Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JL88

Protein Details
Accession A0A397JL88    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
526-571ATAYRKAKAYKQGKKEKYERRKKEKKLKKKQEKKEKKTTNMEFDDLBasic
574-595DELSRQVRPRNRFQNRFQEQSCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
530-562RKAKAYKQGKKEKYERRKKEKKLKKKQEKKEKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MDVQLPSVFLNEYLSHTPFNNCLHITDLTNLPCYNKRICCGKPELSVLIVRTIENLEHEDLELLLRKVTSLPFEHILKKQKNTWGHVHFGASNFYSEMKDGAFTGPHNCVIRFSGATYFKSKKPVDYIPVKQSSSNKSQYALYDNNEGFVCFDDMYIADDDQTITISAENSIEQNGTEIENYLLTKFEVNIILPRILTPAISQSFSSLVIVNSLVELEKSRLVLVAIVVITKFRRNPFKQRNNGAPAIIDPREVQELRHIRAQINCLTQIRDNCQQILYDLEWLQDSYMAQQRNQTRLTVNISRRRRPLYQNQQQPVRPSLNTLLPPRFPPLSAQIRRENLSSERSTFTQTRPSTRSNTPTSSDSPSRSIIEPEDQLLINFNGSDNNNNLEPEREEPNEEDQDIEAYNNENLRQFLQQIHEIEPEPQLIAERDIATFVAKPPKFSGISNEDAQEWLQEFLVAAKNPENDHNAHTWAELRAAFIENHFRRLAKRVNLNAARTLPYFVRGLLPDIKAIIKTHEPADLATAYRKAKAYKQGKKEKYERRKKEKKLKKKQEKKEKKTTNMEFDDLQLDELSRQVRPRNRFQNRFQEQSCEQNSNVYQPPQLRGKCYNCGEMGHFTRDYHFNNISEDEYEAYEAIRNKPNTRTNSIRRSERITRQPTTILKPNQSTPTPKIVEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.24
4 0.26
5 0.28
6 0.3
7 0.31
8 0.27
9 0.27
10 0.29
11 0.3
12 0.29
13 0.28
14 0.3
15 0.26
16 0.29
17 0.29
18 0.29
19 0.32
20 0.34
21 0.39
22 0.38
23 0.42
24 0.47
25 0.49
26 0.54
27 0.56
28 0.58
29 0.56
30 0.56
31 0.53
32 0.47
33 0.47
34 0.4
35 0.36
36 0.31
37 0.25
38 0.21
39 0.2
40 0.18
41 0.17
42 0.19
43 0.16
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.14
48 0.15
49 0.17
50 0.14
51 0.13
52 0.12
53 0.12
54 0.14
55 0.16
56 0.19
57 0.18
58 0.22
59 0.26
60 0.3
61 0.35
62 0.4
63 0.48
64 0.5
65 0.53
66 0.55
67 0.59
68 0.63
69 0.63
70 0.67
71 0.62
72 0.6
73 0.57
74 0.53
75 0.47
76 0.4
77 0.38
78 0.29
79 0.24
80 0.2
81 0.19
82 0.16
83 0.14
84 0.14
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.15
92 0.17
93 0.21
94 0.22
95 0.21
96 0.22
97 0.22
98 0.25
99 0.22
100 0.21
101 0.24
102 0.26
103 0.29
104 0.34
105 0.36
106 0.35
107 0.44
108 0.43
109 0.4
110 0.43
111 0.47
112 0.49
113 0.54
114 0.58
115 0.58
116 0.63
117 0.6
118 0.57
119 0.57
120 0.55
121 0.54
122 0.53
123 0.45
124 0.41
125 0.42
126 0.4
127 0.41
128 0.38
129 0.32
130 0.33
131 0.32
132 0.32
133 0.29
134 0.27
135 0.21
136 0.18
137 0.17
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.1
143 0.11
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.13
178 0.15
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.14
183 0.12
184 0.12
185 0.09
186 0.13
187 0.14
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.1
219 0.14
220 0.17
221 0.27
222 0.33
223 0.44
224 0.54
225 0.64
226 0.71
227 0.74
228 0.78
229 0.75
230 0.71
231 0.6
232 0.49
233 0.4
234 0.35
235 0.29
236 0.21
237 0.15
238 0.14
239 0.18
240 0.18
241 0.16
242 0.2
243 0.25
244 0.26
245 0.3
246 0.3
247 0.27
248 0.3
249 0.33
250 0.29
251 0.27
252 0.28
253 0.25
254 0.26
255 0.26
256 0.26
257 0.28
258 0.29
259 0.28
260 0.26
261 0.25
262 0.23
263 0.21
264 0.21
265 0.17
266 0.13
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.19
279 0.23
280 0.27
281 0.28
282 0.26
283 0.22
284 0.24
285 0.3
286 0.32
287 0.36
288 0.4
289 0.46
290 0.5
291 0.54
292 0.56
293 0.55
294 0.55
295 0.59
296 0.61
297 0.64
298 0.67
299 0.68
300 0.69
301 0.66
302 0.62
303 0.55
304 0.46
305 0.37
306 0.3
307 0.27
308 0.25
309 0.27
310 0.27
311 0.26
312 0.24
313 0.25
314 0.25
315 0.23
316 0.19
317 0.18
318 0.21
319 0.29
320 0.32
321 0.35
322 0.38
323 0.4
324 0.41
325 0.39
326 0.34
327 0.26
328 0.27
329 0.24
330 0.21
331 0.2
332 0.2
333 0.23
334 0.22
335 0.21
336 0.26
337 0.26
338 0.29
339 0.31
340 0.34
341 0.36
342 0.38
343 0.43
344 0.38
345 0.4
346 0.37
347 0.36
348 0.36
349 0.36
350 0.34
351 0.3
352 0.28
353 0.27
354 0.26
355 0.23
356 0.22
357 0.18
358 0.18
359 0.16
360 0.15
361 0.14
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.11
366 0.08
367 0.07
368 0.06
369 0.08
370 0.08
371 0.1
372 0.09
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.11
378 0.12
379 0.13
380 0.16
381 0.15
382 0.16
383 0.18
384 0.22
385 0.22
386 0.21
387 0.19
388 0.15
389 0.15
390 0.13
391 0.11
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.11
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.15
404 0.18
405 0.19
406 0.21
407 0.21
408 0.21
409 0.21
410 0.19
411 0.17
412 0.13
413 0.11
414 0.1
415 0.08
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.11
425 0.19
426 0.18
427 0.2
428 0.21
429 0.26
430 0.26
431 0.26
432 0.3
433 0.26
434 0.3
435 0.3
436 0.29
437 0.25
438 0.24
439 0.23
440 0.17
441 0.13
442 0.09
443 0.08
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.12
448 0.11
449 0.11
450 0.13
451 0.15
452 0.17
453 0.19
454 0.21
455 0.18
456 0.21
457 0.22
458 0.22
459 0.2
460 0.2
461 0.19
462 0.16
463 0.17
464 0.14
465 0.13
466 0.12
467 0.13
468 0.13
469 0.12
470 0.22
471 0.21
472 0.24
473 0.25
474 0.24
475 0.24
476 0.31
477 0.38
478 0.34
479 0.42
480 0.43
481 0.53
482 0.57
483 0.57
484 0.55
485 0.5
486 0.45
487 0.37
488 0.34
489 0.24
490 0.22
491 0.2
492 0.16
493 0.17
494 0.15
495 0.18
496 0.2
497 0.21
498 0.19
499 0.2
500 0.2
501 0.18
502 0.18
503 0.18
504 0.16
505 0.17
506 0.18
507 0.2
508 0.19
509 0.18
510 0.21
511 0.18
512 0.16
513 0.17
514 0.21
515 0.19
516 0.22
517 0.24
518 0.24
519 0.29
520 0.38
521 0.46
522 0.51
523 0.6
524 0.68
525 0.74
526 0.81
527 0.85
528 0.86
529 0.86
530 0.88
531 0.89
532 0.89
533 0.92
534 0.93
535 0.94
536 0.94
537 0.94
538 0.95
539 0.95
540 0.95
541 0.95
542 0.96
543 0.96
544 0.97
545 0.95
546 0.95
547 0.93
548 0.92
549 0.92
550 0.89
551 0.87
552 0.8
553 0.73
554 0.62
555 0.54
556 0.46
557 0.36
558 0.28
559 0.18
560 0.14
561 0.11
562 0.13
563 0.13
564 0.12
565 0.16
566 0.23
567 0.31
568 0.38
569 0.48
570 0.57
571 0.66
572 0.73
573 0.78
574 0.81
575 0.8
576 0.82
577 0.73
578 0.7
579 0.62
580 0.63
581 0.58
582 0.51
583 0.43
584 0.42
585 0.41
586 0.4
587 0.42
588 0.34
589 0.34
590 0.34
591 0.39
592 0.42
593 0.44
594 0.44
595 0.48
596 0.51
597 0.56
598 0.57
599 0.56
600 0.49
601 0.49
602 0.46
603 0.45
604 0.44
605 0.4
606 0.38
607 0.33
608 0.35
609 0.39
610 0.38
611 0.37
612 0.37
613 0.33
614 0.35
615 0.36
616 0.34
617 0.29
618 0.26
619 0.21
620 0.17
621 0.17
622 0.14
623 0.12
624 0.14
625 0.17
626 0.21
627 0.28
628 0.32
629 0.35
630 0.44
631 0.52
632 0.55
633 0.6
634 0.65
635 0.67
636 0.73
637 0.78
638 0.77
639 0.74
640 0.75
641 0.76
642 0.76
643 0.77
644 0.75
645 0.71
646 0.66
647 0.69
648 0.67
649 0.65
650 0.65
651 0.62
652 0.62
653 0.62
654 0.65
655 0.65
656 0.64
657 0.63
658 0.59
659 0.61