Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HT05

Protein Details
Accession A0A397HT05    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-140SVKDPESKSNLKKRNKKKSHDRVDARITNKITKSEKRRLRRIRERHSNTICFHydrophilic
254-277DDYHIFIKEKKKFKKEEENESLSFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-133SNLKKRNKKKSHDRVDARITNKITKSEKRRLRRIRER
264-266KKF
282-289KIKSKKKK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042246  ZCCHC9  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTRYTKLEKKKFEKAAGFNVAPLIPERGKNQEESEEESEEESGEESEKESEKESEEEIEHKEKSPINNKKRTLDNEETDDIISVKEENSVKDPESKSNLKKRNKKKSHDRVDARITNKITKSEKRRLRRIRERHSNTICFGCREKGHSVRDCPIAKEKGVGICYNCGSAEHIAKDCRRLLKEVDKYQYAKCFVCNEQGHLSSKCPKNEKGLYPKGGGCRFCGKVDHLAKDCTLKKEDLGIVSVGKIDLNHADDDDYHIFIKEKKKFKKEEENESLSFAHAEKIKSKKKKIINF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.76
3 0.74
4 0.66
5 0.56
6 0.5
7 0.41
8 0.32
9 0.28
10 0.24
11 0.18
12 0.21
13 0.23
14 0.29
15 0.3
16 0.33
17 0.34
18 0.35
19 0.36
20 0.41
21 0.41
22 0.35
23 0.34
24 0.31
25 0.28
26 0.22
27 0.19
28 0.12
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.11
34 0.12
35 0.13
36 0.14
37 0.15
38 0.17
39 0.18
40 0.18
41 0.19
42 0.18
43 0.2
44 0.22
45 0.25
46 0.24
47 0.24
48 0.27
49 0.27
50 0.34
51 0.42
52 0.48
53 0.54
54 0.62
55 0.65
56 0.68
57 0.72
58 0.71
59 0.7
60 0.67
61 0.62
62 0.58
63 0.55
64 0.49
65 0.41
66 0.35
67 0.26
68 0.17
69 0.13
70 0.08
71 0.07
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.15
76 0.17
77 0.18
78 0.25
79 0.27
80 0.27
81 0.32
82 0.38
83 0.42
84 0.51
85 0.59
86 0.62
87 0.7
88 0.76
89 0.81
90 0.84
91 0.87
92 0.88
93 0.9
94 0.91
95 0.91
96 0.87
97 0.82
98 0.82
99 0.78
100 0.69
101 0.63
102 0.54
103 0.49
104 0.44
105 0.42
106 0.39
107 0.4
108 0.47
109 0.5
110 0.57
111 0.61
112 0.7
113 0.75
114 0.8
115 0.83
116 0.85
117 0.86
118 0.88
119 0.87
120 0.86
121 0.83
122 0.74
123 0.65
124 0.59
125 0.5
126 0.4
127 0.34
128 0.27
129 0.21
130 0.23
131 0.26
132 0.27
133 0.33
134 0.34
135 0.36
136 0.36
137 0.42
138 0.39
139 0.36
140 0.36
141 0.32
142 0.28
143 0.27
144 0.25
145 0.21
146 0.22
147 0.21
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.13
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.14
159 0.17
160 0.17
161 0.21
162 0.22
163 0.25
164 0.25
165 0.26
166 0.29
167 0.36
168 0.44
169 0.47
170 0.48
171 0.47
172 0.48
173 0.48
174 0.48
175 0.42
176 0.33
177 0.29
178 0.29
179 0.26
180 0.33
181 0.31
182 0.3
183 0.31
184 0.33
185 0.35
186 0.32
187 0.33
188 0.33
189 0.38
190 0.4
191 0.41
192 0.4
193 0.45
194 0.52
195 0.57
196 0.58
197 0.61
198 0.59
199 0.57
200 0.58
201 0.56
202 0.54
203 0.47
204 0.4
205 0.39
206 0.37
207 0.36
208 0.35
209 0.31
210 0.35
211 0.4
212 0.43
213 0.39
214 0.39
215 0.38
216 0.43
217 0.44
218 0.39
219 0.37
220 0.31
221 0.29
222 0.33
223 0.34
224 0.28
225 0.25
226 0.22
227 0.19
228 0.18
229 0.18
230 0.12
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.13
239 0.13
240 0.19
241 0.19
242 0.17
243 0.15
244 0.16
245 0.17
246 0.21
247 0.31
248 0.34
249 0.42
250 0.51
251 0.6
252 0.68
253 0.76
254 0.83
255 0.82
256 0.84
257 0.84
258 0.81
259 0.72
260 0.66
261 0.57
262 0.46
263 0.39
264 0.28
265 0.23
266 0.2
267 0.22
268 0.26
269 0.36
270 0.45
271 0.54
272 0.63
273 0.67