Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397JL41

Protein Details
Accession A0A397JL41    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-49GPLTAGKKRKGVKNKGGEEKRAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-48AGKKRKGVKNKGGEEKRA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MNNFYNSNGEGSSKTLGKRKVNDNEAGPLTAGKKRKGVKNKGGEEKRAARFIYTCNKEIKKRIERAMTQFLHLIDYKEINPTQREYTVLGPTGCIYTSIITKTVSCSCPDFQLGFKCKHILFVFLKVLKVNPNGYFIYQKALITKELRLIFKNSPKIILPSEKQIEKLKAXFRFTPPLLQKLCHVLAPISNLLFVFLKVLKVNPNGYFIYQKALITKELRLIFKNSPKIILPSEKQIEKLKAIASIKRRPIEGNCPVCLEPLNNNEPLIWCQSGSLVYIAELYGMIRCELEISIIYVEEYFLKINVKDKICR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.31
3 0.38
4 0.44
5 0.51
6 0.58
7 0.64
8 0.67
9 0.69
10 0.65
11 0.64
12 0.58
13 0.51
14 0.41
15 0.33
16 0.3
17 0.3
18 0.32
19 0.28
20 0.33
21 0.39
22 0.49
23 0.58
24 0.65
25 0.7
26 0.75
27 0.81
28 0.85
29 0.85
30 0.81
31 0.78
32 0.77
33 0.71
34 0.65
35 0.56
36 0.47
37 0.42
38 0.43
39 0.45
40 0.41
41 0.4
42 0.43
43 0.49
44 0.53
45 0.59
46 0.63
47 0.62
48 0.65
49 0.7
50 0.7
51 0.7
52 0.72
53 0.74
54 0.64
55 0.56
56 0.5
57 0.43
58 0.37
59 0.31
60 0.25
61 0.17
62 0.18
63 0.17
64 0.19
65 0.2
66 0.21
67 0.22
68 0.23
69 0.24
70 0.23
71 0.24
72 0.22
73 0.24
74 0.24
75 0.24
76 0.21
77 0.18
78 0.18
79 0.17
80 0.15
81 0.11
82 0.09
83 0.08
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.14
90 0.18
91 0.18
92 0.18
93 0.2
94 0.2
95 0.22
96 0.23
97 0.21
98 0.19
99 0.26
100 0.29
101 0.28
102 0.28
103 0.29
104 0.27
105 0.32
106 0.29
107 0.27
108 0.25
109 0.27
110 0.31
111 0.29
112 0.3
113 0.24
114 0.25
115 0.22
116 0.23
117 0.21
118 0.17
119 0.19
120 0.19
121 0.2
122 0.21
123 0.17
124 0.18
125 0.16
126 0.15
127 0.13
128 0.14
129 0.16
130 0.15
131 0.16
132 0.19
133 0.21
134 0.22
135 0.21
136 0.24
137 0.26
138 0.31
139 0.36
140 0.31
141 0.29
142 0.28
143 0.29
144 0.27
145 0.28
146 0.23
147 0.23
148 0.26
149 0.25
150 0.27
151 0.29
152 0.3
153 0.28
154 0.33
155 0.3
156 0.33
157 0.33
158 0.34
159 0.34
160 0.32
161 0.37
162 0.35
163 0.37
164 0.33
165 0.32
166 0.3
167 0.31
168 0.3
169 0.23
170 0.19
171 0.14
172 0.14
173 0.16
174 0.16
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.13
187 0.15
188 0.18
189 0.17
190 0.2
191 0.19
192 0.2
193 0.21
194 0.17
195 0.18
196 0.16
197 0.15
198 0.13
199 0.14
200 0.16
201 0.15
202 0.16
203 0.19
204 0.21
205 0.22
206 0.21
207 0.24
208 0.26
209 0.31
210 0.36
211 0.31
212 0.29
213 0.28
214 0.29
215 0.27
216 0.28
217 0.23
218 0.23
219 0.26
220 0.25
221 0.27
222 0.29
223 0.3
224 0.27
225 0.28
226 0.23
227 0.26
228 0.29
229 0.32
230 0.36
231 0.41
232 0.47
233 0.47
234 0.47
235 0.45
236 0.48
237 0.52
238 0.54
239 0.51
240 0.45
241 0.46
242 0.45
243 0.42
244 0.37
245 0.3
246 0.26
247 0.27
248 0.29
249 0.26
250 0.26
251 0.26
252 0.27
253 0.27
254 0.26
255 0.2
256 0.16
257 0.15
258 0.16
259 0.16
260 0.15
261 0.14
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.06
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.1
277 0.08
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.1
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.13
289 0.14
290 0.2
291 0.28