FuNGI

A0A397JLF0

Protein Details

Accession

A0A397JLF0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
370-391	DLSSIKRKEKMRRTRISQLREE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
376-379	RKEK

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5 IPR036277 SMC_hinge_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0051276 P:chromosome organization GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MAHSKTRALETEVSEEQSFSRASTPSESCSKRMRLEDNLCPSPSSPWNTSRKGKSSQEEYQLGSIVRVCLKNFVTYDSVEFYPGPNLNMIIGPNGTGKSTIVCAIALGLGWNTSLLGRAKEISDFVKHGQERASIEIELKNKNKNIIITRMIKKSNNTSQWKLNGQNVTHREIQARVASINIQADNLCQFLPQDKVCEFSQMSPPELLMQTQKAVGEKEMIEWHERLIELRNEEKSISTAAKADGDQIDNLEKRNAILERDVTRFREREAIMKRVRLYELRIPFARYGIAKTLYDELKIVRTEAHNEYNRLSKENEPANARKSELENNVKDLTQEKKQCSDSFVKKRREMEGIAAKLEETEGEIDTIRKDLSSIKRKEKMRRTRISQLREEINDFEAKLQIPPSKPDSPDLIRRFDDVNNRIREITSKVGNNRELQSQIDVENKSLYRDMASFKRQLQDLEDVRRRRLDALRNEPATIAAIEWLDQNRDRLNSRVYGPVCLEVNIKNMHYADAVETLLGHFMKTFVCEVEQDYHTVTKALCDEKGLKINVVCFSHLSMAKFQPPIPNNQLRTHGFESYLLDQIDAPPTLCTAICNEAQFHRIPVARSESDVDHKNIERLFEFRKYIAGDTSYSITASKYGRRLKQSYTTRIRPARIFTNTINVESKRILESQLNEIQSKLKENENSLYKLKSEERQLNGSLSVLNSEKAKIIEEKNKARAALNEYEKLKIKLDSTNSQLEREITRPQSIQDEENELKEKLCEIARKRGQLAEKFQKFLDESMQLFSGRIRASLLHLQAVSELQALERQTQDRDDALKQAHAKFSDANKKFLAAKSEAKRLLNAANSENENEEIDEETREALQELAGMSLEELEDGLASDRARANLHYTVDPNVIQTYDNRKAQIDDLKSKLTIKTNRLEVLLKEMTTLKEKWEPQLNELVKQISKEFSNAFDRIGCVGEVRISTNDDYDKWGIDILVKFRDNEKLQVLTGQRQSGGERSVSTIMYLMALQELAKTPFRVVDEINQGMDPRNERLVHSQMIQTACRPNTAQYFLITPKLLPDLEYHERMKILCIYNGEWQPETMDWRKYIEARKKSND

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.33
3	0.28
4	0.25
5	0.22
6	0.16
7	0.17
8	0.15
9	0.17
10	0.23
11	0.25
12	0.28
13	0.37
14	0.39
15	0.4
16	0.48
17	0.52
18	0.52
19	0.57
20	0.58
21	0.59
22	0.64
23	0.68
24	0.69
25	0.68
26	0.62
27	0.56
28	0.51
29	0.46
30	0.45
31	0.42
32	0.39
33	0.42
34	0.5
35	0.56
36	0.64
37	0.67
38	0.67
39	0.69
40	0.73
41	0.73
42	0.72
43	0.73
44	0.72
45	0.67
46	0.63
47	0.56
48	0.5
49	0.42
50	0.34
51	0.28
52	0.22
53	0.23
54	0.23
55	0.22
56	0.26
57	0.27
58	0.31
59	0.3
60	0.31
61	0.29
62	0.27
63	0.29
64	0.27
65	0.26
66	0.22
67	0.22
68	0.19
69	0.22
70	0.22
71	0.21
72	0.18
73	0.18
74	0.17
75	0.18
76	0.17
77	0.13
78	0.12
79	0.12
80	0.13
81	0.13
82	0.13
83	0.12
84	0.12
85	0.11
86	0.13
87	0.13
88	0.12
89	0.11
90	0.11
91	0.11
92	0.1
93	0.09
94	0.08
95	0.06
96	0.05
97	0.06
98	0.06
99	0.05
100	0.05
101	0.1
102	0.11
103	0.12
104	0.13
105	0.15
106	0.16
107	0.17
108	0.2
109	0.19
110	0.21
111	0.22
112	0.23
113	0.31
114	0.3
115	0.31
116	0.32
117	0.33
118	0.31
119	0.32
120	0.33
121	0.24
122	0.26
123	0.29
124	0.3
125	0.34
126	0.35
127	0.38
128	0.38
129	0.42
130	0.43
131	0.45
132	0.47
133	0.46
134	0.5
135	0.52
136	0.56
137	0.59
138	0.61
139	0.58
140	0.57
141	0.59
142	0.62
143	0.62
144	0.63
145	0.61
146	0.63
147	0.66
148	0.68
149	0.63
150	0.6
151	0.56
152	0.5
153	0.55
154	0.51
155	0.49
156	0.46
157	0.44
158	0.39
159	0.34
160	0.37
161	0.31
162	0.29
163	0.24
164	0.21
165	0.2
166	0.2
167	0.22
168	0.18
169	0.15
170	0.13
171	0.14
172	0.14
173	0.14
174	0.11
175	0.08
176	0.09
177	0.11
178	0.16
179	0.16
180	0.19
181	0.18
182	0.22
183	0.22
184	0.27
185	0.25
186	0.24
187	0.31
188	0.29
189	0.31
190	0.28
191	0.28
192	0.25
193	0.25
194	0.23
195	0.18
196	0.17
197	0.16
198	0.17
199	0.18
200	0.16
201	0.17
202	0.16
203	0.17
204	0.15
205	0.17
206	0.2
207	0.2
208	0.21
209	0.2
210	0.2
211	0.19
212	0.18
213	0.17
214	0.18
215	0.21
216	0.22
217	0.26
218	0.28
219	0.27
220	0.27
221	0.27
222	0.22
223	0.21
224	0.19
225	0.15
226	0.15
227	0.15
228	0.16
229	0.16
230	0.18
231	0.17
232	0.17
233	0.16
234	0.16
235	0.2
236	0.19
237	0.2
238	0.19
239	0.16
240	0.15
241	0.2
242	0.2
243	0.17
244	0.19
245	0.23
246	0.26
247	0.3
248	0.33
249	0.32
250	0.36
251	0.35
252	0.33
253	0.36
254	0.32
255	0.37
256	0.4
257	0.45
258	0.44
259	0.48
260	0.48
261	0.43
262	0.46
263	0.39
264	0.39
265	0.38
266	0.39
267	0.39
268	0.39
269	0.39
270	0.36
271	0.35
272	0.31
273	0.24
274	0.22
275	0.21
276	0.22
277	0.19
278	0.2
279	0.25
280	0.23
281	0.22
282	0.2
283	0.17
284	0.18
285	0.18
286	0.17
287	0.15
288	0.16
289	0.2
290	0.24
291	0.31
292	0.31
293	0.33
294	0.34
295	0.38
296	0.38
297	0.35
298	0.33
299	0.29
300	0.32
301	0.36
302	0.38
303	0.37
304	0.4
305	0.42
306	0.41
307	0.38
308	0.33
309	0.32
310	0.34
311	0.37
312	0.42
313	0.38
314	0.41
315	0.41
316	0.38
317	0.36
318	0.32
319	0.27
320	0.27
321	0.32
322	0.31
323	0.35
324	0.39
325	0.4
326	0.42
327	0.47
328	0.49
329	0.54
330	0.6
331	0.63
332	0.65
333	0.68
334	0.66
335	0.62
336	0.53
337	0.5
338	0.5
339	0.43
340	0.38
341	0.34
342	0.3
343	0.25
344	0.23
345	0.15
346	0.07
347	0.06
348	0.05
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.07
355	0.06
356	0.07
357	0.13
358	0.23
359	0.32
360	0.39
361	0.47
362	0.55
363	0.62
364	0.71
365	0.75
366	0.77
367	0.77
368	0.8
369	0.78
370	0.82
371	0.83
372	0.8
373	0.76
374	0.7
375	0.64
376	0.57
377	0.51
378	0.42
379	0.35
380	0.29
381	0.23
382	0.18
383	0.15
384	0.13
385	0.12
386	0.13
387	0.15
388	0.16
389	0.19
390	0.25
391	0.28
392	0.28
393	0.3
394	0.33
395	0.33
396	0.41
397	0.41
398	0.4
399	0.36
400	0.36
401	0.36
402	0.34
403	0.39
404	0.34
405	0.39
406	0.37
407	0.37
408	0.36
409	0.34
410	0.33
411	0.27
412	0.27
413	0.23
414	0.24
415	0.27
416	0.32
417	0.35
418	0.36
419	0.34
420	0.32
421	0.29
422	0.25
423	0.23
424	0.19
425	0.18
426	0.2
427	0.18
428	0.16
429	0.18
430	0.17
431	0.17
432	0.16
433	0.15
434	0.11
435	0.12
436	0.15
437	0.18
438	0.21
439	0.24
440	0.25
441	0.28
442	0.28
443	0.27
444	0.26
445	0.29
446	0.29
447	0.34
448	0.39
449	0.38
450	0.39
451	0.4
452	0.37
453	0.34
454	0.36
455	0.36
456	0.38
457	0.45
458	0.51
459	0.5
460	0.5
461	0.45
462	0.39
463	0.31
464	0.22
465	0.13
466	0.07
467	0.06
468	0.06
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.08
473	0.1
474	0.1
475	0.13
476	0.14
477	0.15
478	0.17
479	0.18
480	0.19
481	0.25
482	0.23
483	0.23
484	0.22
485	0.22
486	0.2
487	0.18
488	0.18
489	0.12
490	0.15
491	0.14
492	0.13
493	0.13
494	0.13
495	0.12
496	0.11
497	0.11
498	0.08
499	0.08
500	0.08
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.07
505	0.06
506	0.05
507	0.04
508	0.05
509	0.05
510	0.06
511	0.06
512	0.05
513	0.06
514	0.06
515	0.08
516	0.11
517	0.12
518	0.12
519	0.12
520	0.12
521	0.12
522	0.12
523	0.1
524	0.08
525	0.1
526	0.11
527	0.1
528	0.11
529	0.13
530	0.15
531	0.2
532	0.19
533	0.17
534	0.16
535	0.18
536	0.2
537	0.19
538	0.17
539	0.12
540	0.13
541	0.15
542	0.16
543	0.15
544	0.14
545	0.15
546	0.18
547	0.18
548	0.19
549	0.22
550	0.21
551	0.26
552	0.3
553	0.36
554	0.36
555	0.37
556	0.42
557	0.37
558	0.42
559	0.39
560	0.33
561	0.27
562	0.24
563	0.24
564	0.2
565	0.21
566	0.15
567	0.13
568	0.12
569	0.12
570	0.13
571	0.1
572	0.09
573	0.06
574	0.06
575	0.07
576	0.07
577	0.06
578	0.06
579	0.09
580	0.1
581	0.11
582	0.12
583	0.12
584	0.14
585	0.14
586	0.13
587	0.14
588	0.14
589	0.14
590	0.16
591	0.21
592	0.19
593	0.2
594	0.21
595	0.19
596	0.21
597	0.23
598	0.22
599	0.19
600	0.19
601	0.21
602	0.2
603	0.19
604	0.16
605	0.16
606	0.18
607	0.19
608	0.2
609	0.17
610	0.19
611	0.19
612	0.19
613	0.18
614	0.16
615	0.13
616	0.13
617	0.14
618	0.12
619	0.11
620	0.1
621	0.09
622	0.11
623	0.11
624	0.14
625	0.2
626	0.27
627	0.32
628	0.38
629	0.41
630	0.42
631	0.51
632	0.55
633	0.58
634	0.6
635	0.6
636	0.62
637	0.63
638	0.63
639	0.55
640	0.51
641	0.48
642	0.43
643	0.42
644	0.34
645	0.38
646	0.35
647	0.35
648	0.35
649	0.28
650	0.26
651	0.23
652	0.23
653	0.16
654	0.16
655	0.16
656	0.15
657	0.17
658	0.21
659	0.25
660	0.25
661	0.24
662	0.24
663	0.25
664	0.23
665	0.25
666	0.2
667	0.2
668	0.2
669	0.23
670	0.28
671	0.29
672	0.32
673	0.3
674	0.29
675	0.26
676	0.27
677	0.28
678	0.26
679	0.29
680	0.32
681	0.34
682	0.36
683	0.37
684	0.35
685	0.32
686	0.28
687	0.21
688	0.14
689	0.13
690	0.1
691	0.09
692	0.09
693	0.09
694	0.1
695	0.1
696	0.12
697	0.14
698	0.19
699	0.27
700	0.34
701	0.4
702	0.44
703	0.46
704	0.45
705	0.42
706	0.4
707	0.38
708	0.38
709	0.36
710	0.36
711	0.35
712	0.37
713	0.39
714	0.36
715	0.32
716	0.26
717	0.23
718	0.23
719	0.27
720	0.29
721	0.3
722	0.37
723	0.36
724	0.35
725	0.34
726	0.31
727	0.28
728	0.26
729	0.28
730	0.22
731	0.24
732	0.23
733	0.24
734	0.27
735	0.27
736	0.27
737	0.22
738	0.27
739	0.25
740	0.27
741	0.29
742	0.23
743	0.22
744	0.2
745	0.19
746	0.14
747	0.17
748	0.21
749	0.22
750	0.33
751	0.38
752	0.41
753	0.42
754	0.45
755	0.48
756	0.48
757	0.53
758	0.53
759	0.51
760	0.49
761	0.48
762	0.46
763	0.4
764	0.35
765	0.29
766	0.22
767	0.2
768	0.2
769	0.21
770	0.18
771	0.17
772	0.16
773	0.16
774	0.13
775	0.12
776	0.11
777	0.11
778	0.15
779	0.21
780	0.21
781	0.19
782	0.19
783	0.19
784	0.19
785	0.18
786	0.14
787	0.09
788	0.08
789	0.06
790	0.09
791	0.09
792	0.11
793	0.13
794	0.14
795	0.15
796	0.16
797	0.18
798	0.17
799	0.2
800	0.2
801	0.22
802	0.22
803	0.25
804	0.28
805	0.29
806	0.31
807	0.28
808	0.29
809	0.29
810	0.36
811	0.42
812	0.4
813	0.41
814	0.37
815	0.39
816	0.41
817	0.38
818	0.36
819	0.3
820	0.37
821	0.38
822	0.46
823	0.48
824	0.45
825	0.43
826	0.4
827	0.4
828	0.35
829	0.33
830	0.27
831	0.27
832	0.27
833	0.27
834	0.26
835	0.22
836	0.18
837	0.16
838	0.14
839	0.12
840	0.11
841	0.11
842	0.1
843	0.1
844	0.09
845	0.09
846	0.09
847	0.07
848	0.06
849	0.07
850	0.07
851	0.06
852	0.06
853	0.06
854	0.05
855	0.06
856	0.06
857	0.04
858	0.04
859	0.03
860	0.03
861	0.04
862	0.05
863	0.06
864	0.06
865	0.09
866	0.11
867	0.12
868	0.13
869	0.14
870	0.18
871	0.21
872	0.24
873	0.24
874	0.24
875	0.26
876	0.27
877	0.26
878	0.22
879	0.19
880	0.17
881	0.15
882	0.18
883	0.24
884	0.29
885	0.32
886	0.32
887	0.32
888	0.33
889	0.38
890	0.41
891	0.4
892	0.39
893	0.4
894	0.41
895	0.41
896	0.42
897	0.41
898	0.42
899	0.42
900	0.41
901	0.44
902	0.47
903	0.48
904	0.49
905	0.47
906	0.39
907	0.39
908	0.36
909	0.29
910	0.25
911	0.25
912	0.25
913	0.27
914	0.26
915	0.23
916	0.28
917	0.3
918	0.34
919	0.42
920	0.42
921	0.41
922	0.51
923	0.48
924	0.43
925	0.44
926	0.41
927	0.32
928	0.32
929	0.31
930	0.24
931	0.23
932	0.23
933	0.22
934	0.22
935	0.27
936	0.27
937	0.26
938	0.24
939	0.24
940	0.22
941	0.22
942	0.17
943	0.12
944	0.12
945	0.13
946	0.13
947	0.14
948	0.15
949	0.16
950	0.17
951	0.19
952	0.2
953	0.19
954	0.23
955	0.22
956	0.21
957	0.19
958	0.19
959	0.16
960	0.19
961	0.21
962	0.2
963	0.26
964	0.26
965	0.27
966	0.28
967	0.37
968	0.35
969	0.36
970	0.37
971	0.32
972	0.32
973	0.37
974	0.38
975	0.36
976	0.39
977	0.36
978	0.32
979	0.31
980	0.33
981	0.31
982	0.3
983	0.24
984	0.21
985	0.23
986	0.24
987	0.22
988	0.2
989	0.17
990	0.14
991	0.14
992	0.12
993	0.09
994	0.07
995	0.07
996	0.07
997	0.08
998	0.1
999	0.13
1000	0.16
1001	0.16
1002	0.17
1003	0.2
1004	0.22
1005	0.23
1006	0.23
1007	0.27
1008	0.32
1009	0.33
1010	0.34
1011	0.31
1012	0.29
1013	0.3
1014	0.32
1015	0.27
1016	0.23
1017	0.28
1018	0.28
1019	0.3
1020	0.36
1021	0.38
1022	0.37
1023	0.37
1024	0.36
1025	0.35
1026	0.37
1027	0.36
1028	0.33
1029	0.36
1030	0.33
1031	0.34
1032	0.32
1033	0.33
1034	0.36
1035	0.39
1036	0.37
1037	0.3
1038	0.35
1039	0.34
1040	0.37
1041	0.33
1042	0.26
1043	0.24
1044	0.26
1045	0.25
1046	0.21
1047	0.21
1048	0.25
1049	0.31
1050	0.36
1051	0.35
1052	0.33
1053	0.35
1054	0.34
1055	0.35
1056	0.34
1057	0.31
1058	0.29
1059	0.31
1060	0.32
1061	0.39
1062	0.43
1063	0.43
1064	0.36
1065	0.33
1066	0.32
1067	0.31
1068	0.35
1069	0.32
1070	0.32
1071	0.3
1072	0.33
1073	0.38
1074	0.42
1075	0.5
1076	0.53
1077	0.58

A0A397JLF0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer