Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HCL2

Protein Details
Accession A0A397HCL2    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MSKYGRKPRPRGSKAGQWSSEHydrophilic
54-79NYNNSNNYRNNNNRNNRNNYKIRPTIHydrophilic
1095-1121IAFSSKYKCKERCSKKLECGHKCEKACHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-10PRP
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13, mito 2, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045055  DNA2/NAM7-like  
IPR041679  DNA2/NAM7-like_C  
IPR041677  DNA2/NAM7_AAA_11  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR047187  SF1_C_Upf1  
Gene Ontology GO:0004386  F:helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13086  AAA_11  
PF13087  AAA_12  
CDD cd17936  EEXXEc_NFX1  
cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd18808  SF1_C_Upf1  
Amino Acid Sequences MSKYGRKPRPRGSKAGQWSSEGLSDETVQNNNNYTYNNYNNNNSQQSRRGGGGNYNNSNNYRNNNNRNNRNNYKIRPTIPQLIELVKPSKNTGFRSIPVIPTHKEIISFPPPESIPINKIETPYSSIEEYLETHYKLLREDCIRPLREGIEDYIYPKEDVKAKDNVKDGVKDDSNKLIDPRRPSLRIYENINLVGVTYANVGVVHRISFRTQHGERIKWITSKRLIPGTLVIFTKDKFKTVKFATVVSRHESLLEKSWDLQIDVLFRPEDAEFVLPEGYIMVEATSSYFEAYRHVLNVLQEMNPETLPFQEHIINGNGKIEIPKYLEMRMQSNPKYDFEEIPAFPDLEKHLGTSHIDVTKDWNEWPHIDQMNTELHATQYEALKRIISRKLALIQGPPGTGKTYIGLAAVKILLKNTPGVIIIACQTNHALDQFLSGILEFEPEVVRLGSRSKSEKIKNLTLFSKFQSLRNSDTESAPYNPETGRLYKKRDTIMNKMTKLCREIEDPYISLDYVISNKILSEAQLQSLKQEDWVSSSSNNDSKDDDQKNIKDWLTESVSTHSAVHAEIEFNVSQAVDIEKKKDEEDEDEVDEEVLKEIQEEFQSVEGGKMVNGSFSELRGEQYINDDVYVNENDLNRYAKCKDLWEIPTNVRAVLHNRWRNERLEVICDELKQLFQEYQKLSNEIKREKIREDLAILKSARVVGMTTTAAAKYHELLINLKPKIMIVEEAAETLEAHIVTALTPYTEHLILIGDHQQLRPNVSVYDLAKNHNLDVSLFERLTKFLPLTQLTEQRRMRTEIRELLTPIYGDILTDHPRVNDYPKVQGIVDDLFFFDHTQEETTMANSMSKYNEFEAKICSKLASFLVKNGTNPQTITILSMYSGQRRKIEDLLRNESRSYPQIKSIRVSSVDGYQGEENEIIILSLVRSRDPRYGIGFLRVSNRVCVALSRAKHGLYIFGNEAQLSRQSDLWKIILRRMKKNSCLGQFIDLFCPKHSDIEKGFDGLALTQAWCYNDIPSIGGCTKKCGESLPCGHICDNECHFELHTRISCQAKCTSTLKCGHPCKNKCGEACGDCKVTIQLDPECGHSKEITCDIAFSSKYKCKERCSKKLECGHKCEKACSAPCTTNCDVDVKFKYPCGHINRVKCYQLETKKNEPCYFCKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.84
3 0.75
4 0.67
5 0.62
6 0.54
7 0.5
8 0.41
9 0.32
10 0.23
11 0.23
12 0.22
13 0.22
14 0.22
15 0.21
16 0.21
17 0.23
18 0.24
19 0.24
20 0.23
21 0.25
22 0.3
23 0.36
24 0.42
25 0.43
26 0.47
27 0.52
28 0.57
29 0.61
30 0.58
31 0.56
32 0.55
33 0.56
34 0.53
35 0.49
36 0.45
37 0.4
38 0.44
39 0.48
40 0.5
41 0.51
42 0.52
43 0.54
44 0.53
45 0.55
46 0.5
47 0.46
48 0.47
49 0.51
50 0.58
51 0.65
52 0.72
53 0.78
54 0.83
55 0.88
56 0.86
57 0.86
58 0.85
59 0.82
60 0.82
61 0.79
62 0.73
63 0.72
64 0.7
65 0.71
66 0.62
67 0.58
68 0.51
69 0.46
70 0.45
71 0.41
72 0.38
73 0.3
74 0.3
75 0.3
76 0.34
77 0.37
78 0.4
79 0.43
80 0.45
81 0.44
82 0.49
83 0.49
84 0.47
85 0.47
86 0.47
87 0.41
88 0.4
89 0.42
90 0.35
91 0.33
92 0.3
93 0.32
94 0.34
95 0.34
96 0.3
97 0.32
98 0.31
99 0.33
100 0.34
101 0.31
102 0.26
103 0.29
104 0.34
105 0.31
106 0.32
107 0.31
108 0.3
109 0.31
110 0.3
111 0.29
112 0.24
113 0.23
114 0.22
115 0.21
116 0.2
117 0.21
118 0.22
119 0.2
120 0.2
121 0.22
122 0.22
123 0.24
124 0.24
125 0.26
126 0.27
127 0.31
128 0.39
129 0.46
130 0.47
131 0.46
132 0.46
133 0.41
134 0.39
135 0.37
136 0.3
137 0.26
138 0.25
139 0.25
140 0.26
141 0.25
142 0.23
143 0.22
144 0.23
145 0.25
146 0.28
147 0.3
148 0.36
149 0.38
150 0.44
151 0.47
152 0.48
153 0.46
154 0.46
155 0.43
156 0.42
157 0.43
158 0.4
159 0.39
160 0.41
161 0.39
162 0.37
163 0.4
164 0.39
165 0.4
166 0.43
167 0.48
168 0.49
169 0.49
170 0.49
171 0.53
172 0.54
173 0.54
174 0.54
175 0.52
176 0.46
177 0.44
178 0.43
179 0.34
180 0.26
181 0.21
182 0.14
183 0.09
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.13
195 0.17
196 0.2
197 0.27
198 0.27
199 0.36
200 0.42
201 0.43
202 0.46
203 0.48
204 0.49
205 0.46
206 0.47
207 0.46
208 0.45
209 0.47
210 0.48
211 0.47
212 0.44
213 0.39
214 0.42
215 0.36
216 0.33
217 0.29
218 0.26
219 0.22
220 0.22
221 0.29
222 0.24
223 0.26
224 0.25
225 0.26
226 0.33
227 0.35
228 0.43
229 0.36
230 0.4
231 0.43
232 0.45
233 0.47
234 0.42
235 0.4
236 0.32
237 0.33
238 0.31
239 0.27
240 0.27
241 0.27
242 0.23
243 0.23
244 0.26
245 0.24
246 0.22
247 0.21
248 0.16
249 0.17
250 0.16
251 0.17
252 0.14
253 0.13
254 0.14
255 0.13
256 0.12
257 0.1
258 0.1
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.09
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.12
282 0.14
283 0.13
284 0.16
285 0.16
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.16
290 0.14
291 0.13
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.15
300 0.18
301 0.19
302 0.17
303 0.18
304 0.16
305 0.14
306 0.15
307 0.13
308 0.12
309 0.14
310 0.17
311 0.17
312 0.19
313 0.21
314 0.22
315 0.24
316 0.27
317 0.32
318 0.31
319 0.36
320 0.37
321 0.36
322 0.39
323 0.38
324 0.34
325 0.3
326 0.33
327 0.27
328 0.28
329 0.27
330 0.22
331 0.2
332 0.2
333 0.17
334 0.14
335 0.14
336 0.12
337 0.11
338 0.13
339 0.14
340 0.14
341 0.17
342 0.17
343 0.17
344 0.17
345 0.21
346 0.23
347 0.23
348 0.21
349 0.2
350 0.19
351 0.21
352 0.23
353 0.25
354 0.24
355 0.23
356 0.22
357 0.22
358 0.22
359 0.21
360 0.2
361 0.13
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.12
367 0.13
368 0.15
369 0.15
370 0.16
371 0.18
372 0.23
373 0.26
374 0.24
375 0.24
376 0.25
377 0.28
378 0.3
379 0.3
380 0.26
381 0.25
382 0.24
383 0.23
384 0.2
385 0.17
386 0.15
387 0.14
388 0.12
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.08
400 0.07
401 0.08
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.08
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.05
426 0.05
427 0.04
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.06
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.09
436 0.1
437 0.13
438 0.17
439 0.21
440 0.29
441 0.33
442 0.4
443 0.44
444 0.5
445 0.5
446 0.5
447 0.5
448 0.45
449 0.43
450 0.37
451 0.39
452 0.32
453 0.32
454 0.35
455 0.34
456 0.34
457 0.35
458 0.38
459 0.31
460 0.31
461 0.3
462 0.25
463 0.24
464 0.22
465 0.19
466 0.16
467 0.14
468 0.15
469 0.15
470 0.17
471 0.24
472 0.27
473 0.34
474 0.37
475 0.42
476 0.43
477 0.48
478 0.5
479 0.5
480 0.55
481 0.57
482 0.55
483 0.55
484 0.54
485 0.49
486 0.46
487 0.39
488 0.31
489 0.26
490 0.26
491 0.25
492 0.25
493 0.23
494 0.21
495 0.2
496 0.18
497 0.15
498 0.12
499 0.08
500 0.07
501 0.07
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.09
509 0.09
510 0.12
511 0.14
512 0.14
513 0.13
514 0.15
515 0.15
516 0.12
517 0.13
518 0.1
519 0.11
520 0.12
521 0.13
522 0.11
523 0.13
524 0.14
525 0.16
526 0.17
527 0.16
528 0.17
529 0.18
530 0.26
531 0.27
532 0.27
533 0.29
534 0.3
535 0.32
536 0.33
537 0.31
538 0.23
539 0.22
540 0.23
541 0.21
542 0.2
543 0.18
544 0.17
545 0.17
546 0.17
547 0.17
548 0.12
549 0.1
550 0.09
551 0.09
552 0.06
553 0.06
554 0.05
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.06
560 0.05
561 0.05
562 0.06
563 0.08
564 0.08
565 0.11
566 0.12
567 0.13
568 0.13
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.18
573 0.18
574 0.17
575 0.17
576 0.17
577 0.15
578 0.14
579 0.11
580 0.07
581 0.05
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.05
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.07
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.06
594 0.06
595 0.05
596 0.06
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.09
604 0.08
605 0.09
606 0.1
607 0.1
608 0.08
609 0.11
610 0.12
611 0.1
612 0.1
613 0.1
614 0.09
615 0.11
616 0.11
617 0.09
618 0.1
619 0.1
620 0.1
621 0.11
622 0.13
623 0.11
624 0.14
625 0.14
626 0.15
627 0.16
628 0.18
629 0.19
630 0.23
631 0.28
632 0.29
633 0.31
634 0.3
635 0.32
636 0.31
637 0.28
638 0.22
639 0.18
640 0.18
641 0.22
642 0.3
643 0.31
644 0.33
645 0.39
646 0.42
647 0.43
648 0.41
649 0.4
650 0.32
651 0.31
652 0.29
653 0.27
654 0.25
655 0.23
656 0.22
657 0.16
658 0.15
659 0.11
660 0.12
661 0.1
662 0.11
663 0.16
664 0.17
665 0.22
666 0.23
667 0.26
668 0.26
669 0.27
670 0.33
671 0.3
672 0.36
673 0.36
674 0.38
675 0.37
676 0.4
677 0.39
678 0.34
679 0.33
680 0.33
681 0.28
682 0.3
683 0.28
684 0.24
685 0.22
686 0.21
687 0.18
688 0.11
689 0.1
690 0.05
691 0.07
692 0.07
693 0.07
694 0.07
695 0.07
696 0.08
697 0.08
698 0.08
699 0.07
700 0.1
701 0.11
702 0.11
703 0.13
704 0.18
705 0.25
706 0.24
707 0.24
708 0.21
709 0.19
710 0.19
711 0.18
712 0.14
713 0.08
714 0.1
715 0.1
716 0.1
717 0.1
718 0.09
719 0.08
720 0.07
721 0.07
722 0.05
723 0.04
724 0.04
725 0.04
726 0.04
727 0.05
728 0.05
729 0.04
730 0.04
731 0.05
732 0.07
733 0.07
734 0.06
735 0.06
736 0.07
737 0.07
738 0.08
739 0.12
740 0.12
741 0.13
742 0.14
743 0.18
744 0.18
745 0.2
746 0.2
747 0.17
748 0.15
749 0.15
750 0.19
751 0.16
752 0.23
753 0.21
754 0.22
755 0.25
756 0.25
757 0.24
758 0.21
759 0.2
760 0.13
761 0.15
762 0.15
763 0.14
764 0.14
765 0.14
766 0.14
767 0.15
768 0.15
769 0.14
770 0.12
771 0.11
772 0.16
773 0.17
774 0.2
775 0.24
776 0.31
777 0.33
778 0.42
779 0.42
780 0.41
781 0.42
782 0.43
783 0.42
784 0.39
785 0.43
786 0.41
787 0.41
788 0.4
789 0.38
790 0.34
791 0.31
792 0.26
793 0.19
794 0.13
795 0.11
796 0.08
797 0.08
798 0.1
799 0.13
800 0.15
801 0.15
802 0.14
803 0.16
804 0.18
805 0.21
806 0.23
807 0.22
808 0.26
809 0.26
810 0.28
811 0.26
812 0.25
813 0.23
814 0.19
815 0.18
816 0.12
817 0.11
818 0.1
819 0.1
820 0.1
821 0.08
822 0.07
823 0.07
824 0.08
825 0.09
826 0.09
827 0.09
828 0.1
829 0.11
830 0.1
831 0.11
832 0.1
833 0.11
834 0.12
835 0.13
836 0.14
837 0.15
838 0.2
839 0.2
840 0.2
841 0.25
842 0.25
843 0.25
844 0.24
845 0.22
846 0.17
847 0.18
848 0.2
849 0.21
850 0.19
851 0.21
852 0.27
853 0.28
854 0.29
855 0.34
856 0.34
857 0.28
858 0.28
859 0.26
860 0.22
861 0.2
862 0.21
863 0.15
864 0.12
865 0.11
866 0.15
867 0.15
868 0.21
869 0.25
870 0.27
871 0.3
872 0.33
873 0.36
874 0.39
875 0.45
876 0.46
877 0.49
878 0.55
879 0.57
880 0.55
881 0.53
882 0.47
883 0.43
884 0.41
885 0.38
886 0.31
887 0.34
888 0.38
889 0.4
890 0.41
891 0.41
892 0.4
893 0.37
894 0.38
895 0.3
896 0.28
897 0.29
898 0.26
899 0.25
900 0.21
901 0.19
902 0.18
903 0.16
904 0.13
905 0.1
906 0.09
907 0.06
908 0.06
909 0.05
910 0.04
911 0.07
912 0.07
913 0.09
914 0.12
915 0.15
916 0.2
917 0.23
918 0.26
919 0.29
920 0.34
921 0.33
922 0.37
923 0.35
924 0.32
925 0.35
926 0.36
927 0.32
928 0.28
929 0.28
930 0.23
931 0.21
932 0.2
933 0.21
934 0.24
935 0.24
936 0.27
937 0.28
938 0.27
939 0.29
940 0.28
941 0.28
942 0.22
943 0.25
944 0.23
945 0.22
946 0.22
947 0.2
948 0.2
949 0.16
950 0.19
951 0.18
952 0.17
953 0.18
954 0.19
955 0.22
956 0.25
957 0.26
958 0.28
959 0.27
960 0.34
961 0.38
962 0.43
963 0.49
964 0.57
965 0.62
966 0.63
967 0.71
968 0.72
969 0.71
970 0.69
971 0.62
972 0.57
973 0.52
974 0.47
975 0.44
976 0.4
977 0.36
978 0.31
979 0.34
980 0.29
981 0.32
982 0.32
983 0.32
984 0.3
985 0.36
986 0.36
987 0.33
988 0.32
989 0.26
990 0.25
991 0.18
992 0.17
993 0.11
994 0.1
995 0.09
996 0.11
997 0.11
998 0.13
999 0.13
1000 0.12
1001 0.14
1002 0.14
1003 0.14
1004 0.13
1005 0.17
1006 0.18
1007 0.22
1008 0.21
1009 0.25
1010 0.27
1011 0.28
1012 0.28
1013 0.29
1014 0.31
1015 0.35
1016 0.41
1017 0.43
1018 0.44
1019 0.45
1020 0.45
1021 0.43
1022 0.42
1023 0.39
1024 0.37
1025 0.33
1026 0.31
1027 0.29
1028 0.3
1029 0.3
1030 0.29
1031 0.3
1032 0.31
1033 0.29
1034 0.33
1035 0.39
1036 0.39
1037 0.39
1038 0.43
1039 0.38
1040 0.39
1041 0.41
1042 0.4
1043 0.41
1044 0.46
1045 0.5
1046 0.53
1047 0.6
1048 0.65
1049 0.72
1050 0.74
1051 0.75
1052 0.78
1053 0.78
1054 0.7
1055 0.67
1056 0.65
1057 0.6
1058 0.59
1059 0.55
1060 0.48
1061 0.41
1062 0.4
1063 0.36
1064 0.29
1065 0.26
1066 0.26
1067 0.22
1068 0.25
1069 0.25
1070 0.29
1071 0.32
1072 0.31
1073 0.31
1074 0.28
1075 0.28
1076 0.27
1077 0.3
1078 0.29
1079 0.24
1080 0.24
1081 0.23
1082 0.26
1083 0.25
1084 0.23
1085 0.27
1086 0.3
1087 0.37
1088 0.46
1089 0.51
1090 0.56
1091 0.66
1092 0.75
1093 0.78
1094 0.8
1095 0.83
1096 0.83
1097 0.87
1098 0.88
1099 0.86
1100 0.84
1101 0.83
1102 0.83
1103 0.76
1104 0.71
1105 0.68
1106 0.66
1107 0.63
1108 0.59
1109 0.56
1110 0.55
1111 0.55
1112 0.59
1113 0.54
1114 0.49
1115 0.44
1116 0.44
1117 0.38
1118 0.39
1119 0.41
1120 0.37
1121 0.37
1122 0.37
1123 0.4
1124 0.39
1125 0.46
1126 0.46
1127 0.51
1128 0.56
1129 0.63
1130 0.67
1131 0.7
1132 0.7
1133 0.63
1134 0.61
1135 0.61
1136 0.63
1137 0.64
1138 0.63
1139 0.66
1140 0.7
1141 0.78
1142 0.78
1143 0.74