FuNGI

A0A397IQ93

Protein Details

Accession

A0A397IQ93

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
339-360	PFSVRTILKRRRQTERLRIPEN	Hydrophilic
393-416	EIESLMRKRKKTKTTQEENIKEES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSNRPNHNTQNRKGRSDYNYLCGMRYRHLLPQPLDPPIDLVWKPDLEKIMNVRRTSRTVQSTRLPLLSDADLGMPYDLSVVSNAFYGDDSVLCPRRFSGLDSKDVALLVPAKPAINVIPGLAQLRRHSNDPKTWLRRTQYISASESAYRNDNAAMTMESRMATLKASNEFLLRTHEEQIAAIEYSFEAANDPKRLKQLKHAKDPNIKPVEIIPVFPDFEVRNALLAHLILDGDPWGGISLEDDDDHGEMIQDRAAKAIKRPMASGTERFLMLYAPSKESTERLQNKRRFEDLDGEVFTFKWVRDYNIENQYYPKNSELLFYEKYVDDDMNKEKHMLYSPFSVRTILKRRRQTERLRIPENYGKSSYLKSNYKAPIDDKEFIEVCRSNRLHEHEIESLMRKRKKTKTTQEENIKEESIKEESIKEENLQEESIQEDTIQEDTIQEDTIQEDTFFNKNNHSEI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.7
3	0.7
4	0.66
5	0.6
6	0.61
7	0.56
8	0.52
9	0.49
10	0.45
11	0.38
12	0.39
13	0.37
14	0.36
15	0.42
16	0.49
17	0.46
18	0.52
19	0.52
20	0.52
21	0.5
22	0.41
23	0.37
24	0.31
25	0.35
26	0.26
27	0.25
28	0.24
29	0.25
30	0.26
31	0.27
32	0.3
33	0.25
34	0.29
35	0.35
36	0.41
37	0.45
38	0.46
39	0.48
40	0.49
41	0.53
42	0.53
43	0.53
44	0.53
45	0.51
46	0.55
47	0.57
48	0.58
49	0.56
50	0.53
51	0.46
52	0.37
53	0.36
54	0.3
55	0.23
56	0.17
57	0.15
58	0.13
59	0.12
60	0.11
61	0.08
62	0.06
63	0.06
64	0.06
65	0.05
66	0.06
67	0.06
68	0.06
69	0.07
70	0.07
71	0.07
72	0.07
73	0.07
74	0.07
75	0.07
76	0.08
77	0.14
78	0.2
79	0.2
80	0.2
81	0.2
82	0.24
83	0.24
84	0.28
85	0.32
86	0.3
87	0.35
88	0.38
89	0.38
90	0.34
91	0.33
92	0.29
93	0.19
94	0.18
95	0.13
96	0.12
97	0.12
98	0.11
99	0.11
100	0.12
101	0.11
102	0.11
103	0.1
104	0.09
105	0.09
106	0.1
107	0.12
108	0.13
109	0.14
110	0.15
111	0.22
112	0.23
113	0.27
114	0.33
115	0.38
116	0.42
117	0.48
118	0.55
119	0.56
120	0.6
121	0.63
122	0.6
123	0.61
124	0.6
125	0.6
126	0.55
127	0.52
128	0.49
129	0.43
130	0.41
131	0.37
132	0.32
133	0.26
134	0.23
135	0.19
136	0.16
137	0.15
138	0.13
139	0.11
140	0.11
141	0.1
142	0.09
143	0.09
144	0.1
145	0.09
146	0.09
147	0.09
148	0.08
149	0.08
150	0.08
151	0.1
152	0.12
153	0.13
154	0.13
155	0.13
156	0.14
157	0.14
158	0.17
159	0.18
160	0.18
161	0.19
162	0.19
163	0.19
164	0.18
165	0.18
166	0.15
167	0.12
168	0.1
169	0.07
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.05
174	0.05
175	0.06
176	0.1
177	0.13
178	0.15
179	0.16
180	0.23
181	0.28
182	0.28
183	0.37
184	0.45
185	0.49
186	0.59
187	0.65
188	0.66
189	0.71
190	0.73
191	0.73
192	0.66
193	0.57
194	0.47
195	0.41
196	0.39
197	0.3
198	0.27
199	0.19
200	0.16
201	0.16
202	0.16
203	0.16
204	0.09
205	0.1
206	0.11
207	0.1
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.08
212	0.07
213	0.07
214	0.05
215	0.05
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.04
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.07
241	0.1
242	0.1
243	0.12
244	0.19
245	0.21
246	0.21
247	0.22
248	0.23
249	0.27
250	0.29
251	0.29
252	0.25
253	0.23
254	0.22
255	0.21
256	0.19
257	0.13
258	0.11
259	0.14
260	0.13
261	0.14
262	0.15
263	0.16
264	0.16
265	0.18
266	0.2
267	0.25
268	0.32
269	0.39
270	0.48
271	0.53
272	0.6
273	0.62
274	0.62
275	0.55
276	0.49
277	0.47
278	0.41
279	0.39
280	0.33
281	0.3
282	0.26
283	0.23
284	0.21
285	0.15
286	0.12
287	0.12
288	0.12
289	0.14
290	0.17
291	0.22
292	0.29
293	0.37
294	0.38
295	0.34
296	0.36
297	0.38
298	0.36
299	0.34
300	0.28
301	0.21
302	0.2
303	0.21
304	0.21
305	0.22
306	0.22
307	0.2
308	0.22
309	0.2
310	0.21
311	0.2
312	0.18
313	0.13
314	0.15
315	0.2
316	0.2
317	0.21
318	0.21
319	0.2
320	0.22
321	0.26
322	0.24
323	0.22
324	0.27
325	0.29
326	0.31
327	0.31
328	0.31
329	0.27
330	0.34
331	0.42
332	0.43
333	0.5
334	0.56
335	0.62
336	0.7
337	0.78
338	0.79
339	0.8
340	0.82
341	0.82
342	0.78
343	0.74
344	0.71
345	0.69
346	0.63
347	0.56
348	0.47
349	0.41
350	0.37
351	0.38
352	0.37
353	0.38
354	0.39
355	0.37
356	0.43
357	0.47
358	0.48
359	0.49
360	0.45
361	0.46
362	0.48
363	0.49
364	0.41
365	0.41
366	0.38
367	0.35
368	0.38
369	0.32
370	0.27
371	0.33
372	0.33
373	0.3
374	0.36
375	0.43
376	0.43
377	0.43
378	0.46
379	0.39
380	0.42
381	0.42
382	0.41
383	0.4
384	0.44
385	0.47
386	0.47
387	0.54
388	0.6
389	0.68
390	0.73
391	0.78
392	0.79
393	0.84
394	0.89
395	0.91
396	0.88
397	0.81
398	0.74
399	0.65
400	0.54
401	0.45
402	0.38
403	0.3
404	0.25
405	0.23
406	0.21
407	0.23
408	0.26
409	0.27
410	0.25
411	0.25
412	0.25
413	0.26
414	0.25
415	0.22
416	0.18
417	0.18
418	0.17
419	0.14
420	0.12
421	0.1
422	0.1
423	0.11
424	0.11
425	0.09
426	0.09
427	0.1
428	0.11
429	0.11
430	0.1
431	0.09
432	0.1
433	0.12
434	0.12
435	0.11
436	0.11
437	0.14
438	0.18
439	0.22
440	0.22
441	0.27

A0A397IQ93

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer