Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397IYT5

Protein Details
Accession A0A397IYT5    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-134LITPEEREQRRQRYQQRRLERQIQRENQNHydrophilic
422-449AEEERKPKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
426-439RKPKKTVLKKKKKE
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MVIAKRCNDCVDEAIKQKNEALSEIVERELSREEKDPNYEVTYTLKDLNRVKDHLDLIKHHVWIRDNILVDNGRTVFNIPTRRTVQRLTPEEREQRRQLYRQRQLLITPEEREQRRQRYQQRRLERQIQRENQNPVTVRLPASNSTTTSPSATVGTFGTTPRRRRRSNETPQSFSQAVSPRRSPEQVTPHFNLLNQQLAEAHLTTSDSSDSSDTDTKDEMANAVLDYLEDNLHNHTSLRVDPFYGDGTQDPLQWMLHFEKVARSNAWDEAKKIRKYATYLEDDAEEWHDEINANDMADWAAWRAGFVEKYCNTRWRNKWMRELENNRQRQGETVDAYYARFRRLVKRVEINVNQHKRLFIKGLLPYIAPLITMQAPGTLAAALELAQAYEEGLDMVNEIEPCKQKGKKKVVESSDEEEEEEAEEERKPKKTVLKKKKKETKVTFDPAHNLDDLAKKFEKMQLNLIQKMEKLX
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.44
3 0.43
4 0.44
5 0.42
6 0.38
7 0.33
8 0.29
9 0.23
10 0.25
11 0.25
12 0.22
13 0.21
14 0.19
15 0.19
16 0.22
17 0.21
18 0.21
19 0.24
20 0.28
21 0.31
22 0.37
23 0.37
24 0.36
25 0.38
26 0.36
27 0.33
28 0.32
29 0.31
30 0.28
31 0.31
32 0.29
33 0.32
34 0.37
35 0.45
36 0.46
37 0.45
38 0.46
39 0.45
40 0.47
41 0.46
42 0.45
43 0.4
44 0.42
45 0.44
46 0.45
47 0.42
48 0.42
49 0.39
50 0.38
51 0.4
52 0.37
53 0.33
54 0.31
55 0.33
56 0.3
57 0.27
58 0.27
59 0.23
60 0.18
61 0.18
62 0.19
63 0.17
64 0.22
65 0.3
66 0.28
67 0.34
68 0.39
69 0.43
70 0.45
71 0.45
72 0.47
73 0.49
74 0.55
75 0.54
76 0.56
77 0.61
78 0.67
79 0.7
80 0.7
81 0.65
82 0.66
83 0.67
84 0.69
85 0.7
86 0.72
87 0.74
88 0.74
89 0.72
90 0.65
91 0.6
92 0.59
93 0.56
94 0.49
95 0.42
96 0.39
97 0.43
98 0.43
99 0.49
100 0.51
101 0.54
102 0.59
103 0.67
104 0.72
105 0.76
106 0.84
107 0.85
108 0.88
109 0.88
110 0.87
111 0.88
112 0.85
113 0.84
114 0.84
115 0.82
116 0.78
117 0.75
118 0.73
119 0.65
120 0.63
121 0.53
122 0.46
123 0.4
124 0.34
125 0.28
126 0.24
127 0.24
128 0.21
129 0.24
130 0.23
131 0.22
132 0.22
133 0.23
134 0.22
135 0.2
136 0.18
137 0.15
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.19
146 0.24
147 0.33
148 0.42
149 0.51
150 0.54
151 0.6
152 0.69
153 0.7
154 0.75
155 0.78
156 0.75
157 0.72
158 0.68
159 0.68
160 0.58
161 0.47
162 0.41
163 0.38
164 0.36
165 0.34
166 0.35
167 0.32
168 0.35
169 0.36
170 0.33
171 0.33
172 0.39
173 0.41
174 0.45
175 0.44
176 0.44
177 0.43
178 0.4
179 0.36
180 0.27
181 0.25
182 0.18
183 0.16
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.11
188 0.1
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.09
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.1
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.08
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.12
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.11
246 0.15
247 0.18
248 0.2
249 0.18
250 0.18
251 0.18
252 0.22
253 0.26
254 0.23
255 0.21
256 0.29
257 0.37
258 0.36
259 0.36
260 0.34
261 0.33
262 0.35
263 0.39
264 0.37
265 0.33
266 0.33
267 0.32
268 0.3
269 0.27
270 0.25
271 0.2
272 0.14
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.16
295 0.18
296 0.23
297 0.26
298 0.33
299 0.35
300 0.44
301 0.49
302 0.53
303 0.61
304 0.63
305 0.7
306 0.7
307 0.75
308 0.75
309 0.79
310 0.78
311 0.78
312 0.76
313 0.68
314 0.61
315 0.53
316 0.45
317 0.4
318 0.35
319 0.27
320 0.23
321 0.23
322 0.22
323 0.23
324 0.25
325 0.23
326 0.19
327 0.2
328 0.21
329 0.28
330 0.35
331 0.41
332 0.44
333 0.51
334 0.56
335 0.62
336 0.66
337 0.66
338 0.69
339 0.69
340 0.65
341 0.57
342 0.53
343 0.46
344 0.43
345 0.38
346 0.3
347 0.3
348 0.3
349 0.32
350 0.31
351 0.29
352 0.26
353 0.23
354 0.2
355 0.14
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.07
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.05
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.13
387 0.16
388 0.19
389 0.27
390 0.33
391 0.39
392 0.49
393 0.6
394 0.64
395 0.7
396 0.77
397 0.77
398 0.78
399 0.76
400 0.72
401 0.66
402 0.58
403 0.49
404 0.39
405 0.32
406 0.25
407 0.2
408 0.15
409 0.1
410 0.12
411 0.16
412 0.21
413 0.25
414 0.26
415 0.32
416 0.41
417 0.51
418 0.6
419 0.67
420 0.74
421 0.79
422 0.88
423 0.93
424 0.94
425 0.94
426 0.93
427 0.92
428 0.91
429 0.91
430 0.86
431 0.8
432 0.76
433 0.67
434 0.59
435 0.49
436 0.39
437 0.33
438 0.34
439 0.31
440 0.31
441 0.3
442 0.28
443 0.31
444 0.37
445 0.42
446 0.38
447 0.45
448 0.47
449 0.54
450 0.58
451 0.58