.36
67	0.37
68	0.35
69	0.36
70	0.4
71	0.43
72	0.35
73	0.35
74	0.39
75	0.43
76	0.44
77	0.41
78	0.37
79	0.4
80	0.45
81	0.46
82	0.46
83	0.41
84	0.43
85	0.44
86	0.44
87	0.4
88	0.36
89	0.38
90	0.34
91	0.36
92	0.36
93	0.39
94	0.38
95	0.43
96	0.43
97	0.38
98	0.35
99	0.33
100	0.34
101	0.33
102	0.35
103	0.31
104	0.31
105	0.33
106	0.4
107	0.4
108	0.37
109	0.32
110	0.28
111	0.27
112	0.27
113	0.24
114	0.16
115	0.16
116	0.15
117	0.15
118	0.17
119	0.17
120	0.21
121	0.21
122	0.22
123	0.24
124	0.25
125	0.29
126	0.27
127	0.26
128	0.22
129	0.22
130	0.22
131	0.24
132	0.24
133	0.27
134	0.3
135	0.3
136	0.29
137	0.29
138	0.29
139	0.3
140	0.34
141	0.35
142	0.31
143	0.33
144	0.35
145	0.39
146	0.4
147	0.38
148	0.36
149	0.37
150	0.37
151	0.34
152	0.32
153	0.33
154	0.31
155	0.28
156	0.26
157	0.17
158	0.17
159	0.18
160	0.17
161	0.11
162	0.11
163	0.12
164	0.11
165	0.11
166	0.09
167	0.11
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.09
172	0.08
173	0.08
174	0.08
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.08
184	0.08
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.11
189	0.13
190	0.16
191	0.16
192	0.16
193	0.15
194	0.17
195	0.2
196	0.19
197	0.16
198	0.14
199	0.16
200	0.16
201	0.16
202	0.14
203	0.11
204	0.11
205	0.11
206	0.1
207	0.08
208	0.08
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.05
216	0.05
217	0.04
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.06
222	0.07
223	0.07
224	0.06
225	0.07
226	0.06
227	0.06
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.08
232	0.09
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.04
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.09
250	0.1
251	0.11
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.09
257	0.1
258	0.08
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.06
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.06
286	0.1
287	0.1
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.14
292	0.15
293	0.18
294	0.21
295	0.26
296	0.3
297	0.34
298	0.38
299	0.38
300	0.4
301	0.38
302	0.34
303	0.3
304	0.29
305	0.28
306	0.25
307	0.22
308	0.19
309	0.18
310	0.15
311	0.13
312	0.1
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.08
325	0.09
326	0.1
327	0.11
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.15
332	0.15
333	0.2
334	0.21
335	0.23
336	0.31
337	0.32
338	0.35
339	0.35
340	0.32
341	0.33
342	0.39
343	0.44
344	0.44
345	0.46
346	0.44
347	0.46
348	0.47
349	0.44
350	0.39
351	0.36
352	0.34
353	0.34
354	0.38
355	0.4
356	0.38
357	0.35
358	0.34
359	0.29
360	0.28
361	0.28
362	0.23
363	0.2
364	0.21
365	0.2
366	0.21
367	0.22
368	0.18
369	0.24
370	0.23
371	0.21
372	0.27
373	0.29
374	0.31
375	0.32
376	0.36
377	0.31
378	0.31
379	0.3
380	0.24
381	0.22
382	0.19
383	0.16
384	0.16
385	0.16
386	0.17
387	0.23
388	0.23
389	0.27
390	0.3
391	0.33
392	0.35
393	0.36
394	0.35
395	0.3
396	0.37
397	0.37
398	0.37
399	0.38
400	0.31
401	0.28
402	0.28
403	0.28
404	0.22
405	0.18
406	0.15
407	0.11
408	0.13
409	0.13
410	0.11
411	0.1
412	0.09
413	0.1
414	0.11
415	0.12
416	0.13
417	0.13
418	0.13
419	0.13
420	0.18
421	0.26
422	0.29
423	0.37
424	0.4
425	0.48
426	0.54
427	0.6
428	0.6
429	0.61
430	0.66
431	0.67
432	0.71
433	0.71
434	0.7
435	0.72
436	0.74
437	0.69
438	0.62
439	0.57
440	0.48
441	0.46
442	0.45
443	0.46
444	0.4
445	0.41
446	0.43
447	0.48
448	0.51
449	0.51
450	0.5
451	0.42
452	0.41
453	0.42
454	0.4
455	0.32
456	0.34
457	0.29
458	0.29
459	0.33
460	0.36
461	0.33
462	0.35

A0A397HV79

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer