Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JY06

Protein Details
Accession A0A397JY06    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-46TSSTSPTTRRTSRNDKRRASNELSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-141KMKKEEEERKEKIAKEKKEAEEKR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039853  Pinin  
IPR006786  Pinin_SDK_MemA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04696  Pinin_SDK_memA  
Amino Acid Sequences MATEVADRVEIKTESVTSQPVITSSTSPTTRRTSRNDKRRASNELSRQNTEETKRPRLDIKDAEVKKRGQRIFGVLLGTLTKFKNDIQNKTEADIKREQIVQKTQDKLKKEHEELVNKMKKEEEERKEKIAKEKKEAEEKRLKELQECWTTQKKNLANFLRTNTEPSLYYLPARVSQPMVETIARQKRQLVLESTSSISRDDNNNNNNNNVIKEEVTDNAEDIEMSDQNDKKVTSAENIKMETDQPEIKDEKSLEENNNNKDDQTQLSSSSVVNNNNNNNESQEEEGEEATIAATTEEGEPPVFNKTEESVVKDEEHTDSKDDPVEY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.21
4 0.17
5 0.18
6 0.17
7 0.16
8 0.16
9 0.16
10 0.16
11 0.17
12 0.23
13 0.25
14 0.27
15 0.32
16 0.38
17 0.44
18 0.49
19 0.55
20 0.59
21 0.66
22 0.75
23 0.81
24 0.81
25 0.84
26 0.83
27 0.83
28 0.8
29 0.78
30 0.78
31 0.77
32 0.75
33 0.68
34 0.63
35 0.59
36 0.57
37 0.52
38 0.51
39 0.48
40 0.52
41 0.51
42 0.52
43 0.54
44 0.53
45 0.58
46 0.55
47 0.54
48 0.55
49 0.56
50 0.6
51 0.58
52 0.58
53 0.55
54 0.58
55 0.53
56 0.47
57 0.46
58 0.45
59 0.44
60 0.41
61 0.36
62 0.27
63 0.25
64 0.22
65 0.2
66 0.16
67 0.13
68 0.11
69 0.11
70 0.13
71 0.22
72 0.28
73 0.34
74 0.35
75 0.42
76 0.43
77 0.43
78 0.48
79 0.4
80 0.39
81 0.37
82 0.35
83 0.31
84 0.34
85 0.34
86 0.33
87 0.39
88 0.4
89 0.41
90 0.45
91 0.48
92 0.5
93 0.51
94 0.51
95 0.54
96 0.56
97 0.53
98 0.55
99 0.55
100 0.56
101 0.56
102 0.62
103 0.57
104 0.49
105 0.47
106 0.41
107 0.36
108 0.37
109 0.43
110 0.4
111 0.45
112 0.48
113 0.53
114 0.57
115 0.57
116 0.59
117 0.58
118 0.55
119 0.54
120 0.59
121 0.58
122 0.63
123 0.63
124 0.61
125 0.61
126 0.58
127 0.57
128 0.53
129 0.48
130 0.4
131 0.42
132 0.41
133 0.37
134 0.37
135 0.35
136 0.39
137 0.4
138 0.39
139 0.43
140 0.39
141 0.37
142 0.44
143 0.44
144 0.4
145 0.41
146 0.41
147 0.38
148 0.34
149 0.34
150 0.26
151 0.22
152 0.18
153 0.18
154 0.18
155 0.15
156 0.15
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.15
161 0.13
162 0.11
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.11
168 0.11
169 0.18
170 0.25
171 0.26
172 0.25
173 0.26
174 0.28
175 0.31
176 0.33
177 0.29
178 0.24
179 0.24
180 0.26
181 0.25
182 0.21
183 0.19
184 0.16
185 0.14
186 0.13
187 0.16
188 0.2
189 0.26
190 0.32
191 0.38
192 0.38
193 0.39
194 0.38
195 0.35
196 0.3
197 0.24
198 0.19
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.13
214 0.14
215 0.14
216 0.17
217 0.16
218 0.15
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.24
223 0.28
224 0.3
225 0.31
226 0.31
227 0.29
228 0.29
229 0.26
230 0.22
231 0.2
232 0.17
233 0.2
234 0.21
235 0.21
236 0.24
237 0.22
238 0.22
239 0.26
240 0.3
241 0.31
242 0.38
243 0.44
244 0.44
245 0.48
246 0.44
247 0.39
248 0.35
249 0.33
250 0.27
251 0.26
252 0.22
253 0.2
254 0.21
255 0.22
256 0.21
257 0.25
258 0.26
259 0.26
260 0.3
261 0.34
262 0.39
263 0.43
264 0.44
265 0.39
266 0.36
267 0.32
268 0.3
269 0.26
270 0.21
271 0.18
272 0.18
273 0.17
274 0.15
275 0.13
276 0.11
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.15
290 0.15
291 0.14
292 0.15
293 0.17
294 0.24
295 0.26
296 0.3
297 0.29
298 0.31
299 0.32
300 0.31
301 0.31
302 0.28
303 0.3
304 0.27
305 0.28
306 0.26
307 0.27