Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JJY7

Protein Details
Accession A0A397JJY7    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-80QQQHQQQSPQQKRGRGRPRKNIPQLPQQPPQQKRGRGRPRKNKLQPQPQLQPQPQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-68KRGRGRPRKNIPQLPQQPPQQKRGRGRPRKNK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR003314  Mu-type_HTH  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR000156  Ran_bind_dom  
IPR045255  RanBP1-like  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046907  P:intracellular transport  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF00638  Ran_BP1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51702  HTH_MU  
PS50196  RANBD1  
Amino Acid Sequences MPVMTRAQLRKQQQQQDQLPYQQPQQQQHQQQSPQQKRGRGRPRKNIPQLPQQPPQQKRGRGRPRKNKLQPQPQLQPQPQPTPQPQPQPTPQPTTQPTTQPQPQLQTTPLPQSQGVFGSGTKYSGSSFMGGFASMALSSQKSNMSIFDEQPSQNDDENKNEIGIEKEVPLGTKTQTLFHELEVLTGEENESTRHSIRAKLYCLDGQTGKERGVGTLKINYPKNNEKSPRLVMRADNVLRVILNVSLFHGMHIERSQEKFVRLFAFEGDILVHLAVKLPNSNAADDLYKAIMDAISPAQNQQHP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.78
3 0.79
4 0.77
5 0.74
6 0.71
7 0.64
8 0.61
9 0.57
10 0.56
11 0.53
12 0.57
13 0.59
14 0.61
15 0.68
16 0.71
17 0.7
18 0.71
19 0.76
20 0.75
21 0.76
22 0.73
23 0.72
24 0.72
25 0.77
26 0.81
27 0.81
28 0.82
29 0.83
30 0.88
31 0.91
32 0.93
33 0.92
34 0.87
35 0.87
36 0.87
37 0.83
38 0.8
39 0.77
40 0.77
41 0.72
42 0.74
43 0.72
44 0.71
45 0.73
46 0.77
47 0.79
48 0.8
49 0.87
50 0.89
51 0.9
52 0.93
53 0.94
54 0.93
55 0.93
56 0.93
57 0.9
58 0.88
59 0.86
60 0.83
61 0.82
62 0.74
63 0.72
64 0.66
65 0.65
66 0.59
67 0.57
68 0.54
69 0.53
70 0.56
71 0.57
72 0.56
73 0.55
74 0.57
75 0.61
76 0.6
77 0.58
78 0.54
79 0.52
80 0.51
81 0.5
82 0.47
83 0.44
84 0.43
85 0.42
86 0.45
87 0.43
88 0.42
89 0.41
90 0.4
91 0.36
92 0.34
93 0.31
94 0.28
95 0.29
96 0.28
97 0.24
98 0.23
99 0.21
100 0.2
101 0.17
102 0.16
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.06
120 0.06
121 0.04
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.12
132 0.13
133 0.14
134 0.15
135 0.17
136 0.16
137 0.17
138 0.18
139 0.16
140 0.15
141 0.18
142 0.17
143 0.18
144 0.2
145 0.2
146 0.18
147 0.16
148 0.15
149 0.13
150 0.13
151 0.1
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.12
160 0.12
161 0.14
162 0.15
163 0.19
164 0.19
165 0.18
166 0.22
167 0.18
168 0.18
169 0.15
170 0.15
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.09
179 0.1
180 0.13
181 0.14
182 0.19
183 0.25
184 0.29
185 0.31
186 0.3
187 0.32
188 0.31
189 0.31
190 0.29
191 0.24
192 0.21
193 0.23
194 0.23
195 0.21
196 0.21
197 0.2
198 0.19
199 0.21
200 0.2
201 0.18
202 0.23
203 0.26
204 0.3
205 0.34
206 0.36
207 0.39
208 0.47
209 0.5
210 0.53
211 0.56
212 0.54
213 0.57
214 0.62
215 0.61
216 0.56
217 0.54
218 0.46
219 0.44
220 0.48
221 0.43
222 0.37
223 0.3
224 0.27
225 0.23
226 0.21
227 0.18
228 0.1
229 0.1
230 0.08
231 0.09
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.11
237 0.14
238 0.15
239 0.17
240 0.19
241 0.22
242 0.27
243 0.28
244 0.31
245 0.29
246 0.31
247 0.31
248 0.28
249 0.26
250 0.22
251 0.22
252 0.19
253 0.18
254 0.15
255 0.12
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.06
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.12
264 0.12
265 0.19
266 0.2
267 0.21
268 0.2
269 0.21
270 0.21
271 0.2
272 0.21
273 0.16
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.1
278 0.08
279 0.1
280 0.11
281 0.14
282 0.15
283 0.17