Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397GHR0

Protein Details
Accession A0A397GHR0    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-46ENTPVVEKRRGRPKKEIKQKETSPTAVHydrophilic
52-75EPIIGGKRRGRPRKEIKPDGVPPPBasic
92-116PVPIVEKRRGRPRKKVKPEDALSSTHydrophilic
241-262MSNGNIRKRGRPRKILRFDEEDHydrophilic
279-302ESATDATKRRGRPRKDPQEEPAINHydrophilic
304-325DTKIANVIKPRGRPKKRQRFDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-37KRRGRPKKEIK
57-68GKRRGRPRKEIK
98-108KRRGRPRKKVK
169-178TRRGRPAKIP
247-254RKRGRPRK
287-293RRGRPRK
312-322KPRGRPKKRQR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MATFIRRKELSSNIESSNIENTPVVEKRRGRPKKEIKQKETSPTAVTDTDIEPIIGGKRRGRPRKEIKPDGVPPPTSASFEPDDINNDEEVPVPIVEKRRGRPRKKVKPEDALSSTIIPITTTTNDEIFMPVVEKRQVKPRDIFEPDEDPPSIEPIITNKDINKEVSKTRRGRPAKIPKPEEAPPTTAATTTATTTTTTTTATYTATTIATTTATATANTNANTNATIERTATIPTTTKIMSNGNIRKRGRPRKILRFDEEDQVDQVDQVESVAQQVEESATDATKRRGRPRKDPQEEPAINDDTKIANVIKPRGRPKKRQRFDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.43
3 0.39
4 0.36
5 0.29
6 0.24
7 0.2
8 0.19
9 0.22
10 0.26
11 0.29
12 0.32
13 0.38
14 0.45
15 0.56
16 0.64
17 0.65
18 0.72
19 0.79
20 0.82
21 0.87
22 0.89
23 0.86
24 0.87
25 0.88
26 0.86
27 0.81
28 0.73
29 0.64
30 0.55
31 0.5
32 0.4
33 0.34
34 0.26
35 0.21
36 0.19
37 0.17
38 0.14
39 0.11
40 0.11
41 0.14
42 0.16
43 0.19
44 0.23
45 0.32
46 0.43
47 0.53
48 0.58
49 0.65
50 0.72
51 0.8
52 0.85
53 0.85
54 0.81
55 0.81
56 0.8
57 0.78
58 0.72
59 0.62
60 0.53
61 0.49
62 0.44
63 0.37
64 0.31
65 0.27
66 0.23
67 0.23
68 0.23
69 0.17
70 0.2
71 0.19
72 0.2
73 0.16
74 0.15
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.11
79 0.09
80 0.08
81 0.11
82 0.15
83 0.21
84 0.26
85 0.31
86 0.41
87 0.52
88 0.59
89 0.68
90 0.74
91 0.8
92 0.85
93 0.9
94 0.88
95 0.88
96 0.84
97 0.8
98 0.72
99 0.63
100 0.53
101 0.43
102 0.34
103 0.24
104 0.2
105 0.12
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.09
120 0.13
121 0.15
122 0.16
123 0.25
124 0.29
125 0.32
126 0.36
127 0.38
128 0.41
129 0.43
130 0.45
131 0.38
132 0.39
133 0.36
134 0.33
135 0.3
136 0.22
137 0.18
138 0.17
139 0.14
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.16
148 0.17
149 0.19
150 0.19
151 0.17
152 0.22
153 0.28
154 0.36
155 0.38
156 0.42
157 0.51
158 0.53
159 0.56
160 0.61
161 0.65
162 0.65
163 0.7
164 0.69
165 0.61
166 0.62
167 0.6
168 0.54
169 0.46
170 0.39
171 0.32
172 0.3
173 0.28
174 0.23
175 0.2
176 0.16
177 0.14
178 0.12
179 0.11
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.13
206 0.13
207 0.13
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.15
227 0.17
228 0.19
229 0.27
230 0.35
231 0.4
232 0.48
233 0.49
234 0.56
235 0.65
236 0.72
237 0.72
238 0.75
239 0.78
240 0.8
241 0.88
242 0.88
243 0.83
244 0.8
245 0.73
246 0.7
247 0.63
248 0.53
249 0.43
250 0.36
251 0.3
252 0.22
253 0.2
254 0.11
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.1
270 0.13
271 0.2
272 0.26
273 0.33
274 0.42
275 0.52
276 0.6
277 0.68
278 0.77
279 0.82
280 0.84
281 0.85
282 0.81
283 0.82
284 0.75
285 0.69
286 0.64
287 0.56
288 0.47
289 0.4
290 0.35
291 0.25
292 0.23
293 0.21
294 0.17
295 0.15
296 0.21
297 0.29
298 0.34
299 0.42
300 0.52
301 0.61
302 0.69
303 0.77
304 0.83
305 0.86